Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DTA8

Protein Details
Accession S3DTA8    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
162-184IEPSKTKPPPVPKPNKAKVTKNVHydrophilic
198-220PYENITKKRKDKAKDRSDRFWEIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
206-207RK
296-367GKKVVKPISRTGSGAEKAKVNTKTAEEKALEKAKSAEEKARDKAKATQLKEAAKEEEKERKRLARKEADRQK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12.666, mito_nucl 10.666, cyto 6, cyto_mito 4.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042530  EME1/EME2_C  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR033310  Mms4/EME1/EME2  
IPR047521  XPF_nuclease_EME1_ascomycetes  
Gene Ontology GO:0048476  C:Holliday junction resolvase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0051321  P:meiotic cell cycle  
KEGG glz:GLAREA_10882  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20085  XPF_nuclease_Mms4  
Amino Acid Sequences MPGDVIDLVSSSPPPQSPKPVANKEHGQNNTIRSLAGAAAAARALSSATKPVEKDDWFTISSDGLGPDTYSLPKRSLEPPNTSASSFTKVTKVSTSSKPAESISKNSGANDFFLLSDDFDSTVNFDDSFAQQEPAPKRRRVSSSPALLPPKERPYQRSISNIEPSKTKPPPVPKPNKAKVTKNVVDLDPIVFTSSPDPYENITKKRKDKAKDRSDRFWEISSDNEESVSQTKPVTGKTTAIFKSTVNDDGFLSLTDDEEGFPELHDFSSLPKRSTTYQSSAALRKYNDAREAEKTGKKVVKPISRTGSGAEKAKVNTKTAEEKALEKAKSAEEKARDKAKATQLKEAAKEEEKERKRLARKEADRQKEFAKELAKVNTAKTDKKVSTPEMIIEVASAIDPIIKAQVEKMASSLQVDFKEWNSSKPIVKWKRKVTSQYNEELGHWEPVPLVIKPENHILYVMEMKVLVELALGNEENNLDHHVLQLKSQHPNAKLIYLIEGMLPWSRKNKGNKNKQFAAAVNSHLAPPTGTQRKKKIPDYVDEEIIEEALLQLQIVHEALIHHTAARIETAEWIMAFTQHISTIPYRAEKEALDTAFCMESGQVKTGVDAEDTFVKMLQEILRLTSSCAYGIAGKYPDVPALIRGFEQHGPGMLEDLRKVANRNGAVTDKRIGPSISRRVYSIFMGRDPGSTDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.25
3 0.34
4 0.4
5 0.48
6 0.58
7 0.65
8 0.67
9 0.69
10 0.73
11 0.71
12 0.73
13 0.67
14 0.6
15 0.55
16 0.54
17 0.49
18 0.41
19 0.34
20 0.25
21 0.24
22 0.2
23 0.16
24 0.13
25 0.09
26 0.09
27 0.1
28 0.09
29 0.07
30 0.07
31 0.06
32 0.07
33 0.08
34 0.13
35 0.16
36 0.2
37 0.2
38 0.25
39 0.31
40 0.32
41 0.35
42 0.34
43 0.35
44 0.32
45 0.33
46 0.29
47 0.23
48 0.22
49 0.18
50 0.15
51 0.12
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.12
56 0.15
57 0.18
58 0.19
59 0.21
60 0.22
61 0.26
62 0.33
63 0.41
64 0.45
65 0.48
66 0.5
67 0.54
68 0.55
69 0.51
70 0.47
71 0.39
72 0.37
73 0.31
74 0.3
75 0.27
76 0.26
77 0.28
78 0.29
79 0.31
80 0.32
81 0.37
82 0.43
83 0.43
84 0.44
85 0.44
86 0.42
87 0.45
88 0.42
89 0.41
90 0.39
91 0.4
92 0.39
93 0.38
94 0.4
95 0.32
96 0.3
97 0.26
98 0.21
99 0.15
100 0.16
101 0.15
102 0.12
103 0.12
104 0.11
