Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q59S50

Protein Details
Accession Q59S50    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-43NQNVKVSGGRWKDRRKLQLAHydrophilic
692-718NSNYSESKKGKKEDPRKKMLRMAKMAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
252-259KKKSEKAR
699-713KKGKKEDPRKKMLRM
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR025313  DUF4217  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG cal:CAALFM_C701200CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF13959  DUF4217  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17949  DEADc_DDX31  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MDDDDELLLNFAAPDTSSVAASKNQNVKVSGGRWKDRRKLQLALQGRTKKRQPETGVNLIPVDESKRKRDSEDKVQLDSNKRSKFTESKGENGGKGDSYVSSLFTNNQPTSHLAPTSTTKELTYLPSNAPMKDATNFSGLGLNEKLSIHLTDHLRFMHPTKIQQLVIPSLISTENDLFVKAQTGSGKTLAFVLPIFHKLMRENKFKINRESGLFAIILTPTRELATQIYGVLETLTRCHHWIVPGIVIGGEKKKSEKARLRKGCNILVATPGRLADHLENTKTLDISQLRWLVLDEGDKLMELGFEDTIAQITAKIDSNSKIADTAEKWQGLPSRRINMLCSATLHSNVKKLGSIVLKDPEMISVETASVAGTVSFDETIATTTSTAPDQLIQNVVVVPPKLRLVTLDALLLKISKHSAERTIVFFSCSDSVDFHFDVFTRDGKKFKKVTDEETGEVKTVLVSPEDDENDGLLTAPQLSDNTIIYKLHGSLSQQTRASTLQSFVKDNNSYNKILFCTDVASRGLDLPNVANVIEYDPPFTIDDHLHRIGRSARLGNEGNATLFLLPGIEEGYVDGKLRVAHPREGNLRVKNYEKILQEGFAQGNIKSKDNKLGKWDIHATTWHLDVERWLLEDQASHDEAVRAFTSHIRAYATHLSSEREFFNVKLLHLGHLAKSFGLRETPKKLGKSVGNNSNYSESKKGKKEDPRKKMLRMAKMAVKSASSEFNY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.09
3 0.1
4 0.11
5 0.11
6 0.13
7 0.18
8 0.23
9 0.29
10 0.35
11 0.38
12 0.42
13 0.43
14 0.44
15 0.45
16 0.46
17 0.47
18 0.48
19 0.52
20 0.58
21 0.66
22 0.72
23 0.75
24 0.8
25 0.77
26 0.76
27 0.75
28 0.76
29 0.75
30 0.72
31 0.73
32 0.72
33 0.72
34 0.74
35 0.72
36 0.72
37 0.69
38 0.72
39 0.7
40 0.72
41 0.74
42 0.75
43 0.72
44 0.64
45 0.57
46 0.48
47 0.4
48 0.3
49 0.28
50 0.26
51 0.28
52 0.33
53 0.4
54 0.42
55 0.48
56 0.56
57 0.58
58 0.62
59 0.68
60 0.65
61 0.62
62 0.66
63 0.66
64 0.65
65 0.66
66 0.63
67 0.59
68 0.56
69 0.55
70 0.57
71 0.58
72 0.56
73 0.58
74 0.53
75 0.52
76 0.58
77 0.6
78 0.54
79 0.48
80 0.43
81 0.32
82 0.29
83 0.25
84 0.16
85 0.16
86 0.14
87 0.14
88 0.13
89 0.14
90 0.16
91 0.19
92 0.26
93 0.23
94 0.23
95 0.24
96 0.27
97 0.31
98 0.31
99 0.28
100 0.21
101 0.24
102 0.28
103 0.31
104 0.29
105 0.26
106 0.23
107 0.24
108 0.25
109 0.27
110 0.26
111 0.24
112 0.23
113 0.31
114 0.33
115 0.31
116 0.31
117 0.27
118 0.25
119 0.25
120 0.26
121 0.2
122 0.2
123 0.2
124 0.18
125 0.21
126 0.19
127 0.2
128 0.18
129 0.16
130 0.16
131 0.16
132 0.16
133 0.13
134 0.14
135 0.12
136 0.17
137 0.2
138 0.2
139 0.23
140 0.23
141 0.24
142 0.25
143 0.25
144 0.27
145 0.27
146 0.29
147 0.31
148 0.35
149 0.33
150 0.34
151 0.35
152 0.29
153 0.27
154 0.23
155 0.19
156 0.15
157 0.15
158 0.13
159 0.13
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.13
167 0.1
168 0.12
169 0.13
170 0.15
171 0.16
172 0.18
173 0.17
174 0.15
175 0.17
176 0.15
177 0.13
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.13
182 0.14
183 0.13
184 0.15
185 0.18
186 0.27
187 0.33
188 0.38
189 0.4
190 0.48
191 0.56
192 0.6
193 0.63
194 0.61
195 0.57
196 0.52
197 0.51
198 0.42
199 0.35
200 0.29
201 0.22
202 0.16
203 0.13
204 0.11
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.08
219 0.07
220 0.06
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.1
225 0.12
226 0.13
227 0.14
228 0.18
229 0.18
230 0.17
231 0.16
232 0.15
233 0.14
234 0.13
235 0.13
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.13
240 0.19
241 0.23
242 0.33
243 0.41
244 0.49
245 0.59
246 0.68
247 0.73
248 0.75
249 0.76
250 0.7
251 0.64
252 0.55
253 0.45
254 0.41
255 0.35
256 0.27
257 0.22
258 0.19
259 0.15
260 0.13
261 0.14
262 0.1
263 0.15
264 0.17
265 0.17
266 0.17
267 0.18
268 0.19
269 0.17
270 0.15
271 0.14
272 0.13
273 0.14
274 0.19
275 0.2
