Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CJZ8

Protein Details
Accession S3CJZ8    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-30CGDVLTKKKLDPHRGRCRGATFHydrophilic
55-84QKYQGALYKDNNKNKNKKARFNPPNSAEQEHydrophilic
234-264NRERERERERERKKKSDKEAKDKKRKRLFLEBasic
304-328TPASPLKKTKSSKHKSKRHSSDSAPHydrophilic
336-379SILTAGSKKSKKRKDRRSSSPSGEKKKHRSSRHKDSKDSKDSKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
235-260RERERERERERKKKSDKEAKDKKRKR
310-321KKTKSSKHKSKR
342-383SKKSKKRKDRRSSSPSGEKKKHRSSRHKDSKDSKDSKDKKDA
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039999  LYAR  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51804  ZF_C2HC_LYAR  
Amino Acid Sequences MVSFQCENCGDVLTKKKLDPHRGRCRGATFSCIDCMVHFYGTDYRSHTSCMTEDQKYQGALYKDNNKNKNKKARFNPPNSAEQESNNLFHPTPTPAAAAHKMAAVAHLPHAYVEDVPEIESYLVPDDDDNASRSDDDAPPHAPTPPHVPDAEGAVNVFDFLDTSATPNASNLALPQGVNPQNVRYDYDDNDVNAYLEANNEYAVAGKQQLVHYDAAASMAATNAVQFQTPAPANRERERERERERKKKSDKEAKDKKRKRLFLEINDQVMTDAPPVLHSGLTGGLSRMSTKRGDFPPSPASADTPASPLKKTKSSKHKSKRHSSDSAPATSNGLFSILTAGSKKSKKRKDRRSSSPSGEKKKHRSSRHKDSKDSKDSKDKKDAPKLLEYHPAEKKDDSTAAAAGQMIVYKPRADLFLSFVNKGPESDRGCSMNKALKRFHRERSASGKSLAKPAEEKELFRSLRLRKNDRGEIVIFCVDDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.39
3 0.47
4 0.54
5 0.64
6 0.69
7 0.71
8 0.75
9 0.8
10 0.83
11 0.8
12 0.77
13 0.74
14 0.66
15 0.61
16 0.53
17 0.46
18 0.44
19 0.38
20 0.33
21 0.24
22 0.26
23 0.21
24 0.18
25 0.15
26 0.16
27 0.21
28 0.22
29 0.24
30 0.23
31 0.24
32 0.25
33 0.27
34 0.26
35 0.23
36 0.23
37 0.29
38 0.31
39 0.32
40 0.34
41 0.35
42 0.37
43 0.35
44 0.35
45 0.32
46 0.28
47 0.29
48 0.33
49 0.4
50 0.45
51 0.54
52 0.63
53 0.67
54 0.75
55 0.8
56 0.85
57 0.84
58 0.85
59 0.86
60 0.88
61 0.89
62 0.88
63 0.89
64 0.82
65 0.81
66 0.75
67 0.7
68 0.6
69 0.51
70 0.49
71 0.41
72 0.37
73 0.3
74 0.29
75 0.24
76 0.23
77 0.23
78 0.2
79 0.19
80 0.19
81 0.18
82 0.16
83 0.21
84 0.23
85 0.23
86 0.19
87 0.18
88 0.17
89 0.16
90 0.16
91 0.13
92 0.11
93 0.12
94 0.12
95 0.11
96 0.11
97 0.12
98 0.11
99 0.1
100 0.1
101 0.09
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.09
114 0.1
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.13
121 0.15
122 0.15
123 0.16
124 0.17
125 0.18
126 0.2
127 0.2
128 0.21
129 0.18
130 0.18
131 0.24
132 0.25
133 0.26
134 0.24
135 0.24
136 0.22
137 0.26
138 0.25
139 0.17
140 0.13
141 0.11
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.04
146 0.03
147 0.04
148 0.05
149 0.04
150 0.06
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.15
164 0.18
165 0.19
166 0.2
167 0.19
168 0.21
169 0.22
170 0.24
171 0.2
