Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3DNK3

Protein Details
Accession S3DNK3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
331-350RDPNDWKKRRENDQASGHKNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
336-377WKKRRENDQASGHKNDKGGRNARGRGRGRGRGRGGGGRGGNR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 14.5, nucl 14, cyto 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR002344  Lupus_La  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG glz:GLAREA_06689  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd12291  RRM1_La  
Amino Acid Sequences MSSIPVEAGAVPDPAATSVANDTPLETAETSAPTVAEVEMADPETAEANGETKEAEKTEAVKAEEGDAEKKNGEANKPRTNYNDRRNGNNRNFQGNNYQKDSHPGKSYPFPFSIATRFITPNFHIQIEFYFGDANLPGDKFLYDLVGTENNPVPIKTITNFGRMRRFEPYEEIVAALKEESPLVKYVEVDGVDMVQRVQPFDPASRTPSKVIAKTMYVKGFGEEQALTQKHIEIFFNKLFPPKAIETRLRRGPHREFKGSVFVEVQSEEVLDEFLARDPKPTFEGKELTFMKKLDYMEKKNEDIREGRVIPQKTRYEGGGRGRGNGRDNDRDPNDWKKRRENDQASGHKNDKGGRNARGRGRGRGRGRGGGGRGGNRDNRDRNDDRNREHNGDNDNAKSEVKNEVQSESADIKVDQTSSNGNKRTREEDNGPSEAPAPKKVDVKAEVASEAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.08
4 0.09
5 0.11
6 0.13
7 0.14
8 0.14
9 0.14
10 0.14
11 0.15
12 0.16
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.15
17 0.14
18 0.14
19 0.13
20 0.11
21 0.11
22 0.1
23 0.09
24 0.07
25 0.08
26 0.08
27 0.1
28 0.09
29 0.08
30 0.09
31 0.09
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.09
38 0.08
39 0.09
40 0.11
41 0.11
42 0.13
43 0.14
44 0.16
45 0.21
46 0.26
47 0.26
48 0.25
49 0.25
50 0.25
51 0.26
52 0.25
53 0.25
54 0.22
55 0.22
56 0.21
57 0.21
58 0.23
59 0.24
60 0.3
61 0.36
62 0.42
63 0.5
64 0.52
65 0.55
66 0.59
67 0.65
68 0.67
69 0.67
70 0.69
71 0.62
72 0.7
73 0.75
74 0.78
75 0.77
76 0.77
77 0.7
78 0.68
79 0.67
80 0.59
81 0.62
82 0.59
83 0.56
84 0.52
85 0.5
86 0.42
87 0.5
88 0.51
89 0.45
90 0.43
91 0.39
92 0.38
93 0.44
94 0.47
95 0.43
96 0.4
97 0.38
98 0.34
99 0.34
100 0.34
101 0.28
102 0.26
103 0.24
104 0.24
105 0.23
106 0.26
107 0.25
108 0.28
109 0.27
110 0.26
111 0.23
112 0.22
113 0.22
114 0.23
115 0.21
116 0.14
117 0.12
118 0.11
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.06
131 0.06
132 0.08
133 0.1
134 0.1
135 0.13
136 0.14
137 0.15
138 0.15
139 0.15
140 0.15
141 0.13
142 0.15
143 0.13
144 0.19
145 0.19
146 0.27
147 0.3
148 0.32
149 0.4
150 0.39
151 0.41
152 0.41
153 0.42
154 0.36
155 0.38
156 0.37
157 0.3
158 0.29
159 0.26
160 0.2
161 0.17
162 0.15
163 0.1
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.06
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.1
188 0.12
189 0.15
190 0.14
191 0.19
192 0.22
193 0.24
194 0.23
195 0.28
196 0.3
197 0.29
198 0.3
199 0.27
200 0.26
201 0.28
202 0.31
203 0.25
204 0.23
205 0.21
206 0.19
207 0.18
208 0.16
209 0.14
210 0.1
211 0.09
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.13
216 0.14
217 0.13
218 0.14
219 0.15
220 0.1
221 0.14
222 0.15
223 0.16
224 0.16
225 0.17
226 0.17
227 0.16
228 0.19
229 0.17
230 0.2
231 0.24
232 0.31
233 0.34
234 0.4
235 0.47
236 0.46
237 0.46
238 0.5
239 0.55
240 0.57
241 0.58
242 0.56
243 0.5
244 0.5
245 0.55
246 0.48
247 0.39
248 0.3
249 0.24
250 0.2
251 0.18
252 0.16
253 0.08
254 0.07
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.06
262 0.09
263 0.09
264 0.12
265 0.12
266 0.14
267 0.17
268 0.19
269 0.19
270 0.2
271 0.24
272 0.22
273 0.3
274 0.31
275 0.31
276 0.32
277 0.3
278 0.27
279 0.27
280 0.27
281 0.28
282 0.33
283 0.35
284 0.41
285 0.45
286 0.46
287 0.47
288 0.48
289 0.43
290 0.37
291 0.35
292 0.34
293 0.32
294 0.35
295 0.37
296 0.38
297 0.37
298 0.44
299 0.43
300 0.38
301 0.39
302 0.35
303 0.32
304 0.36
305 0.4
306 0.4
307 0.37
308 0.39
309 0.41
310 0.42
311 0.42
312 0.42
313 0.4
314 0.4
315 0.42
316 0.46
317 0.46
318 0.47
319 0.47
320 0.52
321 0.57
322 0.57
323 0.62
324 0.63
325 0.68
326 0.73
327 0.8
328 0.77
329 0.75
330 0.78
331 0.81
332 0.76
333 0.74
334 0.67
335 0.59
336 0.54
337 0.5
338 0.47
339 0.47
340 0.48
341 0.5
342 0.56
343 0.6
344 0.64
345 0.69
346 0.65
347 0.66
348 0.68
349 0.69
350 0.67
351 0.7
352 0.68
353 0.64
354 0.64
355 0.6
356 0.54
357 0.51
358 0.48
359 0.43
360 0.42
361 0.42
362 0.43
363 0.42
364 0.49
365 0.49
366 0.51
367 0.55
368 0.55
369 0.6
370 0.66
371 0.69
372 0.66
373 0.67
374 0.69
375 0.65
376 0.63
377 0.59
378 0.53
379 0.51
380 0.5
381 0.43
382 0.39
383 0.35
384 0.34
385 0.29
386 0.25
387 0.26
388 0.25
389 0.28
390 0.27
391 0.28
392 0.28
393 0.28
394 0.31
395 0.26
396 0.23
397 0.19
398 0.18
399 0.18
400 0.18
401 0.18
402 0.15
403 0.14
404 0.21
405 0.28
406 0.36
407 0.42
408 0.44
409 0.5
410 0.54
411 0.59
412 0.57
413 0.58
414 0.56
415 0.58
416 0.61
417 0.59
418 0.54
419 0.48
420 0.45
421 0.42
422 0.39
423 0.36
424 0.34
425 0.34
426 0.39
427 0.41
428 0.46
429 0.44
430 0.46
431 0.43
432 0.41