Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CGW3

Protein Details
Accession S3CGW3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
969-994RSMTATSTSKRQRRHSKSIHPGQSGVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013860  AreA_GATA  
IPR039355  Transcription_factor_GATA  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0042128  P:nitrate assimilation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08550  DUF1752  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MMAAASTASPHGTSSPMMSINTTTTEHDFRFPRRPDTGGAGGSGQSSHHHHNLSLDINDSFNHDFTRDMESINNPIEDVSYINATSPSTSRLGLDVDSLYRSAESRLAREAAFADLRRGMGTGSDDATTPGSPDSVQKPEHLMTEMWRFFSKTKQQLPNQERMENLTWRMMHVELRAPQPKTYAASSSSYPPLRTPHAHNAFRPSAPAASKAAGAMNAPSGIAQLRKSSEQNMSFQSSKNNAMGAPGSTHDAMNLDDFIDTRNIASPIAGGAQDAASSKDSHATATAIPIKTRREAAKHFVPQSVPVAPHQVGQDEFAYVTRHHRKTSIDDRRVRPPPSASSAAPTSAPRQKLTLTTQTRKRPADFSPHVVAVGHGADLDVDPELHDYALDHSLANGMGNHDQPTPTGIPFPLDSYMDNDTLLTSAGPFQQQFCISPSSSPMVNHGLFSSNMYSNSGPSMPSSSIPTTADYYSPPGSAYHSTASTPHPLNDGSVNANGDGFYFGSIDMRHGQQRGPQGFRTGPPSTTAAMSTSIASSMTTTAGHTSNPLMYGSSAGNAMFQSGSVPTTGPEGGFSNSFSHIDPAQVFHQQHPDPQASAQSPGLGNPNNLLGDNMFSFGADSDADDDEAGAFADRNLGLSNGEFSPGLEDGSGLDVVNGNMGWDATLPGQFSTQAARYPGGIPPRKQVTIGGATSSDFNDMNSVEWDGTSSSLPRSQSFRNGSISGGRSKMSRTTSTPNVNRQGSVSGGSQFTNGMGTGNPNSPTNDMGVSGFSSVAPSRPGSPLIPGSKNGSSSNLQAQGDSSAPTTCTNCFTQTTPLWRRNPEGQPLCNACGLFLKLHGVVRPLSLKTDVIKKRNRGSGASLPVAGTNTRSGKKPPPSGSSTRKNSTLSMSATASSSQPPMMSATTPPGQQMRAGSVNESDSPASGGNTAGSTPASYAGSANGGKGVVPIAAAPPKNTPGPGAASLPRSMTATSTSKRQRRHSKSIHPGQSGVTPGDIGLGGSSIMDIDSPENSTGSNEAALASTGLNFLDKHTSNLGLANAFGVNQRPLVSPGMIGMGPAASGSMMTPGGSAGGPQEWEWLTMSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.17
3 0.18
4 0.19
5 0.19
6 0.2
7 0.2
8 0.22
9 0.21
10 0.2
11 0.23
12 0.27
13 0.27
14 0.32
15 0.36
16 0.39
17 0.47
18 0.49
19 0.52
20 0.51
21 0.53
22 0.5
23 0.52
24 0.52
25 0.43
26 0.4
27 0.33
28 0.3
29 0.27
30 0.23
31 0.16
32 0.14
33 0.17
34 0.22
35 0.26
36 0.27
37 0.28
38 0.3
39 0.34
40 0.35
41 0.31
42 0.28
43 0.24
44 0.23
45 0.22
46 0.24
47 0.21
48 0.18
49 0.18
50 0.15
51 0.16
52 0.17
53 0.24
54 0.2
55 0.2
56 0.22
57 0.24
58 0.28
59 0.29
60 0.28
61 0.2
62 0.19
63 0.19
64 0.16
65 0.14
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.13
73 0.13
74 0.15
75 0.15
76 0.16
77 0.16
78 0.16
79 0.18
80 0.16
81 0.17
82 0.15
83 0.15
84 0.16
85 0.15
86 0.14
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.16
91 0.17
92 0.19
93 0.23
94 0.25
95 0.24
96 0.25
97 0.24
98 0.23
99 0.25
100 0.23
101 0.22
102 0.22
103 0.22
104 0.21
105 0.2
106 0.16
107 0.13
108 0.16
109 0.14
110 0.14
111 0.14
112 0.14
113 0.15
114 0.16
115 0.14
116 0.12
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.14
121 0.18
122 0.22
123 0.24
124 0.25
125 0.29
126 0.3
127 0.32
128 0.3
129 0.25
130 0.24
131 0.33
132 0.33
133 0.3
134 0.29
135 0.3
136 0.28
137 0.37
138 0.42
139 0.42
140 0.5
141 0.58
142 0.64
143 0.73
144 0.78
145 0.78
146 0.74
147 0.67
148 0.58
149 0.55
150 0.52
151 0.45
152 0.41
153 0.36
154 0.31
155 0.29
156 0.3
157 0.25
158 0.23
159 0.21
160 0.25
161 0.24
162 0.32
163 0.38
164 0.38
165 0.38
166 0.38
167 0.38
168 0.35
169 0.33
170 0.28
171 0.24
172 0.25
173 0.26
174 0.28
175 0.32
176 0.31
177 0.3
178 0.29
179 0.3
180 0.34
181 0.37
182 0.4
183 0.44
184 0.52
185 0.55
186 0.55
187 0.59
188 0.57
189 0.53
190 0.48
191 0.39
192 0.33
193 0.3
194 0.3
195 0.24
196 0.21
197 0.21
198 0.19
199 0.18
200 0.14
201 0.13
202 0.11
203 0.1
204 0.09
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.08
209 0.1
210 0.1
211 0.12
212 0.15
213 0.19
214 0.21
215 0.25
216 0.31
217 0.33
218 0.35
219 0.36
220 0.39
221 0.37
222 0.36
223 0.38
224 0.34
225 0.34
226 0.31
227 0.27
228 0.22
229 0.22
230 0.22
231 0.17
232 0.15
233 0.12
234 0.14
235 0.14
236 0.14
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.08
243 0.07
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.1
250 0.11
251 0.11
252 0.1
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.09
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.13
267 0.13
268 0.13
269 0.14
270 0.13
271 0.12
272 0.17
273 0.23
274 0.2
275 0.21
276 0.24
277 0.26
278 0.27
279 0.32
280 0.31
281 0.31
282 0.36
283 0.42
284 0.48
285 0.52
286 0.52
287 0.51
288 0.47
289 0.42
290 0.4
291 0.36
292 0.27
293 0.21
294 0.23
295 0.21
296 0.22
297 0.21
298 0.19
299 0.17
300 0.17
301 0.17
302 0.12
303 0.12
304 0.11
305 0.12
306 0.11
307 0.2
308 0.27
309 0.3
310 0.3
311 0.33
312 0.36
313 0.42
314 0.53
315 0.55
316 0.55
317 0.61
318 0.64
319 0.7
320 0.74
321 0.67
322 0.6
323 0.53
324 0.48
325 0.46
326 0.46
327 0.37
328 0.34
329 0.33
330 0.3
331 0.27
332 0.24
333 0.23
334 0.25
335 0.27
336 0.23
337 0.24
338 0.24
339 0.28
340 0.32
341 0.36
342 0.39
343 0.45
344 0.52
345 0.59
346 0.66
347 0.64
348 0.61
349 0.55
350 0.51
351 0.53
352 0.49
353 0.46
354 0.42
355 0.39
356 0.37
357 0.32
358 0.29
359 0.19
360 0.15
361 0.09
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.05
367 0.04
368 0.03
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.07
376 0.08
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.06
384 0.07
385 0.08
386 0.09
387 0.11
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.14
392 0.13
393 0.12
394 0.12
395 0.11
396 0.12
397 0.12
398 0.14
399 0.12
400 0.11
401 0.11
402 0.13
403 0.15
404 0.14
405 0.13
406 0.12
407 0.1
408 0.1
409 0.1
410 0.06
411 0.04
412 0.05
413 0.06
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.11
418 0.11
419 0.12
420 0.13
421 0.15
422 0.14
423 0.14
424 0.16
425 0.15
426 0.16
427 0.15
428 0.16
429 0.18
430 0.17
431 0.17
432 0.16
433 0.16
434 0.14
435 0.16
436 0.15
437 0.11
438 0.11
439 0.13
440 0.13
441 0.11
442 0.13
443 0.12
444 0.09
445 0.09
446 0.11
447 0.1
448 0.1
449 0.13
450 0.13
451 0.14
452 0.14
453 0.15
454 0.15
455 0.15
456 0.15
457 0.12
458 0.14
459 0.14
460 0.13
461 0.12
462 0.1
463 0.12
464 0.13
465 0.14
466 0.13
467 0.12
468 0.13
469 0.14
470 0.15
471 0.17
472 0.16
473 0.15
474 0.15
475 0.15
476 0.16
477 0.15
478 0.14
479 0.11
480 0.12
481 0.12
482 0.1
483 0.1
484 0.09
485 0.08
486 0.07
487 0.05
488 0.05
489 0.04
490 0.04
491 0.05
492 0.06
493 0.07
494 0.08
495 0.09
496 0.11
497 0.12
498 0.12
499 0.15
500 0.23
501 0.26
502 0.27
503 0.27
504 0.28
505 0.28
506 0.29
507 0.31
508 0.25
509 0.21
510 0.2
511 0.21
512 0.19
513 0.18
514 0.17
515 0.11
516 0.11
517 0.11
518 0.09
519 0.08
520 0.07
521 0.06
522 0.06
523 0.05
524 0.05
525 0.05
526 0.05
527 0.05
528 0.07
529 0.07
530 0.07
531 0.07
532 0.07
533 0.07
534 0.08
535 0.08
536 0.06
537 0.06
538 0.07
539 0.07
540 0.07
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.06
555 0.07
556 0.06
557 0.07
558 0.07
559 0.08
560 0.08
561 0.09
562 0.09
563 0.1
564 0.11
565 0.1
566 0.11
567 0.1
568 0.11
569 0.1
570 0.11
571 0.11
572 0.15
573 0.16
574 0.16
575 0.22
576 0.21
577 0.23
578 0.24
579 0.24
580 0.2
581 0.19
582 0.21
583 0.16
584 0.17
585 0.15
586 0.13
587 0.12
588 0.12
589 0.15
590 0.13
591 0.12
592 0.11
593 0.12
594 0.11
595 0.11
596 0.1
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.08
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.05
605 0.06
606 0.05
607 0.05
608 0.05
609 0.06
610 0.06
611 0.06
612 0.06
613 0.05
614 0.05
615 0.05
616 0.03
617 0.03
618 0.03
619 0.05
620 0.04
621 0.05
622 0.05
623 0.05
624 0.06
625 0.06
626 0.08
627 0.07
628 0.08
629 0.07
630 0.07
631 0.08
632 0.08
633 0.08
634 0.06
635 0.06
636 0.05
637 0.07
638 0.07
639 0.05
640 0.05
641 0.05
642 0.05
643 0.06
644 0.05
645 0.04
646 0.04
647 0.04
648 0.04
649 0.03
650 0.04
651 0.05
652 0.06
653 0.06
654 0.06
655 0.07
656 0.07
657 0.07
658 0.09
659 0.09
660 0.1
661 0.11
662 0.11
663 0.12
664 0.14
665 0.16
666 0.23
667 0.27
668 0.27
669 0.32
670 0.36
671 0.35
672 0.35
673 0.33
674 0.29
675 0.29
676 0.28
677 0.22
678 0.18
679 0.17
680 0.18
681 0.17
682 0.13
683 0.08
684 0.08
685 0.08
686 0.08
687 0.09
688 0.09
689 0.09
690 0.07
691 0.07
692 0.08
693 0.07
694 0.08
695 0.07
696 0.07
697 0.08
698 0.11
699 0.13
700 0.14
701 0.18
702 0.19
703 0.28
704 0.32
705 0.33
706 0.34
707 0.34
708 0.33
709 0.34
710 0.34
711 0.28
712 0.24
713 0.22
714 0.19
715 0.2
716 0.24
717 0.23
718 0.24
719 0.26
720 0.31
721 0.38
722 0.47
723 0.51
724 0.53
725 0.56
726 0.54
727 0.5
728 0.44
729 0.38
730 0.3
731 0.27
732 0.2
733 0.15
734 0.15
735 0.15
736 0.14
737 0.12
738 0.11
739 0.09
740 0.08
741 0.06
742 0.06
743 0.08
744 0.1
745 0.12
746 0.13
747 0.14
748 0.15
749 0.16
750 0.16
751 0.15
752 0.14
753 0.12
754 0.11
755 0.1
756 0.09
757 0.09
758 0.08
759 0.07
760 0.08
761 0.08
762 0.08
763 0.09
764 0.1
765 0.12
766 0.13
767 0.15
768 0.14
769 0.17
770 0.23
771 0.27
772 0.28
773 0.27
774 0.31
775 0.3
776 0.32
777 0.3
778 0.27
779 0.24
780 0.24
781 0.28
782 0.29
783 0.27
784 0.25
785 0.24
786 0.22
787 0.21
788 0.19
789 0.14
790 0.09
791 0.1
792 0.12
793 0.13
794 0.12
795 0.15
796 0.16
797 0.18
798 0.19
799 0.2
800 0.24
801 0.27
802 0.36
803 0.41
804 0.47
805 0.5
806 0.51
807 0.54
808 0.57
809 0.59
810 0.59
811 0.58
812 0.52
813 0.54
814 0.55
815 0.52
816 0.45
817 0.38
818 0.29
819 0.25
820 0.24
821 0.17
822 0.14
823 0.15
824 0.15
825 0.16
826 0.17
827 0.16
828 0.15
829 0.17
830 0.2
831 0.18
832 0.18
833 0.19
834 0.19
835 0.2
836 0.3
837 0.35
838 0.4
839 0.47
840 0.52
841 0.58
842 0.64
843 0.64
844 0.57
845 0.57
846 0.57
847 0.55
848 0.5
849 0.43
850 0.36
851 0.33
852 0.31
853 0.24
854 0.17
855 0.16
856 0.2
857 0.21
858 0.23
859 0.27
860 0.36
861 0.44
862 0.52
863 0.53
864 0.55
865 0.6
866 0.67
867 0.71
868 0.72
869 0.71
870 0.66
871 0.64
872 0.59
873 0.54
874 0.5
875 0.46
876 0.38
877 0.34
878 0.3
879 0.27
880 0.25
881 0.25
882 0.21
883 0.17
884 0.15
885 0.12
886 0.11
887 0.11
888 0.13
889 0.13
890 0.13
891 0.13
892 0.17
893 0.19
894 0.2
895 0.21
896 0.21
897 0.21
898 0.22
899 0.22
900 0.22
901 0.24
902 0.24
903 0.23
904 0.23
905 0.25
906 0.24
907 0.24
908 0.18
909 0.14
910 0.15
911 0.14
912 0.13
913 0.11
914 0.1
915 0.09
916 0.09
917 0.09
918 0.08
919 0.08
920 0.08
921 0.08
922 0.09
923 0.09
924 0.09
925 0.09
926 0.09
927 0.13
928 0.13
929 0.13
930 0.12
931 0.11
932 0.11
933 0.11
934 0.11
935 0.07
936 0.07
937 0.07
938 0.09
939 0.15
940 0.16
941 0.17
942 0.2
943 0.23
944 0.25
945 0.25
946 0.23
947 0.21
948 0.25
949 0.26
950 0.26
951 0.27
952 0.28
953 0.29
954 0.28
955 0.26
956 0.22
957 0.2
958 0.17
959 0.19
960 0.23
961 0.24
962 0.33
963 0.42
964 0.47
965 0.55
966 0.64
967 0.7
968 0.73
969 0.82
970 0.83
971 0.84
972 0.89
973 0.91
974 0.9
975 0.82
976 0.73
977 0.64
978 0.58
979 0.49
980 0.39
981 0.29
982 0.19
983 0.16
984 0.16
985 0.13
986 0.09
987 0.06
988 0.06
989 0.05
990 0.05
991 0.05
992 0.04
993 0.04
994 0.04
995 0.05
996 0.06
997 0.07
998 0.09
999 0.1
1000 0.1
1001 0.11
1002 0.12
1003 0.12
1004 0.12
1005 0.12
1006 0.09
1007 0.09
1008 0.1
1009 0.1
1010 0.09
1011 0.08
1012 0.08
1013 0.08
1014 0.08
1015 0.08
1016 0.08
1017 0.1
1018 0.18
1019 0.18
1020 0.21
1021 0.23
1022 0.25
1023 0.24
1024 0.27
1025 0.26
1026 0.19
1027 0.18
1028 0.16
1029 0.13
1030 0.12
1031 0.13
1032 0.13
1033 0.13
1034 0.14
1035 0.16
1036 0.16
1037 0.19
1038 0.21
1039 0.2
1040 0.18
1041 0.17
1042 0.19
1043 0.16
1044 0.14
1045 0.12
1046 0.09
1047 0.08
1048 0.08
1049 0.07
1050 0.04
1051 0.04
1052 0.04
1053 0.06
1054 0.06
1055 0.06
1056 0.07
1057 0.07
1058 0.08
1059 0.08
1060 0.08
1061 0.08
1062 0.09
1063 0.11
1064 0.11
1065 0.16
1066 0.15
1067 0.17