Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3C5H3

Protein Details
Accession S3C5H3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
159-184AEDRDKKIRGLKKKLKQAKELQTKRDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-123NAKRREARRKA
163-177DKKIRGLKKKLKQAK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 10.666, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039333  PYM1  
IPR015362  WIBG_mago-bd  
IPR036348  WIBG_N_sf  
Gene Ontology GO:1903259  P:exon-exon junction complex disassembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF09282  Mago-bind  
Amino Acid Sequences MSKPSNAGIVTDADGQRVIPESRRPDGSIRPAIKVRPGYMPPEDVPKYQIPLYRRKAVAAEAEAKTAPETPTPARTIPSAVPGAAPATVPGAVPNASPEVEPSTSASSTAAKNAKRREARRKAAANSAEQSEAKAESKSDSASPAEPPEVPVDTASAPAEDRDKKIRGLKKKLKQAKELQTKRDGGESLLPEQIAKVIRISDLTRELESLGLGDDGEEKEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.17
4 0.18
5 0.18
6 0.16
7 0.24
8 0.29
9 0.34
10 0.37
11 0.38
12 0.4
13 0.46
14 0.51
15 0.53
16 0.49
17 0.5
18 0.5
19 0.49
20 0.52
21 0.47
22 0.41
23 0.39
24 0.39
25 0.39
26 0.38
27 0.41
28 0.34
29 0.39
30 0.39
31 0.32
32 0.34
33 0.31
34 0.31
35 0.3
36 0.33
37 0.28
38 0.36
39 0.42
40 0.45
41 0.44
42 0.42
43 0.41
44 0.39
45 0.4
46 0.34
47 0.34
48 0.26
49 0.27
50 0.26
51 0.24
52 0.22
53 0.19
54 0.16
55 0.11
56 0.13
57 0.14
58 0.18
59 0.21
60 0.21
61 0.2
62 0.2
63 0.21
64 0.19
65 0.21
66 0.17
67 0.15
68 0.14
69 0.13
70 0.13
71 0.1
72 0.09
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.05
77 0.05
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.11
90 0.12
91 0.11
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.14
97 0.17
98 0.18
99 0.24
100 0.27
101 0.35
102 0.41
103 0.49
104 0.55
105 0.61
106 0.65
107 0.69
108 0.72
109 0.66
110 0.66
111 0.61
112 0.53
113 0.45
114 0.39
115 0.32
116 0.26
117 0.23
118 0.16
119 0.15
120 0.12
121 0.11
122 0.1
123 0.09
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.13
130 0.14
131 0.14
132 0.14
133 0.13
134 0.14
135 0.14
136 0.14
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.1
141 0.11
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.14
147 0.14
148 0.18
149 0.23
150 0.25
151 0.29
152 0.37
153 0.45
154 0.5
155 0.59
156 0.66
157 0.69
158 0.78
159 0.83
160 0.82
161 0.83
162 0.83
163 0.82
164 0.83
165 0.82
166 0.77
167 0.76
168 0.71
169 0.63
170 0.57
171 0.47
172 0.38
173 0.37
174 0.33
175 0.28
176 0.27
177 0.25
178 0.21
179 0.2
180 0.22
181 0.17
182 0.14
183 0.13
184 0.12
185 0.13
186 0.16
187 0.18
188 0.19
189 0.23
190 0.25
191 0.24
192 0.24
193 0.24
194 0.21
195 0.2
196 0.15
197 0.11
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.09