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.11
110 0.11
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.12
115 0.16
116 0.16
117 0.15
118 0.15
119 0.23
120 0.29
121 0.36
122 0.43
123 0.43
124 0.46
125 0.53
126 0.59
127 0.58
128 0.6
129 0.6
130 0.62
131 0.63
132 0.66
133 0.64
134 0.58
135 0.55
136 0.53
137 0.51
138 0.49
139 0.47
140 0.44
141 0.47
142 0.52
143 0.54
144 0.54
145 0.52
146 0.52
147 0.57
148 0.56
149 0.5
150 0.47
151 0.46
152 0.47
153 0.46
154 0.43
155 0.41
156 0.47
157 0.57
158 0.64
159 0.71
160 0.71
161 0.79
162 0.84
163 0.87
164 0.84
165 0.81
166 0.79
167 0.78
168 0.73
169 0.68
170 0.63
171 0.54
172 0.49
173 0.41
174 0.33
175 0.23
176 0.19
177 0.14
178 0.1
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.12
184 0.13
185 0.14
186 0.23
187 0.28
188 0.34
189 0.42
190 0.48
191 0.54
192 0.62
193 0.68
194 0.68
195 0.74
196 0.76
197 0.79
198 0.82
199 0.82
200 0.82
201 0.81
202 0.78
203 0.7
204 0.61
205 0.52
206 0.42
207 0.38
208 0.33
209 0.27
210 0.21
211 0.19
212 0.17
213 0.15
214 0.17
215 0.15
216 0.11
217 0.1
218 0.12
219 0.13
220 0.15
221 0.17
222 0.17
223 0.19
224 0.19
225 0.27
226 0.26
227 0.26
228 0.25
229 0.21
230 0.23
231 0.22
232 0.25
233 0.18
234 0.18
235 0.16
236 0.16
237 0.16
238 0.13
239 0.12
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.08
255 0.18
256 0.2
257 0.2
258 0.2
259 0.22
260 0.25
261 0.31
262 0.33
263 0.28
264 0.32
265 0.34
266 0.38
267 0.39
268 0.39
269 0.36
270 0.31
271 0.31
272 0.31
273 0.3
274 0.31
275 0.3
276 0.3
277 0.3
278 0.34
279 0.35
280 0.34
281 0.32
282 0.34
283 0.35
284 0.33
285 0.36
286 0.4
287 0.41
288 0.42
289 0.47
290 0.46
291 0.44
292 0.44
293 0.39
294 0.36
295 0.31
296 0.3
297 0.25
298 0.22
299 0.22
300 0.28
301 0.28
302 0.24
303 0.23
304 0.23
305 0.28
306 0.26
307 0.3
308 0.24
309 0.24
310 0.28
311 0.32
312 0.29
313 0.24
314 0.24
315 0.23
316 0.25
317 0.25
318 0.24
319 0.24
320 0.28
321 0.32
322 0.37
323 0.35
324 0.33
325 0.39
326 0.43
327 0.45
328 0.43
329 0.45
330 0.43
331 0.46
332 0.46
333 0.41
334 0.35
335 0.29
336 0.29
337 0.26
338 0.31
339 0.3
340 0.33
341 0.34
342 0.38
343 0.44
344 0.49
345 0.54
346 0.55
347 0.58
348 0.65
349 0.71
350 0.73
351 0.67
352 0.63
353 0.57
354 0.52
355 0.46
356 0.39
357 0.32
358 0.26
359 0.27
360 0.28
361 0.28
362 0.24
363 0.24
364 0.27
365 0.28
366 0.27
367 0.26
368 0.3
369 0.28
370 0.31
371 0.34
372 0.3
373 0.31
374 0.29
375 0.27
376 0.22
377 0.22
378 0.17
379 0.13
380 0.1
381 0.07
382 0.06
383 0.05
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.05
392 0.09
393 0.09
394 0.09
395 0.1
396 0.1
397 0.1
398 0.12
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.13
403 0.13
404 0.12
405 0.21
406 0.2
407 0.21
408 0.22
409 0.25
410 0.26
411 0.3
412 0.4
413 0.42
414 0.51
415 0.58
416 0.63
417 0.69
418 0.72
419 0.77
420 0.76
421 0.75
422 0.71
423 0.67
424 0.61
425 0.54
426 0.48
427 0.42
428 0.33
429 0.25
430 0.2
431 0.15
432 0.11
433 0.12
434 0.13
435 0.1
436 0.12
437 0.13
438 0.14
439 0.16
440 0.22
441 0.21
442 0.19
443 0.2
444 0.17
445 0.16
446 0.17
447 0.15
448 0.1
449 0.09
450 0.09
451 0.08
452 0.08
453 0.06
454 0.03
455 0.03
456 0.04
457 0.05
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.08
465 0.08
466 0.08
467 0.09
468 0.14
469 0.14
470 0.16
471 0.21
472 0.24
473 0.28
474 0.32
475 0.36
476 0.33
477 0.38
478 0.38
479 0.33
480 0.29
481 0.25
482 0.23
483 0.18
484 0.16
485 0.11
486 0.1
487 0.1
488 0.11
489 0.12
490 0.11
491 0.15
492 0.19
493 0.26
494 0.36
495 0.46
496 0.54
497 0.64
498 0.73
499 0.77
500 0.79
501 0.75
502 0.7
503 0.61
504 0.56
505 0.47
506 0.39
507 0.32
508 0.27
509 0.24
510 0.2
511 0.18
512 0.13
513 0.12
514 0.19
515 0.27
516 0.33
517 0.4
518 0.48
519 0.58
520 0.66
521 0.71
522 0.72
523 0.67
524 0.69
525 0.7
526 0.66
527 0.59
528 0.51
529 0.45
530 0.35
531 0.3
532 0.21
533 0.13
534 0.08
535 0.06
536 0.05
537 0.04
538 0.04
539 0.04
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.06
545 0.07
546 0.09
547 0.09
548 0.09
549 0.1
550 0.11
551 0.1
552 0.11
553 0.1
554 0.09
555 0.11
556 0.11
557 0.11
558 0.1
559 0.1
560 0.1
561 0.09
562 0.09
563 0.08
564 0.08
565 0.08
566 0.09
567 0.11
568 0.12
569 0.14
570 0.17
571 0.21
572 0.22
573 0.24
574 0.25
575 0.22
576 0.27
577 0.3
578 0.27
579 0.24
580 0.22
581 0.22
582 0.2
583 0.2
584 0.15
585 0.09
586 0.14
587 0.15
588 0.16
589 0.16
590 0.15
591 0.16
592 0.18
593 0.18
594 0.14
595 0.12
596 0.13
597 0.15
598 0.16
599 0.16
600 0.14
601 0.13
602 0.12
603 0.15
604 0.14
605 0.15
606 0.15
607 0.17
608 0.19
609 0.19
610 0.21
611 0.21
612 0.2
613 0.16
614 0.16
615 0.14
616 0.16
617 0.16
618 0.19
619 0.18
620 0.18
621 0.2
622 0.2
623 0.2
624 0.18
625 0.17
626 0.16
627 0.18
628 0.18
629 0.17
630 0.18
631 0.21
632 0.22
633 0.23
634 0.2
635 0.2
636 0.2
637 0.19
638 0.2
639 0.18
640 0.18
641 0.17
642 0.18
643 0.19
644 0.2
645 0.23
646 0.25
647 0.31
648 0.31
649 0.33
650 0.36
651 0.4
652 0.41
653 0.42
654 0.41
655 0.38
656 0.37
657 0.37
658 0.34
659 0.33
660 0.4
661 0.46
662 0.48
663 0.45
664 0.45
665 0.45
666 0.47
667 0.45
668 0.43
669 0.36
670 0.31
671 0.35
672 0.34
673 0.33