FuNGI

S3BSV5

Protein Details

Accession

S3BSV5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
220-243	GSTESAAGRKRKKRWDVTESDEKT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
228-233	RKRKKR

Subcellular Location(s)

plas 19, cyto 3.5, cyto_nucl 3.5, nucl 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like IPR034085 TOG
Gene Ontology	GO:0005856 C:cytoskeleton GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MDDEFEQIKKLQQQRNAAANTKMGARADGPGNNKMKLTDAADTDVYGTGNDQDKYEGYHRSLPTGGTADDDEDIDMADSSDNSRRLVGQYTATRTQIDEFARGAGVEEEDILTGRERSNRISDRETDYQKRRFDRVLTPTRVDPFATNRGAGAANGNGKTEEAGKGQSYREIMERRELEREEERVRRTIDAKRKAGDTDDSSAEHQATLTCPDKENEEAGSTESAAGRKRKKRWDVTESDEKTEGPDGRAAAPGAAAEVKKRSRWDQAPAVGSAADMSVAAVKKRSRWDQAPSATPVGNQGLATPAHPSAGLGAPGALSAMIPGTFGNDTSLRNAPLSDEELNEMLPGADEGYKILDPPPGYAPTRAPTHRVVQTPLPSSGFTMQDPDSARMAGQPIPNSIPGMNDLQFLKPEDVAYFGKLSDGANEDTLSVDELKERKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARIFGAGPLFNQILPLLMEKSLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDMVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGSEIISNLSKAAGLATMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLQAVCRSKKSWQARHTGVKIVQQIPILMGCAILPYLKRLVDCIAPCLNDEQTKVRTVTSLAIAALAEASNPYGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGFIIPLMDEEYANYYTSQIMEILLREFSSPDEEMKKVVLKVVSQCASTEGVTAGYLKEHVLDEFFKGFWVRRMALDKRNYRQVVETTVDIGQKVGVSEILERIVTNLKDESESYRRMTVETVEKLVSSLGAADIGERLEERLIDGILHSFQEQTVEDVVMLNGFGSVVNALGARCKPYLPQIVSTILWRLNNKSATVRQQAADLISRIAMVMKQCGEDALMGKLGIVLYEYLGEEYPEVLGSILGALRSIVTVVGISQMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVNTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHIALGVVGLGCEDAMVHLLNLLYPNLFETSPHVIDRIVEAIEAIRVAVGPGLVLNYVWAGLFHPARKVRTIYWRVLSDCYIGAADAMVPYYPDLDEDSVDRPELSVIL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.7
3	0.7
4	0.66
5	0.6
6	0.55
7	0.49
8	0.43
9	0.38
10	0.3
11	0.26
12	0.22
13	0.24
14	0.26
15	0.3
16	0.31
17	0.36
18	0.4
19	0.4
20	0.39
21	0.35
22	0.34
23	0.33
24	0.32
25	0.29
26	0.27
27	0.29
28	0.28
29	0.28
30	0.26
31	0.22
32	0.18
33	0.14
34	0.12
35	0.13
36	0.18
37	0.18
38	0.17
39	0.18
40	0.19
41	0.25
42	0.28
43	0.29
44	0.28
45	0.36
46	0.36
47	0.37
48	0.38
49	0.33
50	0.33
51	0.3
52	0.26
53	0.21
54	0.21
55	0.18
56	0.18
57	0.17
58	0.14
59	0.11
60	0.11
61	0.09
62	0.08
63	0.07
64	0.06
65	0.06
66	0.09
67	0.16
68	0.17
69	0.17
70	0.18
71	0.2
72	0.22
73	0.26
74	0.26
75	0.28
76	0.33
77	0.39
78	0.42
79	0.42
80	0.4
81	0.37
82	0.36
83	0.35
84	0.3
85	0.26
86	0.22
87	0.22
88	0.22
89	0.2
90	0.19
91	0.14
92	0.12
93	0.09
94	0.09
95	0.08
96	0.08
97	0.09
98	0.08
99	0.09
100	0.09
101	0.12
102	0.17
103	0.19
