Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DDX9

Protein Details
Accession S3DDX9    Localization Confidence Low Confidence Score 8.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-86ATLPKKPRKKSYTHVDERNIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 10, cyto 2, pero 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR038717  Tc1-like_DDE_dom  
IPR002492  Transposase_Tc1-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
GO:0006313  P:DNA transposition  
KEGG glz:GLAREA_08800  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13358  DDE_3  
PF01498  HTH_Tnp_Tc3_2  
Amino Acid Sequences MLPPRQPMTPIALNRQFNGQLSPISRQQIVTTYNCGFTPAAIALGFNLIDKTVRYTIEQSAQRASHATLPKKPRKKSYTHVDERNILRFVRTNPKATYAQVRKEVGLKCSVSTIKKILKENGISNWRARRRPFLTDSVAAKRLAWCLRHRGYTVEEWGLFIWSDECSVERGRGKAQEWVFRTPAQKWDKEMIQTYKANKDLSVMVWGCFWDNGRSDLYVLDRDFAAKKHGYSANSYIDVLNAQVAPWYEELDDEGYIFMQDNAPIHTAHKVRDWFIEHGIRVIDWPPYSPDLNPIEHIWWVLKRMLIEHYPHLEGASEDNIEEMQEALKDCWARIPKETFDTLYKSMPRRVEACIKAGGWHTKY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.53
3 0.47
4 0.41
5 0.39
6 0.31
7 0.28
8 0.29
9 0.33
10 0.32
11 0.33
12 0.33
13 0.31
14 0.3
15 0.31
16 0.33
17 0.31
18 0.32
19 0.3
20 0.3
21 0.29
22 0.3
23 0.24
24 0.19
25 0.2
26 0.14
27 0.13
28 0.12
29 0.12
30 0.09
31 0.11
32 0.11
33 0.08
34 0.07
35 0.06
36 0.07
37 0.08
38 0.13
39 0.14
40 0.15
41 0.18
42 0.21
43 0.25
44 0.33
45 0.36
46 0.33
47 0.36
48 0.35
49 0.34
50 0.32
51 0.29
52 0.29
53 0.33
54 0.36
55 0.38
56 0.48
57 0.58
58 0.65
59 0.71
60 0.74
61 0.74
62 0.76
63 0.78
64 0.79
65 0.79
66 0.8
67 0.81
68 0.76
69 0.76
70 0.71
71 0.67
72 0.57
73 0.46
74 0.38
75 0.34
76 0.34
77 0.37
78 0.38
79 0.38
80 0.37
81 0.42
82 0.43
83 0.41
84 0.47
85 0.43
86 0.45
87 0.46
88 0.46
89 0.42
90 0.46
91 0.47
92 0.38
93 0.37
94 0.32
95 0.25
96 0.28
97 0.31
98 0.26
99 0.26
100 0.3
101 0.3
102 0.35
103 0.38
104 0.38
105 0.41
106 0.42
107 0.42
108 0.44
109 0.44
110 0.4
111 0.41
112 0.45
113 0.46
114 0.48
115 0.47
116 0.49
117 0.48
118 0.54
119 0.54
120 0.51
121 0.5
122 0.49
123 0.51
124 0.46
125 0.44
126 0.37
127 0.32
128 0.27
129 0.27
130 0.25
131 0.25
132 0.23
133 0.29
134 0.32
135 0.35
136 0.34
137 0.32
138 0.32
139 0.31
140 0.31
141 0.25
142 0.21
143 0.19
144 0.18
145 0.16
146 0.13
147 0.1
148 0.07
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.07
154 0.07
155 0.1
156 0.11
157 0.12
158 0.14
159 0.18
160 0.18
161 0.23
162 0.25
163 0.29
164 0.3
165 0.32
166 0.32
167 0.31
168 0.32
169 0.27
170 0.34
171 0.32
172 0.3
173 0.3
174 0.32
175 0.31
176 0.31
177 0.35
178 0.29
179 0.3
180 0.32
181 0.31
182 0.32
183 0.33
184 0.31
185 0.26
186 0.24
187 0.2
188 0.17
189 0.2
190 0.16
191 0.14
192 0.13
193 0.14
194 0.12
195 0.11
196 0.12
197 0.08
198 0.09
199 0.11
200 0.11
201 0.12
202 0.12
203 0.12
204 0.13
205 0.14
206 0.13
207 0.12
208 0.11
209 0.12
210 0.13
211 0.12
212 0.16
213 0.14
214 0.14
215 0.19
216 0.23
217 0.23
218 0.26
219 0.3
220 0.29
221 0.28
222 0.29
223 0.23
224 0.19
225 0.18
226 0.14
227 0.1
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.08
250 0.1
251 0.1
252 0.11
253 0.16
254 0.18
255 0.19
256 0.24
257 0.25
258 0.25
259 0.3
260 0.33
261 0.3
262 0.34
263 0.37
264 0.31
265 0.3
266 0.29
267 0.24
268 0.2
269 0.19
270 0.17
271 0.12
272 0.14
273 0.15
274 0.18
275 0.19
276 0.18
277 0.24
278 0.24
279 0.26
280 0.26
281 0.25
282 0.23
283 0.22
284 0.23
285 0.19
286 0.16
287 0.17
288 0.17
289 0.17
290 0.16
291 0.18
292 0.22
293 0.23
294 0.25
295 0.28
296 0.3
297 0.3
298 0.3
299 0.28
300 0.24
301 0.2
302 0.19
303 0.16
304 0.12
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.1
310 0.08
311 0.06
312 0.07
313 0.09
314 0.09
315 0.13
316 0.14
317 0.14
318 0.21
319 0.27
320 0.28
321 0.33
322 0.39
323 0.4
324 0.45
325 0.48
326 0.43
327 0.42
328 0.46
329 0.41
330 0.42
331 0.44
332 0.44
333 0.47
334 0.48
335 0.48
336 0.45
337 0.49
338 0.52
339 0.49
340 0.48
341 0.46
342 0.42
343 0.41
344 0.44