Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DSF0

Protein Details
Accession B0DSF0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
445-474AEAIAPKAPNTKKKGKRGGAPRQRQARITNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
251-254KKKR
451-468KAPNTKKKGKRGGAPRQR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11.5, cyto 6, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019191  Essential_protein_Yae1_N  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_309484  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PF02186  TFIIE_beta  
PF09811  Yae1_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
CDD cd07977  TFIIE_beta_winged_helix  
Amino Acid Sequences MDSPWEEDPDHGAFRDAEWSKISSDFTNAGYREGITAGKESALQEGFDAGFADTGAPIGREIGRLRGISAAILAMVNSSGSGQDESSAAEARNIAGQLANLRFSDVAPRDLEAEEHARQHMEANDDHGMEVGEEMAEKREMEGIEDLLAKLTAGKNTKDPGRPTVEDLKRLSERLQALNSRHERLLTVLTSFAMSKLQKDAAAFKSALHRQDYSSWHSKPRPLDSHPTSSAASPAASASASIEPASPSEGKKKRPKSNIVYSQPADTGTGTNVNTQLVYLVDYLRGTPNPLRVEDLAIYTQTPVDVDMVLREKLKSHDRVQVDPKTGLFSYKHEYNFRNKAALLVEIQRQTRKGSGISVRALKESWKEAPAAVEELEKEGEVLVTRTVKDGQLRMVFWNEIKPTEEAGGMQVEKEFLDLWHELKVPTGADLSKQLAHEGLQVTAAEAIAPKAPNTKKKGKRGGAPRQRQARITNTHLKGIDLSKDYVAPGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.28
3 0.24
4 0.23
5 0.24
6 0.25
7 0.24
8 0.27
9 0.28
10 0.2
11 0.23
12 0.23
13 0.23
14 0.29
15 0.27
16 0.26
17 0.25
18 0.24
19 0.21
20 0.2
21 0.19
22 0.13
23 0.14
24 0.13
25 0.13
26 0.15
27 0.14
28 0.18
29 0.17
30 0.16
31 0.14
32 0.15
33 0.15
34 0.13
35 0.13
36 0.09
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.06
45 0.08
46 0.09
47 0.12
48 0.13
49 0.18
50 0.21
51 0.21
52 0.22
53 0.22
54 0.22
55 0.18
56 0.18
57 0.13
58 0.09
59 0.08
60 0.07
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.04
65 0.04
66 0.04
67 0.06
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.09
73 0.1
74 0.11
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.1
79 0.12
80 0.12
81 0.1
82 0.09
83 0.1
84 0.14
85 0.15
86 0.17
87 0.14
88 0.15
89 0.15
90 0.15
91 0.23
92 0.19
93 0.21
94 0.2
95 0.2
96 0.21
97 0.21
98 0.21
99 0.16
100 0.19
101 0.18
102 0.19
103 0.19
104 0.17
105 0.17
106 0.2
107 0.2
108 0.18
109 0.16
110 0.19
111 0.21
112 0.2
113 0.2
114 0.17
115 0.15
116 0.11
117 0.11
118 0.06
119 0.04
120 0.04
121 0.05
122 0.06
123 0.07
124 0.06
125 0.07
126 0.1
127 0.1
128 0.12
129 0.13
130 0.11
131 0.12
132 0.13
133 0.12
134 0.09
135 0.09
136 0.07
137 0.08
138 0.09
139 0.12
140 0.14
141 0.16
142 0.19
143 0.23
144 0.3
145 0.33
146 0.35
147 0.37
148 0.41
149 0.41
150 0.43
151 0.49
152 0.46
153 0.46
154 0.45
155 0.45
156 0.39
157 0.39
158 0.35
159 0.3
160 0.3
161 0.27
162 0.31
163 0.3
164 0.31
165 0.39
166 0.41
167 0.38
168 0.35
169 0.32
170 0.28
171 0.25
172 0.26
173 0.17
174 0.14
175 0.12
176 0.11
177 0.12
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.12
184 0.13
185 0.14
186 0.15
187 0.2
188 0.17
189 0.2
190 0.19
191 0.18
192 0.24
193 0.26
194 0.28
195 0.26
196 0.24
197 0.23
198 0.28
199 0.31
200 0.3
201 0.34
202 0.33
203 0.37
204 0.39
205 0.42
206 0.41
207 0.45
208 0.45
209 0.42
210 0.49
211 0.47
212 0.51
213 0.48
214 0.46
215 0.39
216 0.33
217 0.3
218 0.21
219 0.16
220 0.1
221 0.08
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.18
236 0.23
237 0.31
238 0.4
239 0.49
240 0.56
241 0.64
242 0.72
243 0.71
244 0.77
245 0.79
246 0.75
247 0.71
248 0.63
249 0.56
250 0.47
251 0.38
252 0.28
253 0.18
254 0.14
255 0.09
256 0.11
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.1
274 0.11
275 0.17
276 0.18
277 0.19
278 0.21
279 0.2
280 0.22
281 0.2
282 0.2
283 0.14
284 0.13
285 0.12
286 0.1
287 0.09
288 0.07
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.07
295 0.09
296 0.1
297 0.11
298 0.11
299 0.12
300 0.16
301 0.23
302 0.26
303 0.28
304 0.35
305 0.37
306 0.43
307 0.49
308 0.51
309 0.48
310 0.43
311 0.39
312 0.35
313 0.32
314 0.29
315 0.23
316 0.2
317 0.22
318 0.27
319 0.3
320 0.32
321 0.35
322 0.41
323 0.48
324 0.46
325 0.43
326 0.37
327 0.36
328 0.32
329 0.3
330 0.24
331 0.2
332 0.23
333 0.24
334 0.26
335 0.26
336 0.26
337 0.26
338 0.26
339 0.25
340 0.21
341 0.24
342 0.28
343 0.31
344 0.34
345 0.38
346 0.36
347 0.35
348 0.34
349 0.3
350 0.28
351 0.27
352 0.26
353 0.22
354 0.21
355 0.21
356 0.22
357 0.21
358 0.2
359 0.16
360 0.14
361 0.13
362 0.14
363 0.13
364 0.11
365 0.09
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.09
371 0.1
372 0.11
373 0.13
374 0.14
375 0.16
376 0.2
377 0.21
378 0.25
379 0.27
380 0.28
381 0.29
382 0.3
383 0.29
384 0.26
385 0.3
386 0.25
387 0.22
388 0.24
389 0.22
390 0.21
391 0.2
392 0.2
393 0.14
394 0.14
395 0.16
396 0.14
397 0.13
398 0.12
399 0.11
400 0.11
401 0.11
402 0.1
403 0.06
404 0.11
405 0.12
406 0.12
407 0.15
408 0.17
409 0.16
410 0.17
411 0.19
412 0.15
413 0.15
414 0.16
415 0.13
416 0.14
417 0.18
418 0.19
419 0.2
420 0.2
421 0.2
422 0.18
423 0.18
424 0.21
425 0.19
426 0.16
427 0.15
428 0.14
429 0.14
430 0.13
431 0.13
432 0.08
433 0.07
434 0.08
435 0.11
436 0.11
437 0.12
438 0.2
439 0.27
440 0.36
441 0.44
442 0.54
443 0.6
444 0.7
445 0.8
446 0.8
447 0.83
448 0.85
449 0.88
450 0.88
451 0.89
452 0.88
453 0.87
454 0.84
455 0.8
456 0.76
457 0.74
458 0.7
459 0.68
460 0.69
461 0.62
462 0.63
463 0.58
464 0.52
465 0.47
466 0.43
467 0.42
468 0.35
469 0.34
470 0.29
471 0.3