Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DF09

Protein Details
Accession S3DF09    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
84-124SEPVDALKRKRKKEYVNGEDEGGREKKAPKKTKAPLPPKANBasic
228-258VTAKDKEKEKERQRTKARDKQKIIKKTQKLDBasic
363-384VSEGKEVFKKSKKKEDETSLDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
91-121KRKRKKEYVNGEDEGGREKKAPKKTKAPLPP
233-253KEKEKERQRTKARDKQKIIKK
Subcellular Location(s) cyto 15, cyto_nucl 13.833, nucl 10.5, mito_nucl 6.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
IPR034392  TatSF1-like_RRM1  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG glz:GLAREA_11819  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12281  RRM1_TatSF1_like  
cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MNGTPSTSSSAAGTAASSFPTDPSEFDADDRISFSKLDNKFLLVVADGTEYEFDDAIKRWIPVVDEALLEQQQKAYQVEGVDESEPVDALKRKRKKEYVNGEDEGGREKKAPKKTKAPLPPKANTAVYVTGLPFDVTIPEVHEVFSRKCGVIAEEIDSGAPRIKLYTDSKGIFKGDALIVFFKPPSVDMAIMLLDDTQFRMADGEGSGRMRVQAADMSYKRVQNDTEVTAKDKEKEKERQRTKARDKQKIIKKTQKLDARLADWSDDEPSAIQETSSRFDKVVILKHMFSLAELADDPAAILDIKEDIREECSKLGEVTNVVLFDLEEEGIASVRFTNAEAAKACVILMNGRNFDGQKVEAYVSEGKEVFKKSKKKEDETSLDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.1
4 0.11
5 0.1
6 0.11
7 0.15
8 0.15
9 0.14
10 0.19
11 0.22
12 0.21
13 0.22
14 0.26
15 0.23
16 0.22
17 0.24
18 0.2
19 0.17
20 0.17
21 0.18
22 0.22
23 0.23
24 0.29
25 0.28
26 0.28
27 0.28
28 0.28
29 0.27
30 0.19
31 0.17
32 0.12
33 0.12
34 0.1
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.08
41 0.09
42 0.1
43 0.13
44 0.15
45 0.14
46 0.15
47 0.16
48 0.18
49 0.18
50 0.2
51 0.18
52 0.17
53 0.17
54 0.19
55 0.19
56 0.18
57 0.16
58 0.14
59 0.14
60 0.16
61 0.16
62 0.14
63 0.14
64 0.13
65 0.15
66 0.15
67 0.15
68 0.13
69 0.13
70 0.12
71 0.1
72 0.1
73 0.08
74 0.11
75 0.14
76 0.2
77 0.3
78 0.38
79 0.45
80 0.55
81 0.64
82 0.7
83 0.76
84 0.81
85 0.8
86 0.8
87 0.74
88 0.66
89 0.58
90 0.48
91 0.43
92 0.33
93 0.24
94 0.19
95 0.24
96 0.3
97 0.39
98 0.48
99 0.5
100 0.6
101 0.67
102 0.74
103 0.79
104 0.81
105 0.81
106 0.8
107 0.76
108 0.69
109 0.65
110 0.56
111 0.47
112 0.4
113 0.31
114 0.23
115 0.21
116 0.17
117 0.13
118 0.12
119 0.11
120 0.08
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.1
130 0.13
131 0.13
132 0.16
133 0.17
134 0.15
135 0.16
136 0.16
137 0.15
138 0.15
139 0.16
140 0.15
141 0.13
142 0.13
143 0.12
144 0.12
145 0.11
146 0.09
147 0.08
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.11
152 0.15
153 0.19
154 0.22
155 0.23
156 0.25
157 0.26
158 0.26
159 0.21
160 0.18
161 0.15
162 0.11
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.09
167 0.1
168 0.1
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.05
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.07
201 0.08
202 0.14
203 0.15
204 0.2
205 0.22
206 0.24
207 0.24
208 0.24
209 0.23
210 0.2
211 0.22
212 0.2
213 0.22
214 0.21
215 0.23
216 0.25
217 0.26
218 0.27
219 0.3
220 0.32
221 0.36
222 0.45
223 0.52
224 0.6
225 0.66
226 0.72
227 0.75
228 0.82
229 0.85
230 0.84
231 0.84
232 0.84
233 0.83
234 0.83
235 0.83
236 0.82
237 0.82
238 0.83
239 0.8
240 0.77
241 0.78
242 0.75
243 0.7
244 0.67
245 0.6
246 0.52
247 0.47
248 0.41
249 0.34
250 0.27
251 0.23
252 0.18
253 0.14
254 0.12
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.09
259 0.08
260 0.09
261 0.11
262 0.15
263 0.17
264 0.17
265 0.15
266 0.16
267 0.21
268 0.23
269 0.28
270 0.31
271 0.31
272 0.31
273 0.31
274 0.32
275 0.27
276 0.23
277 0.17
278 0.11
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.05
286 0.06
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.06
291 0.06
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.13
296 0.15
297 0.17
298 0.17
299 0.18
300 0.19
301 0.19
302 0.2
303 0.17
304 0.15
305 0.15
306 0.15
307 0.13
308 0.12
309 0.11
310 0.1
311 0.09
312 0.09
313 0.07
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.12
325 0.13
326 0.17
327 0.18
328 0.2
329 0.2
330 0.2
331 0.19
332 0.15
333 0.14
334 0.16
335 0.21
336 0.24
337 0.25
338 0.26
339 0.29
340 0.28
341 0.29
342 0.27
343 0.23
344 0.19
345 0.2
346 0.2
347 0.18
348 0.21
349 0.24
350 0.22
351 0.25
352 0.24
353 0.23
354 0.27
355 0.31
356 0.36
357 0.4
358 0.49
359 0.54
360 0.64
361 0.72
362 0.76
363 0.81
364 0.83