FuNGI

S3CIV0

Protein Details

Accession

S3CIV0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
137-156	VLCVLRMKNRPKNTSRNTVA	Hydrophilic
1046-1065	KLDGDKKSKKQEAKPAQLVQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 19, cyto 6.5, cyto_nucl 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MAYVVPIHRSSSIRHALRIKLFSADEECLAIAKSNRVEIWRFTEHDELVLAHSQRVYGTISMLQALRPKDVTTELLFVGTDRFDFFTLAWDHALQSLQTVDHFYDIGEKHLRDSQSQDRCIVDPSGRYMSLLLWEGVLCVLRMKNRPKNTSRNTVAADSLDWMDQVRLSEMFIKASTFLHSETGHPKVAFLYQSQSDRSETRLSSYRLTSDDANSVASRFDTHRDRELNEDLKDIGSALLIPVEADGSERRHNFRGNSNNNNSAGSGDGEPHLGGLLIVGETRLIYYDGITHNRIEKATSTPAIYVAWAQFDRTHYFVADDQGTLRLLTLITRGPVVTRLDIRPIGKTARASTLVYYPSRSMLFVGSHAGDSQLYRISLSGEAPPSATEGSDDKKASSFCQLVQTFTNVGPIFDFSVVDMGSLDSENGVANEYSSGQARIVTGSGVYRDASLRSIRSGVGLEDAGILGDFSNVRSLYSLRLNPATTPPNKVDTLVVSFLTETRVFTFDGEGDIEEKDSLLGGSLEHQSLWASNITRGSQNLVLRVTSDAATLVDTDGGVTVATWSPPEGKSIISVSANDNWVLLSVDGTLLVSLSLDKDLAVAAQNDFSGTDQIACIHAAPKHQDTGVVSMWTAGTVTVVSLSTLQPAGNSVPFRSKNDSTSVARSIALVQVMPPHLAGPTLFVALDEGTVVMFSYNEKDSTLSAPKSTILGVHHANLHLLPSHDESTKGMYSILATANHPSLIYGSEGRIICAAVTAQDTTSVCPFDSEAFPGAVVLASQTEIKLANVDTMRRTHVQTIPIGETIRRVAYAQGERVFALACIGLEVIRGVEIAKCAIKLVDDVLFQPVGKPLLLTGDKEEFLESLICTELPDAQGTMSERFLVGTSFNSNADSAQGGGVASSYGNDPDDTSTMGRLLVVGIDSERNPYIVSAHRLRGPCRSLAVLADGDSKKIVLGLTRTVIVAEYTEMPLGTQSRLRKVASTRASTMVIDLAVNGRYIAIGDMMKSTAVVEYVPAVEAAGSDDEEEEDDATKVREKDKKYRYMKLDGDKKSKKQEAKPAQLVQVARNYQANWTTAVAALGGPSKTGDAAEDKMATDDTESGETISDKDFLSWLEADAYGNLSVLSYNSQGVTAEDRRRLRVTSEMNLGEMVNRIRRVDVEPTNAETAMVHPQAFLATTEGAVYLFGTVAPAALDLLLRLQARLETVVKGLGTTSFSSYRGFRNTERETSEPSRFLDGEMLERFLDLDEEQQQDVAQGLGPSVEDVRGRIEELRRMH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.5
3	0.53
4	0.59
5	0.59
6	0.51
7	0.46
8	0.44
9	0.41
10	0.39
11	0.33
12	0.26
13	0.23
14	0.22
15	0.17
16	0.17
17	0.17
18	0.15
19	0.18
20	0.19
21	0.22
22	0.24
23	0.27
24	0.3
25	0.32
26	0.37
27	0.38
28	0.38
29	0.39
30	0.43
31	0.39
32	0.36
33	0.33
34	0.26
35	0.23
36	0.27
37	0.23
38	0.19
39	0.19
40	0.19
41	0.17
42	0.18
43	0.18
44	0.13
45	0.14
46	0.15
47	0.16
48	0.18
49	0.18
50	0.19
51	0.21
52	0.22
53	0.23
54	0.22
55	0.22
56	0.22
57	0.24
58	0.26
59	0.24
60	0.25
61	0.22
62	0.22
63	0.21
64	0.19
65	0.17
66	0.14
67	0.11
68	0.1
69	0.11
70	0.11
71	0.12
72	0.12
73	0.17
74	0.19
75	0.2
76	0.19
77	0.18
78	0.18
79	0.19
80	0.2
81	0.13
82	0.12
83	0.12
84	0.11
85	0.11
86	0.13
87	0.12
88	0.12
89	0.12
90	0.1
91	0.16
92	0.16
93	0.21
94	0.25
95	0.25
96	0.27
97	0.32
98	0.34
99	0.29
100	0.36
101	0.4
102	0.44
103	0.46
104	0.46
105	0.43
106	0.43
107	0.43
108	0.4
109	0.33
110	0.26
111	0.29
112	0.31
113	0.28
114	0.28
115	0.25
116	0.23
117	0.23
118	0.22
119	0.17
120	0.12
121	0.12
122	0.12
