Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CJD1

Protein Details
Accession S3CJD1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
229-250GLEERVRKMREKREALRRKESVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
236-245KMREKREALR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040050  ZNF830-like  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG glz:GLAREA_01226  -  
Amino Acid Sequences MADVRSLLKNERASRRIQHKHASYTATGTLLCKVCHFQLKSESLWDGHLRSAGHIMRVQKAQEAQDTPSQNPDTASPVPVEATKNKKRKASDDDDGTIHKRTRAANGLPENFFDQGGKPLDLSSSNPINEIRIPSRPATPLKQSPEIPKQPAVDELEWAAFEADIAAVDVPEVDDGVVISAQPLSAAELAAQSTADANRQRKEKAEAELEGDKEDAARKIEDELDEMEGLEERVRKMREKREALRRKESVLQLSSTTSHEPKHNTVEEDDDEEEEEEEDDWDGFRLKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.68
3 0.71
4 0.71
5 0.72
6 0.7
7 0.74
8 0.73
9 0.69
10 0.59
11 0.53
12 0.47
13 0.38
14 0.31
15 0.25
16 0.25
17 0.23
18 0.22
19 0.2
20 0.21
21 0.23
22 0.32
23 0.32
24 0.31
25 0.37
26 0.4
27 0.4
28 0.41
29 0.38
30 0.3
31 0.32
32 0.3
33 0.23
34 0.2
35 0.22
36 0.19
37 0.18
38 0.24
39 0.21
40 0.21
41 0.23
42 0.25
43 0.26
44 0.29
45 0.29
46 0.26
47 0.28
48 0.27
49 0.3
50 0.29
51 0.27
52 0.31
53 0.33
54 0.3
55 0.34
56 0.32
57 0.27
58 0.26
59 0.24
60 0.23
61 0.22
62 0.22
63 0.16
64 0.15
65 0.16
66 0.17
67 0.19
68 0.19
69 0.28
70 0.36
71 0.44
72 0.49
73 0.54
74 0.56
75 0.61
76 0.64
77 0.63
78 0.62
79 0.59
80 0.57
81 0.52
82 0.51
83 0.45
84 0.39
85 0.32
86 0.25
87 0.22
88 0.21
89 0.25
90 0.29
91 0.29
92 0.34
93 0.39
94 0.42
95 0.39
96 0.38
97 0.35
98 0.28
99 0.26
100 0.19
101 0.12
102 0.13
103 0.14
104 0.13
105 0.12
106 0.11
107 0.12
108 0.12
109 0.13
110 0.13
111 0.14
112 0.14
113 0.15
114 0.15
115 0.16
116 0.16
117 0.17
118 0.15
119 0.15
120 0.17
121 0.18
122 0.2
123 0.22
124 0.24
125 0.24
126 0.28
127 0.31
128 0.33
129 0.36
130 0.36
131 0.39
132 0.45
133 0.46
134 0.42
135 0.4
136 0.36
137 0.33
138 0.34
139 0.31
140 0.22
141 0.18
142 0.16
143 0.13
144 0.12
145 0.12
146 0.09
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.02
155 0.02
156 0.03
157 0.03
158 0.02
159 0.03
160 0.02
161 0.02
162 0.02
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.1
183 0.15
184 0.19
185 0.23
186 0.27
187 0.29
188 0.31
189 0.38
190 0.38
191 0.38
192 0.39
193 0.36
194 0.37
195 0.39
196 0.36
197 0.3
198 0.25
199 0.19
200 0.15
201 0.16
202 0.13
203 0.12
204 0.11
205 0.11
206 0.13
207 0.16
208 0.16
209 0.16
210 0.15
211 0.15
212 0.15
213 0.14
214 0.12
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.11
219 0.1
220 0.16
221 0.19
222 0.26
223 0.34
224 0.44
225 0.52
226 0.6
227 0.68
228 0.73
229 0.81
230 0.82
231 0.84
232 0.77
233 0.71
234 0.7
235 0.66
236 0.63
237 0.55
238 0.49
239 0.4
240 0.4
241 0.36
242 0.31
243 0.3
244 0.25
245 0.25
246 0.28
247 0.32
248 0.35
249 0.42
250 0.43
251 0.42
252 0.41
253 0.44
254 0.41
255 0.39
256 0.36
257 0.28
258 0.25
259 0.23
260 0.21
261 0.16
262 0.14
263 0.1
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.08