Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CQN0

Protein Details
Accession S3CQN0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-26QITPRNARSKRALDKRAPKAEENHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 12.5, mito_nucl 12.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MLRQITPRNARSKRALDKRAPKAEENPKTCLFLRGTSASQIVQDCLTDLHAMRAPLAKKFTKKNDIHPFEDPASLEFFSRKNDCSMLLFGSSSKKRRHCLTLCRTFDHAMLDMLEMYVDETSFTRIGQFTGEDGKKRTFPVGSRPMLLFSGTPFYEGGDSSYGAVASSESGRKYALAKSLLTDFFRGDSSPDKIDVEGLSHIIVATAVEPTTADGPEETALPLLHLRTYALRTKRSGQRMPRIELDEIGPRLDVRLGRMKEPDTTMLKEAMRKAKTTEMRTKKNIEVDSMGDKIGRVHQGRQDLGELQTRKMKGLKRGRGEDSAAADDSAAVETTPAGEFDGISGVVEIKNDFSKKARRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.79
3 0.78
4 0.84
5 0.87
6 0.88
7 0.83
8 0.77
9 0.76
10 0.78
11 0.77
12 0.71
13 0.67
14 0.6
15 0.59
16 0.55
17 0.51
18 0.43
19 0.36
20 0.37
21 0.35
22 0.34
23 0.32
24 0.33
25 0.27
26 0.27
27 0.25
28 0.21
29 0.17
30 0.15
31 0.13
32 0.12
33 0.13
34 0.12
35 0.11
36 0.14
37 0.16
38 0.16
39 0.17
40 0.22
41 0.22
42 0.25
43 0.31
44 0.33
45 0.37
46 0.46
47 0.54
48 0.59
49 0.62
50 0.68
51 0.73
52 0.74
53 0.72
54 0.67
55 0.62
56 0.54
57 0.51
58 0.41
59 0.31
60 0.27
61 0.22
62 0.19
63 0.16
64 0.15
65 0.18
66 0.21
67 0.21
68 0.2
69 0.21
70 0.22
71 0.23
72 0.24
73 0.2
74 0.18
75 0.17
76 0.16
77 0.23
78 0.27
79 0.31
80 0.37
81 0.41
82 0.45
83 0.51
84 0.59
85 0.59
86 0.65
87 0.69
88 0.72
89 0.69
90 0.68
91 0.65
92 0.57
93 0.49
94 0.41
95 0.31
96 0.21
97 0.18
98 0.14
99 0.11
100 0.1
101 0.08
102 0.06
103 0.05
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.06
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.16
118 0.18
119 0.19
120 0.21
121 0.23
122 0.24
123 0.25
124 0.26
125 0.21
126 0.21
127 0.28
128 0.35
129 0.34
130 0.34
131 0.34
132 0.33
133 0.3
134 0.29
135 0.19
136 0.11
137 0.13
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.1
145 0.07
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.04
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.1
161 0.12
162 0.15
163 0.15
164 0.15
165 0.16
166 0.19
167 0.2
168 0.19
169 0.17
170 0.13
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.09
175 0.11
176 0.12
177 0.12
178 0.13
179 0.13
180 0.12
181 0.13
182 0.12
183 0.1
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.05
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.12
216 0.18
217 0.22
218 0.25
219 0.28
220 0.36
221 0.43
222 0.5
223 0.54
224 0.56
225 0.62
226 0.65
227 0.66
228 0.64
229 0.6
230 0.52
231 0.45
232 0.38
233 0.34
234 0.27
235 0.24
236 0.18
237 0.14
238 0.14
239 0.16
240 0.14
241 0.13
242 0.21
243 0.22
244 0.25
245 0.29
246 0.29
247 0.3
248 0.32
249 0.34
250 0.28
251 0.3
252 0.29
253 0.29
254 0.29
255 0.3
256 0.34
257 0.37
258 0.34
259 0.33
260 0.34
261 0.39
262 0.45
263 0.5
264 0.54
265 0.56
266 0.62
267 0.67
268 0.7
269 0.66
270 0.66
271 0.59
272 0.52
273 0.45
274 0.4
275 0.38
276 0.33
277 0.28
278 0.21
279 0.19
280 0.17
281 0.2
282 0.24
283 0.22
284 0.26
285 0.31
286 0.37
287 0.38
288 0.39
289 0.36
290 0.31
291 0.32
292 0.35
293 0.32
294 0.28
295 0.33
296 0.32
297 0.32
298 0.36
299 0.39
300 0.41
301 0.51
302 0.57
303 0.6
304 0.67
305 0.7
306 0.69
307 0.66
308 0.6
309 0.54
310 0.48
311 0.39
312 0.31
313 0.26
314 0.21
315 0.18
316 0.14
317 0.1
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.1
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.1
335 0.09
336 0.11
337 0.17
338 0.18
339 0.2
340 0.27