Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

S3D3F6

Protein Details
Accession S3D3F6    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-115EEDLSRTKRRSSPRKRASRSVSHQPADHydrophilic
132-154APSSARPPSRRARTKTPQVKLEPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
60-66ARRARAK
96-105KRRSSPRKRA
343-350KKVAPKRK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 11.5, cyto 5, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025856  HeH/LEM_domain  
IPR044780  Heh2/Src1  
IPR041885  MAN1_winged_helix_dom  
IPR018996  MSC  
IPR036361  SAP_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005637  C:nuclear inner membrane  
GO:0003682  F:chromatin binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12949  HeH  
PF09402  MSC  
CDD cd12935  LEM_like  
Amino Acid Sequences MSDSEVDYLQPGFDPASLTNPRLRSILVTYNVHYASNAKKPELVELFAANVAPQAKKILARRARAKRSSMGIVDAAAGQSATFDDDEEEEDLSRTKRRSSPRKRASRSVSHQPADQYLGVRNSDSEHELPAAPSSARPPSRRARTKTPQVKLEPTDEERFQMTPAPSTAATVRQKSYQTTHSHQQQQSVFSSDNPFQSGSSPMSGSSPTNRQESRRRTTGYTDEQPTLAVAPSARKRLDGSRVVSSPALQPTSYESPAVRAAAQRRVSPFASARMPSLTPEPEQEEEEDEVSEEEEEEDDDEEADGYDPLAPGEEFTPEEQLELTQEEEVVRQQLGRTNKSQKKVAPKRKTGGRSVASALATPLLVLTLTLLSAYGVWYRQEKLAVGFCGLGRPAVPLFAEQLDKLSAIELPALPEWLEWVERVPDYVPDPVYDLFSEYIGHAELPSFVQTLIEPQCEQCPQHAFCYSDFTVRCENGYIEKAHPLALGGLVPLPPTCEPDGERARRVKAVADKAIEELRDRRAKWECGDLIEDDGQAADSPAMDVPLLKEAISEKRSKKMSKEEFDDLWTAAIGDIESRDEVESESDANYAATDPGTVPNTRLSSTSLARLPLRCAVRRSIRLGLARFRLPLSVLVLSVLSLLYMRARYRSHRATLARVPALVDLVLERLAAQKELWLYDEGDNDDDDEASPDQFLFLPQLRDDVLRSTHSLKARERVWKHVQAVVEQNSNVRTGQREGRNGEVGRAWEWIGPVGTAGAIISGANTSADLSVVRRRRSGRPSMAPGSRAGSVARESLPRESLPRDNNVRETVEDGDENKSALHRRWQESRPIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.19
4 0.23
5 0.25
6 0.3
7 0.31
8 0.32
9 0.31
10 0.31
11 0.27
12 0.29
13 0.35
14 0.35
15 0.36
16 0.36
17 0.41
18 0.41
19 0.37
20 0.32
21 0.28
22 0.28
23 0.33
24 0.35
25 0.3
26 0.33
27 0.33
28 0.42
29 0.41
30 0.37
31 0.31
32 0.28
33 0.28
34 0.25
35 0.24
36 0.15
37 0.15
38 0.15
39 0.13
40 0.13
41 0.14
42 0.16
43 0.22
44 0.29
45 0.37
46 0.42
47 0.51
48 0.61
49 0.69
50 0.77
51 0.78
52 0.77
53 0.73
54 0.72
55 0.69
56 0.6
57 0.53
58 0.43
59 0.37
60 0.32
61 0.26
62 0.19
63 0.12
64 0.1
65 0.06
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.08
73 0.11
74 0.11
75 0.12
76 0.11
77 0.11
78 0.14
79 0.14
80 0.19
81 0.19
82 0.25
83 0.31
84 0.42
85 0.53
86 0.61
87 0.71
88 0.76
89 0.86
90 0.87
91 0.9
92 0.88
93 0.88
94 0.85
95 0.84
96 0.83
97 0.74
98 0.7
99 0.62
100 0.55
101 0.48
102 0.42
103 0.32
104 0.28
105 0.29
106 0.26
107 0.24
108 0.22
109 0.2
110 0.21
111 0.23
112 0.19
113 0.18
114 0.19
115 0.19
116 0.19
117 0.18
118 0.17
119 0.13
120 0.13
121 0.16
122 0.22
123 0.28
124 0.3
125 0.36
126 0.44
127 0.55
128 0.64
129 0.67
130 0.7
131 0.74
132 0.83
133 0.86
134 0.83
135 0.81
136 0.78
137 0.78
138 0.71
139 0.66
140 0.61
141 0.57
142 0.54
143 0.46
144 0.41
145 0.35
146 0.32
147 0.27
148 0.27
149 0.22
150 0.19
151 0.19
152 0.2
153 0.18
154 0.2
155 0.21
156 0.23
157 0.27
158 0.29
159 0.3
160 0.32
161 0.34
162 0.36
163 0.39
164 0.38
165 0.4
166 0.43
167 0.49
168 0.54
169 0.61
170 0.59
171 0.62
172 0.57
173 0.54
174 0.5
175 0.45
176 0.36
177 0.29
178 0.32
179 0.27
180 0.25
181 0.23
182 0.22
183 0.18
184 0.19
185 0.2
186 0.17
187 0.16
188 0.15
189 0.13
190 0.14
191 0.15
192 0.15
193 0.17
194 0.21
195 0.23
196 0.29
197 0.31
198 0.36
199 0.45
200 0.53
201 0.56
202 0.57
203 0.58
204 0.54
205 0.58
206 0.6
207 0.59
208 0.57
209 0.53
210 0.47
211 0.43
212 0.4
213 0.34
214 0.26
215 0.18
216 0.11
217 0.08
218 0.13
219 0.18
220 0.23
221 0.23
222 0.23
223 0.26
224 0.31
225 0.38
226 0.38
227 0.38
228 0.39
229 0.39
230 0.4
231 0.38
232 0.33
233 0.29
234 0.25
235 0.23
236 0.17
237 0.16
238 0.2
239 0.25
240 0.24
241 0.22
242 0.18
243 0.2
244 0.21
245 0.22
246 0.17
247 0.16
248 0.19
249 0.26
250 0.29
251 0.29
252 0.3
253 0.34
254 0.33
255 0.33
256 0.3
257 0.27
258 0.29
259 0.26
260 0.25
261 0.23
262 0.22
263 0.2
264 0.22
265 0.19
266 0.16
267 0.18
268 0.2
269 0.19
270 0.2
271 0.2
272 0.19
273 0.18
274 0.17
275 0.15
276 0.11
277 0.1
278 0.09
279 0.08
280 0.06
281 0.05
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.04
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.1
305 0.09
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.06
320 0.07
321 0.12
322 0.17
323 0.2
324 0.26
325 0.35
326 0.41
327 0.45
328 0.49
329 0.49
330 0.55
331 0.63
332 0.68
333 0.67
334 0.69
335 0.72
336 0.76
337 0.76
338 0.7
339 0.68
340 0.59
341 0.51
342 0.46
343 0.42
344 0.34
345 0.28
346 0.23
347 0.14
348 0.12
349 0.09
350 0.07
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.04
362 0.04
363 0.05
364 0.06
365 0.07
366 0.09
367 0.1
368 0.1
369 0.1
370 0.12
371 0.14
372 0.14
373 0.13
374 0.12
375 0.11
376 0.12
377 0.11
378 0.09
379 0.06
380 0.07
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.08
387 0.08
388 0.07
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.07
393 0.07
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.05
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.05
403 0.06
404 0.05
405 0.06
406 0.04
407 0.05
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.1
415 0.1
416 0.09
417 0.11
418 0.11
419 0.11
420 0.1
421 0.1
422 0.08
423 0.08
424 0.08
425 0.07
426 0.07
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.04
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.09
439 0.1
440 0.11
441 0.1
442 0.11
443 0.13
444 0.14
445 0.15
446 0.14
447 0.18
448 0.18
449 0.21
450 0.24
451 0.23
452 0.22
453 0.28
454 0.26
455 0.25
456 0.24
457 0.24
458 0.24
459 0.23
460 0.23
461 0.17
462 0.17
463 0.15
464 0.17
465 0.16
466 0.14
467 0.16
468 0.16
469 0.15
470 0.14
471 0.12
472 0.1
473 0.08
474 0.07
475 0.05
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.06
481 0.06
482 0.09
483 0.1
484 0.1
485 0.12
486 0.19
487 0.28
488 0.29
489 0.34
490 0.35
491 0.36
492 0.37
493 0.36
494 0.34
495 0.32
496 0.35
497 0.34
498 0.32
499 0.31
500 0.31
501 0.32
502 0.27
503 0.21
504 0.18
505 0.21
506 0.25
507 0.25
508 0.29
509 0.33
510 0.36
511 0.36
512 0.41
513 0.35
514 0.31
515 0.33
516 0.28
517 0.24
518 0.22
519 0.19
520 0.12
521 0.11
522 0.09
523 0.07
524 0.06
525 0.04
526 0.03
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.05
533 0.07
534 0.08
535 0.07
536 0.08
537 0.1
538 0.16
539 0.19
540 0.25
541 0.25
542 0.32
543 0.38
544 0.41
545 0.45
546 0.5
547 0.56
548 0.57
549 0.6
550 0.58
551 0.53
552 0.53
553 0.48
554 0.37
555 0.27
556 0.2
557 0.14
558 0.09
559 0.08
560 0.05
561 0.04
562 0.04
563 0.05
564 0.05
565 0.06
566 0.06
567 0.06
568 0.06
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.08
573 0.07
574 0.07
575 0.07
576 0.07
577 0.06
578 0.06
579 0.05
580 0.05
581 0.06
582 0.09
583 0.11
584 0.11
585 0.12
586 0.16
587 0.18
588 0.18
589 0.18
590 0.18
591 0.21
592 0.22
593 0.25
594 0.23
595 0.24
596 0.27
597 0.27
598 0.27
599 0.29
600 0.33
601 0.32
602 0.33
603 0.38
604 0.43
605 0.47
606 0.5
607 0.49
608 0.49
609 0.51
610 0.51
611 0.5
612 0.46
613 0.43
614 0.39
615 0.34
616 0.29
617 0.25
618 0.23
619 0.19
620 0.16
621 0.14
622 0.13
623 0.12
624 0.11
625 0.1
626 0.08
627 0.05
628 0.04
629 0.04
630 0.06
631 0.08
632 0.09
633 0.13
634 0.16
635 0.22
636 0.31
637 0.37
638 0.4
639 0.45
640 0.48
641 0.51
642 0.55
643 0.57
644 0.5
645 0.43
646 0.4
647 0.32
648 0.29
649 0.22
650 0.15
651 0.08
652 0.08
653 0.07
654 0.06
655 0.06
656 0.09
657 0.1
658 0.1
659 0.1
660 0.11
661 0.13
662 0.13
663 0.15
664 0.13
665 0.15
666 0.17
667 0.2
668 0.19
669 0.18
670 0.18
671 0.17
672 0.15
673 0.13
674 0.11
675 0.11
676 0.1
677 0.09
678 0.09
679 0.08
680 0.09
681 0.09
682 0.09
683 0.11
684 0.13
685 0.16
686 0.16
687 0.17
688 0.18
689 0.19
690 0.2
691 0.19
692 0.19
693 0.19
694 0.22
695 0.24
696 0.29
697 0.33
698 0.38
699 0.39
700 0.43
701 0.47
702 0.54
703 0.54
704 0.57
705 0.61
706 0.63
707 0.62
708 0.58
709 0.54
710 0.48
711 0.53
712 0.48
713 0.43
714 0.35
715 0.34
716 0.31
717 0.31
718 0.27
719 0.21
720 0.19
721 0.2
722 0.29
723 0.34
724 0.4
725 0.42
726 0.47
727 0.53
728 0.5
729 0.48
730 0.42
731 0.36
732 0.3
733 0.28
734 0.24
735 0.18
736 0.18
737 0.17
738 0.14
739 0.12
740 0.11
741 0.1
742 0.09
743 0.07
744 0.06
745 0.04
746 0.04
747 0.04
748 0.04
749 0.04
750 0.04
751 0.04
752 0.05
753 0.05
754 0.05
755 0.06
756 0.07
757 0.09
758 0.18
759 0.25
760 0.28
761 0.34
762 0.39
763 0.48
764 0.56
765 0.63
766 0.65
767 0.67
768 0.73
769 0.75
770 0.76
771 0.68
772 0.62
773 0.54
774 0.45
775 0.37
776 0.29
777 0.23
778 0.2
779 0.22
780 0.22
781 0.23
782 0.24
783 0.27
784 0.3
785 0.28
786 0.31
787 0.33
788 0.39
789 0.4
790 0.47
791 0.51
792 0.53
793 0.57
794 0.57
795 0.54
796 0.47
797 0.45
798 0.4
799 0.34
800 0.31
801 0.27
802 0.27
803 0.24
804 0.23
805 0.21
806 0.22
807 0.23
808 0.26
809 0.34
810 0.39
811 0.45
812 0.54
813 0.59