172 0.21
173 0.21
174 0.23
175 0.23
176 0.2
177 0.21
178 0.18
179 0.14
180 0.11
181 0.1
182 0.07
183 0.06
184 0.07
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.07
194 0.09
195 0.09
196 0.11
197 0.13
198 0.13
199 0.12
200 0.12
201 0.1
202 0.09
203 0.08
204 0.06
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.08
216 0.09
217 0.11
218 0.14
219 0.19
220 0.23
221 0.27
222 0.35
223 0.34
224 0.42
225 0.46
226 0.51
227 0.54
228 0.61
229 0.66
230 0.7
231 0.74
232 0.76
233 0.8
234 0.81
235 0.83
236 0.83
237 0.82
238 0.83
239 0.87
240 0.87
241 0.89
242 0.88
243 0.88
244 0.86
245 0.84
246 0.78
247 0.78
248 0.76
249 0.72
250 0.73
251 0.66
252 0.59
253 0.52
254 0.46
255 0.35
256 0.27
257 0.2
258 0.1
259 0.07
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.07
264 0.06
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.08
274 0.09
275 0.1
276 0.11
277 0.12
278 0.19
279 0.22
280 0.28
281 0.28
282 0.32
283 0.35
284 0.35
285 0.35
286 0.29
287 0.27
288 0.23
289 0.23
290 0.18
291 0.16
292 0.18
293 0.18
294 0.18
295 0.21
296 0.22
297 0.3
298 0.35
299 0.41
300 0.49
301 0.58
302 0.68
303 0.75
304 0.81
305 0.82
306 0.88
307 0.89
308 0.86
309 0.83
310 0.76
311 0.74
312 0.69
313 0.63
314 0.54
315 0.44
316 0.38
317 0.31
318 0.27
319 0.17
320 0.13
321 0.09
322 0.07
323 0.09
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.1
328 0.16
329 0.22
330 0.3
331 0.38
332 0.48
333 0.59
334 0.69
335 0.79
336 0.83
337 0.89
338 0.92
339 0.91
340 0.9
341 0.88
342 0.87
343 0.86
344 0.84
345 0.83
346 0.81
347 0.82
348 0.84
349 0.84
350 0.84
351 0.86
352 0.86
353 0.89
354 0.91
355 0.89
356 0.87
357 0.88
358 0.88
359 0.88
360 0.84
361 0.79
362 0.79
363 0.8
364 0.78
365 0.79
366 0.77
367 0.76
368 0.8
369 0.8
370 0.74
371 0.74
372 0.69
373 0.62
374 0.63
375 0.56
376 0.54
377 0.53
378 0.52
379 0.46
380 0.43
381 0.42
382 0.36
383 0.35
384 0.29
385 0.24
386 0.22
387 0.19
388 0.18
389 0.16
390 0.12
391 0.1
392 0.09
393 0.08
394 0.09
395 0.1
396 0.1
397 0.11
398 0.12
399 0.14
400 0.14
401 0.15
402 0.18
403 0.25
404 0.27
405 0.28
406 0.29
407 0.31
408 0.3
409 0.3
410 0.27
411 0.27
412 0.29
413 0.31
414 0.32
415 0.33
416 0.35
417 0.36
418 0.39
419 0.39
420 0.39
421 0.42
422 0.46
423 0.51
424 0.59
425 0.64
426 0.68
427 0.71
428 0.71
429 0.72
430 0.74
431 0.73
432 0.67
433 0.65
434 0.63
435 0.54
436 0.58
437 0.52
438 0.46
439 0.41
440 0.39
441 0.45
442 0.4
443 0.4
444 0.37
445 0.45
446 0.42
447 0.42
448 0.47
449 0.45
450 0.52
451 0.6
452 0.62
453 0.62
454 0.71
455 0.77
456 0.72
457 0.69
458 0.63
459 0.55
460 0.52
461 0.46
462 0.36