104	0.23
105	0.32
106	0.38
107	0.42
108	0.46
109	0.49
110	0.52
111	0.58
112	0.62
113	0.63
114	0.65
115	0.67
116	0.7
117	0.7
118	0.67
119	0.64
120	0.61
121	0.61
122	0.63
123	0.65
124	0.64
125	0.62
126	0.61
127	0.6
128	0.55
129	0.47
130	0.4
131	0.36
132	0.37
133	0.35
134	0.31
135	0.27
136	0.28
137	0.27
138	0.24
139	0.2
140	0.16
141	0.2
142	0.2
143	0.21
144	0.19
145	0.18
146	0.19
147	0.18
148	0.17
149	0.14
150	0.16
151	0.17
152	0.2
153	0.21
154	0.23
155	0.22
156	0.22
157	0.27
158	0.29
159	0.29
160	0.36
161	0.39
162	0.38
163	0.43
164	0.42
165	0.41
166	0.41
167	0.45
168	0.44
169	0.46
170	0.47
171	0.46
172	0.46
173	0.45
174	0.44
175	0.48
176	0.51
177	0.54
178	0.56
179	0.54
180	0.55
181	0.52
182	0.51
183	0.48
184	0.42
185	0.36
186	0.33
187	0.32
188	0.31
189	0.3
190	0.27
191	0.21
192	0.16
193	0.13
194	0.12
195	0.16
196	0.18
197	0.18
198	0.2
199	0.2
200	0.23
201	0.24
202	0.25
203	0.21
204	0.19
205	0.18
206	0.18
207	0.18
208	0.15
209	0.14
210	0.14
211	0.15
212	0.18
213	0.26
214	0.34
215	0.42
216	0.5
217	0.59
218	0.68
219	0.77
220	0.81
221	0.83
222	0.82
223	0.81
224	0.83
225	0.76
226	0.7
227	0.6
228	0.5
229	0.41
230	0.39
231	0.32
232	0.23
233	0.22
234	0.19
235	0.2
236	0.22
237	0.2
238	0.15
239	0.13
240	0.11
241	0.1
242	0.11
243	0.1
244	0.1
245	0.16
246	0.19
247	0.23
248	0.27
249	0.31
250	0.38
251	0.43
252	0.49
253	0.51
254	0.55
255	0.54
256	0.51
257	0.47
258	0.37
259	0.31
260	0.23
261	0.15
262	0.08
263	0.05
264	0.04
265	0.07
266	0.08
267	0.09
268	0.13
269	0.14
270	0.19
271	0.27
272	0.34
273	0.38
274	0.43
275	0.5
276	0.56
277	0.6
278	0.61
279	0.57
280	0.53
281	0.46
282	0.4
283	0.35
284	0.27
285	0.22
286	0.17
287	0.13
288	0.13
289	0.13
290	0.13
291	0.12
292	0.11
293	0.1
294	0.1
295	0.1
296	0.09
297	0.11
298	0.11
299	0.08
300	0.08
301	0.08
302	0.08
303	0.08
304	0.05
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.04
310	0.04
311	0.06
312	0.06
313	0.06
314	0.09
315	0.1
316	0.11
317	0.14
318	0.17
319	0.16
320	0.16
321	0.16
322	0.15
323	0.16
324	0.19
325	0.16
326	0.15
327	0.15
328	0.15
329	0.15
330	0.13
331	0.11
332	0.07
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.08
340	0.08
341	0.08
342	0.09
343	0.11
344	0.11
345	0.13
346	0.16
347	0.18
348	0.2
349	0.21
350	0.22
351	0.23
352	0.29
353	0.28
354	0.29
355	0.28
356	0.33
357	0.37
358	0.37
359	0.37
360	0.36
361	0.4
362	0.4
363	0.38
364	0.33
365	0.28
366	0.27
367	0.27
368	0.23
369	0.17
370	0.17
371	0.16
372	0.18
373	0.2
374	0.21
375	0.18
376	0.17
377	0.17
378	0.14
379	0.16
380	0.16
381	0.16
382	0.15
383	0.17
384	0.18
385	0.19
386	0.18
387	0.17
388	0.14
389	0.13
390	0.15
391	0.13
392	0.14
393	0.14
394	0.14
395	0.15
396	0.16
397	0.15
398	0.12
399	0.12
400	0.11
401	0.13
402	0.13
403	0.14
404	0.12
405	0.11
406	0.11
407	0.11
408	0.11
409	0.09
410	0.11
411	0.1
412	0.11
413	0.11
414	0.11
415	0.1
416	0.1
417	0.09
418	0.07
419	0.06
420	0.09
421	0.1
422	0.11
423	0.15
424	0.15
425	0.16
426	0.2
427	0.24
428	0.26
429	0.35
430	0.41
431	0.43
432	0.48
433	0.48
434	0.46
435	0.48
436	0.47
437	0.44
438	0.44
439	0.41
440	0.41
441	0.44
442	0.43
443	0.41
444	0.47
445	0.5
446	0.45
447	0.42
448	0.41
449	0.43
450	0.5
451	0.46
452	0.37
453	0.28
454	0.26
455	0.25
456	0.22
457	0.17
458	0.1
459	0.09
460	0.1
461	0.11
462	0.11
463	0.1
464	0.09
465	0.07
466	0.08
467	0.08
468	0.07
469	0.07
470	0.07
471	0.07
472	0.1
473	0.12
474	0.13
475	0.12
476	0.12
477	0.15
478	0.17
479	0.18
480	0.15
481	0.15
482	0.14
483	0.18
484	0.19
485	0.17
486	0.18
487	0.17
488	0.18
489	0.17
490	0.17
491	0.13
492	0.13
493	0.14
494	0.13
495	0.15
496	0.16
497	0.16
498	0.16
499	0.18
500	0.18
501	0.16
502	0.14
503	0.13
504	0.13
505	0.14
506	0.13
507	0.12
508	0.09
509	0.09
510	0.08
511	0.08
512	0.06
513	0.04
514	0.03
515	0.04
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.06
522	0.07
523	0.08
524	0.08
525	0.08
526	0.09
527	0.09
528	0.09
529	0.09
530	0.08
531	0.06
532	0.05
533	0.05
534	0.04
535	0.03
536	0.04
537	0.04
538	0.05
539	0.05
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.05
545	0.06
546	0.07
547	0.09
548	0.1
549	0.1
550	0.13
551	0.13
552	0.14
553	0.15
554	0.13
555	0.11
556	0.11
557	0.11
558	0.11
559	0.1
560	0.1
561	0.09
562	0.08
563	0.09
564	0.08
565	0.07
566	0.06
567	0.05
568	0.04
569	0.04
570	0.03
571	0.03
572	0.03
573	0.03
574	0.02
575	0.02
576	0.03
577	0.03
578	0.04
579	0.06
580	0.09
581	0.12
582	0.15
583	0.17
584	0.2
585	0.29
586	0.37
587	0.45
588	0.48
589	0.52
590	0.56
591	0.62
592	0.61
593	0.56
594	0.49
595	0.45
596	0.43
597	0.37
598	0.33
599	0.25
600	0.23
601	0.19
602	0.17
603	0.12
604	0.08
605	0.06
606	0.04
607	0.04
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.05
612	0.07
613	0.07
614	0.07
615	0.08
616	0.1
617	0.13
618	0.13
619	0.16
620	0.16
621	0.15
622	0.16
623	0.16
624	0.16
625	0.14
626	0.15
627	0.14
628	0.14
629	0.16
630	0.17
631	0.15
632	0.15
633	0.14
634	0.14
635	0.12
636	0.11
637	0.08
638	0.08
639	0.08
640	0.07
641	0.06
642	0.05
643	0.04
644	0.03
645	0.03
646	0.03
647	0.03
648	0.03
649	0.03
650	0.04
651	0.05
652	0.06
653	0.06
654	0.06
655	0.07
656	0.07
657	0.07
658	0.07
659	0.06
660	0.05
661	0.05
662	0.06
663	0.08
664	0.13
665	0.22
666	0.24
667	0.26
668	0.31
669	0.34
670	0.36
671	0.36
672	0.38
673	0.32
674	0.31
675	0.3
676	0.24
677	0.2
