Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D5N1

Protein Details
Accession B0D5N1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MTTHKTSKKRPASSQAGPNVKKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012959  CPL_dom  
IPR033133  PUM-HD  
IPR040059  PUM3  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_317976  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08144  CPL  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50303  PUM_HD  
Amino Acid Sequences MTTHKTSKKRPASSQAGPNVKKPNLEKSSSDKKRSRPVTASAQPASTSDSEPDDLEDVENTGGDDEGDWIDEDDEMDVDNNGDAPTLNSTAPKDPNAARESHKAQKIVQEQRRAAKPHSTLLVEAKRVWSLARQKTIPTAERQKHVKNLMDVIRGKVKDIVFKHDASRIVQTVVKYGGQKERDEIAAELKGKYKDLVQNKYSKFLVTKLIRLCPSHRTSILLEFQTHVLRLLLHREATSVLADAFELYANAYERTILLRDFYGKEANLFSFTTGSAEDKERAKKGLSGILEGVDNERRRRTLNALKDNLVTILNNPDKGAVTHAVVHRALWEYISAVNTIQDETEREKLAREIFESCQEVLAEMVHTRDGSRVVREFLAQGTAKDRKQILKVLKPHIERMCLDDEAQLVLFTALDVTDDTKLLSKSLISEMTTPAQKLYASPQGRRSLLYLLLPRTRRHFTPAQIASLAETDEARARTSKKEPQSRESEVRKFASEALITWVQENGASLVREPSGTLVVVDIMLFAEGDKTAAMKTLLAVISSPYPSTDSSTPHPIDLPHTSRLYKTLLQGGHFNRATGTIDTSQTHWDSEAFARSFVANVGRDVVVSMCTKGAGDGAFVISALCEALVRGGEGCAEERKRIKEWFGGKAVKEIEAGEAKGKKILVENLALL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.82
3 0.82
4 0.75
5 0.73
6 0.71
7 0.65
8 0.63
9 0.57
10 0.59
11 0.55
12 0.57
13 0.55
14 0.55
15 0.64
16 0.67
17 0.73
18 0.69
19 0.7
20 0.76
21 0.79
22 0.79
23 0.74
24 0.71
25 0.72
26 0.72
27 0.72
28 0.64
29 0.57
30 0.49
31 0.43
32 0.4
33 0.31
34 0.26
35 0.2
36 0.21
37 0.21
38 0.2
39 0.21
40 0.18
41 0.17
42 0.16
43 0.14
44 0.12
45 0.11
46 0.1
47 0.09
48 0.08
49 0.07
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.07
61 0.07
62 0.06
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.1
73 0.11
74 0.12
75 0.13
76 0.16
77 0.22
78 0.25
79 0.26
80 0.28
81 0.29
82 0.36
83 0.36
84 0.37
85 0.36
86 0.41
87 0.46
88 0.49
89 0.52
90 0.47
91 0.46
92 0.51
93 0.56
94 0.59
95 0.6
96 0.61
97 0.61
98 0.67
99 0.72
100 0.67
101 0.61
102 0.59
103 0.54
104 0.5
105 0.5
106 0.43
107 0.38
108 0.42
109 0.44
110 0.37
111 0.35
112 0.32
113 0.28
114 0.27
115 0.25
116 0.25
117 0.29
118 0.35
119 0.41
120 0.4
121 0.41
122 0.48
123 0.54
124 0.5
125 0.48
126 0.51
127 0.49
128 0.55
129 0.61
130 0.59
131 0.61
132 0.63
133 0.6
134 0.52
135 0.54
136 0.52
137 0.53
138 0.49
139 0.45
140 0.46
141 0.41
142 0.38
143 0.36
144 0.32
145 0.32
146 0.32
147 0.36
148 0.32
149 0.34
150 0.35
151 0.35
152 0.36
153 0.31
154 0.33
155 0.26
156 0.25
157 0.25
158 0.23
159 0.21
160 0.21
161 0.22
162 0.19
163 0.22
164 0.27
165 0.28
166 0.28
167 0.28
168 0.29
169 0.27
170 0.27
171 0.24
172 0.2
173 0.21
174 0.22
175 0.2
176 0.22
177 0.22
178 0.21
179 0.21
180 0.22
181 0.26
182 0.33
183 0.4
184 0.4
185 0.48
186 0.49
187 0.53
188 0.48
189 0.42
190 0.35
191 0.3
192 0.35
193 0.28
194 0.33
195 0.32
196 0.37
197 0.38
198 0.39
199 0.4
200 0.39
201 0.4
202 0.38
203 0.35
204 0.32
205 0.32
206 0.35
207 0.37
208 0.3
209 0.27
210 0.24
211 0.25
212 0.22
213 0.2
214 0.15
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.13
219 0.14
220 0.14
221 0.13
222 0.14
223 0.14
224 0.14
225 0.13
226 0.09
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.11
247 0.12
248 0.13
249 0.15
250 0.14
251 0.15
252 0.15
253 0.15
254 0.14
255 0.13
256 0.12
257 0.1
258 0.1
259 0.09
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.1
264 0.13
265 0.16
266 0.2
267 0.21
268 0.22
269 0.22
270 0.23
271 0.23
272 0.25
273 0.21
274 0.19
275 0.18
276 0.17
277 0.16
278 0.14
279 0.14
280 0.14
281 0.15
282 0.16
283 0.17
284 0.17
285 0.19
286 0.21
287 0.27
288 0.31
289 0.39
290 0.46
291 0.48
292 0.48
293 0.47
294 0.45
295 0.37
296 0.29
297 0.19
298 0.11
299 0.15
300 0.15
301 0.14
302 0.14
303 0.14
304 0.14
305 0.14
306 0.15
307 0.09
308 0.09
309 0.13
310 0.13
311 0.15
312 0.15
313 0.15
314 0.13
315 0.14
316 0.13
317 0.09
318 0.09
319 0.07
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.06
330 0.09
331 0.12
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.14
336 0.16
337 0.15
338 0.14
339 0.14
340 0.15
341 0.18
342 0.19
343 0.17
344 0.15
345 0.14
346 0.13
347 0.1
348 0.09
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.06
356 0.09
357 0.09
358 0.12
359 0.13
360 0.14
361 0.14
362 0.15
363 0.14
364 0.12
365 0.15
366 0.13
367 0.12
368 0.16
369 0.2
370 0.2
371 0.23
372 0.25
373 0.24
374 0.26
375 0.33
376 0.35
377 0.38
378 0.45
379 0.48
380 0.53
381 0.51
382 0.55
383 0.51
384 0.47
385 0.4
386 0.37
387 0.33
388 0.27
389 0.26
390 0.2
391 0.17
392 0.14
393 0.14
394 0.1
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.04
399 0.04
400 0.03
401 0.03
402 0.03
403 0.04
404 0.05
405 0.05
406 0.06
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.09
411 0.08
412 0.09
413 0.11
414 0.13
415 0.11
416 0.13
417 0.14
418 0.17
419 0.18
420 0.16
421 0.14
422 0.13
423 0.12
424 0.12
425 0.15
426 0.21
427 0.23
428 0.27
429 0.33
430 0.38
431 0.39
432 0.39
433 0.36
434 0.29
435 0.28
436 0.29
437 0.26
438 0.25
439 0.3
440 0.32
441 0.32
442 0.35
443 0.37
444 0.34
445 0.36
446 0.37
447 0.35
448 0.43
449 0.43
450 0.4
451 0.37
452 0.36
453 0.3
454 0.25
455 0.21
456 0.11
457 0.09
458 0.07
459 0.1
460 0.11
461 0.11
462 0.13
463 0.15
464 0.2
465 0.27
466 0.35
467 0.41
468 0.5
469 0.55
470 0.59
471 0.65
472 0.67
473 0.7
474 0.7
475 0.67
476 0.63
477 0.59
478 0.53
479 0.46
480 0.4
481 0.35
482 0.26
483 0.21
484 0.21
485 0.21
486 0.19
487 0.19
488 0.18
489 0.14
490 0.13
491 0.13
492 0.09
493 0.09
494 0.09
495 0.1
496 0.11
497 0.11
498 0.11
499 0.11
500 0.11
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.05
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.03
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.05
518 0.05
519 0.07
520 0.07
521 0.06
522 0.07
523 0.11
524 0.12
525 0.11
526 0.11
527 0.11
528 0.14
529 0.14
530 0.14
531 0.1
532 0.12
533 0.13
534 0.17
535 0.18
536 0.2
537 0.23
538 0.32
539 0.32
540 0.31
541 0.32
542 0.28
543 0.3
544 0.34
545 0.34
546 0.31
547 0.34
548 0.34
549 0.34
550 0.36
551 0.36
552 0.31
553 0.3
554 0.32
555 0.31
556 0.31
557 0.38
558 0.38
559 0.43
560 0.39
561 0.36
562 0.29
563 0.29
564 0.3
565 0.24
566 0.25
567 0.19
568 0.21
569 0.22
570 0.23
571 0.26
572 0.24
573 0.23
574 0.19
575 0.17
576 0.18
577 0.19
578 0.26
579 0.22
580 0.21
581 0.21
582 0.21
583 0.21
584 0.19
585 0.22
586 0.15
587 0.15
588 0.18
589 0.17
590 0.17
591 0.17
592 0.15
593 0.13
594 0.13
595 0.13
596 0.11
597 0.11
598 0.11
599 0.1
600 0.12
601 0.09
602 0.09
603 0.09
604 0.09
605 0.09
606 0.09
607 0.08
608 0.06
609 0.06
610 0.05
611 0.04
612 0.04
613 0.04
614 0.05
615 0.06
616 0.06
617 0.07
618 0.07
619 0.08
620 0.09
621 0.11
622 0.18
623 0.2
624 0.26
625 0.32
626 0.36
627 0.41
628 0.45
629 0.47
630 0.48
631 0.52
632 0.54
633 0.57
634 0.59
635 0.55
636 0.57
637 0.53
638 0.46
639 0.41
640 0.33
641 0.29
642 0.26
643 0.26
644 0.26
645 0.28
646 0.27
647 0.29
648 0.29
649 0.26
650 0.27
651 0.32
652 0.3