Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CX92

Protein Details
Accession S3CX92    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-155LEEQKVKKPRAKKADLNGESKHydrophilic
170-196GDGSIVKEKKPRKSRAKKTPEDLQTKLHydrophilic
680-700HPEPKSPKGKGRPKKDTTSDIBasic
727-756VPLSQVRKLNKSPKKPTGRTKKKTADDIYDHydrophilic
760-781QLTHSPPRRRPSQIRSPPRALQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-159APKKTATKKSQVPKEPLEEQKVKKPRAKKADLNGESKPRKK
176-187KEKKPRKSRAKK
335-340KAPKKK
387-401PAKLRSKSPLKRVKK
678-694EVHPEPKSPKGKGRPKK
734-749KLNKSPKKPTGRTKKK
Subcellular Location(s) nucl 17, mito_nucl 12.999, cyto_nucl 11.333, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
KEGG glz:GLAREA_08293  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MASTDIFRIPSSPLKQSFAMSSSPLPAPSELYQKKVPKIIAKRDSIAASANLFSPIDNTPGFVKVSQLDLRNLDPSRVVSTVKEDKLATKVPTKVVAKPRAKNHSTSTSKISDEKLSAAPKKTATKKSQVPKEPLEEQKVKKPRAKKADLNGESKPRKKANDAVVDLENGDGSIVKEKKPRKSRAKKTPEDLQTKLSGSVTKASTKPEKSGSKQTVIQESLNIEAECVDYGLVKAVKRKANWSPPHKSSITGLQNAGSIAGDLTARSPGSDSSTSNSFSNLLGSFGFTNIETTNSMTTKQSKETGVVRKRKLLELVSMNATATNAPAEAATPKTKAPKKKARTITDLATSAFNEEKVVEVESQPAPLLQYFSYQTTERSTKGGINGPAKLRSKSPLKRVKKGSSAQAPILLSPESAMKQAQHQDFIFGTSSQLAREESPTYLRDLHEAMQASNVMFEDPFDDPFKDVVDEPSAVAPRGRLRLSSKKGGLWSAGARDAAGSLLDVEMVDITDSPTVIRQQTPPRVPATTAPIDDVWHDVEADNSVKETIPEHVLGTSSKPGPVEAAIRLQLQGSPAILSPTKTKSPKRSTQTGVKAAPTVNPVAKKGKASGDQMPDFGAYTMFQLQKQIASYHFKPIKSRDSMIAVLEKCWEGQHARTALGSLTTNTKPSAKSNKDKEEVHPEPKSPKGKGRPKKDTTSDIPTSPTKLKKTVGGRKKADADHSDDSDVPLSQVRKLNKSPKKPTGRTKKKTADDIYDSEPQLTHSPPRRRPSQIRSPPRALQLSPSFSTTDVLPASSQESQESQESLFKHITRAIKSLPPTKDPSKPTWYEKILLYDPIVLEDLTVWLNTGALGNVGWDGEVEPKIVKKWCEGRGICCLWKENLRGGSRSRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.42
3 0.43
4 0.42
5 0.36
6 0.34
7 0.28
8 0.26
9 0.26
10 0.26
11 0.25
12 0.24
13 0.22
14 0.24
15 0.25
16 0.34
17 0.32
18 0.36
19 0.43
20 0.48
21 0.52
22 0.54
23 0.56
24 0.55
25 0.63
26 0.68
27 0.69
28 0.68
29 0.66
30 0.64
31 0.6
32 0.52
33 0.44
34 0.36
35 0.29
36 0.24
37 0.22
38 0.18
39 0.17
40 0.15
41 0.15
42 0.14
43 0.15
44 0.14
45 0.15
46 0.15
47 0.18
48 0.19
49 0.17
50 0.18
51 0.16
52 0.22
53 0.26
54 0.27
55 0.29
56 0.3
57 0.32
58 0.36
59 0.35
60 0.31
61 0.28
62 0.27
63 0.27
64 0.26
65 0.25
66 0.19
67 0.27
68 0.34
69 0.34
70 0.35
71 0.32
72 0.33
73 0.37
74 0.41
75 0.37
76 0.35
77 0.38
78 0.38
79 0.45
80 0.45
81 0.48
82 0.53
83 0.6
84 0.61
85 0.65
86 0.72
87 0.74
88 0.74
89 0.71
90 0.68
91 0.68
92 0.65
93 0.61
94 0.58
95 0.52
96 0.51
97 0.49
98 0.45
99 0.39
100 0.35
101 0.34
102 0.33
103 0.37
104 0.4
105 0.4
106 0.41
107 0.41
108 0.49
109 0.55
110 0.59
111 0.59
112 0.62
113 0.68
114 0.74
115 0.79
116 0.79
117 0.77
118 0.74
119 0.73
120 0.72
121 0.7
122 0.69
123 0.67
124 0.62
125 0.65
126 0.68
127 0.68
128 0.67
129 0.68
130 0.7
131 0.72
132 0.77
133 0.76
134 0.77
135 0.81
136 0.81
137 0.77
138 0.73
139 0.72
140 0.71
141 0.68
142 0.66
143 0.61
144 0.59
145 0.59
146 0.62
147 0.61
148 0.63
149 0.61
150 0.57
151 0.52
152 0.48
153 0.42
154 0.34
155 0.24
156 0.13
157 0.1
158 0.06
159 0.06
160 0.13
161 0.15
162 0.18
163 0.26
164 0.33
165 0.43
166 0.53
167 0.63
168 0.66
169 0.76
170 0.84
171 0.88
172 0.92
173 0.91
174 0.87
175 0.87
176 0.85
177 0.81
178 0.72
179 0.65
180 0.57
181 0.5
182 0.44
183 0.36
184 0.28
185 0.22
186 0.25
187 0.23
188 0.24
189 0.25
190 0.29
191 0.36
192 0.37
193 0.39
194 0.42
195 0.48
196 0.49
197 0.58
198 0.57
199 0.54
200 0.57
201 0.57
202 0.55
203 0.5
204 0.45
205 0.37
206 0.32
207 0.29
208 0.27
209 0.22
210 0.15
211 0.13
212 0.13
213 0.1
214 0.09
215 0.07
216 0.05
217 0.05
218 0.09
219 0.11
220 0.11
221 0.17
222 0.24
223 0.29
224 0.3
225 0.37
226 0.42
227 0.51
228 0.59
229 0.63
230 0.65
231 0.64
232 0.69
233 0.63
234 0.55
235 0.47
236 0.47
237 0.44
238 0.38
239 0.34
240 0.28
241 0.28
242 0.27
243 0.25
244 0.15
245 0.09
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.04
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.12
257 0.14
258 0.14
259 0.16
260 0.18
261 0.2
262 0.2
263 0.2
264 0.16
265 0.14
266 0.15
267 0.12
268 0.11
269 0.09
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.08
279 0.09
280 0.12
281 0.12
282 0.13
283 0.14
284 0.18
285 0.19
286 0.22
287 0.24
288 0.22
289 0.25
290 0.31
291 0.39
292 0.44
293 0.5
294 0.5
295 0.53
296 0.55
297 0.54
298 0.51
299 0.43
300 0.4
301 0.35
302 0.35
303 0.3
304 0.28
305 0.25
306 0.21
307 0.19
308 0.13
309 0.09
310 0.07
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.06
316 0.09
317 0.1
318 0.11
319 0.13
320 0.22
321 0.27
322 0.35
323 0.44
324 0.52
325 0.58
326 0.67
327 0.75
328 0.73
329 0.75
330 0.7
331 0.64
332 0.58
333 0.52
334 0.42
335 0.34
336 0.27
337 0.21
338 0.17
339 0.13
340 0.09
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.11
348 0.11
349 0.11
350 0.1
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.1
355 0.06
356 0.08
357 0.09
358 0.11
359 0.13
360 0.13
361 0.14
362 0.17
363 0.19
364 0.18
365 0.18
366 0.18
367 0.17
368 0.2
369 0.24
370 0.24
371 0.25
372 0.27
373 0.28
374 0.33
375 0.33
376 0.31
377 0.28
378 0.28
379 0.35
380 0.38
381 0.46
382 0.5
383 0.55
384 0.63
385 0.7
386 0.71
387 0.7
388 0.67
389 0.65
390 0.63
391 0.58
392 0.5
393 0.46
394 0.39
395 0.31
396 0.28
397 0.2
398 0.12
399 0.09
400 0.1
401 0.07
402 0.08
403 0.08
404 0.07
405 0.11
406 0.17
407 0.18
408 0.19
409 0.18
410 0.2
411 0.19
412 0.2
413 0.18
414 0.11
415 0.11
416 0.09
417 0.1
418 0.08
419 0.09
420 0.08
421 0.08
422 0.09
423 0.1
424 0.1
425 0.12
426 0.12
427 0.13
428 0.15
429 0.14
430 0.14
431 0.13
432 0.14
433 0.14
434 0.14
435 0.13
436 0.11
437 0.12
438 0.1
439 0.09
440 0.08
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.06
445 0.06
446 0.08
447 0.09
448 0.09
449 0.1
450 0.1
451 0.11
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.11
459 0.11
460 0.1
461 0.1
462 0.1
463 0.11
464 0.14
465 0.14
466 0.15
467 0.21
468 0.3
469 0.35
470 0.41
471 0.39
472 0.38
473 0.39
474 0.38
475 0.32
476 0.25
477 0.21
478 0.16
479 0.16
480 0.13
481 0.12
482 0.11
483 0.1
484 0.08
485 0.06
486 0.04
487 0.03
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.03
495 0.03
496 0.03
497 0.03
498 0.04
499 0.04
500 0.05
501 0.07
502 0.08
503 0.1
504 0.14
505 0.22
506 0.3
507 0.33
508 0.35
509 0.35
510 0.35
511 0.34
512 0.32
513 0.31
514 0.26
515 0.23
516 0.22
517 0.2
518 0.19
519 0.19
520 0.17
521 0.12
522 0.09
523 0.09
524 0.07
525 0.07
526 0.08
527 0.09
528 0.07
529 0.07
530 0.07
531 0.07
532 0.07
533 0.08
534 0.08
535 0.09
536 0.1
537 0.1
538 0.1
539 0.11
540 0.11
541 0.12
542 0.13
543 0.12
544 0.12
545 0.12
546 0.12
547 0.12
548 0.13
549 0.13
550 0.11
551 0.13
552 0.14
553 0.14
554 0.14
555 0.13
556 0.13
557 0.11
558 0.11
559 0.08
560 0.08
561 0.07
562 0.09
563 0.1
564 0.1
565 0.13
566 0.16
567 0.23
568 0.29
569 0.35
570 0.44
571 0.52
572 0.6
573 0.63
574 0.67
575 0.67
576 0.7
577 0.72
578 0.69
579 0.62
580 0.55
581 0.5
582 0.42
583 0.38
584 0.3
585 0.25
586 0.2
587 0.2
588 0.21
589 0.24
590 0.26
591 0.25
592 0.26
593 0.29
594 0.31
595 0.33
596 0.37
597 0.4
598 0.39
599 0.37
600 0.35
601 0.29
602 0.25
603 0.21
604 0.14
605 0.07
606 0.08
607 0.12
608 0.12
609 0.12
610 0.14
611 0.14
612 0.15
613 0.16
614 0.16
615 0.15
616 0.22
617 0.23
618 0.31
619 0.36
620 0.35
621 0.39
622 0.43
623 0.48
624 0.46
625 0.46
626 0.4
627 0.4
628 0.4
629 0.37
630 0.37
631 0.29
632 0.25
633 0.24
634 0.21
635 0.17
636 0.15
637 0.16
638 0.12
639 0.13
640 0.2
641 0.2
642 0.2
643 0.2
644 0.2
645 0.18
646 0.18
647 0.16
648 0.1
649 0.14
650 0.15
651 0.16
652 0.17
653 0.19
654 0.19
655 0.26
656 0.36
657 0.39
658 0.48
659 0.56
660 0.64
661 0.67
662 0.68
663 0.67
664 0.66
665 0.64
666 0.63
667 0.56
668 0.5
669 0.5
670 0.55
671 0.56
672 0.49
673 0.52
674 0.55
675 0.63
676 0.69
677 0.75
678 0.78
679 0.78
680 0.84
681 0.81
682 0.78
683 0.74
684 0.73
685 0.65
686 0.56
687 0.53
688 0.45
689 0.43
690 0.42
691 0.42
692 0.37
693 0.38
694 0.39
695 0.43
696 0.52
697 0.57
698 0.61
699 0.64
700 0.64
701 0.66
702 0.71
703 0.67
704 0.63
705 0.57
706 0.54
707 0.49
708 0.47
709 0.43
710 0.36
711 0.34
712 0.28
713 0.24
714 0.17
715 0.17
716 0.15
717 0.18
718 0.24
719 0.27
720 0.33
721 0.41
722 0.51
723 0.56
724 0.66
725 0.71
726 0.76
727 0.83
728 0.84
729 0.87
730 0.88
731 0.9
732 0.87
733 0.88
734 0.87
735 0.84
736 0.85
737 0.8
738 0.77
739 0.72
740 0.68
741 0.63
742 0.59
743 0.52
744 0.43
745 0.37
746 0.3
747 0.27
748 0.25
749 0.28
750 0.32
751 0.42
752 0.5
753 0.57
754 0.62
755 0.69
756 0.77
757 0.77
758 0.79
759 0.8
760 0.82
761 0.84
762 0.83
763 0.79
764 0.77
765 0.72
766 0.61
767 0.58
768 0.55
769 0.53
770 0.47
771 0.43
772 0.36
773 0.32
774 0.33
775 0.24
776 0.21
777 0.15
778 0.15
779 0.13
780 0.13
781 0.17
782 0.18
783 0.18
784 0.16
785 0.17
786 0.19
787 0.21
788 0.21
789 0.18
790 0.2
791 0.2
792 0.23
793 0.26
794 0.24
795 0.25
796 0.29
797 0.34
798 0.34
799 0.37
800 0.38
801 0.39
802 0.45
803 0.51
804 0.5
805 0.5
806 0.54
807 0.55
808 0.59
809 0.58
810 0.6
811 0.6
812 0.62
813 0.63
814 0.65
815 0.63
816 0.58
817 0.56
818 0.55
819 0.48
820 0.45
821 0.39
822 0.33
823 0.28
824 0.26
825 0.24
826 0.17
827 0.14
828 0.12
829 0.12
830 0.09
831 0.09
832 0.08
833 0.07
834 0.07
835 0.07
836 0.08
837 0.06
838 0.06
839 0.06
840 0.06
841 0.06
842 0.06
843 0.06
844 0.06
845 0.06
846 0.1
847 0.11
848 0.11
849 0.13
850 0.15
851 0.2
852 0.25
853 0.27
854 0.31
855 0.4
856 0.45
857 0.54
858 0.55
859 0.56
860 0.6
861 0.65
862 0.6
863 0.55
864 0.52
865 0.47
866 0.51
867 0.5
868 0.48
869 0.5
870 0.5
871 0.5