Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3D2C9

Protein Details
Accession S3D2C9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
318-344IKAVNPKDKDRHGKNGKGKNRNGGKDRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
323-360PKDKDRHGKNGKGKNRNGGKDRDKTGAGVQKSGKTKGG
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043628  DAZ_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR034215  RBM42_RRM  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0030154  P:cell differentiation  
KEGG glz:GLAREA_02113  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51890  DAZ  
PS50102  RRM  
CDD cd12383  RRM_RBM42  
Amino Acid Sequences MSYPPPPGLNSNASHPSLPARPPPTSLPPRQGYNAATSRPGAYPPSSSGYGGFAPRSVAAPQPYNNSYQAPQPYQQPAYGGYNAAPQPDAYGAAPQIRNPFAPPSANPGVRAYEEDPDMAAQIAQWQSAYAGKDASSASNTSGYTGPNPAARRFNNGTSESSGAATSANAAPLGAGARSETFGPSMSSAAMASAAHSDTGVANIVSDSKNPNSKTVVRSGGGITWSDSSLLEWDPAHFRLFVGNLAGEVTDESLYKAFSRWPSIQKARVIRDKRTTKSKGFGFVSFSDGDEFFSAAREMQGKYIGSHPVLLRRSTTEIKAVNPKDKDRHGKNGKGKNRNGGKDRDKTGAGVQKSGKTKGGLKVLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.34
3 0.34
4 0.34
5 0.36
6 0.38
7 0.37
8 0.38
9 0.41
10 0.46
11 0.51
12 0.55
13 0.58
14 0.58
15 0.58
16 0.6
17 0.6
18 0.59
19 0.5
20 0.5
21 0.48
22 0.41
23 0.39
24 0.35
25 0.34
26 0.31
27 0.31
28 0.26
29 0.22
30 0.23
31 0.24
32 0.28
33 0.27
34 0.26
35 0.25
36 0.24
37 0.24
38 0.23
39 0.2
40 0.16
41 0.15
42 0.16
43 0.17
44 0.15
45 0.17
46 0.19
47 0.23
48 0.25
49 0.3
50 0.31
51 0.33
52 0.34
53 0.32
54 0.29
55 0.31
56 0.35
57 0.33
58 0.33
59 0.36
60 0.4
61 0.39
62 0.39
63 0.34
64 0.3
65 0.31
66 0.3
67 0.24
68 0.18
69 0.22
70 0.22
71 0.22
72 0.18
73 0.14
74 0.14
75 0.14
76 0.15
77 0.09
78 0.1
79 0.11
80 0.16
81 0.16
82 0.17
83 0.21
84 0.21
85 0.21
86 0.21
87 0.24
88 0.2
89 0.23
90 0.21
91 0.25
92 0.3
93 0.3
94 0.3
95 0.29
96 0.28
97 0.26
98 0.29
99 0.22
100 0.19
101 0.18
102 0.17
103 0.15
104 0.13
105 0.13
106 0.1
107 0.08
108 0.05
109 0.08
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.11
116 0.12
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.13
133 0.13
134 0.15
135 0.17
136 0.18
137 0.24
138 0.24
139 0.3
140 0.32
141 0.35
142 0.36
143 0.36
144 0.35
145 0.31
146 0.31
147 0.24
148 0.22
149 0.18
150 0.12
151 0.1
152 0.08
153 0.07
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.03
163 0.03
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.09
195 0.11
196 0.17
197 0.18
198 0.2
199 0.23
200 0.27
201 0.29
202 0.31
203 0.33
204 0.27
205 0.28
206 0.26
207 0.24
208 0.2
209 0.18
210 0.14
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.09
221 0.11
222 0.12
223 0.13
224 0.11
225 0.11
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.1
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.06
235 0.05
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.11
245 0.13
246 0.19
247 0.24
248 0.29
249 0.38
250 0.44
251 0.49
252 0.52
253 0.57
254 0.59
255 0.64
256 0.63
257 0.62
258 0.66
259 0.68
260 0.68
261 0.7
262 0.7
263 0.65
264 0.68
265 0.64
266 0.62
267 0.57
268 0.52
269 0.47
270 0.41
271 0.4
272 0.32
273 0.29
274 0.22
275 0.19
276 0.18
277 0.14
278 0.13
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.08
283 0.1
284 0.11
285 0.11
286 0.13
287 0.17
288 0.16
289 0.17
290 0.21
291 0.23
292 0.21
293 0.24
294 0.24
295 0.28
296 0.31
297 0.3
298 0.29
299 0.29
300 0.35
301 0.35
302 0.35
303 0.34
304 0.33
305 0.37
306 0.46
307 0.47
308 0.49
309 0.51
310 0.56
311 0.57
312 0.64
313 0.69
314 0.66
315 0.72
316 0.73
317 0.78
318 0.8
319 0.83
320 0.84
321 0.84
322 0.83
323 0.82
324 0.82
325 0.82
326 0.79
327 0.79
328 0.78
329 0.77
330 0.75
331 0.7
332 0.61
333 0.54
334 0.56
335 0.53
336 0.46
337 0.44
338 0.44
339 0.46
340 0.5
341 0.51
342 0.46
343 0.42
344 0.47
345 0.48