Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

S3CDT4

Protein Details
Accession S3CDT4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
428-458SKKISTKPKKAEPEKKKQKTKPKPKASSGDDBasic
630-655YALLLIRSRIRRRRWRAPKSVVERLPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
429-453KKISTKPKKAEPEKKKQKTKPKPKA
638-648RIRRRRWRAPK
Subcellular Location(s) extr 9, plas 7, E.R. 4, mito 3, golg 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046450  PA_dom_sf  
IPR003137  PA_domain  
IPR001841  Znf_RING  
IPR011016  Znf_RING-CH  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0008237  F:metallopeptidase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG glz:GLAREA_08025  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02225  PA  
PF13639  zf-RING_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd04813  PA_1  
cd16454  RING-H2_PA-TM-RING  
Amino Acid Sequences MRPPRVIIAVVFFVTTVVLTVLSYRSSNHPQIIETASGPTQKPTGLQAFFSIRTPFSLFPPNAIITLTHENSTAFLARPAAFGPQLPVEGLKGQVWIGSGFGDDGIRQGPVVTGAEGELGCSDVPGWMDNYKSVPAVENKDSKSGSGKSSTAAAKANIQDRASEGKVREEHEDTTEKSSKESGSAAGPSTNDGTDDHLHHPLPGSSVSKAKDKHMEGSKGSHADIQSIQESAEIAGKVVLLSRGGCGFLEKVKWAQRRGAIALIVGDDTKGGPLIQMYARGDTSNVTIPSIFTSRTTAHLLSSLIGPGSFLEDALDENGKPVLSVHHTDATRKSGKKQGSQPTFTQMAAGSPKATATSHPTPRATSKKTSPKAEKETSVATERPSWFRSLFFGPRKGDAKTESSRPPSSGQLDWVLVDDWKDDDHVGSKKISTKPKKAEPEKKKQKTKPKPKASSGDDFVIGVQDWRDPDLLSPSSDPDASTQTPSKEEKSDGSSTSSPATKVGGKKHLGGALQEIPEYVPSLRGGSITPGSGEYGTSDSSVEQDIDKNDEDKEEGTAKGLLTTIFGDDEEDVEFLTPHPAVTNDDLPDDDNDELEGLWVTLTPTSGASPFLDTLLVLVVSPLVTLTVVYALLLIRSRIRRRRWRAPKSVVERLPVRTYQTVASISPQPSRISAAVEPTVTTPLLQHSPPSRPRPRSRTTSGIPEPGDIIRANSNPLHVPSMPPRSPEPEKHQGSHTSEWRKYMGKQVECVVCLEEYVDGVSRVMSLPCGHEFHVDCITPWLTTRRRTCPICKGDVVRSLARGTPSSPRYDSYHDDSDEDSQGESATSSLPIPTAAENTDVEQGTPTRTRRPPQPGSWRSLLASSLGSSSRTPPPPQEDRSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.11
3 0.08
4 0.05
5 0.05
6 0.05
7 0.07
8 0.08
9 0.1
10 0.11
11 0.12
12 0.19
13 0.27
14 0.32
15 0.35
16 0.36
17 0.35
18 0.39
19 0.4
20 0.35
21 0.28
22 0.27
23 0.24
24 0.27
25 0.26
26 0.24
27 0.22
28 0.21
29 0.21
30 0.24
31 0.29
32 0.27
33 0.27
34 0.3
35 0.33
36 0.34
37 0.36
38 0.32
39 0.24
40 0.26
41 0.29
42 0.25
43 0.25
44 0.33
45 0.3
46 0.31
47 0.35
48 0.32
49 0.29
50 0.28
51 0.25
52 0.21
53 0.29
54 0.27
55 0.23
56 0.23
57 0.22
58 0.22
59 0.24
60 0.21
61 0.13
62 0.14
63 0.17
64 0.17
65 0.17
66 0.17
67 0.18
68 0.16
69 0.16
70 0.18
71 0.16
72 0.16
73 0.16
74 0.16
75 0.14
76 0.15
77 0.16
78 0.14
79 0.13
80 0.12
81 0.12
82 0.13
83 0.11
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.08
89 0.07
90 0.06
91 0.07
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.09
98 0.1
99 0.09
100 0.08
101 0.08
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.08
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.07
112 0.08
113 0.1
114 0.1
115 0.12
116 0.13
117 0.15
118 0.15
119 0.16
120 0.15
121 0.17
122 0.22
123 0.27
124 0.32
125 0.37
126 0.37
127 0.42
128 0.42
129 0.38
130 0.39
131 0.36
132 0.33
133 0.31
134 0.3
135 0.25
136 0.31
137 0.31
138 0.27
139 0.27
140 0.24
141 0.25
142 0.29
143 0.33
144 0.32
145 0.31
146 0.28
147 0.28
148 0.33
149 0.3
150 0.3
151 0.26
152 0.29
153 0.32
154 0.34
155 0.36
