Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CHD9

Protein Details
Accession S3CHD9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
163-182GRGHRTKSRRSSARLDREKFBasic
566-587QATPKATPTKKGKAKQAPYISAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
167-171RTKSR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 13, cyto 10.5
Family & Domain DBs
KEGG glz:GLAREA_01789  -  
Amino Acid Sequences MDLMPPPPTPSSQRPASIQIIEEESGSESEPESDTNTATPSALSPSTPRRITANSDDEEASERFLDQLRTAIEGYPSYANYCCGGNIPISTASRNSPSFQDSSKAAVTSPPITLRFDTPNGSVQRLSLPPHPEEEKGKGKRKVEVEELLASCTPEITGDEKAGRGHRTKSRRSSARLDREKFSVDVHPADLGILDTIKQVLLPDLKLQNSNEAGKGKKRSLWDGIGSESWREREEHWGVRAELCDLTVYFSSSSNTQKPFDTQPRQGTHFGTLVICLPSAHQGGGQLIQHPTPLFNPSLSPPQTRAHTTILPTASLSPTITWSAFPRMASHSILPITCGHLVTLTYNLYTTEAIGGILQRFPIADPRLYPLFKVVKNLLNEDEFLRYGGMLGSYCTHSYHHTTRQTQHHMPFSLLGTDAIMFSVFKALGLRAMVGPVLGDEAWDEWAQIREERLVRKMYEAGREEESDEEMGEGSSVDSEELKERNIEVEDEEDDIETARVGKAWWRLKMVATDSEKGGVFKVGGEPSDFINQHYPIHPLPNTIWLNESSDNGWEVAMANLKSTPQATPKATPTKKGKAKQAPYISASDYEEKTELMWQYSHAAIFVEIPPYGAGVRGSPRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.52
3 0.54
4 0.49
5 0.43
6 0.38
7 0.36
8 0.32
9 0.28
10 0.22
11 0.18
12 0.16
13 0.16
14 0.13
15 0.1
16 0.11
17 0.12
18 0.12
19 0.13
20 0.14
21 0.14
22 0.14
23 0.15
24 0.14
25 0.14
26 0.13
27 0.11
28 0.15
29 0.15
30 0.15
31 0.19
32 0.27
33 0.35
34 0.36
35 0.36
36 0.36
37 0.4
38 0.46
39 0.49
40 0.49
41 0.42
42 0.44
43 0.43
44 0.39
45 0.39
46 0.32
47 0.25
48 0.17
49 0.15
50 0.14
51 0.16
52 0.17
53 0.13
54 0.17
55 0.16
56 0.18
57 0.19
58 0.19
59 0.19
60 0.17
61 0.19
62 0.18
63 0.18
64 0.17
65 0.17
66 0.17
67 0.16
68 0.16
69 0.14
70 0.13
71 0.14
72 0.13
73 0.13
74 0.14
75 0.17
76 0.18
77 0.2
78 0.2
79 0.21
80 0.25
81 0.26
82 0.25
83 0.24
84 0.27
85 0.28
86 0.27
87 0.28
88 0.24
89 0.27
90 0.27
91 0.24
92 0.2
93 0.2
94 0.22
95 0.21
96 0.22
97 0.21
98 0.21
99 0.24
100 0.25
101 0.26
102 0.28
103 0.28
104 0.28
105 0.26
106 0.32
107 0.32
108 0.32
109 0.29
110 0.25
111 0.27
112 0.27
113 0.28
114 0.27
115 0.29
116 0.28
117 0.33
118 0.35
119 0.33
120 0.35
121 0.39
122 0.43
123 0.47
124 0.56
125 0.58
126 0.58
127 0.61
128 0.63
129 0.61
130 0.57
131 0.53
132 0.47
133 0.46
134 0.44
135 0.39
136 0.33
137 0.28
138 0.21
139 0.16
140 0.13
141 0.07
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.16
149 0.2
150 0.22
151 0.24
152 0.29
153 0.36
154 0.44
155 0.53
156 0.6
157 0.66
158 0.69
159 0.72
160 0.76
161 0.78
162 0.8
163 0.81
164 0.75
165 0.68
166 0.63
167 0.59
168 0.5
169 0.42
170 0.35
171 0.28
172 0.25
173 0.22
174 0.2
175 0.17
176 0.16
177 0.13
178 0.09
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.07
188 0.09
189 0.09
190 0.14
191 0.17
192 0.18
193 0.21
194 0.21
195 0.23
196 0.24
197 0.25
198 0.23
199 0.23
200 0.25
201 0.28
202 0.33
203 0.31
204 0.32
205 0.33
206 0.35
207 0.37
208 0.39
209 0.36
210 0.33
211 0.33
212 0.31
213 0.28
214 0.24
215 0.2
216 0.18
217 0.15
218 0.14
219 0.13
220 0.19
221 0.24
222 0.26
223 0.27
224 0.3
225 0.3
226 0.3
227 0.29
228 0.23
229 0.18
230 0.14
231 0.12
232 0.08
233 0.1
234 0.08
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.11
240 0.15
241 0.17
242 0.2
243 0.2
244 0.2
245 0.23
246 0.3
247 0.37
248 0.39
249 0.41
250 0.47
251 0.49
252 0.53
253 0.52
254 0.46
255 0.39
256 0.33
257 0.27
258 0.19
259 0.16
260 0.13
261 0.11
262 0.1
263 0.07
264 0.07
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.09
280 0.11
281 0.09
282 0.09
283 0.1
284 0.11
285 0.18
286 0.19
287 0.2
288 0.21
289 0.23
290 0.25
291 0.26
292 0.28
293 0.24
294 0.24
295 0.24
296 0.25
297 0.22
298 0.2
299 0.18
300 0.16
301 0.13
302 0.11
303 0.1
304 0.06
305 0.07
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.09
310 0.12
311 0.13
312 0.13
313 0.14
314 0.16
315 0.18
316 0.18
317 0.17
318 0.15
319 0.15
320 0.15
321 0.14
322 0.12
323 0.12
324 0.11
325 0.11
326 0.09
327 0.08
328 0.09
329 0.08
330 0.09
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.05
348 0.06
349 0.11
350 0.12
351 0.12
352 0.13
353 0.17
354 0.21
355 0.21
356 0.21
357 0.21
358 0.25
359 0.25
360 0.28
361 0.28
362 0.29
363 0.3
364 0.32
365 0.28
366 0.23
367 0.23
368 0.2
369 0.19
370 0.14
371 0.13
372 0.11
373 0.08
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.05
378 0.05
379 0.06
380 0.08
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.11
385 0.17
386 0.22
387 0.29
388 0.35
389 0.4
390 0.47
391 0.54
392 0.6
393 0.6
394 0.6
395 0.58
396 0.51
397 0.47
398 0.42
399 0.34
400 0.26
401 0.2
402 0.15
403 0.1
404 0.09
405 0.08
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.04
410 0.06
411 0.05
412 0.05
413 0.06
414 0.06
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.07
419 0.08
420 0.07
421 0.06
422 0.06
423 0.05
424 0.05
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.05
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.1
434 0.11
435 0.12
436 0.12
437 0.15
438 0.19
439 0.22
440 0.26
441 0.27
442 0.26
443 0.28
444 0.33
445 0.31
446 0.36
447 0.35
448 0.34
449 0.33
450 0.33
451 0.32
452 0.27
453 0.25
454 0.18
455 0.15
456 0.12
457 0.09
458 0.08
459 0.07
460 0.06
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.09
468 0.1
469 0.11
470 0.12
471 0.12
472 0.14
473 0.15
474 0.15
475 0.13
476 0.14
477 0.14
478 0.14
479 0.14
480 0.12
481 0.11
482 0.1
483 0.09
484 0.07
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.11
490 0.2
491 0.26
492 0.3
493 0.33
494 0.35
495 0.37
496 0.42
497 0.41
498 0.41
499 0.39
500 0.38
501 0.34
502 0.35
503 0.33
504 0.28
505 0.25
506 0.17
507 0.13
508 0.11
509 0.15
510 0.14
511 0.14
512 0.15
513 0.16
514 0.17
515 0.24
516 0.23
517 0.21
518 0.25
519 0.25
520 0.26
521 0.27
522 0.29
523 0.23
524 0.3
525 0.28
526 0.26
527 0.26
528 0.33
529 0.33
530 0.3
531 0.3
532 0.25
533 0.29
534 0.27
535 0.27
536 0.18
537 0.19
538 0.19
539 0.17
540 0.15
541 0.11
542 0.1
543 0.11
544 0.15
545 0.13
546 0.13
547 0.14
548 0.14
549 0.16
550 0.16
551 0.18
552 0.19
553 0.26
554 0.3
555 0.34
556 0.43
557 0.52
558 0.54
559 0.59
560 0.63
561 0.66
562 0.71
563 0.74
564 0.76
565 0.76
566 0.81
567 0.82
568 0.83
569 0.78
570 0.72
571 0.69
572 0.6
573 0.52
574 0.48
575 0.43
576 0.34
577 0.31
578 0.28
579 0.24
580 0.22
581 0.25
582 0.23
583 0.2
584 0.19
585 0.18
586 0.21
587 0.22
588 0.22
589 0.17
590 0.15
591 0.13
592 0.16
593 0.16
594 0.15
595 0.13
596 0.13
597 0.13
598 0.13
599 0.13
600 0.12
601 0.11
602 0.12