Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D6M3

Protein Details
Accession B0D6M3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
234-285LDQNKIKKFKNLTIKRRWKRWQRSLTGLTVLNLRLRRRLRRSTTNRSKSSTKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
240-253KKFKNLTIKRRWKR
269-274RRRLRR
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 11, cyto 1, plas 1, pero 1, cyto_pero 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006073  GTP-bd  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025662  Sigma_54_int_dom_ATP-bd_1  
Gene Ontology GO:0005525  F:GTP binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_318387  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01926  MMR_HSR1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00675  SIGMA54_INTERACT_1  
CDD cd00882  Ras_like_GTPase  
Amino Acid Sequences MKPAPLVCTSFSNTKMYVEALSPVEFPRIAVSSLKAGNVMTTRGSFTVILVGETGTGKTSFLSLLVNVLAGKTPSSYNLEPYDVTNEYGGPQKHSQTKAAKVYKFTSLNGVDITVLDTPGLADTRGLEKDNEHKESITTAIGENIPEVTAVIILANGTNPRLGVATDYTITTLSSIFPRTLAENIGILFTNVSNPLSWNFELDTLPDELRRAKSFLIDNPLGMQKKYLKDCGKLDQNKIKKFKNLTIKRRWKRWQRSLTGLTVLNLRLRRRLRRSTTNRSKSSTKSTARWPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.25
4 0.23
5 0.18
6 0.19
7 0.18
8 0.18
9 0.18
10 0.17
11 0.18
12 0.17
13 0.16
14 0.16
15 0.15
16 0.16
17 0.16
18 0.17
19 0.2
20 0.21
21 0.21
22 0.19
23 0.17
24 0.18
25 0.18
26 0.18
27 0.14
28 0.14
29 0.15
30 0.15
31 0.17
32 0.14
33 0.13
34 0.16
35 0.14
36 0.13
37 0.12
38 0.11
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.08
47 0.07
48 0.07
49 0.08
50 0.07
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.09
62 0.16
63 0.16
64 0.19
65 0.21
66 0.22
67 0.22
68 0.23
69 0.25
70 0.2
71 0.2
72 0.16
73 0.14
74 0.13
75 0.18
76 0.18
77 0.18
78 0.19
79 0.23
80 0.3
81 0.32
82 0.38
83 0.38
84 0.45
85 0.5
86 0.55
87 0.53
88 0.5
89 0.5
90 0.5
91 0.46
92 0.39
93 0.36
94 0.29
95 0.28
96 0.24
97 0.22
98 0.15
99 0.13
100 0.14
101 0.07
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.08
112 0.09
113 0.1
114 0.09
115 0.11
116 0.19
117 0.24
118 0.26
119 0.24
120 0.23
121 0.23
122 0.23
123 0.23
124 0.15
125 0.1
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.02
140 0.02
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.1
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.1
173 0.09
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.06
181 0.07
182 0.09
183 0.12
184 0.13
185 0.13
186 0.13
187 0.14
188 0.14
189 0.13
190 0.14
191 0.12
192 0.12
193 0.11
194 0.12
195 0.14
196 0.17
197 0.18
198 0.18
199 0.17
200 0.21
201 0.24
202 0.27
203 0.31
204 0.28
205 0.27
206 0.28
207 0.33
208 0.3
209 0.27
210 0.27
211 0.25
212 0.31
213 0.35
214 0.41
215 0.4
216 0.45
217 0.49
218 0.54
219 0.59
220 0.59
221 0.63
222 0.64
223 0.69
224 0.71
225 0.75
226 0.72
227 0.69
228 0.69
229 0.68
230 0.69
231 0.71
232 0.72
233 0.76
234 0.82
235 0.84
236 0.88
237 0.9
238 0.9
239 0.91
240 0.91
241 0.91
242 0.87
243 0.88
244 0.83
245 0.77
246 0.7
247 0.6
248 0.5
249 0.43
250 0.37
251 0.32
252 0.32
253 0.3
254 0.34
255 0.4
256 0.5
257 0.55
258 0.64
259 0.68
260 0.74
261 0.82
262 0.85
263 0.89
264 0.89
265 0.86
266 0.81
267 0.79
268 0.74
269 0.74
270 0.73
271 0.69
272 0.64