Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3E4X1

Protein Details
Accession S3E4X1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
601-626AEIREREKARKERQREEERKLRQSRMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
444-459PKFKHKKIPRGPPSPP
605-625EREKARKERQREEERKLRQSR
Subcellular Location(s) mito 10, mito_nucl 9.833, cyto_mito 8.833, nucl 8.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009038  GOLD_dom  
IPR036598  GOLD_dom_sf  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG glz:GLAREA_06476  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01105  EMP24_GP25L  
PF02731  SKIP_SNW  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50866  GOLD  
Amino Acid Sequences MRLSHLTTGLLALPLTMVSATALTYKLAANEKACFFTSVEKMGAKIAFYFAVQAGGSFDVDYEVVGPNDKIIMDGEKERQGDFVFTATETGEYRFCFNNQMSTFAEKFVDFEIAVENEARASIPAKQGTSPEQTSALEESIFKLSGQLSTITRNQKYFRTRENRNFSTVRRSEKRVRVKRLFGWSGQGIALRGSGSRQFDFMNSSKFTTLPPLPYTTYRKMTNIAAQLSRSLPKPKYTGEEEEIPQHAQHRGPRIVGAGTLDDSQIVLRKSGPPPYGQRAGWRPRAPEDFGDGGAFPEIPVAQYPLDMGKKNAASSTALAIQVDGEGKIKYDAIARQGHNDKRIVHASFKDLIPLRQRADAGDINLDRPSEEEVAASTERTKEALAKLVNGAVAAQKPKNVNVGNRSQPTFVRYTPANQMGDNTRKNDRIMKIVERQVDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWKIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFAEALFTADRHAREEVKSRAQMQQRLAEKEKAQKEDHLRMLAQKAREDRAAAGSGRRNSRTSRSRSGSYSYSESESDSGEEAEIREREKARKERQREEERKLRQSRMGAERRVQMMAREQNRDISEKVALGLAKPTQSSESMFDSRLFNRTSGFDSGFNEDQAYDKPLFQAHDAINSIYRPRQNMDDGDDEEAAEMEMGKIQKSNRFGEALGKGTFKGSGDVEAREGPVQFEKDTGDVFAVDDFLAKVGEGSGTAAGGSGSGEKRGYGLQDGEERGSKRARIDEDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.06
4 0.05
5 0.05
6 0.05
7 0.06
8 0.07
9 0.08
10 0.08
11 0.09
12 0.1
13 0.14
14 0.19
15 0.22
16 0.23
17 0.28
18 0.3
19 0.32
20 0.33
21 0.3
22 0.26
23 0.29
24 0.31
25 0.29
26 0.29
27 0.27
28 0.26
29 0.28
30 0.28
31 0.22
32 0.19
33 0.17
34 0.15
35 0.15
36 0.16
37 0.12
38 0.13
39 0.12
40 0.11
41 0.11
42 0.12
43 0.12
44 0.1
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.1
53 0.1
54 0.09
55 0.11
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.12
60 0.14
61 0.18
62 0.23
63 0.27
64 0.28
65 0.28
66 0.28
67 0.26
68 0.25
69 0.21
70 0.18
71 0.14
72 0.13
73 0.13
74 0.12
75 0.12
76 0.11
77 0.13
78 0.13
79 0.13
80 0.16
81 0.18
82 0.18
83 0.23
84 0.23
85 0.3
86 0.29
87 0.32
88 0.32
89 0.36
90 0.36
91 0.31
92 0.32
93 0.22
94 0.22
95 0.19
96 0.19
97 0.12
98 0.12
99 0.14
100 0.13
101 0.14
102 0.13
103 0.11
104 0.09
105 0.1
106 0.09
107 0.07
108 0.08
109 0.11
110 0.17
111 0.2
112 0.21
113 0.22
114 0.25
115 0.3
116 0.35
117 0.33
118 0.29
119 0.28
120 0.27
121 0.28
122 0.27
123 0.22
124 0.16
125 0.15
126 0.15
127 0.15
128 0.15
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.13
133 0.14
134 0.14
135 0.13
136 0.18
137 0.25
138 0.31
139 0.33
140 0.37
141 0.38
142 0.43
143 0.51
144 0.52
145 0.57
146 0.58
147 0.65
148 0.71
149 0.79
150 0.74
151 0.72
152 0.7
153 0.62
154 0.64
155 0.59
156 0.58
157 0.54
158 0.58
159 0.61
160 0.67
161 0.75
162 0.74
163 0.8
164 0.78
165 0.8
166 0.8
167 0.8
168 0.74
169 0.64
170 0.6
171 0.5
172 0.43
173 0.36
174 0.3
175 0.2
176 0.16
177 0.16
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.13
182 0.16
183 0.16
184 0.17
185 0.17
186 0.17
187 0.23
188 0.24
189 0.25
190 0.23
191 0.24
192 0.24
193 0.23
194 0.23
195 0.24
196 0.24
197 0.23
198 0.23
199 0.25
200 0.27
201 0.33
202 0.39
203 0.39
204 0.42
205 0.4
206 0.39
207 0.39
208 0.39
209 0.39
210 0.37
211 0.35
212 0.31
213 0.29
214 0.29
215 0.28
216 0.28
217 0.25
218 0.26
219 0.25
220 0.28
221 0.31
222 0.31
223 0.35
224 0.38
225 0.41
226 0.38
227 0.41
228 0.37
229 0.38
230 0.37
231 0.32
232 0.27
233 0.23
234 0.22
235 0.2
236 0.22
237 0.26
238 0.27
239 0.27
240 0.27
241 0.26
242 0.24
243 0.21
244 0.19
245 0.12
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.1
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.15
257 0.17
258 0.24
259 0.25
260 0.26
261 0.32
262 0.37
263 0.42
264 0.37
265 0.41
266 0.43
267 0.49
268 0.54
269 0.51
270 0.47
271 0.48
272 0.52
273 0.48
274 0.4
275 0.38
276 0.3
277 0.27
278 0.25
279 0.2
280 0.15
281 0.13
282 0.11
283 0.06
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.1
293 0.12
294 0.13
295 0.13
296 0.16
297 0.17
298 0.18
299 0.18
300 0.15
301 0.14
302 0.14
303 0.15
304 0.13
305 0.12
306 0.12
307 0.11
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.07
312 0.06
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.09
319 0.1
320 0.15
321 0.21
322 0.21
323 0.27
324 0.34
325 0.36
326 0.37
327 0.38
328 0.34
329 0.32
330 0.36
331 0.32
332 0.28
333 0.26
334 0.27
335 0.26
336 0.26
337 0.26
338 0.22
339 0.24
340 0.26
341 0.28
342 0.25
343 0.25
344 0.25
345 0.21
346 0.25
347 0.23
348 0.18
349 0.19
350 0.18
351 0.17
352 0.17
353 0.16
354 0.11
355 0.11
356 0.12
357 0.09
358 0.09
359 0.08
360 0.07
361 0.1
362 0.1
363 0.1
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.09
371 0.15
372 0.14
373 0.14
374 0.14
375 0.15
376 0.14
377 0.12
378 0.11
379 0.07
380 0.08
381 0.1
382 0.09
383 0.12
384 0.13
385 0.14
386 0.19
387 0.2
388 0.22
389 0.25
390 0.31
391 0.34
392 0.36
393 0.36
394 0.31
395 0.3
396 0.29
397 0.27
398 0.21
399 0.18
400 0.16
401 0.18
402 0.22
403 0.26
404 0.24
405 0.21
406 0.22
407 0.25
408 0.3
409 0.3
410 0.28
411 0.26
412 0.27
413 0.29
414 0.34
415 0.3
416 0.29
417 0.31
418 0.33
419 0.36
420 0.39
421 0.41
422 0.35
423 0.35
424 0.3
425 0.27
426 0.23
427 0.24
428 0.24
429 0.21
430 0.22
431 0.31
432 0.37
433 0.37
434 0.47
435 0.5
436 0.56
437 0.65
438 0.75
439 0.73
440 0.75
441 0.78
442 0.77
443 0.75
444 0.7
445 0.64
446 0.54
447 0.51
448 0.47
449 0.48
450 0.48
451 0.49
452 0.47
453 0.48
454 0.5
455 0.45
456 0.42
457 0.42
458 0.41
459 0.4
460 0.37
461 0.35
462 0.33
463 0.33
464 0.31
465 0.29
466 0.22
