FuNGI

S3CQD1

Protein Details

Accession

S3CQD1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
34-67	TTTPGTKADRSRRHSQKPGRRRKPQEFLTPSGRR	Hydrophilic
735-755	GYTARCSQKRLRRALEQAQEE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
42-57	DRSRRHSQKPGRRRKP

Subcellular Location(s)

plas 18, E.R. 4, vacu 2, nucl 1, mito 1, cyto 1, cyto_nucl 1, cyto_mito 1, mito_nucl 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010640 Low_temperature_requirement_A
Gene Ontology	GO:0016020 C:membrane
Pfam	View protein in Pfam PF06772 LtrA

Amino Acid Sequences

MSNNVQPVNGGASTSGAAATPAAAPSSSVPASGTTTPGTKADRSRRHSQKPGRRRKPQEFLTPSGRRVLVALPEDAAALRDKYAGVLRENDSPQIEVVVHGSPEHQQYLQESRDHHETLREKLKAKHGAELLAEWDRVNADFHHVSTELENLADHSASLGHNFSKFGYDATLRTFGGNEGHGAGHGTGHGSSVTTANNSRRGSIASGIDDDDDDEDSSEGDGGMPKWHNQGSGTTMQLFKRPTVKQYFHKGLLWRASEETSVQSFELFFDLLYVGIIAINGDHAAESADGFELLRFVVTFCMSWKIWSDVTQLVSWFSTNDVLQRVEILFLYACLLAVTANMVQAFYGWPSHSEGSTESGTGEEVSTTTEAVVMVVRSLLYRRAEEGGGESTGEESESFLKDTYPALAAYYVTARLFMALYCFVTGLLVPLVQGTMYFQTAIITIGAALWIASIHLSMPVRLACVFVALAFDLFGGSVVVGLFRFARSHSEKNRFARYLMNSLFDFYPAINIEHKVERTNAFIALVLGYSVVGVLYQNSHGYGLNAFLGKAVLGLVQAFIFNWIYFDIDAYNIHVHAIRWRAESSYIWQYAHLIFTLSFILSSAALTRLVAATDCANAEVDQLTEMYQERSSPTVSLGLRLYYSTGLGISLFALTAIALCHQHKTAPTARLSKAARLANRCAVAAVFCALPAAQGLTSMQLMSIATGLITWVLVVEIYGQSCIGDALFETRGACGYTARCSQKRLRRALEQAQEEENAQGNAAGRPDEEIGRQPNLDVNVLSQGQKHGAIFIE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.11
3	0.07
4	0.07
5	0.07
6	0.08
7	0.07
8	0.07
9	0.08
10	0.08
11	0.09
12	0.1
13	0.16
14	0.15
15	0.14
16	0.14
17	0.15
18	0.2
19	0.2
20	0.21
21	0.17
22	0.19
23	0.2
24	0.23
25	0.25
26	0.27
27	0.35
28	0.44
29	0.52
30	0.57
31	0.67
32	0.74
33	0.8
34	0.85
35	0.87
36	0.87
37	0.89
38	0.93
39	0.93
40	0.93
41	0.94
42	0.94
43	0.93
44	0.91
45	0.91
46	0.86
47	0.82
48	0.82
49	0.77
50	0.67
51	0.63
52	0.54
53	0.43
54	0.38
55	0.34
56	0.3
57	0.27
58	0.26
59	0.21
60	0.21
61	0.21
62	0.19
63	0.17
64	0.12
65	0.1
66	0.1
67	0.1
68	0.1
69	0.12
70	0.16
71	0.18
72	0.19
73	0.23
74	0.25
75	0.32
76	0.33
77	0.34
78	0.31
79	0.29
80	0.26
81	0.22
82	0.2
83	0.14
84	0.14
85	0.12
86	0.11
87	0.11
88	0.12
89	0.13
90	0.16
91	0.18
92	0.16
93	0.16
94	0.2
95	0.26
96	0.29
97	0.29
98	0.28
99	0.31
100	0.36
101	0.36
102	0.33
103	0.35
104	0.35
105	0.4
106	0.47
107	0.47
108	0.45
109	0.5
110	0.59
111	0.59
112	0.57
113	0.56
114	0.49
115	0.47
116	0.44
117	0.39
118	0.33
119	0.26
120	0.25
121	0.18
122	0.16
123	0.14
124	0.14
125	0.14
126	0.11
127	0.15
128	0.16
129	0.16
130	0.19
131	0.18
132	0.19
133	0.18
134	0.19
135	0.13
136	0.12
137	0.12
138	0.1
139	0.1
140	0.09
141	0.08
142	0.06
143	0.07
144	0.07
145	0.09
146	0.09
147	0.1
148	0.11
149	0.12
150	0.12
151	0.13
152	0.13
153	0.13
154	0.14
155	0.15
156	0.15
157	0.19
158	0.21
159	0.19
160	0.19
161	0.19
162	0.16
163	0.17
164	0.16
