Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CPB9

Protein Details
Accession B0CPB9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-45LDPSRFDKSKRQEPQEKPSTSKHydrophilic
474-502DMDPGHGTKRKREKDRLDPRKSRRPELPVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
481-501TKRKREKDRLDPRKSRRPELP
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 5.5, mito 5, extr 4, E.R. 3, plas 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_379903  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MSTMDVFAAMGISGFGKETKKKELDPSRFDKSKRQEPQEKPSTSKAGPSEEHSSRDLWEDKNGEPSSYAANLNEGQQLDGVHEPEYDPSDQEDDISQFPITHEISLKDHTKVVSALSLDPSGARIVSGSHDYDCKLWDFGGMDMRCKPFNTWEPSGTYHIHDLKFSNDGTKFLVISGTCQAKLFDRDGEEQTTYIKGDPYIRDMKNTAGHVGELTSCAWHPRDPKLFMTASADSTIRIWDVENKRKQKTVIVVKSKERGARTKVTACGYSSDGKLIGGACLDGALHIWQTSSNFVRPNMTIEGAHAKGTETGSLVFSVDGRTILTRGGDDTVKLWDLRSFKKPLATRSEVATLYPNTNAIFSPDDKFVLTGAGASAKGGQGALLFMEKDNLEIVKTLAVDATPVKVVWHSKINQIVTGLSNGTIVVLYSPETSLNGAKLLLSKGPPRKVTVEDMSDALAAPTILTPHALPMFRDMDPGHGTKRKREKDRLDPRKSRRPELPVTGPGKGGRVGASATQHVVQNLVRDTTRDVDVSFHFVFVTLFSVLALALVGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.09
3 0.14
4 0.21
5 0.25
6 0.35
7 0.39
8 0.44
9 0.54
10 0.62
11 0.67
12 0.7
13 0.72
14 0.73
15 0.74
16 0.73
17 0.72
18 0.71
19 0.71
20 0.73
21 0.76
22 0.76
23 0.78
24 0.86
25 0.86
26 0.82
27 0.76
28 0.73
29 0.7
30 0.61
31 0.59
32 0.52
33 0.48
34 0.45
35 0.46
36 0.47
37 0.43
38 0.45
39 0.4
40 0.37
41 0.31
42 0.35
43 0.34
44 0.27
45 0.31
46 0.31
47 0.3
48 0.39
49 0.38
50 0.33
51 0.29
52 0.29
53 0.26
54 0.25
55 0.25
56 0.16
57 0.18
58 0.18
59 0.2
60 0.22
61 0.19
62 0.16
63 0.16
64 0.16
65 0.15
66 0.16
67 0.15
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.13
72 0.16
73 0.14
74 0.13
75 0.14
76 0.16
77 0.15
78 0.16
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.16
83 0.14
84 0.12
85 0.13
86 0.17
87 0.15
88 0.15
89 0.16
90 0.17
91 0.19
92 0.24
93 0.26
94 0.23
95 0.25
96 0.23
97 0.23
98 0.22
99 0.2
100 0.18
101 0.16
102 0.16
103 0.16
104 0.16
105 0.14
106 0.14
107 0.13
108 0.11
109 0.09
110 0.08
111 0.06
112 0.06
113 0.09
114 0.11
115 0.12
116 0.12
117 0.14
118 0.15
119 0.16
120 0.16
121 0.16
122 0.13
123 0.12
124 0.13
125 0.12
126 0.13
127 0.21
128 0.2
129 0.21
130 0.24
131 0.26
132 0.26
133 0.26
134 0.26
135 0.24
136 0.32
137 0.38
138 0.38
139 0.38
140 0.4
141 0.42
142 0.45
143 0.39
144 0.32
145 0.3
146 0.31
147 0.29
148 0.27
149 0.25
150 0.23
151 0.24
152 0.22
153 0.22
154 0.18
155 0.19
156 0.19
157 0.2
158 0.18
159 0.15
160 0.17
161 0.11
162 0.13
163 0.16
164 0.16
165 0.16
166 0.16
167 0.16
168 0.17
169 0.2
170 0.2
171 0.17
172 0.19
173 0.22
174 0.24
175 0.26
176 0.24
177 0.21
178 0.2
179 0.18
180 0.15
181 0.13
182 0.11
183 0.1
184 0.14
185 0.15
186 0.19
187 0.27
188 0.27
189 0.28
190 0.29
191 0.3
192 0.3
193 0.3
194 0.26
195 0.18
196 0.17
197 0.15
198 0.15
199 0.12
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.08
205 0.09
206 0.11
207 0.14
208 0.21
209 0.27
210 0.3
211 0.31
212 0.34
213 0.33
214 0.31
215 0.33
216 0.27
217 0.21
218 0.2
219 0.18
220 0.14
221 0.14
222 0.13
223 0.08
224 0.07
225 0.06
226 0.14
227 0.22
228 0.31
229 0.39
230 0.45
231 0.47
232 0.5
233 0.5
234 0.47
235 0.47
236 0.49
237 0.5
238 0.52
239 0.54
240 0.55
241 0.58
242 0.56
243 0.51
244 0.44
245 0.4
246 0.36
247 0.38
248 0.38
249 0.39
250 0.39
251 0.38
252 0.36
253 0.31
254 0.28
255 0.24
256 0.22
257 0.18
258 0.14
259 0.13
260 0.11
261 0.11
262 0.09
263 0.07
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.04
276 0.05
277 0.08
278 0.09
279 0.11
280 0.13
281 0.13
282 0.15
283 0.15
284 0.18
285 0.17
286 0.16
287 0.14
288 0.13
289 0.17
290 0.16
291 0.16
292 0.12
293 0.11
294 0.12
295 0.12
296 0.11
297 0.07
298 0.07
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.12
323 0.15
324 0.19
325 0.24
326 0.26
327 0.26
328 0.33
329 0.36
330 0.38
331 0.44
332 0.45
333 0.4
334 0.4
335 0.43
336 0.36
337 0.33
338 0.31
339 0.23
340 0.19
341 0.18
342 0.16
343 0.12
344 0.13
345 0.12
346 0.11
347 0.12
348 0.12
349 0.14
350 0.15
351 0.15
352 0.14
353 0.15
354 0.12
355 0.11
356 0.09
357 0.06
358 0.06
359 0.06
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.04
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.08
377 0.08
378 0.07
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.08
388 0.09
389 0.07
390 0.07
391 0.08
392 0.1
393 0.12
394 0.14
395 0.21
396 0.21
397 0.26
398 0.32
399 0.33
400 0.32
401 0.31
402 0.29
403 0.23
404 0.23
405 0.18
406 0.12
407 0.11
408 0.09
409 0.08
410 0.07
411 0.06
412 0.04
413 0.04
414 0.05
415 0.06
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.09
420 0.1
421 0.1
422 0.1
423 0.09
424 0.1
425 0.12
426 0.13
427 0.14
428 0.16
429 0.23
430 0.31
431 0.38
432 0.4
433 0.41
434 0.44
435 0.45
436 0.49
437 0.47
438 0.43
439 0.37
440 0.36
441 0.32
442 0.28
443 0.24
444 0.17
445 0.11
446 0.07
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.07
452 0.07
453 0.1
454 0.14
455 0.14
456 0.15
457 0.19
458 0.23
459 0.22
460 0.25
461 0.22
462 0.23
463 0.26
464 0.28
465 0.3
466 0.32
467 0.35
468 0.41
469 0.52
470 0.57
471 0.64
472 0.72
473 0.75
474 0.8
475 0.89
476 0.91
477 0.91
478 0.92
479 0.91
480 0.91
481 0.88
482 0.84
483 0.81
484 0.78
485 0.76
486 0.74
487 0.73
488 0.72
489 0.69
490 0.63
491 0.57
492 0.5
493 0.43
494 0.36
495 0.29
496 0.21
497 0.18
498 0.17
499 0.18
500 0.2
501 0.2
502 0.21
503 0.22
504 0.22
505 0.21
506 0.22
507 0.2
508 0.22
509 0.22
510 0.23
511 0.21
512 0.22
513 0.25
514 0.26
515 0.27
516 0.23
517 0.21
518 0.22
519 0.23
520 0.29
521 0.25
522 0.22
523 0.19
524 0.19
525 0.18
526 0.15
527 0.16
528 0.09
529 0.09
530 0.08
531 0.09
532 0.08
533 0.08