467 0.17
468 0.19
469 0.2
470 0.29
471 0.31
472 0.4
473 0.44
474 0.49
475 0.55
476 0.51
477 0.52
478 0.45
479 0.44
480 0.41
481 0.44
482 0.41
483 0.41
484 0.43
485 0.39
486 0.36
487 0.36
488 0.32
489 0.23
490 0.21
491 0.17
492 0.17
493 0.18
494 0.17
495 0.14
496 0.15
497 0.15
498 0.18
499 0.16
500 0.15
501 0.14
502 0.15
503 0.15
504 0.13
505 0.13
506 0.08
507 0.07
508 0.08
509 0.08
510 0.09
511 0.08
512 0.08
513 0.09
514 0.11
515 0.12
516 0.12
517 0.14
518 0.15
519 0.17
520 0.25
521 0.29
522 0.33
523 0.36
524 0.36
525 0.41
526 0.45
527 0.48
528 0.44
529 0.47
530 0.45
531 0.48
532 0.5
533 0.47
534 0.45
535 0.48
536 0.5
537 0.48
538 0.44
539 0.45
540 0.48
541 0.51
542 0.52
543 0.45
544 0.4
545 0.38
546 0.43
547 0.4
548 0.35
549 0.31
550 0.31
551 0.31
552 0.31
553 0.29
554 0.25
555 0.24
556 0.25
557 0.22
558 0.23
559 0.26
560 0.3
561 0.34
562 0.35
563 0.34
564 0.35
565 0.44
566 0.48
567 0.5
568 0.54
569 0.55
570 0.56
571 0.57
572 0.58
573 0.52
574 0.46
575 0.42
576 0.35
577 0.31
578 0.28
579 0.26
580 0.22
581 0.19
582 0.16
583 0.13
584 0.11
585 0.09
586 0.09
587 0.08
588 0.12
589 0.12
590 0.13
591 0.17
592 0.2
593 0.25
594 0.34
595 0.44
596 0.5
597 0.59
598 0.67
599 0.72
600 0.8
601 0.86
602 0.85
603 0.84
604 0.84
605 0.82
606 0.84
607 0.81
608 0.75
609 0.69
610 0.65
611 0.64
612 0.65
613 0.64
614 0.59
615 0.57
616 0.58
617 0.55
618 0.52
619 0.44
620 0.35
621 0.36
622 0.4
623 0.4
624 0.4
625 0.38
626 0.42
627 0.43
628 0.44
629 0.36
630 0.3
631 0.26
632 0.21
633 0.21
634 0.18
635 0.16
636 0.13
637 0.16
638 0.15
639 0.15
640 0.15
641 0.15
642 0.15
643 0.16
644 0.18
645 0.18
646 0.22
647 0.23
648 0.24
649 0.25
650 0.26
651 0.27
652 0.29
653 0.28
654 0.22
655 0.22
656 0.23
657 0.25
658 0.25
659 0.26
660 0.23
661 0.24
662 0.3
663 0.29
664 0.27
665 0.23
666 0.19
667 0.19
668 0.18
669 0.2
670 0.15
671 0.15
672 0.16
673 0.18
674 0.19
675 0.19
676 0.23
677 0.2
678 0.24
679 0.25
680 0.25
681 0.24
682 0.24
683 0.26
684 0.25
685 0.27
686 0.25
687 0.26
688 0.3
689 0.33
690 0.35
691 0.37
692 0.38
693 0.36
694 0.37
695 0.34
696 0.29
697 0.24
698 0.21
699 0.15
700 0.1
701 0.08
702 0.05
703 0.08
704 0.08
705 0.09
706 0.12
707 0.15
708 0.21
709 0.26
710 0.3
711 0.3
712 0.31
713 0.32
714 0.36
715 0.38
716 0.36
717 0.33
718 0.31
719 0.28
720 0.26
721 0.27
722 0.2
723 0.18
724 0.15
725 0.19
726 0.2
727 0.21
728 0.23
729 0.23
730 0.24
731 0.22
732 0.22
733 0.18
734 0.21
735 0.22
736 0.2
737 0.2
738 0.2
739 0.19
740 0.2
741 0.18
742 0.14
743 0.12
744 0.12
745 0.11
746 0.1
747 0.08
748 0.08
749 0.08
750 0.07
751 0.07
752 0.07
753 0.06
754 0.06
755 0.06
756 0.06
757 0.07
758 0.07
759 0.07
760 0.07
761 0.07
762 0.06
763 0.06
764 0.06
765 0.09
766 0.1
767 0.12
768 0.13
769 0.13
770 0.15
771 0.17
772 0.18
773 0.18
774 0.19
775 0.21
776 0.28
777 0.3
778 0.32
779 0.35
780 0.35
781 0.35
782 0.38
783 0.36
784 0.35
785 0.4
786 0.43