165	0.12
166	0.11
167	0.1
168	0.1
169	0.11
170	0.1
171	0.08
172	0.07
173	0.08
174	0.06
175	0.07
176	0.07
177	0.06
178	0.07
179	0.08
180	0.08
181	0.1
182	0.14
183	0.18
184	0.25
185	0.25
186	0.26
187	0.25
188	0.26
189	0.26
190	0.26
191	0.25
192	0.19
193	0.19
194	0.19
195	0.18
196	0.16
197	0.14
198	0.11
199	0.1
200	0.08
201	0.07
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.06
206	0.05
207	0.05
208	0.06
209	0.06
210	0.11
211	0.11
212	0.13
213	0.16
214	0.17
215	0.18
216	0.17
217	0.19
218	0.2
219	0.22
220	0.22
221	0.2
222	0.22
223	0.22
224	0.25
225	0.25
226	0.22
227	0.27
228	0.28
229	0.33
230	0.39
231	0.44
232	0.47
233	0.56
234	0.59
235	0.54
236	0.57
237	0.53
238	0.49
239	0.5
240	0.44
241	0.36
242	0.31
243	0.29
244	0.26
245	0.24
246	0.21
247	0.15
248	0.14
249	0.12
250	0.11
251	0.1
252	0.1
253	0.1
254	0.07
255	0.06
256	0.05
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.04
282	0.03
283	0.04
284	0.05
285	0.05
286	0.06
287	0.06
288	0.11
289	0.11
290	0.12
291	0.13
292	0.15
293	0.15
294	0.17
295	0.19
296	0.17
297	0.19
298	0.19
299	0.17
300	0.15
301	0.15
302	0.13
303	0.1
304	0.08
305	0.08
306	0.07
307	0.09
308	0.1
309	0.1
310	0.1
311	0.11
312	0.1
313	0.1
314	0.09
315	0.08
316	0.06
317	0.05
318	0.07
319	0.05
320	0.05
321	0.04
322	0.05
323	0.04
324	0.04
325	0.05
326	0.04
327	0.05
328	0.05
329	0.04
330	0.04
331	0.05
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.05
336	0.06
337	0.09
338	0.1
339	0.1
340	0.1
341	0.1
342	0.13
343	0.13
344	0.12
345	0.09
346	0.09
347	0.09
348	0.08
349	0.08
350	0.04
351	0.04
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.05
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.08
367	0.09
368	0.09
369	0.11
370	0.12
371	0.12
372	0.12
373	0.14
374	0.11
375	0.1
376	0.1
377	0.08
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.05
382	0.04
383	0.05
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.06
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.07
392	0.06
393	0.06
394	0.07
395	0.07
396	0.06
397	0.07
398	0.07
399	0.06
400	0.06
401	0.05
402	0.05
403	0.06
404	0.05
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.05
411	0.05
412	0.05
413	0.04
414	0.04
415	0.04
416	0.03
417	0.03
418	0.03
419	0.03
420	0.03
421	0.03
422	0.04
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.06
428	0.06
429	0.05
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.04
434	0.03
435	0.03
436	0.02
437	0.02
438	0.02
439	0.02
440	0.02
441	0.02
442	0.05
443	0.06
444	0.06
445	0.07
446	0.07
447	0.08
448	0.08
449	0.09
450	0.06
451	0.07
452	0.07
453	0.05
454	0.06
455	0.05
456	0.05
457	0.04
458	0.04
459	0.03
460	0.03
461	0.03
462	0.03
463	0.02
464	0.03
465	0.03
466	0.03
467	0.03
468	0.04
469	0.04
470	0.04
471	0.05
472	0.05
473	0.12
474	0.18
475	0.26
476	0.34
477	0.43
478	0.49
479	0.55
480	0.62
481	0.56
482	0.52
483	0.5
484	0.45
485	0.45
486	0.39
487	0.36
488	0.29
489	0.3
490	0.29
491	0.22
492	0.19
493	0.11
494	0.12
495	0.1
496	0.11
497	0.1
498	0.11
499	0.13
500	0.16
501	0.17
502	0.16
503	0.18
504	0.18
505	0.19
506	0.19
507	0.17
508	0.14
509	0.14
510	0.13
511	0.1
512	0.09
513	0.06
514	0.05
515	0.04
516	0.04
517	0.03
518	0.03
519	0.02
520	0.02
521	0.03
522	0.04
523	0.05
524	0.05
525	0.06
526	0.07
527	0.07
528	0.08
529	0.08
530	0.08
531	0.08
532	0.08
533	0.08
534	0.07
535	0.07
536	0.06
537	0.06
538	0.05
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.04
543	0.04
544	0.04
545	0.04
546	0.06
547	0.06
548	0.06
549	0.06
550	0.06
551	0.07
552	0.07
553	0.08
554	0.06
555	0.07
556	0.07
557	0.09
558	0.09
559	0.08
560	0.09
561	0.1
562	0.1
563	0.13
564	0.18
565	0.18
566	0.19
567	0.2
568	0.21
569	0.22
570	0.23
571	0.24
572	0.28
573	0.27
574	0.25
575	0.25
576	0.25
577	0.24
578	0.24
579	0.18
580	0.11
581	0.09
582	0.1
583	0.11
584	0.09
585	0.07
586	0.07
587	0.07
588	0.06
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.07
593	0.07
594	0.07
595	0.07
596	0.07
597	0.07
598	0.07
599	0.07
600	0.08
601	0.08
602	0.08
603	0.08
604	0.08
605	0.09
606	0.08
607	0.08
608	0.07
609	0.07
610	0.07
611	0.07
612	0.08
613	0.09
614	0.09
615	0.1
616	0.11
617	0.13
618	0.14
619	0.13
620	0.13
621	0.18
622	0.17
623	0.2
624	0.19
625	0.18
626	0.18
627	0.18
628	0.18
629	0.12
630	0.12
631	0.09
632	0.08
633	0.07
634	0.07
635	0.07
636	0.06
637	0.05
638	0.05
639	0.04
640	0.04
641	0.04
642	0.04
643	0.04
644	0.05
645	0.08
646	0.09
647	0.12
648	0.12
649	0.15
650	0.16
651	0.22
652	0.28
653	0.32
654	0.37
655	0.42
656	0.43
657	0.49
658	0.5
659	0.49
660	0.49
661	0.49
662	0.49
663	0.48
664	0.52
665	0.5
666	0.49
667	0.44
668	0.37
669	0.31
670	0.25
671	0.21
672	0.17
673	0.1
674	0.08
675	0.09
676	0.08
677	0.07
678	0.07
679	0.07
680	0.06
681	0.06
682	0.07
683	0.08
684	0.09
685	0.08
686	0.08
687	0.07
688	0.07
689	0.07
690	0.07
691	0.05
692	0.05
693	0.04
694	0.05
695	0.04
696	0.04
697	0.03
698	0.03
699	0.03
700	0.03
701	0.03
702	0.05
703	0.06
704	0.07
705	0.08
706	0.07
707	0.07
708	0.08
709	0.08
710	0.06
711	0.05
712	0.05
713	0.08
714	0.09
715	0.1
716	0.1
717	0.11
718	0.12
719	0.13
720	0.13
721	0.12
722	0.14
723	0.19
724	0.27
725	0.36
726	0.38
727	0.44
728	0.53
729	0.6
730	0.67
731	0.71
732	0.7
733	0.71
734	0.77
735	0.81
736	0.8
737	0.76
738	0.7
739	0.63
740	0.57
741	0.48
742	0.41
743	0.33
744	0.24
745	0.18
746	0.15
747	0.14
748	0.15
749	0.15
750	0.14
751	0.12
752	0.14
753	0.16
754	0.17
755	0.18
756	0.23
757	0.26
758	0.29
759	0.29
760	0.27
761	0.3
762	0.3
763	0.29
764	0.23
765	0.2
766	0.22
767	0.24
768	0.25
769	0.22
770	0.22
771	0.22
772	0.24
773	0.23

S3CQD1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer