Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DCX8

Protein Details
Accession S3DCX8    Localization Confidence High Confidence Score 20.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MAEPPYKRNRRPDSKQMWDEADHydrophilic
30-66IPTRERDDRRDDRRDDRRRYRSRSPRRDDRRGGGRERBasic
129-148RERSREVKRDRSRSPKRERNBasic
262-281GAVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-83RERDDRRDDRRDDRRRYRSRSPRRDDRRGGGRERGGRRDDREWRNEGRGSR
123-166DGRDRPRERSREVKRDRSRSPKRERNMEERRDAERELKREDREK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG glz:GLAREA_00991  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MAEPPYKRNRRPDSKQMWDEADRRAPSAPIPTRERDDRRDDRRDDRRRYRSRSPRRDDRRGGGRERGGRRDDREWRNEGRGSRRDDYRDRDGPRDRGMYAPADIFALPYRQKSDTVACEDRRDGRDRPRERSREVKRDRSRSPKRERNMEERRDAERELKREDREKSRSLIPDELPTKSRTATPPVSFKVGAPQAQAQDHDRMEVDLSRKSKEKPVEIPVADEEDDDEIVIEDDGMADMQAMMGFGGFSTTQNKKILGNNIGAVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPTRDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.86
3 0.8
4 0.76
5 0.72
6 0.66
7 0.62
8 0.6
9 0.5
10 0.45
11 0.41
12 0.35
13 0.31
14 0.38
15 0.38
16 0.37
17 0.42
18 0.45
19 0.5
20 0.59
21 0.63
22 0.59
23 0.63
24 0.65
25 0.69
26 0.73
27 0.73
28 0.74
29 0.78
30 0.81
31 0.82
32 0.83
33 0.85
34 0.85
35 0.88
36 0.89
37 0.89
38 0.9
39 0.91
40 0.89
41 0.89
42 0.89
43 0.92
44 0.88
45 0.86
46 0.84
47 0.8
48 0.76
49 0.73
50 0.7
51 0.68
52 0.67
53 0.65
54 0.6
55 0.58
56 0.58
57 0.59
58 0.62
59 0.62
60 0.62
61 0.6
62 0.6
63 0.6
64 0.59
65 0.55
66 0.54
67 0.53
68 0.54
69 0.53
70 0.54
71 0.54
72 0.56
73 0.58
74 0.57
75 0.58
76 0.55
77 0.58
78 0.59
79 0.57
80 0.55
81 0.51
82 0.43
83 0.37
84 0.35
85 0.29
86 0.23
87 0.19
88 0.14
89 0.13
90 0.11
91 0.1
92 0.09
93 0.11
94 0.1
95 0.11
96 0.14
97 0.15
98 0.16
99 0.17
100 0.21
101 0.22
102 0.28
103 0.33
104 0.32
105 0.33
106 0.34
107 0.36
108 0.35
109 0.36
110 0.32
111 0.36
112 0.45
113 0.48
114 0.54
115 0.59
116 0.61
117 0.6
118 0.67
119 0.66
120 0.67
121 0.7
122 0.72
123 0.71
124 0.74
125 0.77
126 0.78
127 0.79
128 0.79
129 0.82
130 0.79
131 0.76
132 0.78
133 0.76
134 0.76
135 0.75
136 0.7
137 0.65
138 0.6
139 0.58
140 0.5
141 0.46
142 0.43
143 0.38
144 0.36
145 0.36
146 0.37
147 0.37
148 0.41
149 0.45
150 0.46
151 0.47
152 0.47
153 0.44
154 0.45
155 0.46
156 0.43
157 0.42
158 0.34
159 0.36
160 0.35
161 0.34
162 0.3
163 0.27
164 0.25
165 0.21
166 0.23
167 0.18
168 0.23
169 0.28
170 0.29
171 0.34
172 0.35
173 0.37
174 0.34
175 0.32
176 0.33
177 0.3
178 0.28
179 0.23
180 0.24
181 0.23
182 0.24
183 0.26
184 0.21
185 0.22
186 0.21
187 0.2
188 0.18
189 0.15
190 0.16
191 0.17
192 0.17
193 0.17
194 0.19
195 0.21
196 0.24
197 0.26
198 0.32
199 0.35
200 0.39
201 0.4
202 0.45
203 0.51
204 0.49
205 0.49
206 0.43
207 0.4
208 0.34
209 0.27
210 0.21
211 0.13
212 0.13
213 0.1
214 0.09
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.04
234 0.05
235 0.06
236 0.12
237 0.15
238 0.2
239 0.23
240 0.24
241 0.26
242 0.32
243 0.39
244 0.37
245 0.38
246 0.37
247 0.41
248 0.44
249 0.41
250 0.4
251 0.38
252 0.38
253 0.4
254 0.43
255 0.46
256 0.53
257 0.63
258 0.67
259 0.72
260 0.76
261 0.8
262 0.81
263 0.78
264 0.72
265 0.64
266 0.57
267 0.54
268 0.5
269 0.45
270 0.41
271 0.38
272 0.37