Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CDT9

Protein Details
Accession S3CDT9    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
937-957GTTNGASKKKNKKVARDASPAHydrophilic
1278-1302IEGSEGKKKSASKKQSNPKKRGGKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
621-646AEAVKTAKAAKKATKEAAKAAKAAKK
945-948KKNK
1283-1302GKKKSASKKQSNPKKRGGKA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.333, cyto 5, cyto_mito 3.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033646  CLU-central  
IPR025697  CLU_dom  
IPR028275  CLU_N  
IPR027523  CLU_prot  
IPR023231  GSKIP_dom_sf  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0007005  P:mitochondrion organization  
GO:0051640  P:organelle localization  
Pfam View protein in Pfam  
PF13236  CLU  
PF15044  CLU_N  
PF12807  eIF3_p135  
PF13374  TPR_10  
PF13424  TPR_12  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51823  CLU  
PS50005  TPR  
CDD cd15466  CLU-central  
Amino Acid Sequences MATSEDQTKAPPAEETSKAENAVATQVEGVEDDEPAVEESLVNFTIVLPNSSETLAVTIPSHEQFSEVRQVINESPAAQEYSCFHIEYDGKRINEYGLVSEIPDLTPQAEIRVVLDPYTEKEARLHVIRIRDLIGAAASRPDAVQGVLPGLSIYDSVNADATAAAAAAAPAEYDFAAPIDPSIILPRLSADEVNAPKTVKAIQISPWNPPPANLRQKGHLLYLIITTNEGEQVQVTAHVGGFYVNKSSNAKFDPLPRPAPKNQSAHSLLSLIRQLSPSFDDSFVKLQEFNSKRDPLSTYQINNSLPAAPWLVPSQSSPSCAHTADITRTQEAYLISGTDSVDNLRDWNEELQSARELPRETVQDRIFRERLVSKVFADYIDAATRGALLVASGEINPLNPTEGRDAQIFVYNNIFFSFGADGVGTFTSEGGDEAARVATGKDVAGVRRVNQLDIENLYCPGTVVVDYLGKRIVGQSLVPGIFKQREPGENQIDYGAVDGKEVVAADKRFAEPFAKLSQSLNVKPHTVWDGEGKAFKLEASVETKGLMGTDGRKYVLDLYRITPLDIQWQEENDEAEKAGESAYPHRMTVLRPELIEAYSRFKLREWLDSELAKRTKVKEEAEAVKTAKAAKKATKEAAKAAKAAKKESSDSEDSDDSEESSDSDDSEESDSDEDEEDDEKKEEKPELDDRIDVSKFKFSLNPDAFSGQVPQTDEEKEEMTADEKDVRAVGDHLRATVIPGLIRELSESEISFPMDGRSLTQLLHKAGINIRYLGRIAKACEGEKRLVCLQTIAVREMISRAFKHVSAKYLRYLPLPLTSACISHLLNCLLGAAANANPSSEVDPALRELYSNADLAFEKVTPESLREDIEAETVRRFRFTLPTDWHSALTGHLQLLREVSLKLGIQVLSKKFAFTAEQLSAVAATTTEAAQNGKSNGTTNGASKKKNKKVARDASPAVDSQRVASRAPHTFAAEDIVNVVPIVKNSAPRSTLSEEAMEAGRISLQQNQVKIGQELLLESLSLHEQIYGILHPEVARAYSTLATIYYQLDEKEAAIELSRKAVIVSERVVGVDSSETIQSYLNLGLFVHSQGDSALALGYLKHAFKLWQIVYGLDHPDSITTMNNAAVMLQNLKAFHESRRWFEESLRLSSTVFGEASINSATLLFQLAQSLALDNDSKGSVVRMRECYNIFLSELGAEDKNTKEAEHWLNQLTSNAVNIAKHTKDAEARRIRAGISFPTRAPMTGLVDPAVNTKAVGSSSSVNDGVDSRSIDELMRYIEGSEGKKKSASKKQSNPKKRGGKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.37
3 0.38
4 0.39
5 0.39
6 0.37
7 0.32
8 0.27
9 0.26
10 0.21
11 0.15
12 0.13
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.12
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.07
21 0.08
22 0.09
23 0.09
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.11
28 0.12
29 0.11
30 0.1
31 0.09
32 0.15
33 0.15
34 0.16
35 0.14
36 0.15
37 0.16
38 0.17
39 0.16
40 0.11
41 0.12
42 0.12
43 0.11
44 0.1
45 0.11
