Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PFE1

Protein Details
Accession A0A1D8PFE1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-29SKSSKETSEKTKHINRQRLLHydrophilic
262-287KSRSQAALERKIKKRNQVLKADPLSNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 10.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR026532  BRX1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0009267  P:cellular response to starvation  
GO:0000464  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 upstream of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000465  P:exonucleolytic trimming to generate mature 5'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0030447  P:filamentous growth  
GO:0036180  P:filamentous growth of a population of unicellular organisms in response to biotic stimulus  
GO:0036170  P:filamentous growth of a population of unicellular organisms in response to starvation  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG cal:CAALFM_C112310CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MSAIYKALQSKSSKETSEKTKHINRQRLLVISSRGITYRHRHLIQDLLALLPHARKEPKFDSKKNLHQLNEVAELYNCNNIFFFECRKHQDLYLWISKPPNGPTLKFHIQNLHTLDELNFTGNCLKGSRPILSFDKSFLENDHYKLLKEMFLQTFGVPPNARKSKPFIDHVMTFSIVDGKIWIRNYQINETLDVKENDKIEDDEDYDVDQLNLVEIGPRLVLTLITVLEGSFSGPKIYENKQYVSPNFVRAQLKQQAADQAKSRSQAALERKIKKRNQVLKADPLSNDALFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.48
3 0.52
4 0.59
5 0.59
6 0.62
7 0.66
8 0.73
9 0.78
10 0.81
11 0.73
12 0.71
13 0.7
14 0.66
15 0.58
16 0.54
17 0.48
18 0.4
19 0.39
20 0.32
21 0.28
22 0.26
23 0.29
24 0.3
25 0.35
26 0.41
27 0.42
28 0.42
29 0.44
30 0.49
31 0.44
32 0.42
33 0.33
34 0.25
35 0.22
36 0.21
37 0.19
38 0.14
39 0.13
40 0.14
41 0.19
42 0.19
43 0.27
44 0.35
45 0.45
46 0.53
47 0.58
48 0.63
49 0.68
50 0.77
51 0.79
52 0.77
53 0.68
54 0.63
55 0.6
56 0.54
57 0.5
58 0.4
59 0.31
60 0.24
61 0.23
62 0.2
63 0.22
64 0.17
65 0.13
66 0.12
67 0.12
68 0.15
69 0.15
70 0.19
71 0.2
72 0.24
73 0.3
74 0.33
75 0.34
76 0.32
77 0.34
78 0.35
79 0.36
80 0.39
81 0.34
82 0.33
83 0.33
84 0.34
85 0.33
86 0.3
87 0.31
88 0.26
89 0.26
90 0.28
91 0.35
92 0.39
93 0.37
94 0.36
95 0.36
96 0.35
97 0.38
98 0.38
99 0.31
100 0.25
101 0.24
102 0.22
103 0.17
104 0.17
105 0.12
106 0.09
107 0.08
108 0.1
109 0.09
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.12
114 0.15
115 0.17
116 0.17
117 0.21
118 0.23
119 0.25
120 0.25
121 0.21
122 0.21
123 0.19
124 0.19
125 0.15
126 0.18
127 0.16
128 0.17
129 0.21
130 0.19
131 0.18
132 0.19
133 0.19
134 0.15
135 0.14
136 0.17
137 0.13
138 0.14
139 0.15
140 0.13
141 0.15
142 0.14
143 0.16
144 0.12
145 0.13
146 0.2
147 0.24
148 0.25
149 0.25
150 0.3
151 0.35
152 0.39
153 0.42
154 0.38
155 0.37
156 0.38
157 0.38
158 0.34
159 0.27
160 0.22
161 0.18
162 0.16
163 0.11
164 0.09
165 0.09
166 0.08
167 0.1
168 0.11
169 0.12
170 0.12
171 0.16
172 0.19
173 0.22
174 0.27
175 0.25
176 0.26
177 0.28
178 0.27
179 0.28
180 0.26
181 0.24
182 0.21
183 0.21
184 0.19
185 0.18
186 0.17
187 0.14
188 0.15
189 0.14
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.1
223 0.15
224 0.19
225 0.27
226 0.29
227 0.32
228 0.38
229 0.44
230 0.43
231 0.47
232 0.45
233 0.42
234 0.4
235 0.44
236 0.41
237 0.37
238 0.44
239 0.43
240 0.44
241 0.4
242 0.41
243 0.43
244 0.44
245 0.46
246 0.42
247 0.4
248 0.4
249 0.41
250 0.4
251 0.32
252 0.3
253 0.34
254 0.37
255 0.42
256 0.48
257 0.56
258 0.63
259 0.71
260 0.75
261 0.77
262 0.8
263 0.79
264 0.8
265 0.81
266 0.8
267 0.81
268 0.81
269 0.76
270 0.65
271 0.59
272 0.53