Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D229

Protein Details
Accession B0D229    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
263-295REINKKTRSGDKKLRKQLKTAKKKKYDKPAMTABasic
690-721SSGFVRSKKKASLREKQQKLRAHIDRSKKSRHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
262-288RREINKKTRSGDKKLRKQLKTAKKKKY
650-669QKGREGRDKFGSHKGKQNKS
679-680KA
695-721RSKKKASLREKQQKLRAHIDRSKKSRH
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027312  Sda1  
IPR007949  SDA1_C  
IPR012977  SDA1_N  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_247709  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08158  NUC130_3NT  
PF05285  SDA1  
Amino Acid Sequences MGRGVLLTSNLPQLQNLIKRDPISYKEEFLQQWNHYDSIRQIFKINPDEQAQHFKELVAFISQVAACYPKETADFPSHISILLLENYGVLSSDTRKALVQNLVMLRNKDVITSIELLKTLFPLLPQTTSSTLRSFIRKTILSDIRVANIRSRNHNLNRAVQAMLFSMVERGMGGELRVSNEPTSDRGAHNGEEAMWAVILTKELWKKDVWKDAKSVSIISQGCFHPVIKVQSASIYFFLGDDEESEDSDQEDDVDVRAMHHRREINKKTRSGDKKLRKQLKTAKKKKYDKPAMTANFSAIQLLHDPQSFAEKLYNILNRFDKRFSLDHKILIMQLLSRVMGAHKLCVLGFYTYIVKFLAHRQLRVPSILVALAQSVHDLTPPDAITPIIRKLAQDFVHPGVANGVITAGLNAIREVCRRQPWSMEEDLLGDLIEYRKSRDKAVVAGARGLLKLYREVNPSMLKRRERGKDASMGLASGHQPLPYGHTSEAAVDIEGLSLLEDHLKKLREEEGLTTEDDPAAWQKWEIESDSSSDDASDGWINVDDDDGDDNFAISDSDDELEKSDEPPPAVILTPADFALLNDLRIQAAKTAVGSGGGSQAKRKLAALEAGHSILPPDRQLQDTFVSENDILGPRKKAKADYAERMASIQKGREGRDKFGSHKGKQNKSVPSSSTNREKARNKPIMMVLSSGFVRSKKKASLREKQQKLRAHIDRSKKSRH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.33
3 0.36
4 0.35
5 0.37
6 0.39
7 0.43
8 0.45
9 0.42
10 0.42
11 0.41
12 0.4
13 0.39
14 0.44
15 0.42
16 0.41
17 0.44
18 0.39
19 0.42
20 0.42
21 0.4
22 0.34
23 0.35
24 0.35
25 0.37
26 0.38
27 0.33
28 0.33
29 0.35
30 0.43
31 0.48
32 0.44
33 0.39
34 0.39
35 0.42
36 0.43
37 0.5
38 0.45
39 0.41
40 0.39
41 0.35
42 0.33
43 0.29
44 0.27
45 0.19
46 0.16
47 0.12
48 0.16
49 0.15
50 0.14
51 0.14
52 0.15
53 0.12
54 0.14
55 0.14
56 0.12
57 0.14
58 0.16
59 0.2
60 0.24
61 0.25
62 0.27
63 0.3
64 0.28
65 0.26
66 0.24
67 0.2
68 0.16
69 0.16
70 0.13
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.1
79 0.15
80 0.15
81 0.16
82 0.17
83 0.19
84 0.24
85 0.27
86 0.26
87 0.27
88 0.3
89 0.35
90 0.38
91 0.37
92 0.34
93 0.33
94 0.31
95 0.26
96 0.23
97 0.19
98 0.19
99 0.21
100 0.21
101 0.17
102 0.18
103 0.18
104 0.17
105 0.15
106 0.13
107 0.1
108 0.09
109 0.13
110 0.14
111 0.16
112 0.17
113 0.19
114 0.22
115 0.25
116 0.27
117 0.24
118 0.25
119 0.27
120 0.32
121 0.3
122 0.3
123 0.33
124 0.33
125 0.35
126 0.42
127 0.44
128 0.41
129 0.43
130 0.4
131 0.38
132 0.4
133 0.37
134 0.34
135 0.35
