FuNGI

S3DE68

Protein Details

Accession

S3DE68

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
29-51	SILDSQRPRKRVKQDPEDLKRSL	Hydrophilic
948-967	PYLPKFRKSFTKLPQAKKHI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
539-598	EPAIRGGANAGNGRGRGNDRGGRGGNQRGGQRGGSQQRGRGGPPRASHNPGHMGRGGRPG

Subcellular Location(s)

cyto 12.5, cyto_nucl 12, nucl 8.5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C IPR040801 Ski2_N
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0006401 P:RNA catabolic process
KEGG	glz:GLAREA_11088 -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF00271 Helicase_C PF13234 rRNA_proc-arch PF17911 Ski2_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MADSLVDSLERVHLDSNPGDDTTDDWIDSILDSQRPRKRVKQDPEDLKRSLEEKYLTPSTSFSTEWLNKLQQRWDTPTDFTTLFKIAPTQTRTITRFTREGLEGRVTGYKEVTVPANSATAKNSTSFLRKPANRADMVRGAAGFFPFAPGGLESVEAAAALDEQNIRTESFAGANGGKSKLERVINFSGEGGLLSIPPGFTRGLDFEKVKKDEVDLKEAEEVENVLEEEPDKEPEENGLDAGDKISDSEDPDGVSDESENDDIDSLLPVEFPALQPHGVLAASSAKRGGREWAHMVDVKREITNFRELVPDMAREWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRQIFDEVGILTGDVQISPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPAHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKQKDIYVISTPKRPVPLEHYIWADKGIHKIVDANKKFIEQGWKSANDALSGRDKVKRDAEPAIRGGANAGNGRGRGNDRGGRGGNQRGGQRGGSQQRGRGGPPRASHNPGHMGRGGRPGGRTSAAQDKTLWVHLVQFLKKESLLPACIFVFSKKRCEENADALSNQDFCTATEKSAIHMIIEKSIARLKPEDRLLPQIVRLRDLLGRGIAVHHGGLLPIVKEVVEMLFAQTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGYRKHDGHSFRNLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGSVIIVAPGGGEAPPVTELRQMILGEASKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSEHATQQLLPEHEKSIKLSEADLAKVIREPCNTCDQDIEVCHQASQDFKQRSLDLYLGLLATPVGRRMFCPRRLIVYKRDGIRTPGVLLRDGATNGATPTVHVLEIKSQRDQRDSTDLLPYLPKFRKSFTKLPQAKKHIATRTYQVPIGDIECLTRTVLKGVIPEIFHGGDAYNKAKDELFRICKSWELSEWNEMDVSKVNDLQLRDIIAARFDQAAIAQKAKALACPQFLKHFAMCHDQWLIQENITQLRQLMSDQNLQLLPDYEQRIQVLRDLDFIDESSRVQLKGKVACEIHSADELVLTELVLDNVLAAYEPAEIVALLSAFVFQEKTDTVPNLSGNLEKGMKTIIEISEKVNERQTYHQVILSSDDSNDFVSRPRFGLMEVVYEWARGMSFKNITDLTDVLEGTIVRVITRLDETCREVKNAARIIGDPDLFTKMQTCQEMIKRDITAVASLYM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.2
3	0.22
4	0.21
5	0.21
6	0.2
7	0.19
8	0.18
9	0.2
10	0.2
11	0.17
12	0.14
13	0.14
14	0.14
15	0.14
16	0.15
17	0.14
18	0.17
19	0.21
20	0.3
21	0.37
22	0.44
23	0.51
24	0.57
25	0.64
26	0.7
27	0.77
28	0.79
29	0.82
30	0.87
31	0.9
32	0.87
33	0.78
34	0.7
35	0.63
36	0.53
37	0.45
38	0.4
39	0.33
40	0.29
41	0.35
42	0.37
43	0.34
44	0.33
45	0.32
46	0.3
47	0.3
48	0.28
49	0.22
50	0.27
51	0.29
52	0.32
53	0.36
54	0.4
55	0.41
56	0.46
57	0.52
58	0.49
59	0.52
60	0.56
61	0.57
62	0.53
63	0.52
64	0.49
65	0.46
66	0.39
67	0.34
68	0.3
69	0.25
70	0.22
71	0.19
72	0.21
73	0.21
74	0.28
75	0.31
76	0.32
77	0.35
78	0.43
79	0.45
