Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3D841

Protein Details
Accession S3D841    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-29CGDVLTKKKLDPHRNQCRGASHydrophilic
56-81KYQGALYRPDKKEKNRQNNQNNSHAVHydrophilic
199-242ETPAPKGERERERRRERKDRDLTREEKKDKKRKRLHVETRDLSPBasic
288-313SPGSPLKKTKSSKKRGRSRVDTISNNHydrophilic
318-349ISTRREHSSEERPKRKHRKHREASARPSKAKMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
203-232PKGERERERRRERKDRDLTREEKKDKKRKR
293-305LKKTKSSKKRGRS
328-348ERPKRKHRKHREASARPSKAK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039999  LYAR  
IPR014898  Znf_C2H2_LYAR  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG glz:GLAREA_04972  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08790  zf-LYAR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51804  ZF_C2HC_LYAR  
Amino Acid Sequences MVSFSCEACGDVLTKKKLDPHRNQCRGASFTCLDCMIHFQGQEYRAHTSCISEAQKYQGALYRPDKKEKNRQNNQNNSHAVVPHSAYVEDAEDEYNQDTQLAVVEAPPPEAPSPPSAAPGYGMSPDPVNVFDFLVTSETPNGSRNELPAPEPMVMIEDVPDESRDRELVRVHFEDYQDVDQSVTDLVQYGSAPIQSQFETPAPKGERERERRRERKDRDLTREEKKDKKRKRLHVETRDLSPKHDEEMTDAPPVLHSGLTGGLNRLLSRPSVFPPSPDYSGGDANDASPGSPLKKTKSSKKRGRSRVDTISNNIMSLISTRREHSSEERPKRKHRKHREASARPSKAKMIEYKPMHENADIKDDSQVVLYKPRSEILLDFVNKGPDSERGMSMHKALKAIPPRAHSVRYGIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.4
4 0.49
5 0.58
6 0.63
7 0.66
8 0.73
9 0.8
10 0.83
11 0.79
12 0.76
13 0.7
14 0.61
15 0.57
16 0.48
17 0.4
18 0.38
19 0.34
20 0.27
21 0.22
22 0.26
23 0.22
24 0.22
25 0.21
26 0.21
27 0.26
28 0.28
29 0.31
30 0.28
31 0.3
32 0.28
33 0.3
34 0.28
35 0.25
36 0.24
37 0.29
38 0.29
39 0.26
40 0.27
41 0.3
42 0.33
43 0.31
44 0.31
45 0.28
46 0.28
47 0.32
48 0.39
49 0.45
50 0.46
51 0.55
52 0.61
53 0.66
54 0.74
55 0.78
56 0.81
57 0.81
58 0.87
59 0.88
60 0.91
61 0.88
62 0.86
63 0.78
64 0.69
65 0.61
66 0.51
67 0.42
68 0.34
69 0.28
70 0.21
71 0.19
72 0.17
73 0.14
74 0.14
75 0.13
76 0.11
77 0.1
78 0.09
79 0.08
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.08
86 0.07
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.09
92 0.09
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.11
97 0.12
98 0.13
99 0.13
100 0.16
101 0.16
102 0.19
103 0.17
104 0.17
105 0.17
106 0.16
107 0.15
108 0.13
109 0.13
110 0.1
111 0.1
112 0.11
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.1
127 0.13
128 0.13
129 0.15
130 0.15
131 0.16
132 0.19
133 0.19
134 0.2
135 0.19
136 0.2
137 0.17
138 0.16
139 0.14
140 0.13
141 0.11
142 0.1
143 0.08
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.09
152 0.09
153 0.11
154 0.14
155 0.16
156 0.2
157 0.21
158 0.22
159 0.24
160 0.23
161 0.22
162 0.21
163 0.2
164 0.15
165 0.14
166 0.12
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.06
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.09
185 0.1
186 0.13
187 0.12
188 0.18
189 0.18
190 0.2
191 0.23
192 0.28
193 0.36
194 0.43
195 0.54
196 0.58
197 0.67
198 0.74
199 0.81
200 0.84
201 0.81
202 0.83
203 0.83
204 0.81
205 0.79
206 0.79
207 0.75
208 0.73
209 0.76
210 0.7
211 0.69
212 0.71
213 0.73
214 0.74
215 0.79
216 0.81
217 0.82
218 0.87
219 0.89
220 0.89
221 0.89
222 0.89
223 0.81
224 0.76
225 0.74
226 0.63
227 0.54
228 0.47
229 0.37
230 0.29
231 0.28
232 0.22
233 0.18
234 0.21
235 0.21
236 0.18
237 0.17
238 0.15
239 0.14
240 0.15
241 0.11
242 0.07
243 0.05
244 0.05
245 0.06
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.09
255 0.11
256 0.12
257 0.13
258 0.2
259 0.2
260 0.21
261 0.27
262 0.3
263 0.31
264 0.3
265 0.29
266 0.24
267 0.27
268 0.26
269 0.2
270 0.16
271 0.14
272 0.14
273 0.12
274 0.09
275 0.08
276 0.09
277 0.1
278 0.14
279 0.17
280 0.2
281 0.3
282 0.36
283 0.46
284 0.56
285 0.65
286 0.71
287 0.79
288 0.85
289 0.86
290 0.9
291 0.88
292 0.85
293 0.85
294 0.83
295 0.76
296 0.7
297 0.67
298 0.57
299 0.48
300 0.4
301 0.3
302 0.21
303 0.19
304 0.18
305 0.14
306 0.15
307 0.17
308 0.21
309 0.22
310 0.26
311 0.31
312 0.39
313 0.46
314 0.55
315 0.64
316 0.68
317 0.77
318 0.85
319 0.89
320 0.89
321 0.9
322 0.91
323 0.91
324 0.94
325 0.95
326 0.94
327 0.94
328 0.94
329 0.91
330 0.82
331 0.75
332 0.69
333 0.62
334 0.57
335 0.55
336 0.51
337 0.52
338 0.53
339 0.55
340 0.55
341 0.54
342 0.5
343 0.44
344 0.41
345 0.34
346 0.39
347 0.34
348 0.29
349 0.28
350 0.26
351 0.24
352 0.22
353 0.22
354 0.15
355 0.23
356 0.25
357 0.26
358 0.27
359 0.28
360 0.27
361 0.26
362 0.26
363 0.23
364 0.29
365 0.27
366 0.29
367 0.3
368 0.33
369 0.3
370 0.3
371 0.27
372 0.22
373 0.27
374 0.28
375 0.29
376 0.27
377 0.31
378 0.33
379 0.37
380 0.38
381 0.33
382 0.32
383 0.31
384 0.36
385 0.41
386 0.48
387 0.48
388 0.46
389 0.52
390 0.56
391 0.57
392 0.52