Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CHA6

Protein Details
Accession S3CHA6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-161IAGGRKRKRVKDKDGLKGVKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-164GRKRKRVKDKDGLKGVKIRR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039845  FAM192A  
IPR019331  FAM192A/Fyv6_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG glz:GLAREA_11826  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10187  FAM192A_Fyv6_N  
Amino Acid Sequences MSSGFVSGGTADAPIARDEAWLSAQREIEANIQKKAIEARRQTDGKSLYETLEANKAAKQDAFEEANRLKNQFRALDQDEVEFLDSVLESTRAEEARVKKETAEGLALFRQQQDEADRKARTGDEPTAQLRIGSQVAEGAWIAGGRKRKRVKDKDGLKGVKIRRSSTSDNHAQTQEPGVLTKTREVKEPNAAKVDTVSSAATRGDVSDATSEHHGEGTKLSKVTALVSYGSDDDDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.08
4 0.09
5 0.09
6 0.11
7 0.14
8 0.18
9 0.2
10 0.22
11 0.23
12 0.23
13 0.23
14 0.24
15 0.27
16 0.3
17 0.31
18 0.3
19 0.3
20 0.29
21 0.3
22 0.36
23 0.37
24 0.37
25 0.41
26 0.43
27 0.5
28 0.52
29 0.52
30 0.51
31 0.47
32 0.4
33 0.38
34 0.35
35 0.28
36 0.28
37 0.28
38 0.22
39 0.23
40 0.22
41 0.18
42 0.18
43 0.18
44 0.17
45 0.17
46 0.17
47 0.13
48 0.17
49 0.2
50 0.18
51 0.23
52 0.23
53 0.29
54 0.29
55 0.29
56 0.26
57 0.26
58 0.3
59 0.27
60 0.26
61 0.27
62 0.29
63 0.32
64 0.31
65 0.28
66 0.25
67 0.22
68 0.21
69 0.14
70 0.1
71 0.06
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.04
77 0.05
78 0.08
79 0.07
80 0.08
81 0.13
82 0.17
83 0.23
84 0.26
85 0.25
86 0.23
87 0.25
88 0.25
89 0.21
90 0.19
91 0.13
92 0.12
93 0.13
94 0.14
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.09
99 0.1
100 0.12
101 0.14
102 0.17
103 0.22
104 0.22
105 0.21
106 0.22
107 0.22
108 0.2
109 0.2
110 0.19
111 0.16
112 0.18
113 0.19
114 0.19
115 0.19
116 0.17
117 0.13
118 0.12
119 0.11
120 0.08
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.06
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.06
131 0.14
132 0.16
133 0.25
134 0.32
135 0.41
136 0.52
137 0.62
138 0.69
139 0.72
140 0.79
141 0.8
142 0.83
143 0.77
144 0.68
145 0.66
146 0.61
147 0.57
148 0.51
149 0.44
150 0.39
151 0.43
152 0.46
153 0.43
154 0.47
155 0.48
156 0.48
157 0.49
158 0.45
159 0.39
160 0.35
161 0.32
162 0.26
163 0.18
164 0.16
165 0.14
166 0.16
167 0.16
168 0.2
169 0.26
170 0.24
171 0.3
172 0.33
173 0.35
174 0.43
175 0.48
176 0.47
177 0.45
178 0.44
179 0.39
180 0.36
181 0.33
182 0.24
183 0.2
184 0.16
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.11
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.13
197 0.15
198 0.16
199 0.14
200 0.16
201 0.15
202 0.13
203 0.17
204 0.18
205 0.2
206 0.2
207 0.2
208 0.2
209 0.2
210 0.22
211 0.2
212 0.18
213 0.15
214 0.16
215 0.18
216 0.16
217 0.16