Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CK29

Protein Details
Accession S3CK29    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
295-316VETRAKKLLSKRQKDREDGKSKBasic
366-397KEMDKVWEKRRQEKETRRRIQRENVEKKRIAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-310SKRQKDR
373-403EKRRQEKETRRRIQRENVEKKRIAKGLGAKK
Subcellular Location(s) mito 18, nucl 6.5, cyto_nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG glz:GLAREA_02766  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MARRKVKKQTHLGANGPSGKPTSANAINRSPKSMVIRVGAGEVGPSVSQLVKDVRSMMQPDTAARLKERKANKLKDYLTMSGPLGVTHLMLFSRSESGNTNMRLAITPRGPTLHFQVEKYSLCKDVRRALKHPKGGGKEYLTAPLLVMNNFISPPTESDSQNKIPKHLESLTTTVFQSLFPPINPQHTPLQSIRRVMLLNREPAKDSDDGSYILNLRHYAITTKATGLSKPLRRLNAAEKLLNSQKAKGKKGGLPNLGNLEDIADYMVGGADGSGYMTDATSGSEADTDAEVEVVETRAKKLLSKRQKDREDGKSKNSSSGVEKRAVKLVELGPRLRLRMTKVEDGVCNGKIMWHEYIHKTKEEVKEMDKVWEKRRQEKETRRRIQRENVEKKRIAKGLGAKKGAEDEDEDEMDVDEWDSEGLEGDAEMELNEEADERGEWEDQEEEIAGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.7
3 0.6
4 0.52
5 0.43
6 0.36
7 0.32
8 0.27
9 0.28
10 0.29
11 0.34
12 0.38
13 0.45
14 0.54
15 0.54
16 0.58
17 0.51
18 0.48
19 0.49
20 0.48
21 0.43
22 0.37
23 0.37
24 0.33
25 0.33
26 0.28
27 0.21
28 0.16
29 0.12
30 0.1
31 0.08
32 0.07
33 0.07
34 0.07
35 0.08
36 0.1
37 0.14
38 0.14
39 0.16
40 0.18
41 0.19
42 0.23
43 0.26
44 0.24
45 0.25
46 0.24
47 0.24
48 0.28
49 0.3
50 0.27
51 0.28
52 0.33
53 0.32
54 0.39
55 0.46
56 0.5
57 0.57
58 0.65
59 0.68
60 0.7
61 0.69
62 0.69
63 0.67
64 0.6
65 0.51
66 0.45
67 0.38
68 0.31
69 0.29
70 0.21
71 0.16
72 0.14
73 0.12
74 0.09
75 0.09
76 0.06
77 0.07
78 0.08
79 0.08
80 0.11
81 0.11
82 0.12
83 0.14
84 0.18
85 0.24
86 0.25
87 0.25
88 0.22
89 0.23
90 0.23
91 0.22
92 0.24
93 0.2
94 0.21
95 0.2
96 0.22
97 0.22
98 0.23
99 0.27
100 0.3
101 0.29
102 0.28
103 0.31
104 0.34
105 0.34
106 0.34
107 0.31
108 0.27
109 0.27
110 0.3
111 0.31
112 0.35
113 0.42
114 0.46
115 0.51
116 0.57
117 0.63
118 0.66
119 0.67
120 0.66
121 0.63
122 0.61
123 0.59
124 0.51
125 0.46
126 0.41
127 0.39
128 0.32
129 0.26
130 0.22
131 0.2
132 0.18
133 0.14
134 0.14
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.13
143 0.15
144 0.16
145 0.21
146 0.26
147 0.32
148 0.37
149 0.36
150 0.35
151 0.35
152 0.34
153 0.35
154 0.31
155 0.28
156 0.25
157 0.28
158 0.27
159 0.25
160 0.24
161 0.2
162 0.18
163 0.14
164 0.13
165 0.12
166 0.11
167 0.1
168 0.15
169 0.15
170 0.21
171 0.21
172 0.23
173 0.25
174 0.25
175 0.3
176 0.28
177 0.35
178 0.32
179 0.33
180 0.31
181 0.27
182 0.27
183 0.24
184 0.29
185 0.25
186 0.29
187 0.31
188 0.31
189 0.3
190 0.3
191 0.33
192 0.25
193 0.22
194 0.17
195 0.15
196 0.15
197 0.14
198 0.14
199 0.12
200 0.11
201 0.11
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.11
209 0.11
210 0.11
211 0.13
212 0.13
213 0.13
214 0.16
215 0.22
216 0.24
217 0.3
218 0.33
219 0.32
220 0.33
221 0.36
222 0.38
223 0.39
224 0.38
225 0.33
226 0.3
227 0.32
228 0.34
229 0.36
230 0.3
231 0.25
232 0.28
233 0.33
234 0.35
235 0.36
236 0.37
237 0.38
238 0.46
239 0.49
240 0.51
241 0.46
242 0.45
243 0.44
244 0.39
245 0.34
246 0.25
247 0.18
248 0.11
249 0.1
250 0.08
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.03
256 0.02
257 0.02
258 0.02
259 0.02
260 0.02
261 0.02
262 0.02
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.1
286 0.11
287 0.15
288 0.23
289 0.33
290 0.42
291 0.52
292 0.62
293 0.69
294 0.76
295 0.8
296 0.8
297 0.8
298 0.8
299 0.74
300 0.72
301 0.71
302 0.65
303 0.62
304 0.55
305 0.46
306 0.43
307 0.47
308 0.42
309 0.4
310 0.42
311 0.39
312 0.43
313 0.41
314 0.34
315 0.3
316 0.31
317 0.32
318 0.33
319 0.32
320 0.32
321 0.33
322 0.34
323 0.31
324 0.29
325 0.27
326 0.32
327 0.37
328 0.38
329 0.39
330 0.42
331 0.41
332 0.42
333 0.4
334 0.32
335 0.26
336 0.2
337 0.19
338 0.17
339 0.19
340 0.18
341 0.17
342 0.22
343 0.28
344 0.36
345 0.37
346 0.38
347 0.37
348 0.41
349 0.46
350 0.48
351 0.45
352 0.41
353 0.45
354 0.44
355 0.5
356 0.51
357 0.5
358 0.5
359 0.55
360 0.57
361 0.61
362 0.69
363 0.71
364 0.73
365 0.78
366 0.82
367 0.85
368 0.89
369 0.9
370 0.89
371 0.88
372 0.87
373 0.86
374 0.87
375 0.87
376 0.87
377 0.85
378 0.81
379 0.79
380 0.77
381 0.7
382 0.61
383 0.56
384 0.56
385 0.57
386 0.61
387 0.58
388 0.5
389 0.47
390 0.49
391 0.43
392 0.35
393 0.27
394 0.22
395 0.23
396 0.23
397 0.22
398 0.18
399 0.18
400 0.16
401 0.14
402 0.11
403 0.07
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.05
408 0.06
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.06
413 0.06
414 0.05
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.07
423 0.08
424 0.08
425 0.11
426 0.12
427 0.12
428 0.13
429 0.14
430 0.13
431 0.14