46 0.14
47 0.15
48 0.17
49 0.14
50 0.16
51 0.16
52 0.2
53 0.28
54 0.26
55 0.26
56 0.25
57 0.29
58 0.29
59 0.31
60 0.27
61 0.19
62 0.19
63 0.2
64 0.21
65 0.17
66 0.17
67 0.16
68 0.21
69 0.22
70 0.2
71 0.18
72 0.23
73 0.27
74 0.29
75 0.36
76 0.37
77 0.36
78 0.36
79 0.37
80 0.32
81 0.31
82 0.29
83 0.22
84 0.18
85 0.17
86 0.17
87 0.17
88 0.17
89 0.13
90 0.13
91 0.11
92 0.09
93 0.11
94 0.11
95 0.12
96 0.13
97 0.12
98 0.14
99 0.17
100 0.17
101 0.15
102 0.17
103 0.16
104 0.18
105 0.25
106 0.24
107 0.2
108 0.22
109 0.25
110 0.29
111 0.31
112 0.33
113 0.29
114 0.35
115 0.37
116 0.37
117 0.35
118 0.31
119 0.27
120 0.23
121 0.2
122 0.14
123 0.12
124 0.12
125 0.1
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.1
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.1
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.12
174 0.14
175 0.16
176 0.15
177 0.14
178 0.2
179 0.22
180 0.24
181 0.25
182 0.23
183 0.21
184 0.23
185 0.23
186 0.2
187 0.19
188 0.19
189 0.22
190 0.32
191 0.34
192 0.39
193 0.42
194 0.44
195 0.41
196 0.41
197 0.43
198 0.43
199 0.52
200 0.52
201 0.49
202 0.49
203 0.55
204 0.55
205 0.51
206 0.43
207 0.34
208 0.28
209 0.28
210 0.24
211 0.18
212 0.16
213 0.14
214 0.12
215 0.12
216 0.11
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.11
231 0.12
232 0.14
233 0.18
234 0.19
235 0.23
236 0.24
237 0.27
238 0.26
239 0.34
240 0.4
241 0.42
242 0.5
243 0.5
244 0.55
245 0.58
246 0.64
247 0.63
248 0.61
249 0.57
250 0.57
251 0.56
252 0.51
253 0.46
254 0.39
255 0.32
256 0.28
257 0.29
258 0.22
259 0.19
260 0.18
261 0.17
262 0.17
263 0.19
264 0.19
265 0.18
266 0.19
267 0.19
268 0.2
269 0.23
270 0.22
271 0.2
272 0.18
273 0.17
274 0.26
275 0.27
276 0.29
277 0.33
278 0.36
279 0.35
280 0.37
281 0.4
282 0.34
283 0.39
284 0.4
285 0.36
286 0.36
287 0.41
288 0.38
289 0.36
290 0.32
291 0.26
292 0.2
293 0.19
294 0.17
295 0.12
296 0.13
297 0.14
298 0.13
299 0.12
300 0.13
301 0.18
302 0.17
303 0.2
304 0.21
305 0.23
306 0.25
307 0.25
308 0.24
309 0.21
310 0.24
311 0.24
312 0.29
313 0.28
314 0.27
315 0.26
316 0.26
317 0.25
318 0.22
319 0.19
320 0.12
321 0.1
322 0.09
323 0.1
324 0.1
325 0.08
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.11
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.14
338 0.15
339 0.16
340 0.17
341 0.16
342 0.18
343 0.18
344 0.18
345 0.22
346 0.25
347 0.24
348 0.3
349 0.32
350 0.35
351 0.37
352 0.43
353 0.39
354 0.34
355 0.38
356 0.33
357 0.33
358 0.32
359 0.31
360 0.24
361 0.25
362 0.26
363 0.21
364 0.2
365 0.17
366 0.14
367 0.13
368 0.12
369 0.1
370 0.09
371 0.09
372 0.07
373 0.06
374 0.04
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.04
379 0.04
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.09
388 0.14
389 0.15
390 0.17
391 0.17
392 0.18
393 0.17
394 0.22
395 0.21
396 0.17
397 0.19
398 0.17
399 0.17
400 0.16
401 0.16
402 0.1
403 0.11
404 0.11
405 0.07
406 0.08
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.06
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.04
419 0.04
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.07
429 0.09
430 0.09
431 0.14
432 0.15
433 0.16
434 0.23
435 0.23
436 0.22
437 0.22
438 0.22
439 0.19
440 0.2
441 0.2
442 0.14
443 0.14
444 0.13
445 0.11
446 0.1
447 0.08
448 0.07
449 0.05
450 0.05
451 0.06
452 0.09
453 0.09
454 0.1
455 0.11
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.11
460 0.08
461 0.08
462 0.08
463 0.11
464 0.12
465 0.12
466 0.11
467 0.13
468 0.15
469 0.15
470 0.17
471 0.17
472 0.2
473 0.23
474 0.3
475 0.33
476 0.31
477 0.31
478 0.27
479 0.25
480 0.21
481 0.18
482 0.13
483 0.07
484 0.07
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.08
491 0.08
492 0.09
493 0.11
494 0.12
495 0.12
496 0.13
497 0.14
498 0.11
499 0.13
500 0.16
501 0.15
502 0.15
503 0.16
504 0.19
505 0.23
506 0.25
507 0.26
508 0.24
509 0.24
510 0.24
511 0.25
512 0.23
513 0.19
514 0.16
515 0.16
516 0.17
517 0.17
518 0.19
519 0.17
520 0.15
521 0.14
522 0.13
523 0.1
524 0.08
525 0.09
526 0.12
527 0.12
528 0.12
529 0.12
530 0.13
531 0.12
532 0.11
533 0.09
534 0.06
535 0.08
536 0.1
537 0.1
538 0.11
539 0.11
540 0.11
541 0.16
542 0.18
543 0.18
544 0.18
545 0.18
546 0.23
547 0.23
548 0.23
549 0.19
550 0.16
551 0.21
552 0.2
553 0.21
554 0.17
555 0.17
556 0.18
557 0.18
558 0.18
559 0.11
560 0.11
561 0.09
562 0.08
563 0.07
564 0.06
565 0.05
566 0.06
567 0.06
568 0.09
569 0.14
570 0.14
571 0.14
572 0.15
573 0.16
574 0.16
575 0.22
576 0.25
577 0.21
578 0.2
579 0.21
580 0.21
581 0.2
582 0.22
583 0.15
584 0.15
585 0.16
586 0.16
587 0.16
588 0.15
589 0.22
590 0.21
591 0.27
592 0.26
593 0.28
594 0.3
595 0.32
596 0.32
597 0.33
598 0.32
599 0.26
600 0.25
601 0.23
602 0.26
603 0.29
604 0.3
605 0.27
606 0.32
607 0.37
608 0.36
609 0.37
610 0.32
611 0.27
612 0.26
613 0.25
614 0.22
615 0.2
616 0.21
617 0.23
618 0.28
619 0.32
620 0.37
621 0.39
622 0.38
623 0.4
624 0.43
625 0.39
626 0.37
627 0.37
628 0.35
629 0.31
630 0.32
631 0.29
632 0.24
633 0.25
634 0.24
635 0.25
636 0.24
637 0.23
638 0.24
639 0.21
640 0.2
641 0.19
642 0.17
643 0.12
644 0.1
645 0.09
646 0.06
647 0.07
648 0.07
649 0.06
650 0.06
651 0.06
652 0.06
653 0.07
654 0.07
655 0.06
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.06
661 0.05
662 0.06
663 0.07
664 0.07
665 0.08
666 0.09
667 0.09
668 0.11
669 0.12
670 0.12
671 0.16
672 0.2
673 0.24
674 0.24
675 0.24
676 0.24
677 0.26
678 0.26
679 0.22
680 0.18
681 0.17
682 0.16
683 0.16
684 0.18
685 0.16
686 0.26
687 0.27
688 0.27
689 0.25
690 0.26
691 0.25
692 0.22
693 0.22
694 0.12
695 0.12
696 0.11
697 0.11
