Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DC13

Protein Details
Accession S3DC13    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-185DATQEKLSKTRKKRPVPKTWVDRDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
171-174RKKR
Subcellular Location(s) cyto 17.5, cyto_nucl 14.5, nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024977  Apc4-like_WD40_dom  
IPR013915  Pre-mRNA_splic_Prp19  
IPR038959  Prp19  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0070534  P:protein K63-linked ubiquitination  
KEGG glz:GLAREA_00691  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12894  ANAPC4_WD40  
PF08606  Prp19  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
PS50082  WD_REPEATS_2  
CDD cd16656  RING-Ubox_PRP19  
Amino Acid Sequences MLCSISGEAPQHPVASSKSGIVYEKRLIETYIAENHKDPVNGEELETTDLIDLKSSRIVTPRPPTLTSIPSLLSTFQNEWDAIALESFTLRQQLDQVRKELATALYQHDAAIRVIARVTKERDEARDALSKVSVGAGASGNGDAMQIDSEGLPEDLAAKVDATQEKLSKTRKKRPVPKTWVDRDTIEKFGVASSSEELFAGASSLAVDESGDLVVTGGSEGTAGIYSISEKKVQQSFKVGGAVTDAVWYGSQPVVSTTSGAVKVFGDSEATFTSHAGSANALALHPCGDILASVGVDKSFVIYDLVKGRPVTQIYTDSELTTAAFHPDGHLFAAGGADGQIKLFHTKSGENAANFDLGGPVQDVSFSENGIWFAAVAKGSNSVVIFDLRKEGKAAEAEVLEIGGQVDSIRWDYTGQYLAASGPRGLTITQYTKSTKSWSDVISTAVPATAVEWGSAAKTLVTVNGDGIITVLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.23
3 0.23
4 0.21
5 0.22
6 0.23
7 0.27
8 0.28
9 0.31
10 0.32
11 0.36
12 0.36
13 0.34
14 0.33
15 0.31
16 0.3
17 0.29
18 0.32
19 0.3
20 0.3
21 0.3
22 0.32
23 0.34
24 0.31
25 0.27
26 0.22
27 0.24
28 0.22
29 0.22
30 0.21
31 0.18
32 0.2
33 0.19
34 0.16
35 0.12
36 0.13
37 0.11
38 0.12
39 0.12
40 0.11
41 0.15
42 0.16
43 0.17
44 0.22
45 0.25
46 0.32
47 0.4
48 0.46
49 0.47
50 0.47
51 0.5
52 0.5
53 0.5
54 0.43
55 0.37
56 0.3
57 0.27
58 0.26
59 0.23
60 0.2
61 0.2
62 0.19
63 0.19
64 0.2
65 0.18
66 0.18
67 0.17
68 0.16
69 0.12
70 0.11
71 0.09
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.09
77 0.09
78 0.09
79 0.15
80 0.24
81 0.32
82 0.35
83 0.37
84 0.37
85 0.37
86 0.37
87 0.34
88 0.27
89 0.21
90 0.2
91 0.2
92 0.19
93 0.19
94 0.19
95 0.18
96 0.18
97 0.15
98 0.15
99 0.12
100 0.1
101 0.11
102 0.13
103 0.14
104 0.18
105 0.22
106 0.23
107 0.28
108 0.31
109 0.34
110 0.37
111 0.37
112 0.35
113 0.38
114 0.35
115 0.32
116 0.29
117 0.25
118 0.19
119 0.18
120 0.14
121 0.07
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.06
147 0.09
148 0.11
149 0.12
150 0.15
151 0.16
152 0.18
153 0.24
154 0.32
155 0.38
156 0.46
157 0.54
158 0.62
159 0.71
160 0.8
161 0.84
162 0.87
163 0.87
164 0.87
165 0.87
166 0.85
167 0.78
168 0.7
169 0.62
170 0.57
171 0.51
172 0.43
173 0.33
174 0.25
175 0.21
176 0.18
177 0.17
178 0.11
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.02
205 0.02
206 0.02
207 0.02
208 0.02
209 0.02
210 0.02
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.06
215 0.07
216 0.09
217 0.09
218 0.14
219 0.19
220 0.21
221 0.21
222 0.24
223 0.25
224 0.25
225 0.27
226 0.22
227 0.17
228 0.17
229 0.15
230 0.1
231 0.09
232 0.07
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.04
240 0.05
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.09
261 0.08
262 0.09
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.05
271 0.06
272 0.05
273 0.05
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.06
289 0.06
290 0.08
291 0.13
292 0.14
293 0.15
294 0.16
295 0.17
296 0.19
297 0.2
298 0.19
299 0.17
300 0.21
301 0.21
302 0.25
303 0.24
304 0.2
305 0.19
306 0.18
307 0.16
308 0.13
309 0.1
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.09
314 0.1
315 0.1
316 0.09
317 0.09
318 0.08
319 0.07
320 0.08
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.06
329 0.09
330 0.09
331 0.11
332 0.12
333 0.13
334 0.16
335 0.23
336 0.26
337 0.23
338 0.25
339 0.24
340 0.22
341 0.21
342 0.19
343 0.12
344 0.08
345 0.08
346 0.07
347 0.06
348 0.05
349 0.06
350 0.06
351 0.08
352 0.09
353 0.08
354 0.08
355 0.09
356 0.1
357 0.1
358 0.09
359 0.06
360 0.07
361 0.08
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.09
366 0.09
367 0.11
368 0.1
369 0.1
370 0.11
371 0.13
372 0.14
373 0.12
374 0.19
375 0.18
376 0.19
377 0.19
378 0.19
379 0.19
380 0.21
381 0.21
382 0.17
383 0.16
384 0.16
385 0.15
386 0.15
387 0.11
388 0.09
389 0.08
390 0.05
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.06
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.09
399 0.1
400 0.13
401 0.16
402 0.15
403 0.13
404 0.13
405 0.14
406 0.16
407 0.17
408 0.14
409 0.11
410 0.12
411 0.12
412 0.12
413 0.13
414 0.17
415 0.21
416 0.23
417 0.27
418 0.3
419 0.32
420 0.34
421 0.37
422 0.35
423 0.34
424 0.37
425 0.35
426 0.36
427 0.34
428 0.36
429 0.32
430 0.29
431 0.24
432 0.19
433 0.17
434 0.12
435 0.12
436 0.11
437 0.1
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.1
442 0.11
443 0.11
444 0.07
445 0.08
446 0.09
447 0.11
448 0.13
449 0.13
450 0.12
451 0.14
452 0.14
453 0.13