Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3D2G6

Protein Details
Accession S3D2G6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
356-375SSPAPLKPMMPRKRPPVDVFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
366-384PRKRPPVDVFNRGAKKVKR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG glz:GLAREA_02143  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MYAQLGAPKLIDSCTRACIKNIRSLTDIGDFEYRQIKNILDRIDSPEQLHQIEINSPQIRGEDAELWQKFIARDIPNWKQKNWAPKNPTKWYEVYVKYKKDQAQEIARDEEILRNAMMGLKKHKAGNVSQIVSIRDRTLPKLPRDPRMIANNGGVPLKGKSKNGPTLAKAPPSSLNWTAGSKTKMSDPKGVLARARREAAQIAQMGKLATPTHQLGQRKNQIRQAPAGMANEYRLAAQPALKILSGKRKTTGSYSGGVAGPSLEEREAKLRALTGHAGATANYVGSSDDDDDDILAGGYEYDQDEEEEDGDDLFDEKPERSSQGSSQASRSTPNKSQSRSIGSALSPASGSSTRTSSPAPLKPMMPRKRPPVDVFNRGAKKVKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.3
3 0.31
4 0.34
5 0.41
6 0.42
7 0.48
8 0.49
9 0.48
10 0.45
11 0.45
12 0.44
13 0.41
14 0.37
15 0.3
16 0.31
17 0.26
18 0.26
19 0.32
20 0.29
21 0.25
22 0.26
23 0.25
24 0.27
25 0.33
26 0.34
27 0.29
28 0.31
29 0.37
30 0.41
31 0.4
32 0.36
33 0.36
34 0.35
35 0.33
36 0.31
37 0.24
38 0.2
39 0.22
40 0.22
41 0.25
42 0.23
43 0.23
44 0.23
45 0.22
46 0.22
47 0.2
48 0.21
49 0.15
50 0.16
51 0.25
52 0.24
53 0.26
54 0.25
55 0.26
56 0.23
57 0.23
58 0.28
59 0.22
60 0.28
61 0.34
62 0.44
63 0.51
64 0.55
65 0.52
66 0.54
67 0.55
68 0.61
69 0.62
70 0.62
71 0.62
72 0.67
73 0.76
74 0.77
75 0.76
76 0.7
77 0.62
78 0.56
79 0.56
80 0.54
81 0.55
82 0.53
83 0.55
84 0.53
85 0.58
86 0.59
87 0.55
88 0.54
89 0.51
90 0.52
91 0.53
92 0.53
93 0.49
94 0.44
95 0.4
96 0.34
97 0.3
98 0.22
99 0.17
100 0.13
101 0.11
102 0.11
103 0.13
104 0.15
105 0.14
106 0.18
107 0.2
108 0.24
109 0.25
110 0.27
111 0.27
112 0.27
113 0.34
114 0.35
115 0.34
116 0.32
117 0.33
118 0.33
119 0.31
120 0.3
121 0.22
122 0.19
123 0.2
124 0.21
125 0.27
126 0.33
127 0.36
128 0.46
129 0.48
130 0.51
131 0.56
132 0.55
133 0.52
134 0.52
135 0.5
136 0.42
137 0.39
138 0.34
139 0.29
140 0.26
141 0.2
142 0.15
143 0.13
144 0.18
145 0.18
146 0.18
147 0.22
148 0.28
149 0.34
150 0.39
151 0.4
152 0.37
153 0.42
154 0.43
155 0.43
156 0.37
157 0.32
158 0.29
159 0.28
160 0.3
161 0.24
162 0.24
163 0.21
164 0.22
165 0.21
166 0.22
167 0.21
168 0.17
169 0.16
170 0.2
171 0.24
172 0.26
173 0.31
174 0.28
175 0.32
176 0.35
177 0.35
178 0.32
179 0.32
180 0.33
181 0.3
182 0.3
183 0.25
184 0.23
185 0.23
186 0.21
187 0.19
188 0.17
189 0.15
190 0.15
191 0.15
192 0.14
193 0.12
194 0.13
195 0.09
196 0.08
197 0.1
198 0.1
199 0.12
200 0.16
201 0.2
202 0.23
203 0.32
204 0.4
205 0.44
206 0.47
207 0.5
208 0.51
209 0.49
210 0.48
211 0.41
212 0.35
213 0.31
214 0.29
215 0.23
216 0.19
217 0.18
218 0.16
219 0.13
220 0.11
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.1
225 0.1
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.13
231 0.23
232 0.26
233 0.27
234 0.28
235 0.29
236 0.3
237 0.34
238 0.37
239 0.29
240 0.27
241 0.27
242 0.27
243 0.25
244 0.23
245 0.19
246 0.12
247 0.1
248 0.08
249 0.08
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.11
254 0.12
255 0.13
256 0.13
257 0.14
258 0.14
259 0.17
260 0.17
261 0.14
262 0.13
263 0.14
264 0.14
265 0.12
266 0.12
267 0.09
268 0.08
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.07
281 0.06
282 0.04
283 0.04
284 0.03
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.12
305 0.13
306 0.16
307 0.18
308 0.21
309 0.22
310 0.31
311 0.37
312 0.36
313 0.38
314 0.4
315 0.38
316 0.41
317 0.42
318 0.39
319 0.4
320 0.48
321 0.52
322 0.52
323 0.58
324 0.59
325 0.63
326 0.59
327 0.54
328 0.49
329 0.41
330 0.41
331 0.34
332 0.28
333 0.2
334 0.17
335 0.18
336 0.15
337 0.17
338 0.15
339 0.18
340 0.18
341 0.21
342 0.22
343 0.26
344 0.33
345 0.37
346 0.4
347 0.41
348 0.44
349 0.51
350 0.6
351 0.63
352 0.64
353 0.67
354 0.71
355 0.76
356 0.81
357 0.78
358 0.78
359 0.77
360 0.76
361 0.74
362 0.75
363 0.71
364 0.67