156 0.33
157 0.33
158 0.33
159 0.36
160 0.31
161 0.35
162 0.38
163 0.33
164 0.32
165 0.33
166 0.28
167 0.26
168 0.25
169 0.19
170 0.16
171 0.18
172 0.18
173 0.17
174 0.16
175 0.16
176 0.16
177 0.15
178 0.12
179 0.11
180 0.15
181 0.16
182 0.19
183 0.2
184 0.22
185 0.22
186 0.22
187 0.23
188 0.19
189 0.18
190 0.18
191 0.17
192 0.16
193 0.21
194 0.22
195 0.27
196 0.28
197 0.31
198 0.37
199 0.37
200 0.43
201 0.47
202 0.5
203 0.46
204 0.49
205 0.49
206 0.42
207 0.4
208 0.35
209 0.27
210 0.24
211 0.23
212 0.21
213 0.17
214 0.15
215 0.15
216 0.12
217 0.12
218 0.1
219 0.12
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.11
236 0.12
237 0.12
238 0.17
239 0.25
240 0.31
241 0.32
242 0.36
243 0.38
244 0.4
245 0.41
246 0.38
247 0.3
248 0.25
249 0.23
250 0.19
251 0.15
252 0.1
253 0.08
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.07
262 0.07
263 0.11
264 0.12
265 0.13
266 0.14
267 0.14
268 0.14
269 0.12
270 0.14
271 0.14
272 0.14
273 0.13
274 0.12
275 0.13
276 0.15
277 0.15
278 0.14
279 0.1
280 0.13
281 0.13
282 0.16
283 0.19
284 0.17
285 0.16
286 0.18
287 0.17
288 0.15
289 0.14
290 0.11
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.05
295 0.07
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.08
303 0.06
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.06
309 0.08
310 0.1
311 0.13
312 0.15
313 0.2
314 0.2
315 0.23
316 0.25
317 0.29
318 0.32
319 0.32
320 0.34
321 0.35
322 0.4
323 0.45
324 0.52
325 0.56
326 0.57
327 0.6
328 0.56
329 0.55
330 0.51
331 0.44
332 0.35
333 0.25
334 0.19
335 0.17
336 0.16
337 0.11
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.15
344 0.22
345 0.27
346 0.31
347 0.32
348 0.33
349 0.39
350 0.46
351 0.43
352 0.41
353 0.45
354 0.52
355 0.57
356 0.63
357 0.65
358 0.65
359 0.69
360 0.67
361 0.6
362 0.52
363 0.48
364 0.42
365 0.38
366 0.3
367 0.23
368 0.24
369 0.24
370 0.25
371 0.24
372 0.23
373 0.21
374 0.2
375 0.22
376 0.22
377 0.28
378 0.29
379 0.34
380 0.33
381 0.36
382 0.38
383 0.36
384 0.33
385 0.28
386 0.3
387 0.27
388 0.31
389 0.32
390 0.35
391 0.35
392 0.34
393 0.33
394 0.31
395 0.31
396 0.26
397 0.23
398 0.2
399 0.19
400 0.17
401 0.16
402 0.12
403 0.09
404 0.09
405 0.07
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.09
412 0.1
413 0.11
414 0.12
415 0.13
416 0.19
417 0.25
418 0.35
419 0.38
420 0.45
421 0.51
422 0.59
423 0.68
424 0.71
425 0.76
426 0.76
427 0.8
428 0.83
429 0.86
430 0.87
431 0.86
432 0.87
433 0.88
434 0.9
435 0.89
436 0.89
437 0.87
438 0.84
439 0.84
440 0.78
441 0.73
442 0.64
443 0.54
444 0.43
445 0.35
446 0.28
447 0.2
448 0.14
449 0.08
450 0.06
451 0.05
452 0.05
453 0.06
454 0.07
455 0.06
456 0.07
457 0.11
458 0.11
459 0.11
460 0.12
461 0.12
462 0.12
463 0.13
464 0.12
465 0.09
466 0.12
467 0.12
468 0.14
469 0.15
470 0.15
471 0.19
472 0.2
473 0.21
474 0.19
475 0.2
476 0.2
477 0.23
478 0.24
479 0.22
480 0.25
481 0.23
482 0.22
483 0.23
484 0.21
485 0.16
486 0.14
487 0.15
488 0.15
489 0.18
490 0.22
491 0.28
492 0.28
493 0.3
494 0.31
495 0.32
496 0.29
497 0.25
498 0.24
499 0.2
500 0.19
501 0.17
502 0.15
503 0.12
504 0.12
505 0.12
506 0.09
507 0.06
508 0.06
509 0.07
510 0.07
511 0.08
512 0.08
513 0.09
514 0.1
