FuNGI

S3D2I5

Protein Details

Accession

S3D2I5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
105-124	GVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
419-428	RREENNKRRK

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto 8, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGIPAAFRWLSSKYPKIISPVIEEKPQKMDDGSVIPVDATRPNPNNEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPAPKDEEEMMLEIFRYTDRVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAKEKEEDKEELLKLLKKQNGGTLSSESLEAVTKKAFDSNSITPGTPFMDILAASLRYWCAYKLNTDPAWAKMKIIISDASVPGEGEHKIMDYVRAQRASPDHDPNTRHVIYGLDADLIMLSLATHEPHFRVLREDVFFQDSKARMCKLCGQKGHEAAVCKGEAKQKDGEFDEKDTEQSLKPFIWLHVAVLREYLAVELDVPNLPFRWDLERAIDDWIFLCCFVGNDFLPHLPALEIRENGINTLTALWKENLPIMNGYVTKDGHVDLDRAQFIMTGLAKQEDVIFKRRKQQEDRREENNKRRKMQQEQGRGRNDARPARNTGGDNVFAESAASLILRPIAAFPSDKTITHDMVVNRNSVENANNANKSAASVLKSRMLNRATQATDGTPASAEDSSASTPTEAGTVTASEAPTGDASTEATNLGKRKADQIEEDAKVEDAVASDSPKPKVQEEMPADTVRMWEEGYADRYYEQKFHVEATDIEFRHGVARAYVEGLSWVLLYYFQGCQSWEWYYPYHYAPFAADFVDLGKLSLKFEKGRTSKPFEQLMSVLPAASRHAIPEVFHDLMLNEDSPIIDFYPEEFDLDLNGKKFAWQGVALLPFIDMKRLLGAVEQRYPLLSEADQLRNGMGKIVMLLSDANTELYDQIITKFYSKRQDEIKYKLDPRTSGGISGVIEKMDDYIPHGSLTYPLERKAFPDIEYDRSLTVNYELCATGQSHKSMLLRGVKLPSPVLDRNDKDTLLGKGQRPGRGGYGGYNSRGGGRGNYGGGGGGGQYRQGGQGGRDRPPYHQNGHQDRNSHQGAPPQAWNPPAPGQPGFGQGGQGGQGGYGGQGYRQGDNRSSGHHGSRDYRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.46
3	0.49
4	0.51
5	0.47
6	0.47
7	0.48
8	0.47
9	0.51
10	0.51
11	0.47
12	0.49
13	0.47
14	0.4
15	0.33
16	0.32
17	0.27
18	0.28
19	0.28
20	0.21
21	0.2
22	0.19
23	0.18
24	0.18
25	0.18
26	0.18
27	0.25
28	0.28
29	0.33
30	0.38
31	0.41
32	0.44
33	0.42
34	0.44
35	0.38
36	0.36
37	0.35
38	0.3
39	0.27
40	0.22
41	0.2
42	0.14
43	0.12
44	0.11
45	0.09
46	0.08
47	0.09
48	0.1
49	0.13
50	0.18
51	0.21
52	0.23
53	0.29
54	0.38
55	0.46
56	0.51
57	0.53
58	0.53
59	0.51
60	0.52
61	0.47
62	0.41
63	0.35
64	0.3
65	0.26
66	0.21
67	0.19
68	0.15
69	0.14
70	0.1
71	0.1
72	0.1
73	0.13
74	0.13
75	0.17
76	0.19
77	0.27
78	0.36
79	0.43
80	0.45
81	0.44
82	0.45
83	0.44
84	0.44
85	0.39
86	0.32
87	0.28
88	0.26
89	0.24
90	0.24
91	0.21
92	0.2
93	0.18
94	0.15
95	0.1
96	0.13
97	0.19
98	0.26
99	0.36
100	0.45
101	0.55
102	0.66
103	0.74
104	0.8
105	0.82
106	0.78
107	0.75
108	0.77
109	0.77
110	0.75
111	0.77
112	0.72
113	0.68
114	0.71
115	0.66
116	0.57
117	0.52
118	0.44
119	0.37
120	0.4
121	0.35
122	0.31
123	0.33
124	0.36
125	0.36
126	0.42
127	0.42
128	0.39
129	0.4
130	0.42
131	0.42
132	0.41
133	0.38
134	0.34
135	0.32
136	0.29
137	0.27
138	0.21
139	0.17
140	0.17
141	0.14
142	0.12
143	0.12
144	0.12
145	0.12
146	0.16
147	0.16
148	0.17
149	0.23
150	0.25
151	0.29
152	0.3
153	0.3
154	0.26
155	0.27
156	0.25
157	0.19
158	0.16
159	0.11
160	0.1
161	0.1
162	0.1
163	0.11
164	0.1
165	0.1
166	0.11
167	0.1
168	0.1
169	0.11
170	0.11
171	0.13
172	0.14
173	0.18
174	0.23
175	0.31
176	0.31
177	0.34
178	0.35
179	0.36
180	0.41
181	0.36
182	0.31
183	0.27
184	0.29
185	0.26
186	0.26
187	0.22
188	0.18
189	0.21
190	0.21
191	0.18
192	0.15
193	0.14
194	0.12
195	0.13
196	0.12
197	0.09
198	0.08
199	0.08
200	0.09
201	0.09
202	0.11
203	0.13
204	0.2
205	0.25
206	0.27
207	0.26
208	0.29
209	0.32
210	0.37
211	0.39
212	0.41
213	0.4
214	0.44
215	0.46
216	0.46
217	0.51
218	0.44
219	0.38
220	0.3
221	0.27
222	0.22
223	0.22
224	0.19
225	0.11
226	0.1
227	0.1
228	0.09
229	0.08
230	0.06
231	0.04
232	0.03
233	0.03
234	0.04
235	0.05
236	0.06
237	0.07
238	0.08
239	0.13
240	0.15
241	0.15
242	0.19
243	0.21
244	0.25
245	0.26
246	0.27
247	0.24
248	0.27
249	0.27
250	0.23
251	0.26
252	0.23
253	0.23
254	0.25
255	0.26
256	0.22
257	0.25
258	0.33
259	0.37
260	0.43
261	0.46
262	0.48
263	0.53
264	0.55
265	0.56
266	0.5
267	0.43
268	0.36
269	0.33
270	0.28
271	0.21
272	0.21
273	0.23
274	0.23
275	0.24
276	0.29
277	0.27
278	0.31
279	0.33
280	0.35
281	0.31
282	0.32
283	0.32
284	0.26
285	0.26
286	0.23
287	0.22
288	0.18
289	0.17
290	0.16
291	0.13
292	0.14
293	0.15
294	0.14
295	0.16
296	0.15
297	0.15
298	0.16
299	0.17
300	0.16
301	0.15
302	0.14
303	0.1
304	0.1
305	0.08
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.06
311	0.07
312	0.07
313	0.08
314	0.08
315	0.09
316	0.08
317	0.09
318	0.13
319	0.14
320	0.15
321	0.18
322	0.19
323	0.2
324	0.22
325	0.21
326	0.16
327	0.14
328	0.14
329	0.1
330	0.09
331	0.08
332	0.05
333	0.05
334	0.06
335	0.08
336	0.07
337	0.08
338	0.09
339	0.09
340	0.1
341	0.1
342	0.09
343	0.07
344	0.08
345	0.11
346	0.13
347	0.13
348	0.13
349	0.15
350	0.15
351	0.15
352	0.14
353	0.11
354	0.08
355	0.09
356	0.09
357	0.07
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.1
362	0.12
363	0.12
364	0.12
365	0.12
366	0.11
367	0.13
368	0.13
369	0.14
370	0.13
371	0.12
372	0.12
373	0.12
374	0.11
375	0.11
376	0.12
377	0.11
378	0.11
379	0.14
380	0.14
381	0.14
382	0.13
383	0.11
384	0.11
385	0.12
386	0.1
387	0.07
388	0.08
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.1
393	0.11
394	0.13
395	0.21
396	0.26
397	0.28
398	0.37
399	0.44
400	0.49
401	0.56
402	0.64
403	0.67
404	0.72
405	0.75
406	0.75
407	0.78
408	0.79
409	0.79
410	0.79
411	0.75
412	0.68
413	0.7
414	0.69
415	0.68
416	0.69
417	0.67
418	0.69
419	0.7
420	0.75
421	0.71
422	0.66
423	0.59
424	0.54
425	0.51
426	0.47
427	0.42
428	0.37
429	0.38
430	0.38
431	0.39
432	0.36
433	0.33
434	0.27
435	0.24
436	0.22
437	0.18
438	0.15
439	0.12
440	0.11
441	0.08
442	0.05
443	0.04
444	0.04
445	0.03
446	0.03
447	0.03
448	0.03
449	0.03
450	0.04
451	0.04
452	0.05
453	0.06
454	0.06
455	0.12
456	0.13
457	0.13
458	0.17
459	0.19
460	0.19
461	0.19
462	0.22
463	0.17
464	0.22
465	0.23
466	0.2
467	0.17
468	0.17
469	0.17
470	0.14
471	0.14
472	0.1
473	0.13
474	0.15
475	0.15
476	0.16
477	0.15
478	0.14
479	0.14
480	0.13
481	0.11
482	0.09
483	0.11
484	0.12
485	0.17
486	0.19
487	0.2
488	0.25
489	0.24
490	0.24
491	0.23
492	0.27
493	0.22
494	0.22
495	0.21
496	0.15
497	0.16
498	0.15
499	0.13
500	0.08
501	0.07
502	0.08
503	0.07
504	0.07
505	0.05
506	0.06
507	0.07
508	0.07
509	0.07
510	0.06
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.05
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.07
520	0.06
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.05
527	0.04
528	0.05
529	0.05
530	0.06
531	0.06
532	0.06
533	0.08
534	0.09
535	0.11
536	0.12
537	0.12
538	0.18
539	0.21
540	0.22
541	0.22
542	0.26
543	0.31
544	0.3
545	0.31
546	0.25
547	0.22
548	0.19
549	0.18
550	0.12
551	0.06
552	0.06
553	0.05
554	0.07
555	0.09
556	0.12
557	0.13
558	0.16
559	0.17
560	0.17
561	0.21
562	0.21
563	0.27
564	0.29
565	0.32
566	0.33
567	0.32
568	0.31
569	0.27
570	0.26
571	0.17
572	0.14
573	0.09
574	0.06
575	0.07
576	0.09
577	0.12
578	0.11
579	0.11
580	0.11
581	0.14
582	0.15
583	0.15
584	0.15
585	0.15
586	0.15
587	0.16
588	0.16
589	0.15
590	0.14
591	0.17
592	0.22
593	0.2
594	0.2
595	0.19
596	0.18
597	0.18
598	0.19
599	0.14
600	0.08
601	0.09
602	0.09
603	0.1
604	0.1
605	0.08
606	0.07
607	0.07
608	0.07
609	0.06
610	0.05
611	0.04
612	0.04
613	0.04
614	0.06
615	0.06
616	0.07
617	0.07
618	0.08
619	0.09
620	0.11
621	0.14
622	0.14
623	0.15
624	0.16
625	0.18
626	0.2
627	0.21
628	0.2
629	0.18
630	0.17
631	0.15
632	0.16
633	0.13
634	0.11
635	0.09
636	0.07
637	0.08
638	0.09
639	0.08
640	0.07
641	0.09
642	0.09
643	0.1
644	0.13
645	0.15
646	0.16
647	0.18
648	0.28
649	0.29
650	0.37
651	0.42
652	0.49
653	0.53
654	0.56
655	0.59
656	0.5
657	0.48
658	0.41
659	0.36
660	0.31
661	0.24
662	0.18
663	0.13
664	0.13
665	0.12
666	0.13
667	0.11
668	0.08
669	0.1
670	0.11
671	0.11
672	0.15
673	0.19
674	0.18
675	0.18
676	0.17
677	0.15
678	0.16
679	0.17
680	0.13
681	0.07
682	0.07
683	0.07
684	0.07
685	0.08
686	0.07
687	0.06
688	0.06
689	0.07
690	0.11
691	0.11
692	0.11
693	0.11
694	0.1
695	0.12
696	0.14
697	0.15
698	0.12
699	0.12
700	0.12
701	0.12
702	0.14
703	0.14
704	0.13
705	0.11
706	0.12
707	0.16
708	0.17
709	0.16
710	0.15
711	0.14
712	0.14
713	0.13
714	0.14
715	0.1
716	0.08
717	0.09
718	0.09
719	0.09
720	0.1
721	0.16
722	0.18
723	0.22
724	0.22
725	0.21
726	0.21
727	0.22
728	0.2
729	0.17
730	0.13
731	0.13
732	0.18
733	0.21
734	0.22
735	0.21
736	0.21
737	0.2
738	0.2
739	0.17
740	0.12
741	0.09
742	0.09
743	0.09
744	0.08
745	0.07
746	0.07
747	0.06
748	0.07
749	0.07
750	0.07
751	0.07
752	0.07
753	0.07
754	0.07
755	0.07
756	0.06
757	0.08
758	0.1
759	0.11
760	0.14
761	0.17
762	0.21
763	0.31
764	0.33
765	0.36
766	0.42
767	0.51
768	0.54
769	0.59
770	0.61
771	0.6
772	0.63
773	0.64
774	0.6
775	0.52
776	0.49
777	0.49
778	0.43
779	0.35
780	0.3
781	0.26
782	0.22
783	0.24
784	0.2
785	0.13
786	0.12
787	0.11
788	0.12
789	0.1
790	0.1
791	0.1
792	0.12
793	0.13
794	0.13
795	0.14
796	0.12
797	0.14
798	0.18
799	0.22
800	0.21
801	0.24
802	0.26
803	0.26
804	0.28
805	0.33
806	0.32
807	0.25
808	0.32
809	0.32
810	0.35
811	0.37
812	0.36
813	0.29
814	0.28
815	0.27
816	0.2
817	0.2
818	0.17
819	0.14
820	0.15
821	0.14
822	0.14
823	0.15
824	0.16
825	0.18
826	0.19
827	0.21
828	0.19
829	0.23
830	0.24
831	0.24
832	0.29
833	0.32
834	0.31
835	0.33
836	0.37
837	0.36
838	0.37
839	0.35
840	0.32
841	0.31
842	0.34
843	0.35
844	0.4
845	0.4
846	0.44
847	0.47
848	0.43
849	0.38
850	0.37
851	0.36
852	0.35
853	0.39
854	0.35
855	0.39
856	0.44
857	0.47
858	0.45
859	0.44
860	0.4
861	0.37
862	0.35
863	0.33
864	0.36
865	0.35
866	0.34
867	0.34
868	0.3
869	0.28
870	0.29
871	0.26
872	0.2
873	0.2
874	0.21
875	0.2
876	0.2
877	0.18
878	0.16
879	0.15
880	0.12
881	0.09
882	0.08
883	0.07
884	0.08
885	0.08
886	0.09
887	0.1
888	0.12
889	0.13
890	0.15
891	0.23
892	0.28
893	0.34
894	0.41
895	0.42
896	0.45
897	0.52
898	0.56
899	0.54
900	0.56
901	0.61
902	0.62
903	0.7
904	0.69
905	0.64
906	0.59
907	0.62
908	0.58
909	0.5
910	0.42
911	0.4
912	0.41
913	0.41
914	0.44
915	0.38
916	0.38
917	0.38
918	0.37
919	0.35
920	0.36
921	0.35
922	0.34
923	0.33
924	0.33
925	0.31
926	0.35
927	0.33
928	0.28
929	0.25
930	0.2
931	0.2
932	0.18
933	0.17
934	0.12
935	0.09
936	0.09
937	0.07
938	0.07
939	0.08
940	0.07
941	0.07
942	0.12
943	0.15
944	0.19
945	0.25
946	0.29
947	0.31
948	0.37
949	0.38
950	0.38
951	0.43
952	0.44
953	0.44
954	0.44
955	0.46

S3D2I5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer