Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CTI2

Protein Details
Accession B0CTI2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-77LLLDRKDTRTPAKKNRRRLDTTEEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
253-280ETKRPSPPPEPKSPRRPSPPSPKASKPR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 15, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR000156  Ran_bind_dom  
IPR045255  RanBP1-like  
Gene Ontology GO:0046907  P:intracellular transport  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_305140  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00638  Ran_BP1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50196  RANBD1  
Amino Acid Sequences MSELQHSARKNSPPLTPPSPDTTDAELKLSRKREREVSLEPLTPSTIVDTDPLLLDRKDTRTPAKKNRRRLDTTEEEDDGLTRSRSNSGSPPLSVSPPQEMKMRVRQISQGVEDLSWRNMQATTPDKDADEDNAGLAPGDAQDVIATQGSTVDIKVDSETQDESPPKTPEETQLMPSQSMMDASPAVPRKEALSEESTFRLRSDSESGGDKGLKRKFLERGTSQGPPETVDTSGPEPLKRPRDEADGDDNPRETKRPSPPPEPKSPRRPSPPSPKASKPRGFMAYASTSSPFASVKGQNLFASSNSNKTPPPPSIPAPAAPLSASIPKLGESSTSSNTPTATKRSGFEAFSSSASPFASIKAKLPVSGSTAKLGRAKSPPRRTNTANLNATNPFASYAGTAQSFAVPMQKRARAGSPNGSARSSLERNPTVGVFGASTTTGNNNGSDSGAEDDGGYRSTHTSFGARLRAGKDEDEESKSEEEQSKVLLTEQDVVTGEEEEETIHQVRGKLFSLVGGNTWKERGTGLLKLNVKRDDGTGARLVMRKEAVYTLLLNVTLFSGMRCSLAQDPRYLRFSIIEAGATTHYNLRVSNAKIAQELLEEINANIPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.6
3 0.58
4 0.55
5 0.55
6 0.55
7 0.51
8 0.48
9 0.46
10 0.45
11 0.41
12 0.41
13 0.38
14 0.37
15 0.41
16 0.46
17 0.47
18 0.47
19 0.52
20 0.57
21 0.59
22 0.63
23 0.62
24 0.62
25 0.6
26 0.58
27 0.53
28 0.45
29 0.4
30 0.33
31 0.26
32 0.2
33 0.16
34 0.12
35 0.12
36 0.12
37 0.12
38 0.13
39 0.14
40 0.14
41 0.13
42 0.16
43 0.2
44 0.24
45 0.29
46 0.33
47 0.42
48 0.49
49 0.6
50 0.68
51 0.74
52 0.78
53 0.83
54 0.89
55 0.88
56 0.86
57 0.83
58 0.81
59 0.79
60 0.78
61 0.72
62 0.63
63 0.54
64 0.46
65 0.4
66 0.32
67 0.24
68 0.18
69 0.13
70 0.13
71 0.16
72 0.17
73 0.2
74 0.25
75 0.3
76 0.33
77 0.32
78 0.35
79 0.34
80 0.36
81 0.35
82 0.32
83 0.32
84 0.31
85 0.33
86 0.33
87 0.35
88 0.38
89 0.45
90 0.5
91 0.45
92 0.45
93 0.47
94 0.48
95 0.49
96 0.45
97 0.38
98 0.31
99 0.28
100 0.28
101 0.25
102 0.21
103 0.17
104 0.16
105 0.14
106 0.13
107 0.14
108 0.18
109 0.22
110 0.24
111 0.25
112 0.26
113 0.25
114 0.26
115 0.27
116 0.23
117 0.2
118 0.17
119 0.15
120 0.14
121 0.13
122 0.12
123 0.1
124 0.08
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.06
139 0.07
140 0.06
141 0.07
142 0.08
143 0.1
144 0.1
145 0.11
146 0.13
147 0.13
148 0.18
149 0.19
150 0.21
151 0.25
152 0.25
153 0.25
154 0.26
155 0.26
156 0.26
157 0.31
158 0.31
159 0.28
160 0.32
161 0.32
162 0.3
163 0.28
164 0.24
165 0.17
166 0.16
167 0.13
168 0.08
169 0.07
170 0.08
171 0.13
172 0.16
173 0.17
174 0.16
175 0.16
176 0.17
177 0.19
178 0.2
179 0.18
180 0.19
181 0.2
182 0.22
183 0.24
184 0.24
185 0.22
186 0.21
187 0.18
188 0.14
189 0.16
190 0.18
191 0.17
192 0.18
193 0.21
194 0.21
195 0.22
196 0.23
197 0.22
198 0.25
199 0.27
200 0.3
201 0.28
202 0.32
203 0.38
204 0.42
205 0.47
206 0.42
207 0.44
208 0.44
209 0.46
210 0.41
211 0.36
212 0.3
213 0.24
214 0.23
215 0.18
216 0.15
217 0.12
218 0.13
219 0.12
220 0.16
221 0.16
222 0.14
223 0.16
224 0.23
225 0.3
226 0.3
227 0.32
228 0.3
229 0.35
230 0.37
231 0.38
232 0.39
233 0.37
234 0.38
235 0.36
236 0.34
237 0.29
238 0.27
239 0.25
240 0.19
241 0.21
242 0.27
243 0.37
244 0.43
245 0.52
246 0.61
247 0.66
248 0.75
249 0.77
250 0.76
251 0.77
252 0.77
253 0.75
254 0.74
255 0.75
256 0.73
257 0.76
258 0.76
259 0.72
260 0.71
261 0.72
262 0.72
263 0.74
264 0.71
265 0.62
266 0.58
267 0.55
268 0.49
269 0.41
270 0.36
271 0.29
272 0.25
273 0.23
274 0.18
275 0.15
276 0.14
277 0.14
278 0.1
279 0.08
280 0.11
281 0.12
282 0.14
283 0.16
284 0.17
285 0.16
286 0.17
287 0.17
288 0.13
289 0.17
290 0.15
291 0.16
292 0.16
293 0.17
294 0.16
295 0.18
296 0.21
297 0.18
298 0.22
299 0.23
300 0.24
301 0.27
302 0.28
303 0.27
304 0.27
305 0.25
306 0.21
307 0.17
308 0.15
309 0.12
310 0.13
311 0.12
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.12
320 0.14
321 0.15
322 0.15
323 0.15
324 0.16
325 0.17
326 0.17
327 0.17
328 0.19
329 0.19
330 0.19
331 0.23
332 0.25
333 0.23
334 0.22
335 0.22
336 0.2
337 0.19
338 0.19
339 0.15
340 0.13
341 0.12
342 0.12
343 0.09
344 0.1
345 0.12
346 0.12
347 0.13
348 0.18
349 0.18
350 0.18
351 0.19
352 0.18
353 0.2
354 0.23
355 0.22
356 0.2
357 0.21
358 0.22
359 0.25
360 0.24
361 0.24
362 0.29
363 0.37
364 0.44
365 0.54
366 0.59
367 0.61
368 0.66
369 0.65
370 0.66
371 0.66
372 0.65
373 0.6
374 0.54
375 0.51
376 0.45
377 0.42
378 0.34
379 0.25
380 0.16
381 0.11
382 0.1
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.14
393 0.14
394 0.18
395 0.23
396 0.26
397 0.27
398 0.29
399 0.34
400 0.32
401 0.35
402 0.38
403 0.39
404 0.42
405 0.43
406 0.41
407 0.37
408 0.33
409 0.36
410 0.31
411 0.28
412 0.29
413 0.29
414 0.29
415 0.3
416 0.28
417 0.23
418 0.2
419 0.16
420 0.1
421 0.09
422 0.08
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.08
427 0.1
428 0.1
429 0.1
430 0.1
431 0.1
432 0.11
433 0.1
434 0.1
435 0.1
436 0.09
437 0.09
438 0.08
439 0.09
440 0.09
441 0.1
442 0.09
443 0.07
444 0.09
445 0.1
446 0.11
447 0.11
448 0.12
449 0.14
450 0.19
451 0.24
452 0.23
453 0.26
454 0.27
455 0.31
456 0.31
457 0.3
458 0.27
459 0.26
460 0.29
461 0.28
462 0.27
463 0.26
464 0.25
465 0.24
466 0.26
467 0.25
468 0.23
469 0.2
470 0.2
471 0.19
472 0.17
473 0.18
474 0.16
475 0.13
476 0.17
477 0.16
478 0.17
479 0.16
480 0.17
481 0.16
482 0.15
483 0.14
484 0.09
485 0.09
486 0.07
487 0.07
488 0.1
489 0.1
490 0.11
491 0.13
492 0.15
493 0.17
494 0.2
495 0.21
496 0.2
497 0.18
498 0.2
499 0.2
500 0.18
501 0.18
502 0.19
503 0.19
504 0.19
505 0.2
506 0.18
507 0.16
508 0.16
509 0.19
510 0.19
511 0.24
512 0.27
513 0.33
514 0.39
515 0.43
516 0.49
517 0.48
518 0.46
519 0.4
520 0.37
521 0.36
522 0.32
523 0.32
524 0.29
525 0.27
526 0.29
527 0.31
528 0.3
529 0.28
530 0.28
531 0.24
532 0.22
533 0.22
534 0.2
535 0.18
536 0.19
537 0.17
538 0.16
539 0.16
540 0.14
541 0.13
542 0.11
543 0.1
544 0.09
545 0.08
546 0.08
547 0.09
548 0.1
549 0.1
550 0.13
551 0.2
552 0.28
553 0.3
554 0.36
555 0.41
556 0.45
557 0.48
558 0.46
559 0.39
560 0.33
561 0.33
562 0.3
563 0.26
564 0.21
565 0.18
566 0.19
567 0.19
568 0.18
569 0.17
570 0.17
571 0.17
572 0.18
573 0.18
574 0.2
575 0.25
576 0.28
577 0.35
578 0.35
579 0.36
580 0.35
581 0.36
582 0.33
583 0.27
584 0.27
585 0.19
586 0.17
587 0.16
588 0.15