Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DI70

Protein Details
Accession S3DI70    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-84AATLRFQPTKRPQLPQKAKPKGQFPKAHydrophilic
126-154FYAGEKRQRGGRKRRKNKHREEHVAAQDWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
131-145KRQRGGRKRRKNKHR
349-376KRKKKSDAEGGGFRDPPGGRGKIIGGKK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG glz:GLAREA_08992  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MSKPNSTPVPRAGLSLYANLLDSNSTTSSATVSRGPVVFKPNPDVQEDASSKKPNIDAATLRFQPTKRPQLPQKAKPKGQFPKAVPQETGSFPASISKPPQTAKPAVKSTLADWTATGDDDDVNGFYAGEKRQRGGRKRRKNKHREEHVAAQDWDDIYDPARPNSYEEYKHSDEKIREIREWKDRLYAHRMARKSESEKDSDDEDYRPQMNSQFAPPSNYSFAPPPIDPPSPKASTVPPPPPLETNPPALELPKPAIIEGAISRAPVRYNLPPAPSELPSSEAELEQALAAEPEEGDELTVTEDTPRSRRPGQKGFAERLMSKYGWSKGTGLGADGSGIVNPLRVQIEKRKKKSDAEGGGFRDPPGGRGKIIGGKKNVPEKESETGKFGAMSEVVVLRGMVDGMNLDEEVESAGDGGLMQEIGDECDEKACSFLQYGRVERVYIDRNGETPKVFVKFTNQLSALRAVNALEGRIFNGNTISALFYDTETFETGNYEAKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.31
3 0.27
4 0.2
5 0.2
6 0.18
7 0.17
8 0.13
9 0.11
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.12
14 0.13
15 0.14
16 0.15
17 0.16
18 0.16
19 0.17
20 0.2
21 0.21
22 0.24
23 0.25
24 0.32
25 0.35
26 0.35
27 0.4
28 0.42
29 0.42
30 0.43
31 0.42
32 0.36
33 0.41
34 0.4
35 0.38
36 0.39
37 0.4
38 0.38
39 0.39
40 0.38
41 0.34
42 0.34
43 0.36
44 0.34
45 0.36
46 0.43
47 0.42
48 0.43
49 0.43
50 0.4
51 0.45
52 0.49
53 0.55
54 0.52
55 0.6
56 0.66
57 0.73
58 0.83
59 0.83
60 0.84
61 0.84
62 0.85
63 0.82
64 0.84
65 0.82
66 0.8
67 0.79
68 0.72
69 0.73
70 0.73
71 0.7
72 0.61
73 0.53
74 0.49
75 0.42
76 0.42
77 0.32
78 0.24
79 0.2
80 0.25
81 0.24
82 0.23
83 0.26
84 0.26
85 0.29
86 0.3
87 0.36
88 0.36
89 0.43
90 0.47
91 0.5
92 0.51
93 0.49
94 0.51
95 0.46
96 0.41
97 0.42
98 0.36
99 0.28
100 0.23
101 0.23
102 0.2
103 0.19
104 0.18
105 0.09
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.06
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.1
115 0.12
116 0.18
117 0.19
118 0.19
119 0.27
120 0.36
121 0.45
122 0.54
123 0.62
124 0.68
125 0.78
126 0.87
127 0.92
128 0.94
129 0.95
130 0.95
131 0.94
132 0.92
133 0.89
134 0.87
135 0.82
136 0.77
137 0.65
138 0.55
139 0.46
140 0.36
141 0.28
142 0.2
143 0.14
144 0.09
145 0.14
146 0.14
147 0.13
148 0.15
149 0.15
150 0.17
151 0.23
152 0.27
153 0.25
154 0.28
155 0.35
156 0.36
157 0.39
158 0.39
159 0.39
160 0.35
161 0.4
162 0.45
163 0.4
164 0.4
165 0.41
166 0.45
167 0.47
168 0.49
169 0.42
170 0.42
171 0.41
172 0.42
173 0.45
174 0.47
175 0.45
176 0.48
177 0.49
178 0.45
179 0.47
180 0.48
181 0.45
182 0.46
183 0.43
