Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3D7M0

Protein Details
Accession S3D7M0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-43RKYALDGPSTKRKRNRVSSESSSSDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007224  TIF_Rrn11  
Gene Ontology GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0001181  F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity  
KEGG glz:GLAREA_06131  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04090  RNA_pol_I_TF  
Amino Acid Sequences MPLFDIPLPAPVRRSITSRKYALDGPSTKRKRNRVSSESSSSDDDLNLSANNDDLLVQSTNPLSLTPDEIAQYRLAGLSLNKQLPQAKGLVDWPHRGFAAEVELHNTQDEGKSGAGEHSGGATRSVESDSQEKNGDEFHASQSIRTPHGHRLRLQHLNVLTAVVHKCLLEGDIPRATRAYSLLIRSEPAGKALDLKTTGYWGIGAELLVRSSQQGKSNKFHHIYDSNSDSDLDDDTERVHNTNTEKDIGAEGKTWGSKQGFELAKSYYETLIIQYPYKKQNHAFVSSLDFWSAMAACEIYGIQAEYRKGFEKLPERYDSESATSSDNDSDREDIFADAHEYIGGSVTGSPTASNSKQRARKYHKMDKIWVQKSNIRVSALSASEALSARMDEIMSRPPFDRDRSMLRLRGMLGLYIGDLNVPVKPVEPPEGDDDRERRFLFLQRKSEYERGVIRKLELWESTRKVFDKCRAEGGPDIDLDNLLQSEIVEEENLDQIEQHSPDEYTED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.4
3 0.47
4 0.54
5 0.56
6 0.55
7 0.53
8 0.56
9 0.54
10 0.54
11 0.52
12 0.5
13 0.57
14 0.62
15 0.67
16 0.7
17 0.75
18 0.76
19 0.81
20 0.84
21 0.81
22 0.83
23 0.83
24 0.82
25 0.76
26 0.69
27 0.61
28 0.52
29 0.44
30 0.34
31 0.27
32 0.19
33 0.16
34 0.14
35 0.11
36 0.1
37 0.09
38 0.09
39 0.08
40 0.08
41 0.07
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.11
51 0.11
52 0.15
53 0.14
54 0.15
55 0.16
56 0.16
57 0.18
58 0.15
59 0.15
60 0.12
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.15
66 0.22
67 0.24
68 0.24
69 0.28
70 0.32
71 0.32
72 0.33
73 0.28
74 0.22
75 0.22
76 0.25
77 0.3
78 0.3
79 0.35
80 0.34
81 0.34
82 0.33
83 0.32
84 0.28
85 0.2
86 0.22
87 0.18
88 0.17
89 0.19
90 0.2
91 0.19
92 0.19
93 0.18
94 0.13
95 0.12
96 0.12
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.12
113 0.11
114 0.12
115 0.18
116 0.18
117 0.2
118 0.22
119 0.21
120 0.2
121 0.2
122 0.2
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.2
127 0.2
128 0.2
129 0.24
130 0.25
131 0.26
132 0.27
133 0.28
134 0.32
135 0.4
136 0.44
137 0.44
138 0.49
139 0.54
140 0.59
141 0.57
142 0.52
143 0.44
144 0.41
145 0.37
146 0.29
147 0.22
148 0.17
149 0.17
150 0.12
151 0.12
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.1
158 0.13
159 0.16
160 0.17
161 0.17
162 0.17
163 0.17
164 0.15
165 0.14
166 0.15
167 0.13
168 0.15
169 0.17
170 0.17
171 0.17
172 0.17
173 0.2
174 0.16
175 0.15
176 0.14
177 0.12
178 0.16
179 0.16
180 0.17
181 0.15
182 0.15
183 0.13
184 0.14
185 0.14
186 0.1
187 0.09
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.08
199 0.11
200 0.17
201 0.24
202 0.29
203 0.35
204 0.39
205 0.45
206 0.45
207 0.43
208 0.41
209 0.38
210 0.36
211 0.35
212 0.34
213 0.27
214 0.25
215 0.25
216 0.19
217 0.16
218 0.14
219 0.11
220 0.07
221 0.07
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.12
229 0.15
230 0.16
231 0.16
232 0.15
233 0.15
234 0.16
235 0.15
236 0.13
237 0.11
238 0.1
239 0.09
240 0.1
241 0.09
242 0.12
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.19
247 0.19
248 0.19
249 0.21
250 0.18
251 0.18
252 0.18
253 0.19
254 0.11
255 0.1
256 0.09
257 0.09
258 0.11
259 0.11
260 0.12
261 0.13
262 0.18
263 0.24
264 0.26
265 0.28
266 0.28
267 0.35
268 0.37
269 0.39
270 0.35
271 0.29
272 0.32
273 0.31
274 0.29
275 0.21
276 0.17
277 0.13
278 0.12
279 0.11
280 0.06
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.07
291 0.08
292 0.09
293 0.11
294 0.12
295 0.14
296 0.14
297 0.2
298 0.26
299 0.31
300 0.35
301 0.37
302 0.38
303 0.39
304 0.4
305 0.35
306 0.29
307 0.25
308 0.21
309 0.19
310 0.17
311 0.15
312 0.15
313 0.14
314 0.13
315 0.13
316 0.14
317 0.12
318 0.13
319 0.12
320 0.1
321 0.1
322 0.09
323 0.1
324 0.08
325 0.08
326 0.07
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.04
332 0.04
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.11
339 0.14
340 0.21
341 0.25
342 0.34
343 0.41
344 0.47
345 0.57
346 0.62
347 0.69
348 0.72
349 0.78
350 0.78
351 0.78
352 0.78
353 0.77
354 0.79
355 0.75
356 0.71
357 0.65
358 0.59
359 0.58
360 0.58
361 0.51
362 0.42
363 0.36
364 0.33
365 0.32
366 0.29
367 0.24
368 0.18
369 0.15
370 0.16
371 0.16
372 0.14
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.08
378 0.07
379 0.08
380 0.16
381 0.17
382 0.19
383 0.19
384 0.23
385 0.27
386 0.31
387 0.35
388 0.31
389 0.37
390 0.43
391 0.48
392 0.48
393 0.46
394 0.45
395 0.4
396 0.4
397 0.33
398 0.25
399 0.2
400 0.15
401 0.14
402 0.11
403 0.1
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.07
409 0.06
410 0.07
411 0.09
412 0.12
413 0.17
414 0.18
415 0.2
416 0.26
417 0.3
418 0.31
419 0.36
420 0.37
421 0.36
422 0.41
423 0.39
424 0.34
425 0.34
426 0.4
427 0.44
428 0.48
429 0.53
430 0.49
431 0.54
432 0.59
433 0.62
434 0.56
435 0.52
436 0.52
437 0.49
438 0.52
439 0.49
440 0.44
441 0.43
442 0.43
443 0.42
444 0.37
445 0.35
446 0.38
447 0.4
448 0.42
449 0.43
450 0.42
451 0.42
452 0.46
453 0.52
454 0.52
455 0.51
456 0.55
457 0.51
458 0.53
459 0.54
460 0.49
461 0.43
462 0.35
463 0.32
464 0.24
465 0.23
466 0.19
467 0.15
468 0.11
469 0.08
470 0.07
471 0.06
472 0.07
473 0.07
474 0.08
475 0.07
476 0.07
477 0.08
478 0.12
479 0.12
480 0.11
481 0.1
482 0.12
483 0.17
484 0.18
485 0.17
486 0.16
487 0.16