Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DA92

Protein Details
Accession S3DA92    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
313-333AKAASSKVTKPKAKGKGKSKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
109-111KRK
150-159KREKEERRKR
304-333PAPSKGKGRAKAASSKVTKPKAKGKGKSKA
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 9.333, cyto_mito 8.833, mito 8.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024974  Sde2_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG glz:GLAREA_11061  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13019  Sde2_N_Ubi  
Amino Acid Sequences MATHTVNVLLTSFAGLQLPKTLALPLSSDTTISQLQESIHDRLPKHNERLLLTTTSNKLLPYASDAQISSLLSSPQDDFLSLRLTSRLCGGKGGFGSQLRAAGGRMSSKRKRGQGEENGSSRNLDGRRLRTVNEAKALAEYLAIKPDMAKREKEERRKRWEQVVELAERREEEIKSGNKGKVDGKWVEDKEEAGERTREAVLAAMKSGNYKDNLIETSGAGTRAASSSEDDAGEGSSKATTPPSEPEAKPKSLGFFGFDDDDEFMSDSDEEEESGIKNLPDITEADESEEEVEEIVEKEPTPPPAPSKGKGRAKAASSKVTKPKAKGKGKSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.1
4 0.13
5 0.14
6 0.13
7 0.14
8 0.14
9 0.14
10 0.15
11 0.16
12 0.14
13 0.17
14 0.17
15 0.17
16 0.16
17 0.18
18 0.19
19 0.18
20 0.16
21 0.14
22 0.14
23 0.19
24 0.23
25 0.24
26 0.27
27 0.32
28 0.32
29 0.39
30 0.48
31 0.51
32 0.53
33 0.53
34 0.52
35 0.5
36 0.54
37 0.49
38 0.43
39 0.36
40 0.35
41 0.34
42 0.32
43 0.3
44 0.25
45 0.23
46 0.19
47 0.18
48 0.19
49 0.22
50 0.21
51 0.22
52 0.22
53 0.22
54 0.23
55 0.22
56 0.17
57 0.12
58 0.12
59 0.1
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.11
66 0.12
67 0.15
68 0.13
69 0.13
70 0.14
71 0.14
72 0.14
73 0.18
74 0.2
75 0.17
76 0.2
77 0.19
78 0.21
79 0.21
80 0.22
81 0.21
82 0.18
83 0.2
84 0.17
85 0.18
86 0.14
87 0.14
88 0.13
89 0.11
90 0.11
91 0.15
92 0.19
93 0.26
94 0.32
95 0.4
96 0.46
97 0.51
98 0.56
99 0.57
100 0.62
101 0.64
102 0.67
103 0.65
104 0.61
105 0.56
106 0.5
107 0.44
108 0.34
109 0.29
110 0.21
111 0.21
112 0.24
113 0.26
114 0.33
115 0.34
116 0.35
117 0.39
118 0.43
119 0.4
120 0.38
121 0.35
122 0.28
123 0.27
124 0.26
125 0.17
126 0.13
127 0.11
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.08
133 0.12
134 0.18
135 0.19
136 0.2
137 0.23
138 0.34
139 0.42
140 0.52
141 0.59
142 0.62
143 0.69
144 0.75
145 0.75
146 0.73
147 0.7
148 0.62
149 0.58
150 0.53
151 0.46
152 0.4
153 0.37
154 0.28
155 0.23
156 0.22
157 0.16
158 0.12
159 0.1
160 0.15
161 0.17
162 0.21
163 0.25
164 0.25
165 0.24
166 0.26
167 0.27
168 0.24
169 0.28
170 0.25
171 0.23
172 0.29
173 0.29
174 0.3
175 0.28
176 0.25
177 0.22
178 0.24
179 0.22
180 0.16
181 0.17
182 0.14
183 0.16
184 0.15
185 0.14
186 0.1
187 0.11
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.12
199 0.13
200 0.14
201 0.14
202 0.14
203 0.11
204 0.12
205 0.12
206 0.12
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.07
213 0.08
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.08
227 0.09
228 0.1
229 0.14
230 0.18
231 0.25
232 0.25
233 0.34
234 0.39
235 0.39
236 0.4
237 0.37
238 0.36
239 0.31
240 0.32
241 0.25
242 0.2
243 0.21
244 0.2
245 0.19
246 0.17
247 0.15
248 0.15
249 0.12
250 0.12
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.09
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.1
262 0.1
263 0.08
264 0.09
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.11
269 0.14
270 0.16
271 0.16
272 0.18
273 0.18
274 0.18
275 0.17
276 0.17
277 0.12
278 0.09
279 0.09
280 0.07
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.11
286 0.14
287 0.19
288 0.21
289 0.23
290 0.27
291 0.36
292 0.42
293 0.45
294 0.51
295 0.57
296 0.64
297 0.68
298 0.7
299 0.67
300 0.66
301 0.7
302 0.67
303 0.67
304 0.62
305 0.65
306 0.68
307 0.71
308 0.72
309 0.7
310 0.73
311 0.74
312 0.79
313 0.8