698 0.12
699 0.13
700 0.13
701 0.12
702 0.12
703 0.11
704 0.1
705 0.09
706 0.09
707 0.09
708 0.09
709 0.1
710 0.09
711 0.09
712 0.09
713 0.08
714 0.07
715 0.08
716 0.1
717 0.12
718 0.12
719 0.12
720 0.12
721 0.12
722 0.12
723 0.12
724 0.11
725 0.07
726 0.07
727 0.09
728 0.08
729 0.08
730 0.08
731 0.07
732 0.08
733 0.08
734 0.08
735 0.08
736 0.09
737 0.09
738 0.09
739 0.08
740 0.07
741 0.08
742 0.08
743 0.07
744 0.09
745 0.09
746 0.09
747 0.12
748 0.14
749 0.14
750 0.16
751 0.15
752 0.15
753 0.17
754 0.2
755 0.19
756 0.17
757 0.17
758 0.16
759 0.16
760 0.15
761 0.14
762 0.13
763 0.13
764 0.16
765 0.18
766 0.18
767 0.22
768 0.24
769 0.26
770 0.25
771 0.27
772 0.25
773 0.24
774 0.23
775 0.2
776 0.18
777 0.19
778 0.2
779 0.17
780 0.15
781 0.14
782 0.14
783 0.14
784 0.15
785 0.12
786 0.11
787 0.13
788 0.14
789 0.16
790 0.21
791 0.22
792 0.26
793 0.28
794 0.3
795 0.3
796 0.32
797 0.32
798 0.28
799 0.28
800 0.23
801 0.22
802 0.22
803 0.18
804 0.18
805 0.17
806 0.16
807 0.15
808 0.16
809 0.13
810 0.13
811 0.15
812 0.13
813 0.12
814 0.12
815 0.11
816 0.08
817 0.08
818 0.06
819 0.05
820 0.05
821 0.06
822 0.06
823 0.06
824 0.06
825 0.07
826 0.08
827 0.08
828 0.08
829 0.08
830 0.09
831 0.1
832 0.11
833 0.1
834 0.08
835 0.08
836 0.11
837 0.12
838 0.11
839 0.1
840 0.1
841 0.11
842 0.11
843 0.12
844 0.09
845 0.08
846 0.08
847 0.1
848 0.08
849 0.1
850 0.12
851 0.12
852 0.13
853 0.12
854 0.14
855 0.12
856 0.15
857 0.15
858 0.13
859 0.15
860 0.17
861 0.17
862 0.16
863 0.17
864 0.16
865 0.22
866 0.25
867 0.3
868 0.33
869 0.37
870 0.41
871 0.41
872 0.4
873 0.33
874 0.29
875 0.22
876 0.18
877 0.15
878 0.11
879 0.13
880 0.13
881 0.12
882 0.13
883 0.13
884 0.12
885 0.1
886 0.1
887 0.1
888 0.1
889 0.1
890 0.11
891 0.11
892 0.12
893 0.17
894 0.18
895 0.2
896 0.2
897 0.2
898 0.18
899 0.19
900 0.19
901 0.15
902 0.19
903 0.16
904 0.17
905 0.16
906 0.16
907 0.15
908 0.13
909 0.11
910 0.05
911 0.05
912 0.04
913 0.05
914 0.05
915 0.06
916 0.06
917 0.07
918 0.1
919 0.11
920 0.11
921 0.12
922 0.13
923 0.13
924 0.16
925 0.17
926 0.17
927 0.26
928 0.29
929 0.34
930 0.42
931 0.52
932 0.57
933 0.66
934 0.7
935 0.71
936 0.78
937 0.82
938 0.82
939 0.79
940 0.73
941 0.66
942 0.61
943 0.51
944 0.42
945 0.35
946 0.25
947 0.2
948 0.22
949 0.2
950 0.19
951 0.22
952 0.25
953 0.27
954 0.29
955 0.29
956 0.25
957 0.24
958 0.23
959 0.23
960 0.17
961 0.13
962 0.13
963 0.11
964 0.09
965 0.09
966 0.09
967 0.06
968 0.06
969 0.11
970 0.1
971 0.16
972 0.18
973 0.22
974 0.23
975 0.24
976 0.3
977 0.3
978 0.31
979 0.27
980 0.26
981 0.22
982 0.22
983 0.21
984 0.16
985 0.12
986 0.09
987 0.08
988 0.08
989 0.09
990 0.13
991 0.19
992 0.22
993 0.23
994 0.25
995 0.28
996 0.29
997 0.28
998 0.24
999 0.18
1000 0.15
1001 0.15
1002 0.13
1003 0.1
1004 0.08
