Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DDW1

Protein Details
Accession S3DDW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-253ALKMPPPSFKRVVKKKKDHSVALGIKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
236-257FKRVVKKKKDHSVALGIKKKLK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
IPR043701  Yju2  
Gene Ontology GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000349  P:generation of catalytic spliceosome for first transesterification step  
KEGG glz:GLAREA_11399  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MSERKVLTKYYPPDFDPSKITRSRAPKQAGPKVQTVRLMAPFPMKCTACGEYIYKGRKFNARKETTEEKYYAIPIYRFYIRCTRCSGEITFKTDPKNMDYECERGAKRNTEPWRMNGGGKQESDEERLDRLEREEEEKNAMEELETKTLDAKREMAVADALDEIRTRNARNERMGKDGVEVTVTRESIDDEKKRQEEEDAEAARIAFMRRQEAMEEIIEEEDTAVEDALKMPPPSFKRVVKKKKDHSVALGIKKKLK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.5
3 0.48
4 0.45
5 0.45
6 0.45
7 0.46
8 0.46
9 0.52
10 0.57
11 0.59
12 0.62
13 0.61
14 0.66
15 0.73
16 0.74
17 0.69
18 0.7
19 0.65
20 0.63
21 0.61
22 0.53
23 0.48
24 0.43
25 0.4
26 0.33
27 0.36
28 0.32
29 0.31
30 0.35
31 0.31
32 0.28
33 0.31
34 0.32
35 0.25
36 0.27
37 0.26
38 0.24
39 0.31
40 0.37
41 0.36
42 0.37
43 0.38
44 0.45
45 0.49
46 0.53
47 0.57
48 0.56
49 0.55
50 0.6
51 0.66
52 0.62
53 0.6
54 0.52
55 0.43
56 0.38
57 0.36
58 0.3
59 0.24
60 0.19
61 0.16
62 0.19
63 0.23
64 0.23
65 0.25
66 0.32
67 0.32
68 0.34
69 0.38
70 0.37
71 0.34
72 0.36
73 0.36
74 0.36
75 0.37
76 0.41
77 0.38
78 0.38
79 0.38
80 0.38
81 0.37
82 0.3
83 0.31
84 0.25
85 0.25
86 0.25
87 0.25
88 0.24
89 0.27
90 0.25
91 0.25
92 0.28
93 0.28
94 0.28
95 0.34
96 0.38
97 0.42
98 0.44
99 0.43
100 0.46
101 0.43
102 0.42
103 0.36
104 0.35
105 0.29
106 0.27
107 0.25
108 0.2
109 0.2
110 0.22
111 0.2
112 0.16
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.15
121 0.16
122 0.16
123 0.18
124 0.18
125 0.17
126 0.15
127 0.14
128 0.1
129 0.1
130 0.12
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.14
135 0.16
136 0.17
137 0.16
138 0.15
139 0.13
140 0.15
141 0.15
142 0.12
143 0.11
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.08
152 0.1
153 0.1
154 0.17
155 0.24
156 0.29
157 0.36
158 0.44
159 0.44
160 0.48
161 0.49
162 0.42
163 0.37
164 0.33
165 0.26
166 0.19
167 0.16
168 0.14
169 0.15
170 0.15
171 0.13
172 0.12
173 0.14
174 0.17
175 0.25
176 0.26
177 0.28
178 0.35
179 0.37
180 0.38
181 0.37
182 0.36
183 0.32
184 0.32
185 0.37
186 0.31
187 0.29
188 0.28
189 0.27
190 0.23
191 0.21
192 0.17
193 0.11
194 0.12
195 0.15
196 0.16
197 0.17
198 0.18
199 0.19
200 0.2
201 0.18
202 0.17
203 0.14
204 0.14
205 0.12
206 0.11
207 0.09
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.09
216 0.12
217 0.12
218 0.13
219 0.21
220 0.25
221 0.32
222 0.38
223 0.44
224 0.52
225 0.63
226 0.73
227 0.77
228 0.83
229 0.87
230 0.9
231 0.91
232 0.86
233 0.82
234 0.81
235 0.8
236 0.79
237 0.77