Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DNR4

Protein Details
Accession B0DNR4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-262VDGQRKERKKGVKRGPYKRKNKGDSDGBasic
406-430GAPTQTRKRPRASKTGEPRAKKSKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
240-257RKERKKGVKRGPYKRKNK
412-429RKRPRASKTGEPRAKKSK
Subcellular Location(s) extr 12, mito 7, cyto 4, nucl 2, plas 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_331193  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MFILFDKARDSLLKGLYLILEGLFVFGAPNFWPRADIRASLSGDSIGNAQFQSECLVIYAISSVEVELQAFCSSHPYKVFKDIVNGPDLLAMAMVEQAKTTPPTQEHPYPPVAPYAHQPYNGAGYPPPGPPGYPPPFFPYPPPPDGSHGETGHNGAPPAPYVMFGPPPGMMYAYPPPQQGQPYPPQPTSSAPSVTSRAKRKQVKMACTNCAAACKRCDENRPCDRCQKYSISDTCVDGQRKERKKGVKRGPYKRKNKGDSDGSSPYPGEWPAGSHPPTAATTAAALHAVTSYAHPPEGYYPVFYPPGGAFMPQPPHDGQPNPDGSPPHAAQPPMMPYYLHPAAYPPFHPYPPMYPPPPPGAQQHPLHQQPAPPPEQQQPPQTINPTEAGKKPDDLPNNGVTSGGEGAPTQTRKRPRASKTGEPRAKKSKTVTATSAKDGESEIAAAGVEEDGGAAAAATAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.22
4 0.21
5 0.18
6 0.11
7 0.09
8 0.08
9 0.08
10 0.06
11 0.06
12 0.06
13 0.05
14 0.07
15 0.07
16 0.11
17 0.12
18 0.12
19 0.15
20 0.16
21 0.22
22 0.24
23 0.25
24 0.27
25 0.32
26 0.34
27 0.32
28 0.32
29 0.28
30 0.24
31 0.23
32 0.19
33 0.13
34 0.12
35 0.11
36 0.11
37 0.1
38 0.1
39 0.12
40 0.1
41 0.1
42 0.09
43 0.09
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.06
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.15
60 0.16
61 0.2
62 0.26
63 0.29
64 0.3
65 0.38
66 0.43
67 0.37
68 0.42
69 0.44
70 0.42
71 0.4
72 0.37
73 0.29
74 0.26
75 0.25
76 0.18
77 0.11
78 0.08
79 0.05
80 0.07
81 0.08
82 0.06
83 0.06
84 0.07
85 0.08
86 0.11
87 0.12
88 0.14
89 0.16
90 0.21
91 0.28
92 0.36
93 0.39
94 0.41
95 0.45
96 0.42
97 0.4
98 0.41
99 0.35
100 0.28
101 0.29
102 0.33
103 0.31
104 0.3
105 0.3
106 0.26
107 0.3
108 0.29
109 0.25
110 0.17
111 0.16
112 0.18
113 0.17
114 0.19
115 0.14
116 0.14
117 0.16
118 0.25
119 0.28
120 0.27
121 0.28
122 0.33
123 0.36
124 0.36
125 0.38
126 0.38
127 0.39
128 0.4
129 0.42
130 0.37
131 0.38
132 0.41
133 0.41
134 0.37
135 0.32
136 0.31
137 0.28
138 0.28
139 0.25
140 0.22
141 0.17
142 0.13
143 0.12
144 0.11
145 0.12
146 0.1
147 0.08
148 0.09
149 0.1
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.08
158 0.1
159 0.14
160 0.17
161 0.18
162 0.18
163 0.19
164 0.21
165 0.23
166 0.22
167 0.24
168 0.27
169 0.32
170 0.37
171 0.36
172 0.35
173 0.35
174 0.35
175 0.33
176 0.29
177 0.23
178 0.2
179 0.22
180 0.24
181 0.27
182 0.31
183 0.35
184 0.39
185 0.47
186 0.54
187 0.56
188 0.62
189 0.64
190 0.66
191 0.68
192 0.67
193 0.61
194 0.55
195 0.51
196 0.42
197 0.4
198 0.34
199 0.26
200 0.23
201 0.23
202 0.24
203 0.26
204 0.35
205 0.35
206 0.43
207 0.51
208 0.55
209 0.55
210 0.6
211 0.6
212 0.54
213 0.54
214 0.49
215 0.42
216 0.44
217 0.42
218 0.37
219 0.35
220 0.34
221 0.32
222 0.32
223 0.29
224 0.23
225 0.29
226 0.35
227 0.4
228 0.44
229 0.48
230 0.52
231 0.6
232 0.69
233 0.72
234 0.72
235 0.76
236 0.82
237 0.87
238 0.88
239 0.89
240 0.89
241 0.88
242 0.85
243 0.8
244 0.76
245 0.73
246 0.66
247 0.62
248 0.56
249 0.47
250 0.41
251 0.35
252 0.28
253 0.21
254 0.18
255 0.12
256 0.08
257 0.09
258 0.11
259 0.16
260 0.17
261 0.16
262 0.16
263 0.17
264 0.18
265 0.17
266 0.14
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.09
271 0.07
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.07
279 0.07
280 0.08
281 0.07
282 0.08
283 0.1
284 0.13
285 0.13
286 0.13
287 0.13
288 0.16
289 0.17
290 0.16
291 0.16
292 0.12
293 0.14
294 0.13
295 0.13
296 0.11
297 0.15
298 0.19
299 0.19
300 0.22
301 0.2
302 0.22
303 0.25
304 0.26
305 0.25
306 0.27
307 0.3
308 0.28
309 0.29
310 0.28
311 0.26
312 0.31
313 0.28
314 0.26
315 0.25
316 0.24
317 0.22
318 0.25
319 0.27
320 0.22
321 0.22
322 0.17
323 0.15
324 0.23
325 0.25
326 0.21
327 0.17
328 0.18
329 0.2
330 0.23
331 0.23
332 0.21
333 0.22
334 0.22
335 0.25
336 0.25
337 0.28
338 0.33
339 0.38
340 0.35
341 0.35
342 0.39
343 0.43
344 0.43
345 0.4
346 0.38
347 0.39
348 0.43
349 0.42
350 0.46
351 0.48
352 0.49
353 0.49
354 0.45
355 0.42
356 0.42
357 0.46
358 0.43
359 0.37
360 0.38
361 0.43
362 0.5
363 0.51
364 0.5
365 0.5
366 0.51
367 0.53
368 0.54
369 0.48
370 0.42
371 0.4
372 0.37
373 0.35
374 0.34
375 0.34
376 0.31
377 0.32
378 0.34
379 0.38
380 0.4
381 0.41
382 0.42
383 0.42
384 0.42
385 0.4
386 0.36
387 0.28
388 0.24
389 0.2
390 0.16
391 0.11
392 0.09
393 0.11
394 0.17
395 0.21
396 0.23
397 0.29
398 0.38
399 0.45
400 0.55
401 0.62
402 0.63
403 0.71
404 0.75
405 0.79
406 0.8
407 0.85
408 0.84
409 0.81
410 0.82
411 0.81
412 0.78
413 0.74
414 0.69
415 0.68
416 0.66
417 0.65
418 0.64
419 0.63
420 0.63
421 0.61
422 0.57
423 0.48
424 0.42
425 0.36
426 0.3
427 0.22
428 0.18
429 0.13
430 0.09
431 0.09
432 0.08
433 0.07
434 0.06
435 0.05
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.03