1005 0.08
1006 0.08
1007 0.07
1008 0.08
1009 0.07
1010 0.06
1011 0.06
1012 0.06
1013 0.08
1014 0.07
1015 0.08
1016 0.08
1017 0.09
1018 0.09
1019 0.09
1020 0.1
1021 0.09
1022 0.09
1023 0.08
1024 0.09
1025 0.09
1026 0.1
1027 0.09
1028 0.09
1029 0.09
1030 0.1
1031 0.11
1032 0.1
1033 0.11
1034 0.11
1035 0.11
1036 0.11
1037 0.11
1038 0.1
1039 0.1
1040 0.09
1041 0.09
1042 0.11
1043 0.11
1044 0.13
1045 0.13
1046 0.12
1047 0.11
1048 0.14
1049 0.15
1050 0.15
1051 0.17
1052 0.16
1053 0.16
1054 0.16
1055 0.16
1056 0.13
1057 0.12
1058 0.1
1059 0.09
1060 0.09
1061 0.09
1062 0.09
1063 0.09
1064 0.1
1065 0.09
1066 0.1
1067 0.11
1068 0.1
1069 0.09
1070 0.09
1071 0.1
1072 0.1
1073 0.1
1074 0.1
1075 0.09
1076 0.09
1077 0.08
1078 0.09
1079 0.08
1080 0.07
1081 0.07
1082 0.05
1083 0.05
1084 0.05
1085 0.08
1086 0.1
1087 0.1
1088 0.1
1089 0.11
1090 0.12
1091 0.15
1092 0.24
1093 0.22
1094 0.23
1095 0.24
1096 0.24
1097 0.26
1098 0.28
1099 0.29
1100 0.2
1101 0.2
1102 0.15
1103 0.15
1104 0.15
1105 0.13
1106 0.11
1107 0.1
1108 0.1
1109 0.11
1110 0.11
1111 0.1
1112 0.1
1113 0.1
1114 0.11
1115 0.11
1116 0.11
1117 0.13
1118 0.13
1119 0.14
1120 0.17
1121 0.17
1122 0.2
1123 0.28
1124 0.31
1125 0.34
1126 0.41
1127 0.43
1128 0.41
1129 0.43
1130 0.48
1131 0.42
1132 0.44
1133 0.41
1134 0.35
1135 0.31
1136 0.32
1137 0.3
1138 0.24
1139 0.19
1140 0.14
1141 0.12
1142 0.12
1143 0.14
1144 0.12
1145 0.11
1146 0.09
1147 0.09
1148 0.08
1149 0.07
1150 0.09
1151 0.07
1152 0.07
1153 0.08
1154 0.08
1155 0.08
1156 0.09
1157 0.09
1158 0.08
1159 0.1
1160 0.1
1161 0.09
1162 0.11
1163 0.1
1164 0.1
1165 0.1
1166 0.12
1167 0.15
1168 0.19
1169 0.26
1170 0.3
1171 0.33
1172 0.38
1173 0.4
1174 0.41
1175 0.39
1176 0.36
1177 0.3
1178 0.24
1179 0.22
1180 0.16
1181 0.16
1182 0.15
1183 0.13
1184 0.12
1185 0.14
1186 0.15
1187 0.18
1188 0.18
1189 0.17
1190 0.16
1191 0.23
1192 0.3
1193 0.32
1194 0.35
1195 0.35
1196 0.37
1197 0.37
1198 0.36
1199 0.3
1200 0.24
1201 0.19
1202 0.18
1203 0.16
1204 0.15
1205 0.17
1206 0.22
1207 0.21
1208 0.23
1209 0.24
1210 0.26
1211 0.33
1212 0.39
1213 0.47
1214 0.5
1215 0.52
1216 0.54
1217 0.54
1218 0.5
1219 0.46
1220 0.42
1221 0.4
1222 0.38
1223 0.38
1224 0.34
1225 0.38
1226 0.38
1227 0.34
1228 0.33
1229 0.29
1230 0.27
1231 0.26
1232 0.27
1233 0.23
1234 0.23
1235 0.23
1236 0.23
1237 0.2
1238 0.15
1239 0.12
1240 0.11
1241 0.12
1242 0.12
1243 0.13
1244 0.12
1245 0.15
1246 0.17
1247 0.21
1248 0.21
1249 0.19
1250 0.2
1251 0.2
1252 0.19
1253 0.18
1254 0.18
1255 0.16
1256 0.16
1257 0.17
1258 0.17
1259 0.16
1260 0.16
1261 0.15
1262 0.15
1263 0.14
1264 0.13
1265 0.16
1266 0.2
1267 0.23
1268 0.31
1269 0.31
1270 0.32
1271 0.36
1272 0.42
1273 0.49
1274 0.55
1275 0.62
1276 0.64
1277 0.72
1278 0.81
1279 0.88
1280 0.93
1281 0.92
1282 0.91