515 0.09
516 0.09
517 0.08
518 0.09
519 0.08
520 0.08
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.08
529 0.07
530 0.07
531 0.08
532 0.09
533 0.11
534 0.12
535 0.12
536 0.12
537 0.12
538 0.12
539 0.11
540 0.12
541 0.11
542 0.11
543 0.11
544 0.12
545 0.11
546 0.11
547 0.11
548 0.09
549 0.08
550 0.08
551 0.07
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.07
557 0.06
558 0.06
559 0.05
560 0.05
561 0.06
562 0.05
563 0.07
564 0.06
565 0.05
566 0.06
567 0.07
568 0.09
569 0.12
570 0.15
571 0.14
572 0.14
573 0.15
574 0.15
575 0.15
576 0.15
577 0.12
578 0.09
579 0.08
580 0.08
581 0.07
582 0.07
583 0.06
584 0.04
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.05
590 0.05
591 0.05
592 0.06
593 0.07
594 0.08
595 0.08
596 0.09
597 0.09
598 0.09
599 0.09
600 0.08
601 0.07
602 0.07
603 0.06
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.04
608 0.04
609 0.03
610 0.03
611 0.03
612 0.03
613 0.03
614 0.04
615 0.04
616 0.04
617 0.04
618 0.04
619 0.05
620 0.06
621 0.07
622 0.11
623 0.18
624 0.27
625 0.35
626 0.46
627 0.56
628 0.65
629 0.75
630 0.82
631 0.85
632 0.87
633 0.88
634 0.89
635 0.86
636 0.86
637 0.78
638 0.72
639 0.66
640 0.59
641 0.54
642 0.46
643 0.42
644 0.33
645 0.31
646 0.27
647 0.27
648 0.24
649 0.2
650 0.21
651 0.23
652 0.23
653 0.25
654 0.26
655 0.24
656 0.23
657 0.26
658 0.23
659 0.21
660 0.2
661 0.22
662 0.21
663 0.2
664 0.2
665 0.17
666 0.19
667 0.15
668 0.13
669 0.1
670 0.12
671 0.15
672 0.14
673 0.18
674 0.21
675 0.29
676 0.37
677 0.47
678 0.53
679 0.6
680 0.7
681 0.74
682 0.77
683 0.77
684 0.76
685 0.75
686 0.69
687 0.7
688 0.64
689 0.62
690 0.55
691 0.47
692 0.42
693 0.33
694 0.32
695 0.21
696 0.19
697 0.17
698 0.16
699 0.19
700 0.18
701 0.19
702 0.19
703 0.21
704 0.23
705 0.19
706 0.23
707 0.28
708 0.37
709 0.36
710 0.37
711 0.38
712 0.42
713 0.48
714 0.52
715 0.53
716 0.54
717 0.57
718 0.57
719 0.58
720 0.59
721 0.58
722 0.58
723 0.58
724 0.57
725 0.55
726 0.55
727 0.54
728 0.49
729 0.46
730 0.48
731 0.48
732 0.42
733 0.43
734 0.47
735 0.47
736 0.44
737 0.43
738 0.35
739 0.25
740 0.22
741 0.19
742 0.12
743 0.08
744 0.09
745 0.09
746 0.07
747 0.07
748 0.07
749 0.07
750 0.08
751 0.08
752 0.09
753 0.09
754 0.12
755 0.16
756 0.18
757 0.18
758 0.23
759 0.24
760 0.26
761 0.3
762 0.27
763 0.24
764 0.27
765 0.26
766 0.21
767 0.22
768 0.27
769 0.27
770 0.35
771 0.43
772 0.47
773 0.55
774 0.61
775 0.67
776 0.7
777 0.72
778 0.7
779 0.69
780 0.66
781 0.64
782 0.65
783 0.62
784 0.53
785 0.48
786 0.43
787 0.4
788 0.37
789 0.32
790 0.27
791 0.31
792 0.32
793 0.36
794 0.35
795 0.36
796 0.38
797 0.43
798 0.46
799 0.44
800 0.48
801 0.43
802 0.42
803 0.41
804 0.4
805 0.36
806 0.31
807 0.24
808 0.17
809 0.16
810 0.14
811 0.12
812 0.09
813 0.07
814 0.08
815 0.08
816 0.08
817 0.08
818 0.08
819 0.1
820 0.11
821 0.12
822 0.12
823 0.14
824 0.15
825 0.17
826 0.22
827 0.2
828 0.19
829 0.19
830 0.19
831 0.22
832 0.28
833 0.29
834 0.33
835 0.41
836 0.47
837 0.54
838 0.64
839 0.67
840 0.71
841 0.8
842 0.77
843 0.78
844 0.76
845 0.69
846 0.6
847 0.53
848 0.43
849 0.34
850 0.28
851 0.21
852 0.19
853 0.17
854 0.18
855 0.17
856 0.21
857 0.28
858 0.32
859 0.35
860 0.4
861 0.48
862 0.55