184 0.39
185 0.39
186 0.37
187 0.35
188 0.32
189 0.28
190 0.21
191 0.2
192 0.2
193 0.19
194 0.18
195 0.16
196 0.16
197 0.17
198 0.17
199 0.18
200 0.2
201 0.19
202 0.23
203 0.23
204 0.23
205 0.23
206 0.22
207 0.21
208 0.18
209 0.19
210 0.18
211 0.17
212 0.17
213 0.2
214 0.22
215 0.21
216 0.24
217 0.28
218 0.26
219 0.27
220 0.25
221 0.24
222 0.28
223 0.33
224 0.34
225 0.33
226 0.34
227 0.34
228 0.35
229 0.34
230 0.34
231 0.3
232 0.29
233 0.25
234 0.24
235 0.23
236 0.22
237 0.2
238 0.14
239 0.14
240 0.12
241 0.12
242 0.1
243 0.1
244 0.09
245 0.1
246 0.09
247 0.09
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.12
255 0.12
256 0.18
257 0.2
258 0.22
259 0.21
260 0.24
261 0.26
262 0.24
263 0.22
264 0.17
265 0.18
266 0.17
267 0.18
268 0.16
269 0.13
270 0.12
271 0.1
272 0.1
273 0.07
274 0.06
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.04
282 0.03
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.04
289 0.05
290 0.07
291 0.08
292 0.12
293 0.14
294 0.19
295 0.26
296 0.33
297 0.41
298 0.49
299 0.53
300 0.58
301 0.62
302 0.61
303 0.59
304 0.55
305 0.47
306 0.41
307 0.39
308 0.3
309 0.25
310 0.26
311 0.24
312 0.23
313 0.23
314 0.21
315 0.19
316 0.22
317 0.2
318 0.16
319 0.13
320 0.11
321 0.1
322 0.09
323 0.08
324 0.05
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.07
330 0.08
331 0.09
332 0.13
333 0.23
334 0.34
335 0.44
336 0.51
337 0.58
338 0.61
339 0.66
340 0.72
341 0.71
342 0.69
343 0.65
344 0.65
345 0.6
346 0.59
347 0.53
348 0.44
349 0.39
350 0.3
351 0.26
352 0.26
353 0.23
354 0.2
355 0.21
356 0.24
357 0.26
358 0.31
359 0.35
360 0.33
361 0.37
362 0.43
363 0.5
364 0.5
365 0.44
366 0.42
367 0.41
368 0.44
369 0.45
370 0.4
371 0.35
372 0.34
373 0.33
374 0.29
375 0.25
376 0.19
377 0.13
378 0.12
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.07
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.05
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.03
407 0.04
408 0.05
409 0.06
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.1
414 0.11
415 0.1
416 0.11
417 0.11
418 0.11
419 0.12
420 0.15
421 0.21
422 0.26
423 0.29
424 0.33
425 0.34
426 0.33
427 0.33
428 0.36
429 0.33
430 0.31
431 0.33
432 0.29
433 0.3
434 0.35
435 0.36
436 0.31
437 0.27
438 0.29
439 0.27
440 0.27
441 0.25
442 0.29
443 0.34
444 0.37
445 0.42
446 0.39
447 0.38
448 0.4
449 0.43
450 0.36
451 0.29
452 0.26
453 0.19
454 0.21
455 0.2
456 0.17
457 0.15
458 0.14
459 0.15
460 0.18
461 0.18
462 0.15
463 0.15
464 0.15
465 0.14
466 0.14
467 0.13
468 0.1
469 0.12
470 0.12
471 0.11
472 0.12
473 0.13
474 0.14
475 0.14
476 0.14
477 0.12
478 0.14
479 0.14