276 0.19
277 0.19
278 0.19
279 0.15
280 0.15
281 0.14
282 0.1
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.06
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.06
301 0.07
302 0.08
303 0.09
304 0.1
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.09
310 0.11
311 0.11
312 0.14
313 0.17
314 0.17
315 0.17
316 0.18
317 0.23
318 0.24
319 0.29
320 0.28
321 0.29
322 0.31
323 0.32
324 0.31
325 0.3
326 0.29
327 0.23
328 0.21
329 0.19
330 0.17
331 0.19
332 0.2
333 0.16
334 0.16
335 0.16
336 0.15
337 0.14
338 0.13
339 0.16
340 0.15
341 0.16
342 0.15
343 0.17
344 0.17
345 0.16
346 0.16
347 0.12
348 0.11
349 0.1
350 0.08
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.05
356 0.03
357 0.03
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.04
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.07
374 0.06
375 0.07
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.11
392 0.13
393 0.13
394 0.14
395 0.13
396 0.13
397 0.13
398 0.12
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.08
404 0.1
405 0.13
406 0.16
407 0.18
408 0.19
409 0.22
410 0.21
411 0.2
412 0.18
413 0.17
414 0.15
415 0.14
416 0.12
417 0.1
418 0.11
419 0.14
420 0.14
421 0.12
422 0.11
423 0.11
424 0.13
425 0.13
426 0.15
427 0.15
428 0.16
429 0.22
430 0.24
431 0.32
432 0.34
433 0.35
434 0.43
435 0.42
436 0.46
437 0.49
438 0.5
439 0.44
440 0.43
441 0.41
442 0.31
443 0.28
444 0.22
445 0.13
446 0.1
447 0.09
448 0.07
449 0.07
450 0.07
451 0.1
452 0.11
453 0.11
454 0.1
455 0.1
456 0.09
457 0.09
458 0.08
459 0.05
460 0.05
461 0.04
462 0.04
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.07
467 0.07
468 0.09
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.11
473 0.11
474 0.11
475 0.12
476 0.12
477 0.19
478 0.23
479 0.28
480 0.28
481 0.27
482 0.28
483 0.28
484 0.28
485 0.21
486 0.19
487 0.19
488 0.2
489 0.22
490 0.21
491 0.27
492 0.26
493 0.28
494 0.33
495 0.32
496 0.32
497 0.31
498 0.31
499 0.27
500 0.25
501 0.23
502 0.16
503 0.14
504 0.14
505 0.15
506 0.14
507 0.14
508 0.13
509 0.14
510 0.15
511 0.12
512 0.12
513 0.1
514 0.1
515 0.1
516 0.09
517 0.07
518 0.07
519 0.09
520 0.11
521 0.1
522 0.11
523 0.11
524 0.13
525 0.13
526 0.13
527 0.14
528 0.14
529 0.17
530 0.21
531 0.24
532 0.24
533 0.23
534 0.26
535 0.27
536 0.29
537 0.3
538 0.28
539 0.26
540 0.31
541 0.32
542 0.3
543 0.3
544 0.26
545 0.22
546 0.19
547 0.17
548 0.11
549 0.1
550 0.08
551 0.05
552 0.05
553 0.04
554 0.05
555 0.04
556 0.04
557 0.05
558 0.07
559 0.07
560 0.08
561 0.08
562 0.08
563 0.1
564 0.12
565 0.2
566 0.22
567 0.29
568 0.31
569 0.37
570 0.42
571 0.48
572 0.53
573 0.51
574 0.53
575 0.5
576 0.51
577 0.49
578 0.47
579 0.47
580 0.41
581 0.39
582 0.35
583 0.32
584 0.29
585 0.28
586 0.25
587 0.21
588 0.2
589 0.16
590 0.23
591 0.24
592 0.26
593 0.27
594 0.29
595 0.36
596 0.4
597 0.43
598 0.43
599 0.49
600 0.47
601 0.5
602 0.54
603 0.46
604 0.43
605 0.42
606 0.38
607 0.32
608 0.31
609 0.26
610 0.2
611 0.18
612 0.18
613 0.19
614 0.16
615 0.16
616 0.15
617 0.14
618 0.14
619 0.15
620 0.16
621 0.18
622 0.18
623 0.16
624 0.17
625 0.18
626 0.18
627 0.2
628 0.17
629 0.13
630 0.14
631 0.17
632 0.2
633 0.2
634 0.21
635 0.2
636 0.2
637 0.25
638 0.33
639 0.31
640 0.3
641 0.3
642 0.33
643 0.33
644 0.35
645 0.3
646 0.24
647 0.24
648 0.21
649 0.27
650 0.25
651 0.24
652 0.27
653 0.27
654 0.26
655 0.29
656 0.3
657 0.25
658 0.26
659 0.26
660 0.2
661 0.21
662 0.21
663 0.18
664 0.23
665 0.26
666 0.3
667 0.36
668 0.45
669 0.5
670 0.51
671 0.52
672 0.54
673 0.57
674 0.6
675 0.63
676 0.64
677 0.62
678 0.61
679 0.61
680 0.6
681 0.54
682 0.49
683 0.47
684 0.44
685 0.48
686 0.55
687 0.59
688 0.61
689 0.69
690 0.76
691 0.79
692 0.83
693 0.85
694 0.85
695 0.86
696 0.86
697 0.85
698 0.84
699 0.81
700 0.78
701 0.75
702 0.71
703 0.68
704 0.6
705 0.52
706 0.44
707 0.39