Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CMD1

Protein Details
Accession S3CMD1    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-35VIDPKRRKQIQDRLAQRARRRBasic
54-80SSVTVSRKKDVKKRTRPEKDSNTKNTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-35QRARRR
61-68KKDVKKRT
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021833  DUF3425  
KEGG glz:GLAREA_02271  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11905  DUF3425  
Amino Acid Sequences MGRKVEKEEDNWYGVIDPKRRKQIQDRLAQRARRRRLAEQAAQKNDPETTDEISSVTVSRKKDVKKRTRPEKDSNTKNTTSSKPQLTSLTTTKATPLPRDDIHLHPPTLTIYSALFHNGSYLNLTCSTSYALSPTPPSFPHTPPSLRPTSTQLSTAHYRWIDRFPIPKLRDRMITWAAVFNAEEFLADLFDGVGGGSLVIRERGEELCGGGLGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.34
3 0.35
4 0.39
5 0.45
6 0.56
7 0.59
8 0.66
9 0.7
10 0.74
11 0.75
12 0.77
13 0.76
14 0.76
15 0.8
16 0.8
17 0.79
18 0.78
19 0.77
20 0.76
21 0.74
22 0.7
23 0.72
24 0.74
25 0.73
26 0.74
27 0.75
28 0.72
29 0.68
30 0.61
31 0.52
32 0.44
33 0.36
34 0.28
35 0.21
36 0.18
37 0.17
38 0.17
39 0.16
40 0.15
41 0.15
42 0.13
43 0.14
44 0.15
45 0.16
46 0.2
47 0.26
48 0.33
49 0.41
50 0.51
51 0.58
52 0.65
53 0.75
54 0.82
55 0.87
56 0.88
57 0.89
58 0.89
59 0.88
60 0.87
61 0.84
62 0.79
63 0.7
64 0.64
65 0.59
66 0.52
67 0.49
68 0.45
69 0.41
70 0.36
71 0.37
72 0.37
73 0.34
74 0.34
75 0.29
76 0.27
77 0.24
78 0.22
79 0.22
80 0.23
81 0.22
82 0.2
83 0.21
84 0.21
85 0.21
86 0.25
87 0.26
88 0.26
89 0.31
90 0.31
91 0.28
92 0.24
93 0.24
94 0.2
95 0.18
96 0.15
97 0.09
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.07
103 0.06
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.09
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.12
121 0.12
122 0.13
123 0.13
124 0.18
125 0.2
126 0.21
127 0.25
128 0.27
129 0.29
130 0.31
131 0.37
132 0.36
133 0.34
134 0.34
135 0.36
136 0.36
137 0.34
138 0.33
139 0.28
140 0.29
141 0.32
142 0.31
143 0.31
144 0.27
145 0.28
146 0.27
147 0.3
148 0.29
149 0.28
150 0.33
151 0.32
152 0.41
153 0.43
154 0.48
155 0.49
156 0.49
157 0.51
158 0.47
159 0.5
160 0.43
161 0.43
162 0.35
163 0.33
164 0.3
165 0.25
166 0.23
167 0.16
168 0.14
169 0.11
170 0.1
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.04
185 0.05
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.1
190 0.11
191 0.13
192 0.13
193 0.13
194 0.12