80	0.48
81	0.5
82	0.48
83	0.47
84	0.45
85	0.46
86	0.41
87	0.42
88	0.4
89	0.38
90	0.32
91	0.31
92	0.33
93	0.28
94	0.26
95	0.24
96	0.21
97	0.17
98	0.19
99	0.2
100	0.16
101	0.17
102	0.16
103	0.2
104	0.2
105	0.2
106	0.2
107	0.2
108	0.2
109	0.2
110	0.21
111	0.21
112	0.27
113	0.28
114	0.33
115	0.4
116	0.43
117	0.49
118	0.56
119	0.6
120	0.57
121	0.58
122	0.58
123	0.53
124	0.51
125	0.46
126	0.36
127	0.3
128	0.26
129	0.23
130	0.17
131	0.11
132	0.11
133	0.1
134	0.1
135	0.1
136	0.09
137	0.09
138	0.09
139	0.1
140	0.07
141	0.08
142	0.08
143	0.06
144	0.06
145	0.05
146	0.05
147	0.05
148	0.06
149	0.07
150	0.07
151	0.1
152	0.11
153	0.11
154	0.11
155	0.12
156	0.12
157	0.13
158	0.13
159	0.13
160	0.13
161	0.15
162	0.18
163	0.18
164	0.18
165	0.17
166	0.19
167	0.23
168	0.27
169	0.27
170	0.31
171	0.36
172	0.36
173	0.37
174	0.34
175	0.28
176	0.22
177	0.21
178	0.14
179	0.08
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.06
185	0.07
186	0.07
187	0.07
188	0.1
189	0.13
190	0.17
191	0.22
192	0.25
193	0.29
194	0.37
195	0.39
196	0.38
197	0.35
198	0.35
199	0.39
200	0.41
201	0.42
202	0.34
203	0.33
204	0.35
205	0.34
206	0.31
207	0.22
208	0.19
209	0.12
210	0.12
211	0.1
212	0.07
213	0.07
214	0.07
215	0.09
216	0.1
217	0.12
218	0.13
219	0.13
220	0.13
221	0.15
222	0.18
223	0.16
224	0.14
225	0.13
226	0.12
227	0.11
228	0.11
229	0.09
230	0.06
231	0.06
232	0.07
233	0.08
234	0.09
235	0.11
236	0.11
237	0.11
238	0.12
239	0.14
240	0.13
241	0.12
242	0.1
243	0.09
244	0.11
245	0.11
246	0.1
247	0.08
248	0.09
249	0.08
250	0.08
251	0.08
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.07
258	0.07
259	0.1
260	0.11
261	0.11
262	0.11
263	0.11
264	0.11
265	0.1
266	0.1
267	0.07
268	0.14
269	0.14
270	0.14
271	0.17
272	0.16
273	0.18
274	0.19
275	0.24
276	0.2
277	0.25
278	0.29
279	0.29
280	0.31
281	0.34
282	0.34
283	0.33
284	0.32
285	0.29
286	0.25
287	0.24
288	0.23
289	0.23
290	0.28
291	0.24
292	0.22
293	0.24
294	0.23
295	0.26
296	0.25
297	0.23
298	0.17
299	0.23
300	0.23
301	0.2
302	0.21
303	0.19
304	0.17
305	0.17
306	0.17
307	0.15
308	0.17
309	0.19
310	0.17
311	0.17
312	0.17
313	0.18
314	0.19
315	0.18
316	0.17
317	0.15
318	0.15
319	0.14
320	0.14
321	0.14
322	0.1
323	0.07
324	0.06
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.06
331	0.06
332	0.07
333	0.07
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.06
340	0.06
341	0.07
342	0.07
343	0.06
344	0.05
345	0.07
346	0.07
347	0.08
348	0.08
349	0.07
350	0.08
351	0.1
352	0.11
353	0.18
354	0.19
355	0.21
356	0.23
357	0.26
358	0.26
359	0.3
360	0.38
361	0.38
362	0.46
363	0.47
364	0.52
365	0.53
366	0.54
367	0.61
368	0.52
369	0.45
370	0.42
371	0.41
372	0.34
373	0.3
374	0.29
375	0.17
376	0.17
377	0.15
378	0.08
379	0.06
380	0.06
381	0.05
382	0.04
383	0.05
384	0.04
