Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CCQ2

Protein Details
Accession S3CCQ2    Localization Confidence High Confidence Score 26.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-31HQDATRAERKAKKRKLQDAIPDLPEHydrophilic
43-65TGELMDKKVKKRKRDLAADTGTTHydrophilic
68-95TEGEEDKRARKKEKRKKKSQEVDEPIQEBasic
102-125VTDEAPRKSKKERKAERKAKEAAEBasic
151-174DTAAKKNNRNREKQRKSANKTPLNHydrophilic
271-292GGNTKDRRNKIQDKNTKLNEERHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-21ERKAKKRK
50-56KVKKRKR
74-85KRARKKEKRKKK
107-122PRKSKKERKAERKAKE
156-168KNNRNREKQRKSA
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG glz:GLAREA_08153  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MAPAKHHQDATRAERKAKKRKLQDAIPDLPEEKDQDSLDNVGTGELMDKKVKKRKRDLAADTGTTDGTEGEEDKRARKKEKRKKKSQEVDEPIQEENPVESVTDEAPRKSKKERKAERKAKEAAEALKTAADPEATSKDHPNAEENTVKTDTAAKKNNRNREKQRKSANKTPLNGEEEKPKTPAKFIVFIGNLPFSATKASITSHFASVKPKSVRALTQKDDPTKSKGCAFVEFEGYDHMKTCLKLFHHSVFDDGISPARKINVELTAGGGGNTKDRRNKIQDKNTKLNEERVRRLQEEEKAKWEKRANQPAQPLDENGIHPSRRGIVPKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.72
3 0.75
4 0.77
5 0.78
6 0.8
7 0.86
8 0.88
9 0.88
10 0.88
11 0.86
12 0.82
13 0.75
14 0.67
15 0.57
16 0.49
17 0.42
18 0.34
19 0.26
20 0.22
21 0.2
22 0.19
23 0.2
24 0.2
25 0.18
26 0.16
27 0.15
28 0.12
29 0.11
30 0.09
31 0.1
32 0.1
33 0.12
34 0.17
35 0.21
36 0.3
37 0.4
38 0.47
39 0.55
40 0.64
41 0.71
42 0.76
43 0.82
44 0.81
45 0.81
46 0.8
47 0.72
48 0.63
49 0.53
50 0.43
51 0.32
52 0.25
53 0.14
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.15
59 0.16
60 0.22
61 0.3
62 0.35
63 0.44
64 0.52
65 0.62
66 0.67
67 0.78
68 0.83
69 0.87
70 0.92
71 0.94
72 0.95
73 0.94
74 0.94
75 0.91
76 0.86
77 0.79
78 0.7
79 0.59
80 0.49
81 0.38
82 0.27
83 0.19
84 0.13
85 0.09
86 0.07
87 0.06
88 0.07
89 0.08
90 0.13
91 0.14
92 0.14
93 0.2
94 0.23
95 0.26
96 0.35
97 0.42
98 0.47
99 0.57
100 0.67
101 0.72
102 0.81
103 0.87
104 0.84
105 0.85
106 0.81
107 0.72
108 0.66
109 0.58
110 0.5
111 0.42
112 0.36
113 0.27
114 0.22
115 0.2
116 0.16
117 0.13
118 0.09
119 0.06
120 0.08
121 0.11
122 0.11
123 0.13
124 0.14
125 0.17
126 0.18
127 0.19
128 0.2
129 0.19
130 0.21
131 0.24
132 0.22
133 0.23
134 0.23
135 0.22
136 0.19
137 0.23
138 0.24
139 0.27
140 0.35
141 0.35
142 0.44
143 0.51
144 0.61
145 0.62
146 0.67
147 0.71
148 0.75
149 0.78
150 0.77
151 0.81
152 0.82
153 0.82
154 0.81
155 0.81
156 0.75
157 0.69
158 0.65
159 0.6
160 0.54
161 0.48
162 0.4
163 0.39
164 0.35
165 0.34
166 0.33
167 0.3
168 0.25
169 0.24
170 0.29
171 0.23
172 0.24
173 0.23
174 0.27
175 0.25
176 0.25
177 0.26
178 0.21
179 0.18
180 0.15
181 0.14
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.08
188 0.09
189 0.13
190 0.14
191 0.16
192 0.17
193 0.18
194 0.23
195 0.23
196 0.3
197 0.28
198 0.28
199 0.28
200 0.29
201 0.34
202 0.38
203 0.44
204 0.39
205 0.45
206 0.49
207 0.52
208 0.54
209 0.51
210 0.48
211 0.45
212 0.43
213 0.39
214 0.38
215 0.35
216 0.35
217 0.35
218 0.31
219 0.31
220 0.29
221 0.25
222 0.23
223 0.23
224 0.18
225 0.16
226 0.15
227 0.14
228 0.14
229 0.15
230 0.17
231 0.18
232 0.23
233 0.27
234 0.31
235 0.32
236 0.32
237 0.32
238 0.28
239 0.26
240 0.23
241 0.18
242 0.18
243 0.15
244 0.15
245 0.15
246 0.16
247 0.16
248 0.16
249 0.19
250 0.19
251 0.18
252 0.18
253 0.19
254 0.18
255 0.18
256 0.17
257 0.15
258 0.11
259 0.16
260 0.2
261 0.23
262 0.29
263 0.34
264 0.42
265 0.5
266 0.61
267 0.65
268 0.73
269 0.78
270 0.8
271 0.85
272 0.84
273 0.83
274 0.75
275 0.74
276 0.73
277 0.71
278 0.7
279 0.69
280 0.69
281 0.61
282 0.64
283 0.61
284 0.6
285 0.61
286 0.57
287 0.58
288 0.6
289 0.6
290 0.63
291 0.64
292 0.65
293 0.66
294 0.74
295 0.71
296 0.7
297 0.77
298 0.75
299 0.74
300 0.66
301 0.57
302 0.5
303 0.47
304 0.41
305 0.37
306 0.36
307 0.3
308 0.28
309 0.29
310 0.3
311 0.31