Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CTX1

Protein Details
Accession B0CTX1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-31ASSLSPSMSTRKRPRSHENDENIPPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 11, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046496  DUF6589  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_321719  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF20231  DUF6589  
Amino Acid Sequences MSDAINASSLSPSMSTRKRPRSHENDENIPPTTPVNAKPMKFIDCSAPKKPRLSAKNGRHFTPQDIQNMRESYAQQAPTRVMKEKEQKAAAAARGAEIEAGQATDRVEQAWSLLRPLFPSMHDFLRELLTTRHPVRSSQVSNLLTFHGHDLLNLIRDRHPSVANDWALSTARQLVSSDVSSLPQGHQSLTSYISLREVLSDAEILAPTLFQILQQACGMLSTSQDQPSRKHPDLVLATTLCMLAKARNDHASDFPTTMCMYFLACGTSHSVFDVLNHAGVTFSYTQAVAKIKQLGRERLTMMREIARSRAFMVIWDNLNIAFKVSEQRHDAKDHFDNGTTATLLPLYDVDFGGLPLELLPSRDCRIPVLKFGAKDLLPTSEEAQRVKAGQLSHIQDILYEAFPSLRKRLKDKIPPAPTVLQIPVHKTEQYPLPAMHIDESSFRNVGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.37
3 0.47
4 0.57
5 0.65
6 0.72
7 0.8
8 0.82
9 0.85
10 0.85
11 0.82
12 0.8
13 0.79
14 0.74
15 0.65
16 0.55
17 0.46
18 0.36
19 0.33
20 0.27
21 0.24
22 0.3
23 0.34
24 0.34
25 0.4
26 0.43
27 0.43
28 0.42
29 0.4
30 0.41
31 0.44
32 0.5
33 0.53
34 0.58
35 0.59
36 0.62
37 0.66
38 0.66
39 0.65
40 0.68
41 0.7
42 0.72
43 0.77
44 0.76
45 0.73
46 0.71
47 0.65
48 0.61
49 0.6
50 0.54
51 0.53
52 0.53
53 0.52
54 0.5
55 0.49
56 0.44
57 0.38
58 0.34
59 0.3
60 0.32
61 0.34
62 0.29
63 0.3
64 0.32
65 0.34
66 0.37
67 0.37
68 0.34
69 0.39
70 0.47
71 0.52
72 0.57
73 0.53
74 0.5
75 0.48
76 0.5
77 0.43
78 0.36
79 0.29
80 0.22
81 0.2
82 0.2
83 0.16
84 0.1
85 0.09
86 0.06
87 0.06
88 0.05
89 0.06
90 0.06
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.14
98 0.13
99 0.14
100 0.16
101 0.16
102 0.17
103 0.19
104 0.19
105 0.15
106 0.19
107 0.2
108 0.2
109 0.22
110 0.21
111 0.2
112 0.21
113 0.2
114 0.17
115 0.17
116 0.18
117 0.23
118 0.25
119 0.29
120 0.27
121 0.28
122 0.32
123 0.38
124 0.37
125 0.35
126 0.41
127 0.37
128 0.37
129 0.36
130 0.32
131 0.24
132 0.21
133 0.18
134 0.13
135 0.11
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.15
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.18
144 0.2
145 0.21
146 0.22
147 0.19
148 0.21
149 0.27
150 0.25
151 0.23
152 0.21
153 0.2
154 0.18
155 0.17
156 0.15
157 0.11
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.1
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.11
174 0.11
175 0.12
176 0.13
177 0.14
178 0.11
179 0.11
180 0.12
181 0.11
182 0.1
183 0.09
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.03
195 0.04
196 0.04
197 0.03
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.05
207 0.06
208 0.07
209 0.08
210 0.12
211 0.15
212 0.17
213 0.18
214 0.26
215 0.34
216 0.33
217 0.34
218 0.31
219 0.35
220 0.36
221 0.35
222 0.3
223 0.22
224 0.21
225 0.18
226 0.18
227 0.11
228 0.08
229 0.07
230 0.06
231 0.1
232 0.12
233 0.14
234 0.19
235 0.2
236 0.21
237 0.23
238 0.23
239 0.21
240 0.2
241 0.17
242 0.14
243 0.13
244 0.12
245 0.1
246 0.08
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.09
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.12
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.1
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.1
274 0.13
275 0.11
276 0.13
277 0.21
278 0.21
279 0.28
280 0.34
281 0.39
282 0.39
283 0.41
284 0.41
285 0.39
286 0.39
287 0.34
288 0.3
289 0.28
290 0.27
291 0.25
292 0.27
293 0.23
294 0.22
295 0.21
296 0.22
297 0.17
298 0.16
299 0.19
300 0.18
301 0.17
302 0.17
303 0.16
304 0.14
305 0.16
306 0.14
307 0.12
308 0.08
309 0.08
310 0.15
311 0.16
312 0.2
313 0.24
314 0.29
315 0.31
316 0.35
317 0.36
318 0.35
319 0.38
320 0.38
321 0.35
322 0.31
323 0.28
324 0.26
325 0.26
326 0.19
327 0.15
328 0.11
329 0.1
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.07
341 0.06
342 0.05
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.09
347 0.12
348 0.14
349 0.17
350 0.17
351 0.2
352 0.27
353 0.28
354 0.33
355 0.38
356 0.39
357 0.37
358 0.39
359 0.41
360 0.34
361 0.34
362 0.29
363 0.24
364 0.22
365 0.23
366 0.23
367 0.22
368 0.25
369 0.24
370 0.24
371 0.23
372 0.23
373 0.23
374 0.23
375 0.19
376 0.21
377 0.28
378 0.3
379 0.3
380 0.29
381 0.28
382 0.24
383 0.26
384 0.24
385 0.17
386 0.13
387 0.11
388 0.12
389 0.16
390 0.2
391 0.25
392 0.29
393 0.33
394 0.4
395 0.49
396 0.57
397 0.65
398 0.71
399 0.75
400 0.76
401 0.75
402 0.74
403 0.69
404 0.6
405 0.54
406 0.47
407 0.43
408 0.38
409 0.39
410 0.38
411 0.37
412 0.36
413 0.33
414 0.35
415 0.36
416 0.38
417 0.37
418 0.32
419 0.34
420 0.34
421 0.35
422 0.32
423 0.26
424 0.22
425 0.22
426 0.25
427 0.24