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.06
393	0.05
394	0.05
395	0.07
396	0.07
397	0.08
398	0.08
399	0.08
400	0.07
401	0.08
402	0.11
403	0.1
404	0.09
405	0.1
406	0.11
407	0.11
408	0.11
409	0.11
410	0.09
411	0.09
412	0.09
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.09
417	0.07
418	0.06
419	0.08
420	0.08
421	0.08
422	0.09
423	0.09
424	0.07
425	0.09
426	0.09
427	0.07
428	0.07
429	0.08
430	0.09
431	0.08
432	0.08
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.05
438	0.03
439	0.03
440	0.03
441	0.03
442	0.03
443	0.03
444	0.03
445	0.02
446	0.03
447	0.03
448	0.03
449	0.04
450	0.05
451	0.05
452	0.05
453	0.06
454	0.06
455	0.07
456	0.07
457	0.07
458	0.07
459	0.09
460	0.1
461	0.1
462	0.13
463	0.17
464	0.21
465	0.23
466	0.26
467	0.3
468	0.31
469	0.35
470	0.33
471	0.33
472	0.36
473	0.4
474	0.38
475	0.38
476	0.37
477	0.35
478	0.37
479	0.33
480	0.28
481	0.29
482	0.35
483	0.33
484	0.34
485	0.35
486	0.33
487	0.32
488	0.31
489	0.25
490	0.19
491	0.18
492	0.17
493	0.13
494	0.12
495	0.17
496	0.22
497	0.31
498	0.31
499	0.31
500	0.31
501	0.31
502	0.31
503	0.29
504	0.32
505	0.23
506	0.28
507	0.29
508	0.3
509	0.3
510	0.32
511	0.3
512	0.22
513	0.22
514	0.18
515	0.17
516	0.18
517	0.19
518	0.21
519	0.22
520	0.25
521	0.3
522	0.3
523	0.29
524	0.35
525	0.37
526	0.36
527	0.35
528	0.34
529	0.28
530	0.25
531	0.23
532	0.16
533	0.14
534	0.11
535	0.11
536	0.1
537	0.1
538	0.11
539	0.11
540	0.12
541	0.13
542	0.16
543	0.19
544	0.2
545	0.24
546	0.24
547	0.26
548	0.28
549	0.29
550	0.29
551	0.28
552	0.29
553	0.27
554	0.27
555	0.24
556	0.23
557	0.26
558	0.27
559	0.31
560	0.31
561	0.31
562	0.34
563	0.35
564	0.34
565	0.34
566	0.34
567	0.31
568	0.32
569	0.37
570	0.37
571	0.4
572	0.4
573	0.36
574	0.4
575	0.36
576	0.36
577	0.31
578	0.28
579	0.25
580	0.3
581	0.28
582	0.21
583	0.21
584	0.2
585	0.19
586	0.19
587	0.18
588	0.14
589	0.22
590	0.22
591	0.22
592	0.21
593	0.21
594	0.21
595	0.22
596	0.19
597	0.1
598	0.1
599	0.13
600	0.16
601	0.16
602	0.16
603	0.16
604	0.16
605	0.16
606	0.16
607	0.14
608	0.12
609	0.13
610	0.12
611	0.13
612	0.12
613	0.12
614	0.12
615	0.12
616	0.17
617	0.17
618	0.23
619	0.24
620	0.26
621	0.27
622	0.32
623	0.34
624	0.34
625	0.38
626	0.32
627	0.3
628	0.28
629	0.28
630	0.22
631	0.19
632	0.13
633	0.08
634	0.06
635	0.11
636	0.11
637	0.1
638	0.14
639	0.14
640	0.13
641	0.16
642	0.16
643	0.12
644	0.15
645	0.15
646	0.12
647	0.13
648	0.12
649	0.1
650	0.14
651	0.14
652	0.12
653	0.14
654	0.14
655	0.19
656	0.22
657	0.24
658	0.22
659	0.27
660	0.27
661	0.25
662	0.29
663	0.28
664	0.26
665	0.24
666	0.23
667	0.19
668	0.19
669	0.19
670	0.15
671	0.1
672	0.1
673	0.08
674	0.09
675	0.07
676	0.06
677	0.05
678	0.05
679	0.05
680	0.04
681	0.05
682	0.05
683	0.04
684	0.04
685	0.04
686	0.04
687	0.04
688	0.04
689	0.04
690	0.04
691	0.04
692	0.04
693	0.05
694	0.05
695	0.05
696	0.05
697	0.05
698	0.04
699	0.05
700	0.04
701	0.04
702	0.04
703	0.04
704	0.06
705	0.05
706	0.06
707	0.06
708	0.06
709	0.06
710	0.06
711	0.07
712	0.07
713	0.07
714	0.07
715	0.06
716	0.07
717	0.07
718	0.07
719	0.08
720	0.1
721	0.13
722	0.19
723	0.23
724	0.28
725	0.28
726	0.29
727	0.34
728	0.36
729	0.38
730	0.41
731	0.41
732	0.36
733	0.41
734	0.4
735	0.34
736	0.29
737	0.25
738	0.19
739	0.15
740	0.15
741	0.09
742	0.1
743	0.1
744	0.1
745	0.11
746	0.11
747	0.11
748	0.12
749	0.12
750	0.12
751	0.12
752	0.12
753	0.11
754	0.09
755	0.09
756	0.08
757	0.07
758	0.06
759	0.05
760	0.04
761	0.03
762	0.02
763	0.02
764	0.03
765	0.03
766	0.03
767	0.02
768	0.03
769	0.05
770	0.05
771	0.06
772	0.07
773	0.08
774	0.08
775	0.11
776	0.1
777	0.09
778	0.11
779	0.1
780	0.1
781	0.11
782	0.12
783	0.11
784	0.12
785	0.13
786	0.14
787	0.16
788	0.21
789	0.23
790	0.29
791	0.29
792	0.32
793	0.33
794	0.32
795	0.31
796	0.25
797	0.22
798	0.15
799	0.13
800	0.09
801	0.07
802	0.06
803	0.05
804	0.06
805	0.06
806	0.07
807	0.09
808	0.11
809	0.13
810	0.14
811	0.14
812	0.14
813	0.15
814	0.17
815	0.17
816	0.19
817	0.19
818	0.23
819	0.25
820	0.25
821	0.25
822	0.26
823	0.26
824	0.24
825	0.23
826	0.2
827	0.19
828	0.19
829	0.19
830	0.18
831	0.18
832	0.17
833	0.16
834	0.18
835	0.17
836	0.17
837	0.17
838	0.14
839	0.13
840	0.16
841	0.17
842	0.17
843	0.18
844	0.2
845	0.21
846	0.31
847	0.31
848	0.28
849	0.28
850	0.25
851	0.25
852	0.24
853	0.24
854	0.18
855	0.18
856	0.17
857	0.16
858	0.15
859	0.15
860	0.18
861	0.23
862	0.22
863	0.23
864	0.26
865	0.27
866	0.28
867	0.28
868	0.25
869	0.17
870	0.15
871	0.15
872	0.12
873	0.11
874	0.08
875	0.06
876	0.06
877	0.06
878	0.08
879	0.08
880	0.09
881	0.1
882	0.2
883	0.28
884	0.33
885	0.4
886	0.39
887	0.46
888	0.53
889	0.56
890	0.55
891	0.55
892	0.55
893	0.53
894	0.56
895	0.48
896	0.46
897	0.45
898	0.38
899	0.32
900	0.28
901	0.25
902	0.22
903	0.21
904	0.18
905	0.16
906	0.15
907	0.13
908	0.1
909	0.09
910	0.09
911	0.09
912	0.08
913	0.07
914	0.09
915	0.09
916	0.09
917	0.09
918	0.09
919	0.16
920	0.23
921	0.25
922	0.29
923	0.32
924	0.35
925	0.39
926	0.4
927	0.37
928	0.38
929	0.37
930	0.34
931	0.35
932	0.32
933	0.29
934	0.31
935	0.28
936	0.28
937	0.3
938	0.34
939	0.3
940	0.34
941	0.43
942	0.46
943	0.55
944	0.55
945	0.62
946	0.65
947	0.74
948	0.8
949	0.78
950	0.77
951	0.74
952	0.74
953	0.71
954	0.65
955	0.59
956	0.54
957	0.53
958	0.49
959	0.44
960	0.36
961	0.29
962	0.27
963	0.25
964	0.2
965	0.13
966	0.12
967	0.11
968	0.11
969	0.11
970	0.1
971	0.1
972	0.1
973	0.12
974	0.12
975	0.12
976	0.13
977	0.16
978	0.15
979	0.16
980	0.17
981	0.16
982	0.14
983	0.13
984	0.12
985	0.11
986	0.14
987	0.15
988	0.14
989	0.14
990	0.16
991	0.17
992	0.18
993	0.2
994	0.26
995	0.31
996	0.32
997	0.34
998	0.34
999	0.36
1000	0.37
1001	0.35
1002	0.3
1003	0.29
1004	0.29
1005	0.33
1006	0.33
1007	0.3
1008	0.28
1009	0.25
1010	0.22
1011	0.2
1012	0.19
1013	0.15
1014	0.15
1015	0.16
1016	0.18
1017	0.19
1018	0.2
1019	0.18
1020	0.17
1021	0.17
1022	0.18
1023	0.17
1024	0.14
1025	0.14
1026	0.13
1027	0.12
1028	0.11
1029	0.1
1030	0.09
1031	0.16
1032	0.17
1033	0.19
1034	0.17
1035	0.18
1036	0.21
1037	0.21
1038	0.22
1039	0.2
1040	0.21
1041	0.25
1042	0.28
1043	0.29
1044	0.32
1045	0.34
1046	0.36
1047	0.33
1048	0.32
1049	0.3
1050	0.34
1051	0.32
1052	0.3
1053	0.3
1054	0.27
1055	0.26
1056	0.28
1057	0.26
1058	0.19
1059	0.21
1060	0.19
1061	0.21
1062	0.2
1063	0.2
1064	0.16
1065	0.16
1066	0.16
1067	0.16
1068	0.19
1069	0.18
1070	0.24
1071	0.23
1072	0.26
1073	0.25
1074	0.25
1075	0.24
1076	0.2
1077	0.19
1078	0.19
1079	0.23
1080	0.21
1081	0.23
1082	0.24
1083	0.25
1084	0.25
1085	0.26
1086	0.24
1087	0.2
1088	0.21
1089	0.2
1090	0.2
1091	0.18
1092	0.18
1093	0.16
1094	0.13
1095	0.13
1096	0.15
1097	0.16
1098	0.16
1099	0.18
1100	0.21
1101	0.25
1102	0.31
1103	0.32
1104	0.35
1105	0.33
1106	0.34
1107	0.36
1108	0.34
1109	0.3
1110	0.25
1111	0.24
1112	0.17
1113	0.17
1114	0.16
1115	0.13
1116	0.11
1117	0.09
1118	0.07
1119	0.07
1120	0.07
1121	0.06
1122	0.05
1123	0.04
1124	0.04
1125	0.04
1126	0.04
1127	0.03
1128	0.04
1129	0.04
1130	0.04
1131	0.04
1132	0.04
1133	0.04
1134	0.04
1135	0.05
1136	0.04
1137	0.04
1138	0.04
1139	0.05
1140	0.05
1141	0.06
1142	0.06
1143	0.05
1144	0.08
1145	0.08
1146	0.11
1147	0.15
1148	0.17
1149	0.18
1150	0.21
1151	0.22
1152	0.21
1153	0.22
1154	0.21
1155	0.18
1156	0.21
1157	0.21
1158	0.18
1159	0.18
1160	0.18
1161	0.16
1162	0.16
1163	0.18
1164	0.17
1165	0.2
1166	0.21
1167	0.23
1168	0.29
1169	0.32
1170	0.33
1171	0.37
1172	0.36
1173	0.35
1174	0.4
1175	0.45
1176	0.43
1177	0.42
1178	0.43
1179	0.37
1180	0.35
1181	0.36
1182	0.32
1183	0.26
1184	0.2
1185	0.19
1186	0.17
1187	0.18
1188	0.18
1189	0.14
1190	0.17
1191	0.19
1192	0.2
1193	0.2
1194	0.21
1195	0.2
1196	0.2
1197	0.26
1198	0.22
1199	0.23
1200	0.21
1201	0.23
1202	0.21
1203	0.21
1204	0.2
1205	0.14
1206	0.13
1207	0.1
1208	0.12
1209	0.16
1210	0.2
1211	0.2
1212	0.25
1213	0.26
1214	0.27
1215	0.29
1216	0.27
1217	0.22
1218	0.21
1219	0.19
1220	0.15
1221	0.15
1222	0.14
1223	0.12
1224	0.14
1225	0.11
1226	0.09
1227	0.1
1228	0.1
1229	0.11
1230	0.16
1231	0.17
1232	0.19
1233	0.24
1234	0.29
1235	0.35
1236	0.38
1237	0.38
1238	0.36
1239	0.39
1240	0.43
1241	0.44
1242	0.42
1243	0.37
1244	0.36
1245	0.38
1246	0.41
1247	0.37
1248	0.29
1249	0.25
1250	0.27
1251	0.25
1252	0.24
1253	0.22
1254	0.19
1255	0.25
1256	0.26
1257	0.26
1258	0.3
1259	0.37
1260	0.43
1261	0.44
1262	0.46
1263	0.4
1264	0.39
1265	0.4
1266	0.34
1267	0.28

S3DE68

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer