FuNGI

S3C522

Protein Details

Accession

S3C522

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
401-425	GVPPVGKPKKARKKKTVQLLPKDAE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
121-145	EEARLKRAASRGRGRGRGGRGRGRG
406-415	GKPKKARKKK

Subcellular Location(s)

mito 23, nucl 2.5, cyto_nucl 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPRTRRGAPRGGAAASRAAAPATPKQEDTPSQPFAHPAATVISSSESTPAPSIPPTSSAAAAASSSSIPAPTSASTSAPASASTTGRSFVFKPKVVRRTDDERKALAEQEEKKFNDRAAEEARLKRAASRGRGRGRGGRGRGRGDFGGGRDGLVRRTVAPDGPFSQVPGATGAPGGPGGFGGAGGRGGFRGSANGGGFAAGGSGGIGSGRGGGSTFSAVAEDHEYDPRLNTDTFMGRASGDYTDAKDELAETHAPSASASASAGKQKAANLLPMGIRREEHREPEVIVTTTAELEAADAAAAAAAAADVEDESDDELFFDNSAVDSAHAMNLDDDNEVWSRAIKTDGSVTILDANGESIVITDIDTLAEKQQEIAAAKAARAAGIKEEADDAAPSLDSLGVPPVGKPKKARKKKTVQLLPKDAEDLTVEQGLQAMLHDLAMDQPPQPDKERIVAEDAILGDGETPAPPAADGSDDQPKEQPRREGRLFLFQFPPVLPSLKPYDATDLTDAPDAAGTAHQSARGPVKQEPGADGDVLMLDGVAPIDLTGADPLSRERANLADIGHGGFLGTLNIRKSGRAELSWGGMTYEMMPGTDVNFLTTAVLLEDSDEKRKAGDAAAAAAATMVGNAFGMGPVGGKYNLVPVFSSETDWVVDPSELVIPEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.39
3	0.3
4	0.27
5	0.2
6	0.16
7	0.15
8	0.17
9	0.22
10	0.26
11	0.28
12	0.29
13	0.31
14	0.37
15	0.4
16	0.44
17	0.45
18	0.44
19	0.43
20	0.43
21	0.43
22	0.38
23	0.36
24	0.28
25	0.21
26	0.19
27	0.18
28	0.17
29	0.15
30	0.16
31	0.14
32	0.15
33	0.16
34	0.13
35	0.14
36	0.15
37	0.14
38	0.14
39	0.15
40	0.18
41	0.17
42	0.2
43	0.21
44	0.22
45	0.22
46	0.2
47	0.19
48	0.16
49	0.15
50	0.12
51	0.1
52	0.08
53	0.08
54	0.08
55	0.08
56	0.08
57	0.08
58	0.1
59	0.1
60	0.13
61	0.14
62	0.15
63	0.16
64	0.17
65	0.18
66	0.16
67	0.15
68	0.14
69	0.16
70	0.16
71	0.17
72	0.17
73	0.17
74	0.17
75	0.2
76	0.2
77	0.26
78	0.33
79	0.35
80	0.43
81	0.52
82	0.59
83	0.61
84	0.64
85	0.61
86	0.64
87	0.69
88	0.7
89	0.65
90	0.58
91	0.57
92	0.54
93	0.51
94	0.44
95	0.42
96	0.4
97	0.41
98	0.47
99	0.45
100	0.47
101	0.46
102	0.43
103	0.42
104	0.35
105	0.35
106	0.32
107	0.38
108	0.41
109	0.43
110	0.46
111	0.42
112	0.41
113	0.38
114	0.4
115	0.4
116	0.43
117	0.48
118	0.54
119	0.6
120	0.66
121	0.67
122	0.67
123	0.69
124	0.68
125	0.67
126	0.66
127	0.64
128	0.63
129	0.61
130	0.57
131	0.49
132	0.43
133	0.38
134	0.3
135	0.29
136	0.23
137	0.22
138	0.21
139	0.21
140	0.19
141	0.18
142	0.17
143	0.13
144	0.16
145	0.18
146	0.18
147	0.18
148	0.21
149	0.21
150	0.24
151	0.23
152	0.21
153	0.21
154	0.18
155	0.17
156	0.15
157	0.13
158	0.09
159	0.1
160	0.09
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.04
165	0.04
166	0.04
167	0.04
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.06
179	0.07
180	0.1
181	0.1
182	0.11
183	0.11
184	0.1
185	0.1
186	0.08
187	0.07
188	0.04
189	0.03
190	0.03
191	0.02
192	0.02
193	0.02
194	0.02
195	0.02
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.04
200	0.04
201	0.05
202	0.06
203	0.06
204	0.05
205	0.06
206	0.06
207	0.07
208	0.08
209	0.09
210	0.1
211	0.12
212	0.13
213	0.13
214	0.13
215	0.13
216	0.14
217	0.12
218	0.12
219	0.13
220	0.14
221	0.14
222	0.14
223	0.13
224	0.11
225	0.11
226	0.12
227	0.09
228	0.1
229	0.09
230	0.1
231	0.11
232	0.11
233	0.11
234	0.09
235	0.09
236	0.08
237	0.1
238	0.1
239	0.08
240	0.09
241	0.1
242	0.1
243	0.09
244	0.09
245	0.07
246	0.06
247	0.06
248	0.06
249	0.07
250	0.11
251	0.11
252	0.12
253	0.12
254	0.13
255	0.18
256	0.17
257	0.18
258	0.15
259	0.16
260	0.17
261	0.19
262	0.2
263	0.15
264	0.15
265	0.15
266	0.22
267	0.22
268	0.24
269	0.24
270	0.23
271	0.24
272	0.25
273	0.25
274	0.18
275	0.16
276	0.12
277	0.11
278	0.1
279	0.08
280	0.06
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.03
285	0.03
286	0.02
287	0.02
288	0.02
289	0.02
290	0.02
291	0.02
292	0.01
293	0.01
294	0.01
295	0.02
296	0.02
297	0.02
298	0.02
299	0.02
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.06
321	0.05
322	0.05
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.07
328	0.06
329	0.07
330	0.08
331	0.07
332	0.07
333	0.09
334	0.1
335	0.11
336	0.11
337	0.1
338	0.1
339	0.1
340	0.09
341	0.07
342	0.07
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.05
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.07
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.11
364	0.11
365	0.11
366	0.13
367	0.12
368	0.1
369	0.1
370	0.1
371	0.08
372	0.1
373	0.1
374	0.08
375	0.09
376	0.08
377	0.08
378	0.08
379	0.07
380	0.05
381	0.05
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.04
386	0.04
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.06
391	0.15
392	0.17
393	0.2
394	0.27
395	0.37
396	0.47
397	0.58
398	0.68
399	0.69
400	0.78
401	0.82
402	0.87
403	0.86
404	0.85
405	0.83
406	0.82
407	0.73
408	0.62
409	0.57
410	0.45
411	0.36
412	0.27
413	0.19
414	0.12
415	0.11
416	0.1
417	0.08
418	0.09
419	0.08
420	0.07
421	0.05
422	0.05
423	0.04
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.05
428	0.07
429	0.08
430	0.07
431	0.1
432	0.12
433	0.14
434	0.18
435	0.19
436	0.2
437	0.24
438	0.26
439	0.25
440	0.27
441	0.25
442	0.21
443	0.2
444	0.19
445	0.14
446	0.12
447	0.1
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.04
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.06
459	0.07
460	0.09
461	0.17
462	0.18
463	0.19
464	0.23
465	0.29
466	0.33
467	0.37
468	0.44
469	0.43
470	0.52
471	0.55
472	0.58
473	0.55
474	0.59
475	0.57
476	0.52
477	0.47
478	0.38
479	0.37
480	0.29
481	0.28
482	0.19
483	0.19
484	0.14
485	0.15
486	0.2
487	0.21
488	0.22
489	0.21
490	0.26
491	0.25
492	0.28
493	0.26
494	0.22
495	0.21
496	0.21
497	0.2
498	0.13
499	0.12
500	0.1
501	0.08
502	0.08
503	0.07
504	0.08
505	0.09
506	0.1
507	0.11
508	0.13
509	0.19
510	0.21
511	0.23
512	0.25
513	0.31
514	0.32
515	0.33
516	0.32
517	0.3
518	0.28
519	0.25
520	0.21
521	0.15
522	0.12
523	0.11
524	0.09
525	0.05
526	0.03
527	0.03
528	0.03
529	0.03
530	0.03
531	0.03
532	0.03
533	0.03
534	0.04
535	0.04
536	0.05
537	0.05
538	0.06
539	0.07
540	0.12
541	0.12
542	0.12
543	0.13
544	0.14
545	0.16
546	0.17
547	0.17
548	0.15
549	0.15
550	0.15
551	0.14
552	0.12
553	0.1
554	0.08
555	0.08
556	0.06
557	0.07
558	0.1
559	0.11
560	0.16
561	0.16
562	0.17
563	0.2
564	0.26
565	0.28
566	0.26
567	0.3
568	0.27
569	0.31
570	0.3
571	0.28
572	0.21
573	0.17
574	0.17
575	0.13
576	0.13
577	0.1
578	0.09
579	0.09
580	0.09
581	0.1
582	0.12
583	0.11
584	0.11
585	0.11
586	0.11
587	0.11
588	0.11
589	0.1
590	0.07
591	0.08
592	0.06
593	0.08
594	0.13
595	0.15
596	0.21
597	0.22
598	0.21
599	0.21
600	0.23
601	0.23
602	0.19
603	0.21
604	0.17
605	0.19
606	0.19
607	0.18
608	0.17
609	0.15
610	0.13
611	0.08
612	0.07
613	0.04
614	0.03
615	0.03
616	0.03
617	0.04
618	0.04
619	0.04
620	0.04
621	0.05
622	0.06
623	0.08
624	0.08
625	0.09
626	0.09
627	0.16
628	0.18
629	0.18
630	0.18
631	0.18
632	0.25
633	0.25
634	0.27
635	0.21
636	0.21
637	0.21
638	0.22
639	0.2
640	0.15
641	0.15
642	0.12
643	0.12
644	0.14

S3C522

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer