Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DDX6

Protein Details
Accession S3DDX6    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-36ALAIRQHERRAVKRKEKNLRQWATTQRQHydrophilic
308-339MRTPLMEAKRKERKMKKKLAKKQKLTPDMWEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-24RRAVKRKE
310-332TPLMEAKRKERKMKKKLAKKQKL
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 10.5, cyto_mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005824  KOW  
IPR041988  KOW_RPL26/RPL24  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR003256  Ribosomal_L24  
IPR005825  Ribosomal_L24/26_CS  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG glz:GLAREA_05298  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00467  KOW  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01108  RIBOSOMAL_L24  
CDD cd06089  KOW_RPL26  
Amino Acid Sequences MQKVFRRTALAIRQHERRAVKRKEKNLRQWATTQRQQNTAFGRDRSARLKEEKLNRREDYELGPIRPKRDVGDLKSKYGTLDNQALQGLPLPQKELFKRLEPFGGKYLNIWKGDRVVILEGPDKGKIGIISAIDGKKAKVTVKDLNRVDIQIPQVFVEKENPDQRPVSTIDGPMDINSVRVVATIPGKDGNLKDVIVKQFVNTNFRKTRSGYSWSRMIPGLDIIVPWPKREKRVVKPKADTPSDTLRIDVDVQSYIPTLLRPPMPRSVIDELRNKFSVFRTRHEPEYIAAKEAEEQAKLDQKKTIKAMRTPLMEAKRKERKMKKKLAKKQKLTPDMWEKIGKTIAAKKGYVGKEDSGPTPEVLPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.69
3 0.68
4 0.68
5 0.69
6 0.71
7 0.76
8 0.77
9 0.84
10 0.88
11 0.91
12 0.92
13 0.92
14 0.88
15 0.82
16 0.81
17 0.81
18 0.79
19 0.75
20 0.73
21 0.66
22 0.67
23 0.65
24 0.63
25 0.58
26 0.56
27 0.54
28 0.47
29 0.48
30 0.45
31 0.48
32 0.48
33 0.47
34 0.46
35 0.47
36 0.53
37 0.56
38 0.62
39 0.67
40 0.67
41 0.71
42 0.67
43 0.65
44 0.6
45 0.54
46 0.48
47 0.47
48 0.45
49 0.39
50 0.45
51 0.43
52 0.43
53 0.43
54 0.4
55 0.33
56 0.38
57 0.42
58 0.41
59 0.49
60 0.5
61 0.51
62 0.51
63 0.49
64 0.4
65 0.36
66 0.32
67 0.25
68 0.29
69 0.26
70 0.26
71 0.26
72 0.24
73 0.21
74 0.2
75 0.19
76 0.15
77 0.15
78 0.16
79 0.18
80 0.23
81 0.25
82 0.29
83 0.28
84 0.31
85 0.34
86 0.34
87 0.39
88 0.36
89 0.37
90 0.36
91 0.35
92 0.29
93 0.28
94 0.33
95 0.31
96 0.32
97 0.29
98 0.26
99 0.26
100 0.27
101 0.25
102 0.19
103 0.16
104 0.14
105 0.15
106 0.16
107 0.15
108 0.15
109 0.15
110 0.14
111 0.12
112 0.12
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.09
118 0.13
119 0.13
120 0.14
121 0.15
122 0.14
123 0.13
124 0.15
125 0.16
126 0.16
127 0.21
128 0.28
129 0.34
130 0.43
131 0.42
132 0.43
133 0.42
134 0.39
135 0.34
136 0.29
137 0.25
138 0.17
139 0.17
140 0.14
141 0.16
142 0.15
143 0.15
144 0.16
145 0.15
146 0.19
147 0.24
148 0.25
149 0.25
150 0.26
151 0.25
152 0.24
153 0.24
154 0.23
155 0.19
156 0.18
157 0.17
158 0.17
159 0.17
160 0.14
161 0.13
162 0.09
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.14
182 0.15
183 0.15
184 0.15
185 0.13
186 0.18
187 0.19
188 0.25
189 0.22
190 0.29
191 0.31
192 0.33
193 0.36
194 0.33
195 0.37
196 0.35
197 0.41
198 0.38
199 0.38
200 0.41
201 0.39
202 0.38
203 0.33
204 0.29
205 0.22
206 0.18
207 0.15
208 0.09
209 0.08
210 0.07
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.21
215 0.22
216 0.27
217 0.36
218 0.44
219 0.48
220 0.6
221 0.68
222 0.7
223 0.73
224 0.75
225 0.74
226 0.69
227 0.61
228 0.54
229 0.53
230 0.48
231 0.43
232 0.36
233 0.28
234 0.26
235 0.25
236 0.21
237 0.14
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.08
244 0.07
245 0.08
246 0.11
247 0.15
248 0.18
249 0.21
250 0.28
251 0.3
252 0.3
253 0.35
254 0.39
255 0.4
256 0.43
257 0.47
258 0.43
259 0.46
260 0.47
261 0.41
262 0.36
263 0.35
264 0.38
265 0.34
266 0.36
267 0.4
268 0.43
269 0.47
270 0.47
271 0.44
272 0.36
273 0.41
274 0.38
275 0.31
276 0.27
277 0.23
278 0.22
279 0.26
280 0.26
281 0.17
282 0.17
283 0.18
284 0.26
285 0.28
286 0.27
287 0.28
288 0.29
289 0.35
290 0.42
291 0.46
292 0.45
293 0.49
294 0.56
295 0.58
296 0.58
297 0.56
298 0.57
299 0.59
300 0.6
301 0.58
302 0.6
303 0.63
304 0.67
305 0.74
306 0.77
307 0.79
308 0.82
309 0.89
310 0.9
311 0.9
312 0.93
313 0.94
314 0.95
315 0.93
316 0.92
317 0.91
318 0.9
319 0.82
320 0.81
321 0.79
322 0.73
323 0.68
324 0.64
325 0.54
326 0.48
327 0.48
328 0.39
329 0.34
330 0.38
331 0.41
332 0.4
333 0.39
334 0.39
335 0.45
336 0.47
337 0.46
338 0.42
339 0.37
340 0.38
341 0.41
342 0.4
343 0.35
344 0.33
345 0.3