678	0.18
679	0.15
680	0.08
681	0.05
682	0.04
683	0.03
684	0.03
685	0.03
686	0.04
687	0.05
688	0.04
689	0.05
690	0.07
691	0.08
692	0.09
693	0.08
694	0.08
695	0.08
696	0.08
697	0.08
698	0.06
699	0.06
700	0.06
701	0.06
702	0.06
703	0.06
704	0.06
705	0.06
706	0.06
707	0.06
708	0.09
709	0.09
710	0.1
711	0.13
712	0.13
713	0.13
714	0.14
715	0.16
716	0.13
717	0.15
718	0.14
719	0.13
720	0.16
721	0.21
722	0.21
723	0.19
724	0.19
725	0.19
726	0.19
727	0.17
728	0.14
729	0.09
730	0.08
731	0.08
732	0.08
733	0.06
734	0.05
735	0.06
736	0.05
737	0.06
738	0.06
739	0.06
740	0.07
741	0.08
742	0.09
743	0.1
744	0.1
745	0.09
746	0.1
747	0.1
748	0.13
749	0.16
750	0.15
751	0.18
752	0.24
753	0.29
754	0.36
755	0.44
756	0.47
757	0.48
758	0.56
759	0.54
760	0.48
761	0.47
762	0.41
763	0.37
764	0.31
765	0.27
766	0.2
767	0.21
768	0.2
769	0.17
770	0.15
771	0.1
772	0.09
773	0.08
774	0.07
775	0.05
776	0.05
777	0.06
778	0.07
779	0.07
780	0.07
781	0.07
782	0.08
783	0.12
784	0.11
785	0.12
786	0.12
787	0.12
788	0.13
789	0.14
790	0.19
791	0.19
792	0.22
793	0.22
794	0.24
795	0.24
796	0.24
797	0.24
798	0.22
799	0.24
800	0.23
801	0.23
802	0.2
803	0.2
804	0.19
805	0.18
806	0.14
807	0.07
808	0.06
809	0.04
810	0.04
811	0.04
812	0.04
813	0.04
814	0.04
815	0.05
816	0.04
817	0.05
818	0.05
819	0.05
820	0.05
821	0.06
822	0.06
823	0.06
824	0.06
825	0.07
826	0.07
827	0.07
828	0.07
829	0.06
830	0.06
831	0.08
832	0.08
833	0.09
834	0.09
835	0.09
836	0.08
837	0.08
838	0.08
839	0.07
840	0.06
841	0.04
842	0.03
843	0.03
844	0.03
845	0.03
846	0.03
847	0.03
848	0.04
849	0.04
850	0.04
851	0.07
852	0.08
853	0.1
854	0.11
855	0.11
856	0.12
857	0.19
858	0.27
859	0.27
860	0.29
861	0.29
862	0.31
863	0.31
864	0.31
865	0.27
866	0.22
867	0.22
868	0.21
869	0.22
870	0.25
871	0.27
872	0.27
873	0.3
874	0.33
875	0.37
876	0.41
877	0.4
878	0.34
879	0.33
880	0.33
881	0.29
882	0.27
883	0.2
884	0.15
885	0.12
886	0.12
887	0.1
888	0.1
889	0.09
890	0.08
891	0.1
892	0.1
893	0.11
894	0.11
895	0.11
896	0.11
897	0.1
898	0.11
899	0.09
900	0.09
901	0.08
902	0.08
903	0.09
904	0.08
905	0.07
906	0.06
907	0.05
908	0.04
909	0.05
910	0.06
911	0.06
912	0.06
913	0.06
914	0.06
915	0.06
916	0.06
917	0.05
918	0.05
919	0.05
920	0.04
921	0.04
922	0.04
923	0.05
924	0.04
925	0.04
926	0.04
927	0.04
928	0.04
929	0.04
930	0.04
931	0.03
932	0.03
933	0.04
934	0.05
935	0.06
936	0.06
937	0.09
938	0.12
939	0.13
940	0.13
941	0.15
942	0.17
943	0.18
944	0.21
945	0.2
946	0.24
947	0.25
948	0.26
949	0.28
950	0.29
951	0.34
952	0.37
953	0.46
954	0.46
955	0.51
956	0.53
957	0.59
958	0.62
959	0.64
960	0.61
961	0.61
962	0.58
963	0.53
964	0.5
965	0.42
966	0.36
967	0.28
968	0.23
969	0.14
970	0.11
971	0.08
972	0.08
973	0.08
974	0.09
975	0.1
976	0.11
977	0.14
978	0.18
979	0.2
980	0.22
981	0.23
982	0.23
983	0.26
984	0.25
985	0.24
986	0.25
987	0.23
988	0.21
989	0.19
990	0.18
991	0.19
992	0.19
993	0.19
994	0.15
995	0.18
996	0.22
997	0.22
998	0.24
999	0.22
1000	0.27
1001	0.33
1002	0.43
1003	0.5
1004	0.51
1005	0.59
1006	0.65
1007	0.72
1008	0.67
1009	0.6
1010	0.51
1011	0.42
1012	0.37
1013	0.28
1014	0.2
1015	0.12
1016	0.14
1017	0.13
1018	0.12
1019	0.11
1020	0.11
1021	0.11
1022	0.1
1023	0.1
1024	0.07
1025	0.07
1026	0.08
1027	0.1
1028	0.12
1029	0.12
1030	0.13
1031	0.14
1032	0.16
1033	0.19
1034	0.26
1035	0.29
1036	0.35
1037	0.38
1038	0.42
1039	0.42
1040	0.43
1041	0.4
1042	0.32
1043	0.29
1044	0.2
1045	0.17
1046	0.11
1047	0.09
1048	0.06
1049	0.06
1050	0.05
1051	0.04
1052	0.04
1053	0.04
1054	0.05
1055	0.05
1056	0.06
1057	0.09
1058	0.1
1059	0.1
1060	0.11
1061	0.16
1062	0.16
1063	0.18
1064	0.18
1065	0.17
1066	0.18
1067	0.18
1068	0.19
1069	0.21
1070	0.23
1071	0.26
1072	0.26
1073	0.25
1074	0.28
1075	0.27
1076	0.26
1077	0.2
1078	0.17
1079	0.14
1080	0.14
1081	0.15
1082	0.11
1083	0.11
1084	0.11
1085	0.11
1086	0.13
1087	0.12
1088	0.13
1089	0.11
1090	0.11
1091	0.11
1092	0.1
1093	0.1
1094	0.09
1095	0.08
1096	0.07
1097	0.08
1098	0.08
1099	0.08
1100	0.08
1101	0.08
1102	0.08
1103	0.07
1104	0.06
1105	0.07
1106	0.11
1107	0.1
1108	0.1
1109	0.11
1110	0.14
1111	0.19
1112	0.21
1113	0.23
1114	0.2
1115	0.2
1116	0.22
1117	0.27
1118	0.3
1119	0.27
1120	0.27
1121	0.26
1122	0.26
1123	0.25
1124	0.23
1125	0.18
1126	0.11
1127	0.1
1128	0.08
1129	0.06
1130	0.05
1131	0.05
1132	0.05
1133	0.04
1134	0.04
1135	0.04
1136	0.03
1137	0.05
1138	0.05
1139	0.05
1140	0.06
1141	0.06
1142	0.07
1143	0.09
1144	0.09
1145	0.08
1146	0.08
1147	0.1
1148	0.11
1149	0.11
1150	0.1
1151	0.14
1152	0.21
1153	0.23
1154	0.24
1155	0.23
1156	0.21
1157	0.22
1158	0.24
1159	0.21
1160	0.14
1161	0.11
1162	0.11
1163	0.11
1164	0.11
1165	0.1
1166	0.08
1167	0.06
1168	0.05
1169	0.06
1170	0.06
1171	0.05
1172	0.05
1173	0.05
1174	0.06
1175	0.06
1176	0.06
1177	0.06
1178	0.06
1179	0.06
1180	0.06
1181	0.06
1182	0.06
1183	0.12
1184	0.16
1185	0.17
1186	0.25
1187	0.31
1188	0.34
1189	0.39
1190	0.42
1191	0.43
1192	0.5
1193	0.56
1194	0.55
1195	0.57
1196	0.6
1197	0.57
1198	0.57
1199	0.52
1200	0.43
1201	0.36
1202	0.3
1203	0.23
1204	0.17
1205	0.14
1206	0.11
1207	0.1
1208	0.08
1209	0.08
1210	0.06
1211	0.06
1212	0.07
1213	0.08
1214	0.08
1215	0.08
1216	0.11
1217	0.11
1218	0.13
1219	0.15
1220	0.18
1221	0.18
1222	0.19
1223	0.18
1224	0.15

S3BSV5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer