Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3C5W5

Protein Details
Accession S3C5W5    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-55AVLLHGLHRRHKNQHRVSTYHydrophilic
234-253STDKHGPKPHAEKKRKIVEDBasic
282-317KETKEMTEKNEKKKDKSRDKKKKRKRGDEFDDLFSGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-249GPKPHAEKKRK
290-307KNEKKKDKSRDKKKKRKR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10, mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047205  RMP1  
IPR047204  RMP1_RBD  
Gene Ontology GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
CDD cd22573  RMP1_RBD  
Amino Acid Sequences MATKQISTKRAVAPPPPPPTQTASFSGVAEHLDDTAVLLHGLHRRHKNQHRVSTYWWPSFGQLRRAVTRLLEDVQNADKAHGIKRITSRVGDTRALVPKVYLAFSRLVADKQFAPLGLLLVGVLAQVQSAVNDIERILGIAADAADAANSKTGAKTAAPPTSASRDTGKQSASRSLPDIDFGVAVSRDDETGGNTAKSASVSRLKKRARKDDSEEDVPKLAAASAPGTAATLKSTDKHGPKPHAEKKRKIVEDQGRTITEHEDVKATTENTKPAQASEPGDKETKEMTEKNEKKKDKSRDKKKKRKRGDEFDDLFSGLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.64
3 0.62
4 0.56
5 0.52
6 0.53
7 0.51
8 0.47
9 0.42
10 0.4
11 0.37
12 0.35
13 0.33
14 0.27
15 0.23
16 0.19
17 0.15
18 0.1
19 0.08
20 0.08
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.06
25 0.06
26 0.09
27 0.13
28 0.18
29 0.25
30 0.33
31 0.4
32 0.51
33 0.61
34 0.68
35 0.74
36 0.8
37 0.79
38 0.75
39 0.74
40 0.75
41 0.73
42 0.65
43 0.56
44 0.47
45 0.42
46 0.46
47 0.44
48 0.41
49 0.39
50 0.41
51 0.43
52 0.43
53 0.42
54 0.35
55 0.33
56 0.29
57 0.25
58 0.22
59 0.19
60 0.2
61 0.21
62 0.22
63 0.19
64 0.17
65 0.17
66 0.17
67 0.2
68 0.22
69 0.21
70 0.23
71 0.28
72 0.34
73 0.34
74 0.33
75 0.35
76 0.35
77 0.39
78 0.36
79 0.32
80 0.32
81 0.35
82 0.34
83 0.3
84 0.24
85 0.22
86 0.22
87 0.22
88 0.16
89 0.12
90 0.12
91 0.13
92 0.15
93 0.14
94 0.14
95 0.13
96 0.15
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.11
101 0.11
102 0.1
103 0.09
104 0.07
105 0.07
106 0.05
107 0.04
108 0.04
109 0.03
110 0.03
111 0.02
112 0.02
113 0.02
114 0.02
115 0.02
116 0.03
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.02
132 0.02
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.05
140 0.06
141 0.06
142 0.11
143 0.14
144 0.16
145 0.17
146 0.18
147 0.2
148 0.23
149 0.23
150 0.2
151 0.19
152 0.19
153 0.21
154 0.23
155 0.22
156 0.2
157 0.21
158 0.26
159 0.24
160 0.23
161 0.22
162 0.22
163 0.21
164 0.19
165 0.17
166 0.12
167 0.1
168 0.09
169 0.08
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.05
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.09
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.18
188 0.24
189 0.29
190 0.39
191 0.45
192 0.51
193 0.6
194 0.67
195 0.66
196 0.69
197 0.72
198 0.72
199 0.72
200 0.74
201 0.67
202 0.58
203 0.51
204 0.42
205 0.34
206 0.24
207 0.17
208 0.09
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.14
222 0.21
223 0.26
224 0.34
225 0.41
226 0.47
227 0.55
228 0.65
229 0.7
230 0.73
231 0.77
232 0.78
233 0.8
234 0.83
235 0.79
236 0.72
237 0.73
238 0.72
239 0.71
240 0.68
241 0.64
242 0.54
243 0.51
244 0.48
245 0.39
246 0.32
247 0.25
248 0.2
249 0.17
250 0.16
251 0.17
252 0.2
253 0.19
254 0.21
255 0.22
256 0.26
257 0.26
258 0.3
259 0.28
260 0.27
261 0.3
262 0.29
263 0.31
264 0.34
265 0.36
266 0.34
267 0.37
268 0.35
269 0.33
270 0.31
271 0.3
272 0.28
273 0.28
274 0.32
275 0.41
276 0.49
277 0.58
278 0.65
279 0.68
280 0.71
281 0.78
282 0.82
283 0.83
284 0.86
285 0.87
286 0.88
287 0.93
288 0.96
289 0.97
290 0.97
291 0.97
292 0.97
293 0.97
294 0.96
295 0.94
296 0.94
297 0.87
298 0.81
299 0.72