136 0.36
137 0.39
138 0.44
139 0.49
140 0.52
141 0.6
142 0.57
143 0.58
144 0.58
145 0.52
146 0.47
147 0.38
148 0.32
149 0.24
150 0.21
151 0.14
152 0.1
153 0.09
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.11
164 0.12
165 0.13
166 0.13
167 0.14
168 0.15
169 0.15
170 0.19
171 0.19
172 0.18
173 0.2
174 0.22
175 0.21
176 0.21
177 0.2
178 0.16
179 0.14
180 0.14
181 0.1
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.1
189 0.14
190 0.15
191 0.17
192 0.18
193 0.24
194 0.3
195 0.39
196 0.4
197 0.39
198 0.42
199 0.42
200 0.45
201 0.4
202 0.35
203 0.26
204 0.29
205 0.27
206 0.23
207 0.25
208 0.21
209 0.22
210 0.22
211 0.2
212 0.15
213 0.18
214 0.21
215 0.19
216 0.19
217 0.18
218 0.2
219 0.21
220 0.2
221 0.16
222 0.13
223 0.11
224 0.1
225 0.1
226 0.08
227 0.07
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.05
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.07
242 0.06
243 0.07
244 0.14
245 0.16
246 0.16
247 0.21
248 0.25
249 0.31
250 0.41
251 0.5
252 0.54
253 0.59
254 0.64
255 0.63
256 0.69
257 0.7
258 0.69
259 0.7
260 0.7
261 0.73
262 0.78
263 0.84
264 0.76
265 0.77
266 0.78
267 0.79
268 0.79
269 0.79
270 0.8
271 0.8
272 0.88
273 0.86
274 0.87
275 0.87
276 0.81
277 0.76
278 0.76
279 0.69
280 0.63
281 0.55
282 0.45
283 0.36
284 0.31
285 0.25
286 0.15
287 0.12
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.08
292 0.09
293 0.09
294 0.12
295 0.12
296 0.11
297 0.12
298 0.11
299 0.12
300 0.16
301 0.2
302 0.17
303 0.2
304 0.25
305 0.26
306 0.28
307 0.28
308 0.25
309 0.25
310 0.26
311 0.28
312 0.32
313 0.31
314 0.3
315 0.29
316 0.29
317 0.25
318 0.23
319 0.18
320 0.09
321 0.08
322 0.07
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.09
333 0.1
334 0.11
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.08
343 0.09
344 0.12
345 0.2
346 0.19
347 0.2
348 0.21
349 0.25
350 0.26
351 0.26
352 0.23
353 0.14
354 0.14
355 0.13
356 0.11
357 0.07
358 0.06
359 0.05
360 0.05
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.05
366 0.05
367 0.07
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.11
375 0.1
376 0.11
377 0.11
378 0.12
379 0.18
380 0.18
381 0.18
382 0.19
383 0.19
384 0.21
385 0.21
386 0.19
387 0.14
388 0.13
389 0.11
390 0.08
391 0.07
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.03
396 0.03
397 0.04
398 0.04
399 0.05
400 0.06
401 0.07
402 0.1
403 0.14
404 0.2
405 0.23
406 0.24
407 0.28
408 0.29
409 0.33
410 0.32
411 0.29
412 0.23
413 0.21
414 0.2
415 0.15
416 0.12
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.08
421 0.07
422 0.1
423 0.17
424 0.18
425 0.2
426 0.23
427 0.24
428 0.25
429 0.32
430 0.34
431 0.27
432 0.27
433 0.27
434 0.23
435 0.22
436 0.19
437 0.12
438 0.09
439 0.11
440 0.12
441 0.15
442 0.17
443 0.18
444 0.22
445 0.27
446 0.3
447 0.36
448 0.41
449 0.4
450 0.41
451 0.49
452 0.52
453 0.52
454 0.54
455 0.49
456 0.49
457 0.47
458 0.46
459 0.38
460 0.31
461 0.26
462 0.22
463 0.18
464 0.14
465 0.13
466 0.09
467 0.1
468 0.1
469 0.15
470 0.14
471 0.16
472 0.14
473 0.14
474 0.15
475 0.15
476 0.16
477 0.11
478 0.1
479 0.07
480 0.07
481 0.06
482 0.05
483 0.05
484 0.03
485 0.03
486 0.03
487 0.07
488 0.08
489 0.09
490 0.13
491 0.15
492 0.15
493 0.18
494 0.22
495 0.21
496 0.22
497 0.24
498 0.23
499 0.23
500 0.24
501 0.23
502 0.19
503 0.16
504 0.14
505 0.12
506 0.11
507 0.1
508 0.1
509 0.09
510 0.1
511 0.12
512 0.14
513 0.15
514 0.15
515 0.14
516 0.16
517 0.17
518 0.16
519 0.14
520 0.12
521 0.11
522 0.08
523 0.09
524 0.08
525 0.07
526 0.07
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.08
531 0.07
532 0.07
533 0.08
534 0.08
535 0.07
536 0.07
537 0.07
538 0.07
539 0.07
540 0.06
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.06
545 0.07
546 0.07
547 0.08
548 0.1
549 0.1
550 0.11
551 0.14
552 0.16
553 0.16
554 0.16
555 0.16
556 0.15
557 0.15
558 0.14
559 0.11
560 0.11
561 0.11
562 0.1
563 0.1
564 0.09
565 0.08
566 0.15
567 0.14
568 0.13
569 0.13
570 0.14
571 0.14
572 0.14
573 0.15
574 0.1
575 0.1
576 0.1
577 0.1
578 0.1
579 0.1
580 0.1
581 0.09
582 0.08
583 0.13
584 0.16
585 0.16
586 0.18
587 0.22
588 0.24
589 0.24
590 0.25
591 0.21
592 0.22
593 0.28
594 0.27
595 0.25
596 0.26
597 0.26
598 0.25
599 0.22
600 0.2
601 0.15
602 0.15
603 0.14
604 0.16
605 0.17
606 0.2
607 0.21
608 0.23
609 0.25
610 0.26
611 0.25
612 0.21
613 0.23
614 0.2
615 0.19
616 0.19
617 0.2
618 0.2
619 0.23
620 0.28
621 0.29
622 0.35
623 0.38
624 0.4
625 0.43
626 0.52
627 0.57
628 0.6
629 0.62
630 0.59
631 0.56
632 0.53
633 0.47
634 0.41
635 0.36
636 0.3
637 0.29
638 0.31
639 0.35
640 0.42
641 0.44
642 0.45
643 0.51
644 0.52
645 0.51
646 0.57
647 0.62
648 0.58
649 0.64
650 0.69
651 0.69
652 0.74
653 0.77
654 0.76
655 0.74
656 0.75
657 0.69
658 0.67
659 0.65
660 0.63
661 0.65
662 0.63
663 0.63
664 0.66
665 0.69
666 0.71
667 0.75
668 0.77
669 0.69
670 0.67
671 0.67
672 0.64
673 0.58
674 0.5
675 0.4
676 0.34
677 0.32
678 0.27
679 0.23
680 0.2
681 0.25
682 0.27
683 0.33
684 0.39
685 0.48
686 0.57
687 0.64
688 0.72
689 0.78
690 0.84
691 0.88
692 0.89
693 0.89
694 0.87
695 0.84
696 0.84
697 0.82
698 0.81
699 0.79
700 0.8
701 0.81