Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3D3D1

Protein Details
Accession S3D3D1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-30STVTRPPHPRKASLRLRTTKHydrophilic
48-69LALFKQRLRPRQTRRILIQRVLHydrophilic
284-306EIMHRTCKTCPRCRAPIQKYDGCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, mito_nucl 13.333, cyto_nucl 9.833, mito 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031127  E3_UB_ligase_RBR  
IPR002867  IBR_dom  
IPR044066  TRIAD_supradom  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
KEGG glz:GLAREA_02494  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01485  IBR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51873  TRIAD  
CDD cd20335  BRcat_RBR  
Amino Acid Sequences MNPKNSNQTMSTVTRPPHPRKASLRLRTTKVFDQQFSDLSNSTLKKLLALFKQRLRPRQTRRILIQRVLELSHLITSSEHNAVSGLLKRGAPLTHRQISEWPTFPSSYTKTFCSSKHSRAVCKSCGSDNAETRIREGKLDPKCNDECCICEDCMRSYVAARLTDHNYTHLWGRVACPCCNSVLSPNTVRSFLSHRLLQPYTEFVYSQHLRHLENFRWCADDNCHSGQIHHDGDENPQMTCVKCSKVTCFTHAYFWHEGNKRGDHNAMTYASFSSPENMASRSQEIMHRTCKTCPRCRAPIQKYDGCNLVHCENCNHDFNHEKALRPPKGLTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.52
3 0.56
4 0.6
5 0.61
6 0.65
7 0.68
8 0.77
9 0.79
10 0.79
11 0.81
12 0.79
13 0.79
14 0.77
15 0.75
16 0.71
17 0.7
18 0.66
19 0.57
20 0.54
21 0.51
22 0.46
23 0.42
24 0.37
25 0.28
26 0.24
27 0.28
28 0.23
29 0.23
30 0.24
31 0.22
32 0.21
33 0.24
34 0.3
35 0.32
36 0.4
37 0.46
38 0.49
39 0.59
40 0.64
41 0.69
42 0.71
43 0.73
44 0.74
45 0.78
46 0.8
47 0.79
48 0.81
49 0.83
50 0.81
51 0.76
52 0.71
53 0.64
54 0.56
55 0.48
56 0.4
57 0.3
58 0.23
59 0.18
60 0.14
61 0.11
62 0.09
63 0.1
64 0.13
65 0.14
66 0.13
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.13
71 0.15
72 0.14
73 0.15
74 0.15
75 0.16
76 0.17
77 0.18
78 0.19
79 0.23
80 0.29
81 0.33
82 0.33
83 0.34
84 0.37
85 0.41
86 0.43
87 0.37
88 0.31
89 0.27
90 0.27
91 0.27
92 0.28
93 0.26
94 0.26
95 0.26
96 0.26
97 0.28
98 0.31
99 0.31
100 0.34
101 0.37
102 0.38
103 0.45
104 0.47
105 0.49
106 0.55
107 0.6
108 0.55
109 0.52
110 0.48
111 0.41
112 0.43
113 0.41
114 0.37
115 0.34
116 0.35
117 0.36
118 0.34
119 0.34
120 0.34
121 0.29
122 0.26
123 0.25
124 0.27
125 0.31
126 0.39
127 0.38
128 0.39
129 0.41
130 0.41
131 0.41
132 0.34
133 0.27
134 0.23
135 0.25
136 0.19
137 0.19
138 0.19
139 0.18
140 0.18
141 0.17
142 0.13
143 0.11
144 0.14
145 0.14
146 0.15
147 0.15
148 0.16
149 0.19
150 0.21
151 0.2
152 0.19
153 0.16
154 0.16
155 0.16
156 0.15
157 0.13
158 0.11
159 0.13
160 0.18
161 0.21
162 0.2
163 0.2
164 0.19
165 0.19
166 0.19
167 0.18
168 0.16
169 0.15
170 0.18
171 0.19
172 0.22
173 0.22
174 0.22
175 0.21
176 0.18
177 0.21
178 0.22
179 0.23
180 0.23
181 0.23
182 0.28
183 0.29
184 0.28
185 0.23
186 0.22
187 0.2
188 0.18
189 0.17
190 0.12
191 0.19
192 0.2
193 0.2
194 0.21
195 0.21
196 0.21
197 0.27
198 0.32
199 0.29
200 0.35
201 0.37
202 0.33
203 0.35
204 0.34
205 0.31
206 0.3
207 0.3
208 0.27
209 0.27
210 0.29
211 0.26
212 0.26
213 0.26
214 0.28
215 0.24
216 0.2
217 0.2
218 0.18
219 0.2
220 0.26
221 0.23
222 0.17
223 0.18
224 0.18
225 0.16
226 0.19
227 0.19
228 0.16
229 0.21
230 0.23
231 0.27
232 0.35
233 0.37
234 0.39
235 0.42
236 0.41
237 0.42
238 0.42
239 0.43
240 0.37
241 0.36
242 0.4
243 0.38
244 0.42
245 0.41
246 0.44
247 0.4
248 0.41
249 0.42
250 0.34
251 0.33
252 0.31
253 0.27
254 0.23
255 0.21
256 0.19
257 0.17
258 0.16
259 0.15
260 0.13
261 0.12
262 0.14
263 0.15
264 0.15
265 0.17
266 0.19
267 0.2
268 0.19
269 0.21
270 0.23
271 0.27
272 0.3
273 0.36
274 0.4
275 0.4
276 0.46
277 0.54
278 0.58
279 0.63
280 0.68
281 0.69
282 0.72
283 0.8
284 0.84
285 0.83
286 0.83
287 0.82
288 0.79
289 0.73
290 0.68
291 0.63
292 0.53
293 0.47
294 0.42
295 0.39
296 0.35
297 0.34
298 0.34
299 0.35
300 0.38
301 0.39
302 0.35
303 0.35
304 0.38
305 0.38
306 0.45
307 0.41
308 0.39
309 0.44
310 0.54
311 0.53
312 0.51