123	0.12
124	0.12
125	0.08
126	0.09
127	0.12
128	0.17
129	0.25
130	0.35
131	0.44
132	0.53
133	0.63
134	0.69
135	0.77
136	0.79
137	0.82
138	0.77
139	0.74
140	0.69
141	0.61
142	0.55
143	0.45
144	0.37
145	0.29
146	0.25
147	0.18
148	0.14
149	0.12
150	0.11
151	0.11
152	0.11
153	0.11
154	0.1
155	0.11
156	0.16
157	0.16
158	0.17
159	0.16
160	0.16
161	0.15
162	0.16
163	0.17
164	0.14
165	0.14
166	0.16
167	0.16
168	0.19
169	0.24
170	0.27
171	0.29
172	0.27
173	0.26
174	0.24
175	0.27
176	0.25
177	0.21
178	0.22
179	0.23
180	0.26
181	0.28
182	0.28
183	0.28
184	0.27
185	0.3
186	0.3
187	0.26
188	0.28
189	0.34
190	0.34
191	0.36
192	0.37
193	0.36
194	0.32
195	0.34
196	0.31
197	0.26
198	0.26
199	0.23
200	0.23
201	0.2
202	0.18
203	0.16
204	0.14
205	0.14
206	0.13
207	0.19
208	0.23
209	0.27
210	0.34
211	0.37
212	0.38
213	0.42
214	0.48
215	0.48
216	0.42
217	0.4
218	0.33
219	0.29
220	0.28
221	0.22
222	0.14
223	0.08
224	0.07
225	0.06
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.06
233	0.08
234	0.12
235	0.18
236	0.21
237	0.25
238	0.29
239	0.34
240	0.36
241	0.43
242	0.5
243	0.53
244	0.6
245	0.62
246	0.64
247	0.6
248	0.58
249	0.49
250	0.38
251	0.3
252	0.22
253	0.16
254	0.12
255	0.11
256	0.11
257	0.1
258	0.1
259	0.09
260	0.06
261	0.05
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.05
274	0.1
275	0.14
276	0.17
277	0.19
278	0.2
279	0.23
280	0.25
281	0.25
282	0.22
283	0.2
284	0.21
285	0.25
286	0.25
287	0.23
288	0.21
289	0.22
290	0.2
291	0.19
292	0.16
293	0.11
294	0.13
295	0.12
296	0.13
297	0.15
298	0.17
299	0.2
300	0.2
301	0.2
302	0.16
303	0.18
304	0.19
305	0.2
306	0.18
307	0.15
308	0.14
309	0.15
310	0.15
311	0.13
312	0.11
313	0.08
314	0.07
315	0.07
316	0.09
317	0.08
318	0.08
319	0.09
320	0.09
321	0.09
322	0.13
323	0.15
324	0.16
325	0.19
326	0.19
327	0.23
328	0.27
329	0.27
330	0.26
331	0.26
332	0.26
333	0.25
334	0.26
335	0.25
336	0.26
337	0.27
338	0.26
339	0.25
340	0.26
341	0.27
342	0.26
343	0.25
344	0.21
345	0.21
346	0.2
347	0.19
348	0.15
349	0.14
350	0.13
351	0.12
352	0.14
353	0.12
354	0.12
355	0.12
356	0.11
357	0.1
358	0.09
359	0.1
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.09
364	0.1
365	0.1
366	0.11
367	0.13
368	0.12
369	0.12
370	0.12
371	0.12
372	0.12
373	0.11
374	0.1
375	0.08
376	0.09
377	0.12
378	0.16
379	0.17
380	0.16
381	0.18
382	0.19
383	0.19
384	0.23
385	0.21
386	0.18
387	0.27
388	0.27
389	0.26
390	0.27
391	0.27
392	0.23
393	0.22
394	0.26
395	0.17
396	0.16
397	0.15
398	0.14
399	0.14
400	0.12
401	0.12
402	0.06
403	0.08
404	0.08
405	0.07
406	0.06
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.06
420	0.07
421	0.07
422	0.08
423	0.07
424	0.08
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.07
429	0.06
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.07
435	0.08
436	0.09
437	0.11
438	0.12
439	0.12
440	0.12
441	0.13
442	0.13
443	0.13
444	0.13
445	0.11
446	0.1
447	0.09
448	0.08
449	0.07
450	0.07
451	0.06
452	0.05
453	0.05
454	0.03
455	0.04
456	0.04
457	0.04
458	0.06
459	0.07
460	0.07
461	0.08
462	0.08
463	0.11
464	0.16
465	0.17
466	0.17
467	0.2
468	0.2
469	0.2
470	0.25
471	0.28
472	0.25
473	0.27
474	0.27
475	0.29
476	0.29
477	0.28
478	0.24
479	0.2
480	0.21
481	0.18
482	0.16
483	0.12
484	0.12
485	0.11
486	0.13
487	0.11
488	0.09
489	0.09
490	0.1
491	0.1
492	0.11
493	0.11
494	0.09
495	0.09
496	0.09
497	0.08
498	0.07
499	0.07
500	0.07
501	0.06
502	0.06
503	0.05
504	0.05
505	0.04
506	0.04
507	0.04
508	0.03
509	0.06
510	0.07
511	0.07
512	0.07
513	0.07
514	0.07
515	0.07
516	0.08
517	0.08
518	0.08
519	0.09
520	0.11
521	0.12
522	0.13
523	0.13
524	0.15
525	0.17
526	0.17
527	0.18
528	0.17
529	0.16
530	0.15
531	0.16
532	0.14
533	0.1
534	0.09
535	0.07
536	0.07
537	0.07
538	0.06
539	0.06
540	0.04
541	0.04
542	0.04
543	0.04
544	0.04
545	0.03
546	0.03
547	0.04
548	0.04
549	0.04
550	0.04
551	0.05
552	0.07
553	0.07
554	0.09
555	0.08
556	0.08
557	0.1
558	0.11
559	0.12
560	0.1
561	0.11
562	0.12
563	0.14
564	0.14
565	0.13
566	0.12
567	0.1
568	0.1
569	0.09
570	0.07
571	0.05
572	0.04
573	0.04
574	0.04
575	0.04
576	0.03
577	0.03
578	0.03
579	0.03
580	0.02
581	0.03
582	0.03
583	0.03
584	0.03
585	0.03
586	0.03
587	0.04
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.06
592	0.06
593	0.06
594	0.06
595	0.06
596	0.05
597	0.05
598	0.05
599	0.04
600	0.05
601	0.06
602	0.06
603	0.06
604	0.07
605	0.08
606	0.1
607	0.13
608	0.13
609	0.14
610	0.14
611	0.15
612	0.13
613	0.16
614	0.15
615	0.12
616	0.11
617	0.1
618	0.1
619	0.09
620	0.08
621	0.04
622	0.03
623	0.03
624	0.03
625	0.03
626	0.03
627	0.03
628	0.04
629	0.04
630	0.05
631	0.06
632	0.06
633	0.05
634	0.06
635	0.07
636	0.08
637	0.09
638	0.09
639	0.15
640	0.17
641	0.2
642	0.25
643	0.25
644	0.25
645	0.28
646	0.32
647	0.28
648	0.3
649	0.29
650	0.24
651	0.22
652	0.2
653	0.18
654	0.14
655	0.12
656	0.08
657	0.06
658	0.08
659	0.08
660	0.08
661	0.07
662	0.06
663	0.06
664	0.07
665	0.06
666	0.06
667	0.06
668	0.06
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.06
674	0.04
675	0.03
676	0.03
677	0.03
678	0.03
679	0.02
680	0.03
681	0.03
682	0.05
683	0.06
684	0.06
685	0.07
686	0.08
687	0.08
688	0.12
689	0.16
690	0.14
691	0.14
692	0.15
693	0.15
694	0.15
695	0.14
696	0.12
697	0.09
698	0.12
699	0.12
700	0.13
701	0.14
702	0.13
703	0.13
704	0.11
705	0.11
706	0.08
707	0.08
708	0.09
709	0.1
710	0.12
711	0.12
712	0.12
713	0.13
714	0.15
715	0.15
716	0.13
717	0.11
718	0.09
719	0.09
720	0.11
721	0.12
722	0.09
723	0.09
724	0.1
725	0.11
726	0.11
727	0.1
728	0.08
729	0.07
730	0.07
731	0.08
732	0.07
733	0.07
734	0.12
735	0.12
736	0.12
737	0.12
738	0.11
739	0.09
740	0.09
741	0.09
742	0.05
743	0.06
744	0.06
745	0.05
746	0.08
747	0.08
748	0.09
749	0.1
750	0.1
751	0.09
752	0.09
753	0.09
754	0.09
755	0.1
756	0.1
757	0.1
758	0.1
759	0.1
760	0.09
761	0.09
762	0.06
763	0.05
764	0.04
765	0.03
766	0.04
767	0.04
768	0.04
769	0.05
770	0.05
771	0.05
772	0.06
773	0.06
774	0.1
775	0.11
776	0.12
777	0.13
778	0.15
779	0.18
780	0.19
781	0.2
782	0.21
783	0.24
784	0.25
785	0.25
786	0.27
787	0.25
788	0.25
789	0.24
790	0.19
791	0.17
792	0.15
793	0.14
794	0.11
795	0.1
796	0.1
797	0.15
798	0.18
799	0.21
800	0.21
801	0.22
802	0.21
803	0.21
804	0.2
805	0.13
806	0.11
807	0.07
808	0.05
809	0.04
810	0.04
811	0.04
812	0.04
813	0.04
814	0.03
815	0.03
816	0.03
817	0.04
818	0.04
819	0.05
820	0.06
821	0.07
822	0.07
823	0.07
824	0.07
825	0.07
826	0.07
827	0.08
828	0.09
829	0.09
830	0.09
831	0.11
832	0.11
833	0.11
834	0.11
835	0.11
836	0.1
837	0.09
838	0.08
839	0.07
840	0.13
841	0.14
842	0.14
843	0.16
844	0.17
845	0.18
846	0.18
847	0.18
848	0.12
849	0.12
850	0.12
851	0.09
852	0.07
853	0.07
854	0.07
855	0.06
856	0.07
857	0.07
858	0.07
859	0.08
860	0.07
861	0.06
862	0.09
863	0.1
864	0.11
865	0.1
866	0.1
867	0.09
868	0.1
869	0.1
870	0.08
871	0.07
872	0.07
873	0.09
874	0.1
875	0.11
876	0.11
877	0.11
878	0.11
879	0.11
880	0.09
881	0.08
882	0.06
883	0.06
884	0.05
885	0.05
886	0.05
887	0.04
888	0.04
889	0.04
890	0.04
891	0.05
892	0.06
893	0.06
894	0.07
895	0.08
896	0.09
897	0.1
898	0.1
899	0.1
900	0.1
901	0.1
902	0.09
903	0.07
904	0.07
905	0.05
906	0.05
907	0.05
908	0.05
909	0.07
910	0.07
911	0.09
912	0.09
913	0.09
914	0.09
915	0.09
916	0.11
917	0.14
918	0.2
919	0.22
920	0.25
921	0.3
922	0.32
923	0.34
924	0.39
925	0.38
926	0.33
927	0.31
928	0.3
929	0.26
930	0.24
931	0.25
932	0.18
933	0.16
934	0.21
935	0.19
936	0.18
937	0.17
938	0.16
939	0.13
940	0.14
941	0.13
942	0.08
943	0.1
944	0.12
945	0.13
946	0.14
947	0.14
948	0.13
949	0.13
950	0.11
951	0.09
952	0.08
953	0.08
954	0.08
955	0.09
956	0.08
957	0.08
958	0.09
959	0.1
960	0.1
961	0.14
962	0.16
963	0.22
964	0.27
965	0.27
966	0.31
967	0.33
968	0.42
969	0.44
970	0.46
971	0.43
972	0.42
973	0.42
974	0.37
975	0.34
976	0.25
977	0.18
978	0.13
979	0.11
980	0.09
981	0.08
982	0.08
983	0.07
984	0.06
985	0.06
986	0.06
987	0.06
988	0.06
989	0.06
990	0.07
991	0.08
992	0.08
993	0.08
994	0.08
995	0.08
996	0.06
997	0.06
998	0.06
999	0.05
1000	0.06
1001	0.06
1002	0.07
1003	0.06
1004	0.06
1005	0.05
1006	0.05
1007	0.07
1008	0.06
1009	0.06
1010	0.06
1011	0.06
1012	0.07
1013	0.07
1014	0.08
1015	0.07
1016	0.07
1017	0.07
1018	0.08
1019	0.08
1020	0.13
1021	0.15
1022	0.22
1023	0.28
1024	0.33
1025	0.44
1026	0.53
1027	0.63
1028	0.65
1029	0.73
1030	0.72
1031	0.75
1032	0.76
1033	0.76
1034	0.76
1035	0.74
1036	0.77
1037	0.76
1038	0.76
1039	0.77
1040	0.77
1041	0.76
1042	0.74
1043	0.77
1044	0.77
1045	0.79
1046	0.81
1047	0.76
1048	0.72
1049	0.68
1050	0.61
1051	0.53
1052	0.5
1053	0.41
1054	0.34
1055	0.32
1056	0.29
1057	0.28
1058	0.29
1059	0.27
1060	0.21
1061	0.21
1062	0.2
1063	0.17
1064	0.17
1065	0.13
1066	0.1
1067	0.1
1068	0.11
1069	0.09
1070	0.09
1071	0.09
1072	0.09
1073	0.09
1074	0.09
1075	0.1
1076	0.1
1077	0.12
1078	0.15
1079	0.15
1080	0.15
1081	0.16
1082	0.16
1083	0.14
1084	0.12
1085	0.11
1086	0.11
1087	0.11
1088	0.11
1089	0.1
1090	0.11
1091	0.11
1092	0.11
1093	0.12
1094	0.12
1095	0.1
1096	0.11
1097	0.11
1098	0.11
1099	0.14
1100	0.13
1101	0.12
1102	0.12
1103	0.13
1104	0.13
1105	0.12
1106	0.14
1107	0.1
1108	0.1
1109	0.09
1110	0.07
1111	0.07
1112	0.07
1113	0.09
1114	0.08
1115	0.09
1116	0.09
1117	0.1
1118	0.1
1119	0.11
1120	0.17
1121	0.23
1122	0.28
1123	0.35
1124	0.38
1125	0.42
1126	0.44
1127	0.45
1128	0.41
1129	0.43
1130	0.43
1131	0.41
1132	0.46
1133	0.42
1134	0.4
1135	0.39
1136	0.36
1137	0.28
1138	0.25
1139	0.22
1140	0.2
1141	0.21
1142	0.21
1143	0.22
1144	0.24
1145	0.27
1146	0.32
1147	0.35
1148	0.36
1149	0.38
1150	0.41
1151	0.42
1152	0.4
1153	0.35
1154	0.27
1155	0.23
1156	0.23
1157	0.22
1158	0.18
1159	0.15
1160	0.16
1161	0.16
1162	0.17
1163	0.15
1164	0.1
1165	0.09
1166	0.09
1167	0.1
1168	0.09
1169	0.09
1170	0.08
1171	0.08
1172	0.05
1173	0.05
1174	0.05
1175	0.05
1176	0.05
1177	0.05
1178	0.05
1179	0.05
1180	0.05
1181	0.05
1182	0.05
1183	0.05
1184	0.06
1185	0.1
1186	0.1
1187	0.1
1188	0.11
1189	0.11
1190	0.13
1191	0.17
1192	0.17
1193	0.15
1194	0.16
1195	0.18
1196	0.17
1197	0.16
1198	0.15
1199	0.13
1200	0.14
1201	0.15
1202	0.18
1203	0.18
1204	0.19
1205	0.22
1206	0.24
1207	0.28
1208	0.31
1209	0.35
1210	0.35
1211	0.43
1212	0.48
1213	0.53
1214	0.56
1215	0.53
1216	0.56
1217	0.57
1218	0.59
1219	0.52
1220	0.48
1221	0.47
1222	0.41
1223	0.39
1224	0.35
1225	0.3
1226	0.3
1227	0.28
1228	0.28
1229	0.22
1230	0.22
1231	0.21
1232	0.16
1233	0.17
1234	0.11
1235	0.13
1236	0.16
1237	0.19
1238	0.19
1239	0.19
1240	0.19
1241	0.17
1242	0.17
1243	0.14
1244	0.1
1245	0.08
1246	0.08
1247	0.08
1248	0.08
1249	0.09
1250	0.09
1251	0.11
1252	0.1
1253	0.11
1254	0.15
1255	0.16
1256	0.18
1257	0.23
1258	0.27

S3CIV0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer