Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CXR0

Protein Details
Accession S3CXR0    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
284-305TTTTNGGRKKKRKGAMTNPSTYHydrophilic
369-388NYTMSGKKHVKKGKYQSGMEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
291-296RKKKRK
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG glz:GLAREA_00879  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MARKKWIDKKTATHFTLVHRPQNDPLLHDAEASSMVLNPTNVPNSSKVKQLDDLASELGSDVNHIRDNEGEAASYGVYYDDTEYDYMQHMRELGSGSGEAHFVEAPAPTNKGKGKQSLEDALRNAKLEDREGIELDEEILPSKNLRKVTYQAQQDVPDALAGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDEDEDIFGQLAKDGEEIDEEEFEQGAFEDDDEEGWESDDTAKPSKEYSDAPKGPPELLDDEREDHGDGDWMANFSKFKKDQKAQVPLAPSQSDLQSSMMTTTTNGGRKKKRKGAMTNPSTYSMTSSSMFRTEGMSTLDTRFEKLEEKYNEDMDDDNSVSAVSSVSSVQGPVRGDFNNIMDDFLGNYTMSGKKHVKKGKYQSGMEQLDEVRRGLGPAIIRKQYV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.6
3 0.63
4 0.6
5 0.58
6 0.5
7 0.51
8 0.5
9 0.55
10 0.5
11 0.42
12 0.41
13 0.38
14 0.35
15 0.33
16 0.28
17 0.21
18 0.2
19 0.17
20 0.12
21 0.09
22 0.1
23 0.1
24 0.11
25 0.12
26 0.15
27 0.18
28 0.19
29 0.2
30 0.25
31 0.31
32 0.32
33 0.38
34 0.37
35 0.38
36 0.4
37 0.43
38 0.41
39 0.36
40 0.36
41 0.3
42 0.26
43 0.22
44 0.18
45 0.14
46 0.1
47 0.09
48 0.08
49 0.1
50 0.13
51 0.14
52 0.14
53 0.15
54 0.18
55 0.2
56 0.18
57 0.16
58 0.13
59 0.14
60 0.13
61 0.11
62 0.08
63 0.05
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.12
73 0.13
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.12
78 0.13
79 0.14
80 0.11
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.09
93 0.1
94 0.13
95 0.13
96 0.18
97 0.21
98 0.26
99 0.3
100 0.35
101 0.38
102 0.4
103 0.44
104 0.47
105 0.48
106 0.45
107 0.43
108 0.4
109 0.36
110 0.33
111 0.28
112 0.24
113 0.22
114 0.19
115 0.2
116 0.18
117 0.18
118 0.18
119 0.18
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.11
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.07
128 0.08
129 0.12
130 0.15
131 0.17
132 0.19
133 0.22
134 0.25
135 0.33
136 0.39
137 0.4
138 0.4
139 0.4
140 0.4
141 0.37
142 0.34
143 0.26
144 0.19
145 0.14
146 0.11
147 0.09
148 0.07
149 0.06
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.12
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.08
210 0.1
211 0.11
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.13
216 0.14
217 0.15
218 0.2
219 0.28
220 0.31
221 0.32
222 0.34
223 0.34
224 0.32
225 0.3
226 0.26
227 0.2
228 0.19
229 0.2
230 0.18
231 0.19
232 0.19
233 0.2
234 0.17
235 0.13
236 0.11
237 0.1
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.17
247 0.2
248 0.26
249 0.35
250 0.4
251 0.48
252 0.57
253 0.65
254 0.6
255 0.59
256 0.57
257 0.49
258 0.48
259 0.39
260 0.31
261 0.23
262 0.21
263 0.18
264 0.15
265 0.14
266 0.11
267 0.11
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.1
273 0.13
274 0.19
275 0.24
276 0.31
277 0.41
278 0.5
279 0.6
280 0.67
281 0.7
282 0.74
283 0.79
284 0.82
285 0.83
286 0.82
287 0.78
288 0.71
289 0.67
290 0.58
291 0.47
292 0.39
293 0.29
294 0.23
295 0.19
296 0.18
297 0.16
298 0.17
299 0.17
300 0.15
301 0.16
302 0.14
303 0.15
304 0.17
305 0.16
306 0.16
307 0.17
308 0.22
309 0.2
310 0.21
311 0.19
312 0.18
313 0.21
314 0.22
315 0.3
316 0.29
317 0.35
318 0.36
319 0.37
320 0.36
321 0.33
322 0.32
323 0.23
324 0.23
325 0.17
326 0.14
327 0.12
328 0.11
329 0.1
330 0.09
331 0.08
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.09
339 0.13
340 0.14
341 0.14
342 0.17
343 0.17
344 0.2
345 0.21
346 0.22
347 0.24
348 0.22
349 0.22
350 0.19
351 0.18
352 0.16
353 0.14
354 0.14
355 0.08
356 0.08
357 0.11
358 0.15
359 0.15
360 0.22
361 0.29
362 0.35
363 0.45
364 0.54
365 0.59
366 0.65
367 0.76
368 0.79
369 0.8
370 0.77
371 0.76
372 0.77
373 0.72
374 0.63
375 0.55
376 0.47
377 0.43
378 0.41
379 0.33
380 0.24
381 0.21
382 0.21
383 0.18
384 0.19
385 0.19
386 0.26
387 0.34