Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PCQ3

Protein Details
Accession A0A1D8PCQ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
524-554PVEKESKAAAKNRKKREAKKQAQEKNNSPAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
527-544KESKAAAKNRKKREAKKQ
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 10.5, nucl 7.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011387  TIF2A  
IPR013979  TIF_beta_prop-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0022627  C:cytosolic small ribosomal subunit  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0043022  F:ribosome binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0000049  F:tRNA binding  
KEGG cal:CAALFM_C102430CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08662  eIF2A  
Amino Acid Sequences MSKTTEIFCRLPKSVELIQDFKDITPSPKANAECRAALYSKNGDFFAYTQPQEVVILDTTGEAKVYHRIEIPEVFDIYFSPEGTYLCLWCKPIQLNKENGTWNNNLKIFNIKTKTIIAEWSAKHQNAWKPQFTSEENLFARSINQKEIHFFELDPTSDSTVNINQPSFKYKVNDPKATLQAFQISPGRNPSVAIFIPEKSGKPANVSIYNIPNFNQPICFKNFFKAEKCQLKWNSLGTALLALASTDHDTTNKSYYGETNLYLLGIAGSYDSRIDLKREGPIHDITWSPTAREFAVSYGYMPSETTFFDSRGNAIHSLPTAPRNTILYSPHAKFVLVAGFGNLQGTVDVYDRQNKFSKVVTFEASNTSVCEWSPCGRFILTATTSPRLRVDNGCKIWHASGKLIYLKEFPELFSIGWKPQPLDCFPPIRNLEPAPEAHESTKEYLEKRQALASAAAKKPAGAYRPPHARGGGAGSGSGVASSLYQKELQNNLRSNGSTPSPPPGLSRAAGNIPRVRTVVGAPPPVEKESKAAAKNRKKREAKKQAQEKNNSPAPEATTSASPVPAQAQAPASTPAPTPATAGVIGGVASLEEKKIRSLLKKLRAIEQLKMKQASGETLEDTQVIKISKEDEIRSELQTLGWNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.45
3 0.44
4 0.41
5 0.41
6 0.43
7 0.42
8 0.35
9 0.35
10 0.29
11 0.28
12 0.33
13 0.32
14 0.31
15 0.37
16 0.4
17 0.4
18 0.45
19 0.46
20 0.39
21 0.4
22 0.41
23 0.36
24 0.34
25 0.35
26 0.35
27 0.34
28 0.34
29 0.31
30 0.27
31 0.27
32 0.27
33 0.3
34 0.29
35 0.27
36 0.26
37 0.26
38 0.26
39 0.25
40 0.24
41 0.18
42 0.13
43 0.12
44 0.1
45 0.11
46 0.11
47 0.1
48 0.1
49 0.08
50 0.08
51 0.16
52 0.17
53 0.19
54 0.21
55 0.23
56 0.26
57 0.29
58 0.31
59 0.27
60 0.27
61 0.24
62 0.21
63 0.19
64 0.2
65 0.18
66 0.15
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.15
71 0.16
72 0.13
73 0.15
74 0.17
75 0.19
76 0.19
77 0.24
78 0.29
79 0.36
80 0.43
81 0.47
82 0.53
83 0.54
84 0.59
85 0.59
86 0.55
87 0.53
88 0.49
89 0.46
90 0.46
91 0.45
92 0.4
93 0.35
94 0.41
95 0.38
96 0.42
97 0.42
98 0.36
99 0.35
100 0.37
101 0.38
102 0.31
103 0.3
104 0.25
105 0.28
106 0.27
107 0.32
108 0.36
109 0.34
110 0.35
111 0.39
112 0.43
113 0.46
114 0.52
115 0.5
116 0.47
117 0.49
118 0.53
119 0.49
120 0.48
121 0.4
122 0.41
123 0.36
124 0.35
125 0.32
126 0.27
127 0.27
128 0.27
129 0.27
130 0.25
131 0.27
132 0.26
133 0.3
134 0.33
135 0.33
136 0.27
137 0.25
138 0.23
139 0.23
140 0.23
141 0.21
142 0.19
143 0.18
144 0.18
145 0.18
146 0.16
147 0.17
148 0.2
149 0.21
150 0.2
151 0.2
152 0.21
153 0.26
154 0.26
155 0.26
156 0.26
157 0.31
158 0.41
159 0.48
160 0.52
161 0.51
162 0.55
163 0.58
164 0.56
165 0.49
166 0.4
167 0.37
168 0.31
169 0.3
170 0.28
171 0.23
172 0.23
173 0.26
174 0.26
175 0.21
176 0.22
177 0.2
178 0.19
179 0.18
180 0.2
181 0.17
182 0.16
183 0.19
184 0.2
185 0.2
186 0.19
187 0.22
188 0.19
189 0.21
190 0.24
191 0.26
192 0.28
193 0.3
194 0.29
195 0.32
196 0.33
197 0.3
198 0.27
199 0.26
200 0.24
201 0.22
202 0.22
203 0.18
204 0.2
205 0.26
206 0.29
207 0.26
208 0.3
209 0.36
210 0.36
211 0.39
212 0.43
213 0.46
214 0.51
215 0.52
216 0.56
217 0.53
218 0.52
219 0.51
220 0.46
221 0.38
222 0.29
223 0.27
224 0.18
225 0.16
226 0.12
227 0.09
228 0.07
229 0.05
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.08
237 0.1
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.13
242 0.14
243 0.18
244 0.18
245 0.17
246 0.15
247 0.14
248 0.13
249 0.12
250 0.11
251 0.06
252 0.04
253 0.04
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.04
259 0.05
260 0.06
261 0.08
262 0.1
263 0.11
264 0.17
265 0.19
266 0.2
267 0.22
268 0.23
269 0.22
270 0.21
271 0.2
272 0.17
273 0.19
274 0.18
275 0.15
276 0.14
277 0.15
278 0.13
279 0.14
280 0.13
281 0.08
282 0.11
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.09
293 0.09
294 0.1
295 0.11
296 0.11
297 0.11
298 0.12
299 0.13
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.13
307 0.13
308 0.12
309 0.13
310 0.13
311 0.14
312 0.15
313 0.16
314 0.17
315 0.21
316 0.22
317 0.23
318 0.21
319 0.2
320 0.18
321 0.17
322 0.14
323 0.1
324 0.09
325 0.07
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.06
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.06
336 0.07
337 0.15
338 0.15
339 0.19
340 0.22
341 0.22
342 0.23
343 0.26
344 0.29
345 0.25
346 0.27
347 0.25
348 0.22
349 0.23
350 0.24
351 0.21
352 0.17
353 0.14
354 0.13
355 0.11
356 0.1
357 0.1
358 0.09
359 0.12
360 0.13
361 0.14
362 0.14
363 0.14
364 0.14
365 0.14
366 0.18
367 0.15
368 0.17
369 0.19
370 0.22
371 0.22
372 0.23
373 0.24
374 0.2
375 0.21
376 0.24
377 0.29
378 0.34
379 0.37
380 0.38
381 0.36
382 0.36
383 0.35
384 0.32
385 0.26
386 0.19
387 0.18
388 0.2
389 0.23
390 0.22
391 0.21
392 0.2
393 0.19
394 0.2
395 0.18
396 0.16
397 0.14
398 0.14
399 0.13
400 0.15
401 0.16
402 0.14
403 0.16
404 0.16
405 0.16
406 0.17
407 0.2
408 0.2
409 0.24
410 0.26
411 0.29
412 0.29
413 0.36
414 0.37
415 0.35
416 0.35
417 0.3
418 0.3
419 0.26
420 0.26
421 0.23
422 0.22
423 0.22
424 0.2
425 0.21
426 0.2
427 0.2
428 0.23
429 0.22
430 0.21
431 0.25
432 0.32
433 0.33
434 0.32
435 0.32
436 0.29
437 0.27
438 0.3
439 0.3
440 0.3
441 0.28
442 0.29
443 0.27
444 0.26
445 0.27
446 0.27
447 0.25
448 0.23
449 0.26
450 0.32
451 0.42
452 0.44
453 0.44
454 0.41
455 0.37
456 0.33
457 0.33
458 0.27
459 0.18
460 0.15
461 0.13
462 0.13
463 0.12
464 0.11
465 0.06
466 0.04
467 0.04
468 0.06
469 0.07
470 0.08
471 0.12
472 0.13
473 0.18
474 0.26
475 0.32
476 0.38
477 0.41
478 0.41
479 0.41
480 0.4
481 0.37
482 0.33
483 0.29
484 0.24
485 0.22
486 0.26
487 0.24
488 0.24
489 0.25
490 0.25
491 0.26
492 0.23
493 0.24
494 0.21
495 0.25
496 0.28
497 0.31
498 0.32
499 0.3
500 0.32
501 0.31
502 0.29
503 0.24
504 0.23
505 0.25
506 0.26
507 0.28
508 0.27
509 0.29
510 0.31
511 0.33
512 0.32
513 0.25
514 0.23
515 0.26
516 0.32
517 0.35
518 0.4
519 0.49
520 0.58
521 0.67
522 0.74
523 0.78
524 0.81
525 0.86
526 0.89
527 0.9
528 0.9
529 0.91
530 0.92
531 0.91
532 0.9
533 0.89
534 0.84
535 0.82
536 0.77
537 0.67
538 0.59
539 0.51
540 0.46
541 0.4
542 0.35
543 0.28
544 0.23
545 0.24
546 0.23
547 0.21
548 0.17
549 0.15
550 0.15
551 0.16
552 0.15
553 0.16
554 0.18
555 0.18
556 0.2
557 0.22
558 0.2
559 0.19
560 0.19
561 0.19
562 0.19
563 0.18
564 0.18
565 0.16
566 0.18
567 0.16
568 0.16
569 0.12
570 0.1
571 0.09
572 0.08
573 0.06
574 0.04
575 0.05
576 0.06
577 0.07
578 0.09
579 0.1
580 0.12
581 0.17
582 0.23
583 0.29
584 0.39
585 0.47
586 0.55
587 0.62
588 0.63
589 0.67
590 0.71
591 0.68
592 0.65
593 0.66
594 0.63
595 0.63
596 0.62
597 0.54
598 0.48
599 0.45
600 0.42
601 0.36
602 0.31
603 0.25
604 0.25
605 0.25
606 0.23
607 0.23
608 0.19
609 0.19
610 0.17
611 0.15
612 0.15
613 0.17
614 0.21
615 0.26
616 0.28
617 0.28
618 0.34
619 0.36
620 0.37
621 0.36
622 0.31
623 0.27