Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DFN5

Protein Details
Accession S3DFN5    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-75VPEVKKSKKVAKSTPAPEKIHydrophilic
374-398EDVPAAAKSKKSKKKGKAATTEAESHydrophilic
407-430ETTVAKKASKSKKTKEPEPEIVEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-29KKRKASVPESGAEKLKVKKVKK
46-48KRK
60-67KKSKKVAK
281-296RFKKIPRNRIEGRKLK
380-390AKSKKSKKKGK
445-455VKKPRKAKKTA
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.166, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG glz:GLAREA_05282  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAKEIETKKRKASVPESGAEKLKVKKVKKIVEPVEPVEPTPVAVKKRKAAVESADVPEVKKSKKVAKSTPAPEKITTKKVTKTVTPVEATDVESLPKKVTKKVTRVTKTVIEPEQEGEAEDAGGDEEDSEVDDQTQALLKGFESEDEGEDESSGEGLEEGAPVPEIKVTKAQKKALKKANEEAKGDKPGVVYVGRVPHGFYEHEMREYFGQFGTILKLRLSRNKATGASKHYAFIQFASSVVAEIVAKTMDNYLMFNHIMKVKLVAEEAVPADLWKGAGTRFKKIPRNRIEGRKLKLPATEQMWDERAEKLQAKRAAKATKLKEIGYEFELPEIKSAKGLAKKSEAPAAIEAPETETKAIEDAPAATEPTEAIEDVPAAAKSKKSKKKGKAATTEAESEETPAIAAETTVAKKASKSKKTKEPEPEIVEEVKTVTEVTEVTVEKVKKPRKAKKTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.66
2 0.67
3 0.64
4 0.61
5 0.59
6 0.53
7 0.5
8 0.45
9 0.47
10 0.5
11 0.49
12 0.54
13 0.61
14 0.67
15 0.7
16 0.75
17 0.74
18 0.75
19 0.76
20 0.71
21 0.68
22 0.59
23 0.5
24 0.43
25 0.36
26 0.27
27 0.26
28 0.28
29 0.28
30 0.35
31 0.4
32 0.43
33 0.51
34 0.55
35 0.52
36 0.53
37 0.51
38 0.52
39 0.51
40 0.48
41 0.45
42 0.4
43 0.38
44 0.38
45 0.37
46 0.31
47 0.3
48 0.33
49 0.39
50 0.47
51 0.55
52 0.59
53 0.64
54 0.72
55 0.76
56 0.81
57 0.79
58 0.75
59 0.69
60 0.68
61 0.65
62 0.63
63 0.6
64 0.55
65 0.54
66 0.57
67 0.57
68 0.54
69 0.56
70 0.54
71 0.54
72 0.5
73 0.44
74 0.42
75 0.39
76 0.36
77 0.3
78 0.23
79 0.19
80 0.19
81 0.19
82 0.18
83 0.21
84 0.21
85 0.25
86 0.35
87 0.42
88 0.5
89 0.58
90 0.67
91 0.68
92 0.71
93 0.69
94 0.66
95 0.61
96 0.58
97 0.53
98 0.44
99 0.39
100 0.35
101 0.32
102 0.25
103 0.21
104 0.14
105 0.11
106 0.09
107 0.08
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.04
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.04
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.11
132 0.11
133 0.12
134 0.13
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.08
139 0.07
140 0.06
141 0.04
142 0.03
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.15
155 0.2
156 0.27
157 0.33
158 0.4
159 0.45
160 0.53
161 0.61
162 0.63
163 0.66
164 0.63
165 0.65
166 0.67
167 0.67
168 0.6
169 0.55
170 0.51
171 0.46
172 0.42
173 0.35
174 0.26
175 0.2
176 0.2
177 0.16
178 0.12
179 0.11
180 0.14
181 0.13
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.14
186 0.14
187 0.13
188 0.16
189 0.15
190 0.17
191 0.17
192 0.17
193 0.17
194 0.17
195 0.16
196 0.1
197 0.1
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.14
205 0.15
206 0.22
207 0.27
208 0.28
209 0.29
210 0.33
211 0.35
212 0.34
213 0.37
214 0.35
215 0.33
216 0.31
217 0.28
218 0.26
219 0.24
220 0.21
221 0.17
222 0.13
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.08
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.1
245 0.11
246 0.12
247 0.11
248 0.13
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.1
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.04
263 0.05
264 0.06
265 0.13
266 0.15
267 0.2
268 0.26
269 0.34
270 0.42
271 0.49
272 0.58
273 0.6
274 0.67
275 0.7
276 0.74
277 0.77
278 0.76
279 0.73
280 0.7
281 0.64
282 0.58
283 0.54
284 0.46
285 0.41
286 0.37
287 0.36
288 0.29
289 0.29
290 0.28
291 0.26
292 0.25
293 0.21
294 0.18
295 0.19
296 0.23
297 0.22
298 0.29
299 0.34
300 0.35
301 0.38
302 0.44
303 0.46
304 0.47
305 0.53
306 0.49
307 0.51
308 0.52
309 0.48
310 0.45
311 0.42
312 0.39
313 0.34
314 0.32
315 0.23
316 0.23
317 0.25
318 0.2
319 0.21
320 0.2
321 0.16
322 0.14
323 0.15
324 0.18
325 0.23
326 0.26
327 0.27
328 0.31
329 0.35
330 0.36
331 0.4
332 0.36
333 0.31
334 0.31
335 0.28
336 0.23
337 0.2
338 0.18
339 0.16
340 0.17
341 0.15
342 0.14
343 0.12
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.1
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.1
355 0.09
356 0.1
357 0.1
358 0.08
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.08
363 0.09
364 0.08
365 0.1
366 0.11
367 0.15
368 0.24
369 0.35
370 0.44
371 0.53
372 0.63
373 0.71
374 0.8
375 0.87
376 0.88
377 0.88
378 0.86
379 0.83
380 0.77
381 0.7
382 0.6
383 0.52
384 0.42
385 0.33
386 0.26
387 0.19
388 0.14
389 0.1
390 0.09
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.1
395 0.11
396 0.13
397 0.15
398 0.15
399 0.19
400 0.29
401 0.38
402 0.45
403 0.54
404 0.61
405 0.7
406 0.79
407 0.85
408 0.86
409 0.85
410 0.85
411 0.81
412 0.76
413 0.69
414 0.62
415 0.53
416 0.43
417 0.34
418 0.24
419 0.18
420 0.13
421 0.1
422 0.08
423 0.08
424 0.09
425 0.14
426 0.14
427 0.16
428 0.23
429 0.24
430 0.3
431 0.4
432 0.46
433 0.5
434 0.6
435 0.69